MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004088	CGT	2	6	779996	780001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124608
15002	NC_004088	CTG	2	6	780015	780020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124608
15003	NC_004088	TTG	2	6	780081	780086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124608
15004	NC_004088	AAG	2	6	780102	780107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124608
15005	NC_004088	ACT	2	6	780245	780250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124608
15006	NC_004088	AGC	3	9	780271	780279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124608
15007	NC_004088	GCA	2	6	780466	780471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124609
15008	NC_004088	CAAC	2	8	780513	780520	50 %	0 %	0 %	50 %	22124609
15009	NC_004088	CAG	2	6	780525	780530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124609
15010	NC_004088	GAT	2	6	780582	780587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124609
15011	NC_004088	GC	4	8	780590	780597	0 %	0 %	50 %	50 %	22124609
15012	NC_004088	AT	3	6	780720	780725	50 %	50 %	0 %	0 %	22124609
15013	NC_004088	GCAG	2	8	780731	780738	25 %	0 %	50 %	25 %	22124609
15014	NC_004088	TGC	2	6	780749	780754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124609
15015	NC_004088	CG	3	6	780803	780808	0 %	0 %	50 %	50 %	22124609
15016	NC_004088	TAT	2	6	780831	780836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124609
15017	NC_004088	GAT	2	6	780861	780866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124609
15018	NC_004088	TGG	2	6	780925	780930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124609
15019	NC_004088	AGC	2	6	780950	780955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124609
15020	NC_004088	GTA	2	6	780957	780962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124609
15021	NC_004088	ACA	2	6	780968	780973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124609
15022	NC_004088	TCGC	2	8	781092	781099	0 %	25 %	25 %	50 %	22124609
15023	NC_004088	AAC	2	6	781197	781202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124609
15024	NC_004088	TTG	2	6	781213	781218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124609
15025	NC_004088	TTG	2	6	781233	781238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124609
15026	NC_004088	GAC	2	6	781266	781271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124609
15027	NC_004088	ATCGGA	2	12	781274	781285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22124609
15028	NC_004088	AAC	2	6	781302	781307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_004088	CGA	2	6	781435	781440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_004088	ATT	2	6	781460	781465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_004088	ACT	2	6	781485	781490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484874
15032	NC_004088	CTGA	2	8	781545	781552	25 %	25 %	25 %	25 %	161484874
15033	NC_004088	GTG	2	6	781800	781805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484874
15034	NC_004088	CGG	2	6	781814	781819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484874
15035	NC_004088	GTT	3	9	781866	781874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484874
15036	NC_004088	GTC	2	6	781885	781890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15037	NC_004088	ACC	2	6	781897	781902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161484874
15038	NC_004088	TGC	2	6	781966	781971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15039	NC_004088	GTT	2	6	782036	782041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484874
15040	NC_004088	TCG	2	6	782066	782071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15041	NC_004088	GAC	2	6	782126	782131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15042	NC_004088	GTGG	2	8	782163	782170	0 %	25 %	75 %	0 %	161484874
15043	NC_004088	TGC	2	6	782225	782230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15044	NC_004088	TAT	2	6	782231	782236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161484874
15045	NC_004088	CGTA	2	8	782240	782247	25 %	25 %	25 %	25 %	161484874
15046	NC_004088	ACA	2	6	782296	782301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484874
15047	NC_004088	CG	3	6	782517	782522	0 %	0 %	50 %	50 %	161484874
15048	NC_004088	CGT	2	6	782547	782552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15049	NC_004088	AGTTG	2	10	782597	782606	20 %	40 %	40 %	0 %	161484874
15050	NC_004088	CGT	2	6	782631	782636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15051	NC_004088	CGC	2	6	782648	782653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161484874
15052	NC_004088	CAA	2	6	782664	782669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484874
15053	NC_004088	GAA	2	6	782724	782729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161484874
15054	NC_004088	GCT	2	6	782751	782756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15055	NC_004088	CTG	2	6	782760	782765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15056	NC_004088	CCA	2	6	782799	782804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161484874
15057	NC_004088	AATTC	2	10	782830	782839	40 %	40 %	0 %	20 %	161484874
15058	NC_004088	TGA	2	6	782843	782848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484874
15059	NC_004088	GTG	2	6	782878	782883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484874
15060	NC_004088	CTG	2	6	782917	782922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15061	NC_004088	TGG	2	6	782933	782938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484874
15062	NC_004088	TCG	2	6	782951	782956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15063	NC_004088	CGT	2	6	782961	782966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15064	NC_004088	TGA	2	6	783008	783013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484874
15065	NC_004088	TTG	2	6	783034	783039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484874
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15067	NC_004088	GTT	2	6	783092	783097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484874
15068	NC_004088	ACCCGT	2	12	783159	783170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161484874
15069	NC_004088	GGT	2	6	783243	783248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484874
15070	NC_004088	GGT	2	6	783252	783257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484874
15071	NC_004088	CGT	2	6	783261	783266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15072	NC_004088	CGT	2	6	783294	783299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
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15075	NC_004088	TCG	2	6	783320	783325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
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15078	NC_004088	CGT	2	6	783366	783371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15079	NC_004088	CGT	2	6	783405	783410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15080	NC_004088	GAT	2	6	783411	783416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484874
15081	NC_004088	CTG	3	9	783427	783435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15082	NC_004088	GCC	2	6	783438	783443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161484874
15083	NC_004088	CGT	2	6	783453	783458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484874
15084	NC_004088	TGA	2	6	783494	783499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124611
15085	NC_004088	T	7	7	783529	783535	0 %	100 %	0 %	0 %	22124611
15086	NC_004088	TAT	2	6	783541	783546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124611
15087	NC_004088	T	6	6	783578	783583	0 %	100 %	0 %	0 %	22124611
15088	NC_004088	AG	3	6	783646	783651	50 %	0 %	50 %	0 %	22124611
15089	NC_004088	A	6	6	783744	783749	100 %	0 %	0 %	0 %	22124612
15090	NC_004088	CAAT	2	8	783803	783810	50 %	25 %	0 %	25 %	22124612
15091	NC_004088	AC	3	6	783913	783918	50 %	0 %	0 %	50 %	22124612
15092	NC_004088	TCC	2	6	784055	784060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124612
15093	NC_004088	CAA	2	6	784086	784091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_004088	GTT	2	6	784098	784103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_004088	GAA	2	6	784164	784169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124613
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15098	NC_004088	TGC	2	6	784376	784381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124613
15099	NC_004088	GAA	2	6	784388	784393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124613
15100	NC_004088	TGA	2	6	784413	784418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124613
15101	NC_004088	CTG	2	6	784454	784459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_004088	TC	3	6	784582	784587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_004088	CAA	2	6	784605	784610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_004088	T	7	7	784634	784640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_004088	CTGC	2	8	784658	784665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_004088	TGA	2	6	784740	784745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124614
15107	NC_004088	ATC	2	6	784764	784769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124614
15108	NC_004088	TAA	2	6	784793	784798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124614
15109	NC_004088	TACTT	2	10	784817	784826	20 %	60 %	0 %	20 %	22124614
15110	NC_004088	CGA	2	6	784834	784839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124614
15111	NC_004088	AGCGC	2	10	784846	784855	20 %	0 %	40 %	40 %	22124614
15112	NC_004088	GCC	2	6	784893	784898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124614
15113	NC_004088	GGT	2	6	784914	784919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124614
15114	NC_004088	TTG	2	6	784955	784960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124614
15115	NC_004088	CGCT	2	8	784992	784999	0 %	25 %	25 %	50 %	22124614
15116	NC_004088	AAC	2	6	785094	785099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124614
15117	NC_004088	AGGCAA	2	12	785119	785130	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22124614
15118	NC_004088	CGG	2	6	785146	785151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124614
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15490	NC_004088	GCA	2	6	804079	804084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124630
15491	NC_004088	AT	3	6	804135	804140	50 %	50 %	0 %	0 %	22124630
15492	NC_004088	GTG	2	6	804192	804197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124630
15493	NC_004088	TGG	2	6	804230	804235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124630
15494	NC_004088	GAT	2	6	804308	804313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124630
15495	NC_004088	TG	3	6	804339	804344	0 %	50 %	50 %	0 %	22124630
15496	NC_004088	CTA	2	6	804370	804375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124630
15497	NC_004088	GGCCA	2	10	804473	804482	20 %	0 %	40 %	40 %	22124630
15498	NC_004088	ATG	2	6	804530	804535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124630
15499	NC_004088	TTG	2	6	804578	804583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124630
15500	NC_004088	AGA	2	6	804589	804594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124630

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