MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004088	TGA	2	6	51083	51088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123958
1002	NC_004088	A	6	6	51111	51116	100 %	0 %	0 %	0 %	22123958
1003	NC_004088	A	7	7	51129	51135	100 %	0 %	0 %	0 %	22123958
1004	NC_004088	ATA	2	6	51278	51283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123958
1005	NC_004088	TCA	2	6	51289	51294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_004088	TCA	2	6	51309	51314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_004088	ATA	2	6	51318	51323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004088	GAA	2	6	51361	51366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123959
1009	NC_004088	CGA	2	6	51411	51416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123959
1010	NC_004088	TTA	2	6	51488	51493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123959
1011	NC_004088	ATC	2	6	51556	51561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123959
1012	NC_004088	TGG	2	6	51656	51661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123959
1013	NC_004088	CATG	2	8	51699	51706	25 %	25 %	25 %	25 %	22123959
1014	NC_004088	AGA	2	6	51714	51719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123959
1015	NC_004088	ATT	2	6	51751	51756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123959
1016	NC_004088	GGT	2	6	51805	51810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123959
1017	NC_004088	CAA	2	6	51846	51851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123959
1018	NC_004088	CTT	2	6	51915	51920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123959
1019	NC_004088	CAG	2	6	51951	51956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123959
1020	NC_004088	CTC	2	6	52070	52075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123959
1021	NC_004088	CTTAC	2	10	52089	52098	20 %	40 %	0 %	40 %	22123959
1022	NC_004088	ACT	2	6	52130	52135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123959
1023	NC_004088	CCTG	2	8	52199	52206	0 %	25 %	25 %	50 %	22123959
1024	NC_004088	ATT	2	6	52243	52248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123959
1025	NC_004088	GGC	2	6	52261	52266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123959
1026	NC_004088	CGT	2	6	52351	52356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123959
1027	NC_004088	CGC	2	6	52416	52421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123959
1028	NC_004088	TTC	2	6	52423	52428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123959
1029	NC_004088	TCA	2	6	52532	52537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123959
1030	NC_004088	CCA	2	6	52660	52665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123959
1031	NC_004088	CGT	2	6	52681	52686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123959
1032	NC_004088	CGA	2	6	52832	52837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123960
1033	NC_004088	CTT	2	6	52846	52851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123960
1034	NC_004088	GTTT	2	8	52877	52884	0 %	75 %	25 %	0 %	22123960
1035	NC_004088	TCC	2	6	52915	52920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123960
1036	NC_004088	ATG	2	6	53033	53038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123960
1037	NC_004088	CGA	2	6	53199	53204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123960
1038	NC_004088	CCG	2	6	53247	53252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123960
1039	NC_004088	GCTTT	2	10	53416	53425	0 %	60 %	20 %	20 %	22123961
1040	NC_004088	A	6	6	53446	53451	100 %	0 %	0 %	0 %	22123961
1041	NC_004088	GAT	2	6	53454	53459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123961
1042	NC_004088	TGT	2	6	53494	53499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123961
1043	NC_004088	ACT	2	6	53506	53511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123961
1044	NC_004088	CAT	2	6	53534	53539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123961
1045	NC_004088	AC	3	6	53545	53550	50 %	0 %	0 %	50 %	22123961
1046	NC_004088	TGA	2	6	53602	53607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123961
1047	NC_004088	CAGCG	2	10	53631	53640	20 %	0 %	40 %	40 %	22123961
1048	NC_004088	TG	3	6	53699	53704	0 %	50 %	50 %	0 %	22123961
1049	NC_004088	GTT	2	6	53705	53710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123961
1050	NC_004088	CAG	2	6	53741	53746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123961
1051	NC_004088	GCC	2	6	53778	53783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123961
1052	NC_004088	CA	3	6	53858	53863	50 %	0 %	0 %	50 %	22123961
1053	NC_004088	GAT	2	6	53970	53975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123961
1054	NC_004088	CCG	2	6	54087	54092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123961
1055	NC_004088	TC	3	6	54112	54117	0 %	50 %	0 %	50 %	22123961
1056	NC_004088	TC	3	6	54130	54135	0 %	50 %	0 %	50 %	22123961
1057	NC_004088	GCC	2	6	54143	54148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123961
1058	NC_004088	CCA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123961
1059	NC_004088	TAA	2	6	54469	54474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123961
1060	NC_004088	AT	3	6	54478	54483	50 %	50 %	0 %	0 %	22123961
1061	NC_004088	CTT	2	6	54522	54527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123962
1062	NC_004088	GAA	2	6	54558	54563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123962
1063	NC_004088	ACG	2	6	54628	54633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123962
1064	NC_004088	CCA	2	6	54659	54664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_004088	TCTG	2	8	54730	54737	0 %	50 %	25 %	25 %	22123963
1066	NC_004088	TTTGA	2	10	54755	54764	20 %	60 %	20 %	0 %	22123963
1067	NC_004088	GTG	2	6	54776	54781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123963
1068	NC_004088	TGC	2	6	54812	54817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123963
1069	NC_004088	GAA	2	6	54908	54913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123963
1070	NC_004088	CTT	2	6	54922	54927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123963
1071	NC_004088	CTGA	2	8	54929	54936	25 %	25 %	25 %	25 %	22123963
1072	NC_004088	TCA	2	6	54954	54959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123963
1073	NC_004088	ATG	2	6	54960	54965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123963
1074	NC_004088	G	6	6	54973	54978	0 %	0 %	100 %	0 %	22123963
1075	NC_004088	CGT	2	6	54998	55003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123963
1076	NC_004088	CTG	3	9	55051	55059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123963
1077	NC_004088	TGAG	2	8	55180	55187	25 %	25 %	50 %	0 %	22123963
1078	NC_004088	CCG	2	6	55258	55263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123963
1079	NC_004088	TGA	2	6	55302	55307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123963
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1081	NC_004088	TGT	2	6	55377	55382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123963
1082	NC_004088	GCGCT	2	10	55393	55402	0 %	20 %	40 %	40 %	22123963
1083	NC_004088	CAT	2	6	55463	55468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123963
1084	NC_004088	CTC	2	6	55476	55481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123964
1085	NC_004088	GAT	2	6	55509	55514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123964
1086	NC_004088	TCA	2	6	55547	55552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123964
1087	NC_004088	T	6	6	55570	55575	0 %	100 %	0 %	0 %	22123964
1088	NC_004088	CTG	2	6	55600	55605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123964
1089	NC_004088	CAGC	2	8	55675	55682	25 %	0 %	25 %	50 %	22123964
1090	NC_004088	ACCTT	2	10	55793	55802	20 %	40 %	0 %	40 %	22123964
1091	NC_004088	GA	3	6	55836	55841	50 %	0 %	50 %	0 %	22123964
1092	NC_004088	ACA	2	6	55941	55946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123964
1093	NC_004088	CG	3	6	55950	55955	0 %	0 %	50 %	50 %	22123964
1094	NC_004088	CAC	2	6	55959	55964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123964
1095	NC_004088	AAG	2	6	55967	55972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123964
1096	NC_004088	GTC	2	6	56124	56129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123964
1097	NC_004088	CGAAC	2	10	56142	56151	40 %	0 %	20 %	40 %	22123964
1098	NC_004088	GCTCCT	2	12	56157	56168	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22123964
1099	NC_004088	GA	4	8	56177	56184	50 %	0 %	50 %	0 %	22123964
1100	NC_004088	GAAT	2	8	56187	56194	50 %	25 %	25 %	0 %	22123964
1101	NC_004088	GCGA	2	8	56242	56249	25 %	0 %	50 %	25 %	22123964
1102	NC_004088	CAG	2	6	56334	56339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123964
1103	NC_004088	GGC	2	6	56357	56362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123964
1104	NC_004088	CGTT	2	8	56566	56573	0 %	50 %	25 %	25 %	22123965
1105	NC_004088	TG	3	6	56698	56703	0 %	50 %	50 %	0 %	22123965
1106	NC_004088	GTAA	2	8	56978	56985	50 %	25 %	25 %	0 %	22123965
1107	NC_004088	GGA	2	6	57080	57085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004088	TATT	3	12	57086	57097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004088	CAAC	2	8	57132	57139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_004088	CTT	2	6	57198	57203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123966
1111	NC_004088	TGT	2	6	57245	57250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123966
1112	NC_004088	CAG	2	6	57297	57302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123966
1113	NC_004088	GT	3	6	57324	57329	0 %	50 %	50 %	0 %	22123966
1114	NC_004088	CTG	2	6	57388	57393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123966
1115	NC_004088	TCA	2	6	57479	57484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_004088	CTG	2	6	57525	57530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004088	TACT	2	8	57535	57542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_004088	TA	3	6	57547	57552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004088	ACG	2	6	57561	57566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004088	TGA	2	6	57616	57621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004088	CGA	2	6	57665	57670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_004088	TGTA	2	8	57710	57717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004088	A	6	6	57854	57859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004088	TCTG	2	8	58040	58047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_004088	ATT	2	6	58054	58059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004088	T	6	6	58132	58137	0 %	100 %	0 %	0 %	22123967
1127	NC_004088	TGC	2	6	58152	58157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123967
1128	NC_004088	ATTT	2	8	58231	58238	25 %	75 %	0 %	0 %	22123967
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1130	NC_004088	TCG	2	6	58400	58405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123967
1131	NC_004088	GCA	2	6	58436	58441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123967
1132	NC_004088	TCT	2	6	58466	58471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123967
1133	NC_004088	ACTG	2	8	58560	58567	25 %	25 %	25 %	25 %	22123967
1134	NC_004088	ATG	2	6	58568	58573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123967
1135	NC_004088	C	6	6	58601	58606	0 %	0 %	0 %	100 %	22123967
1136	NC_004088	TGG	2	6	58740	58745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123967
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1138	NC_004088	TTG	2	6	58798	58803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123967
1139	NC_004088	GCC	2	6	58832	58837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123967
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1141	NC_004088	GAA	2	6	58870	58875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123967
1142	NC_004088	ATAA	2	8	58905	58912	75 %	25 %	0 %	0 %	22123967
1143	NC_004088	GCA	2	6	58954	58959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_004088	CAA	2	6	58966	58971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_004088	TTA	2	6	59080	59085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123968
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1153	NC_004088	TGG	2	6	59491	59496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123968
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1232	NC_004088	GGC	2	6	63352	63357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123971
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1254	NC_004088	ATT	3	9	64402	64410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_004088	GGA	2	6	64431	64436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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