MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004088	AGT	2	6	521358	521363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124383
10002	NC_004088	AATACT	2	12	521389	521400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22124384
10003	NC_004088	CTT	2	6	521436	521441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124384
10004	NC_004088	TAA	2	6	521590	521595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124384
10005	NC_004088	TTA	2	6	521802	521807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124384
10006	NC_004088	AAG	2	6	521841	521846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124384
10007	NC_004088	A	8	8	521949	521956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_004088	T	6	6	521970	521975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_004088	AAC	2	6	522033	522038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_004088	AC	3	6	522042	522047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_004088	GAAA	2	8	522086	522093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_004088	TAT	2	6	522128	522133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_004088	CGC	2	6	522159	522164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_004088	AACG	2	8	522178	522185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_004088	TG	3	6	522211	522216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_004088	GGCA	2	8	522249	522256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10017	NC_004088	ATA	2	6	522260	522265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_004088	GCT	2	6	522349	522354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_004088	CAAA	2	8	522380	522387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10020	NC_004088	GGC	2	6	522429	522434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_004088	AGT	2	6	522469	522474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_004088	TAC	2	6	522476	522481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_004088	GCG	2	6	522493	522498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_004088	ACT	2	6	522543	522548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_004088	TAG	2	6	522640	522645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_004088	CGA	2	6	522668	522673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_004088	GCA	2	6	522742	522747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_004088	GT	3	6	522795	522800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_004088	GAA	2	6	522801	522806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_004088	GAG	2	6	522835	522840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_004088	AGA	2	6	522884	522889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_004088	CAG	2	6	522910	522915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_004088	G	6	6	523057	523062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_004088	GGA	2	6	523101	523106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_004088	GGC	2	6	523121	523126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_004088	GAA	2	6	523364	523369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_004088	TGC	2	6	523440	523445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_004088	GTC	2	6	523452	523457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_004088	TTG	2	6	523513	523518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_004088	TGG	2	6	523530	523535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_004088	GGA	2	6	523566	523571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_004088	TCA	2	6	523591	523596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_004088	AC	3	6	523617	523622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_004088	AC	3	6	523786	523791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_004088	GTAG	2	8	523827	523834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_004088	CCT	2	6	523927	523932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_004088	CA	3	6	523961	523966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_004088	TTG	2	6	524032	524037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_004088	GGT	2	6	524051	524056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004088	GGT	2	6	524086	524091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_004088	CCA	2	6	524108	524113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_004088	GCA	2	6	524136	524141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_004088	GCCT	2	8	524190	524197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_004088	AGG	2	6	524205	524210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_004088	CCA	2	6	524235	524240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_004088	GT	3	6	524281	524286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_004088	CCG	2	6	524354	524359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_004088	TC	3	6	524396	524401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_004088	AAT	2	6	524403	524408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_004088	CGA	2	6	524564	524569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_004088	GCG	2	6	524703	524708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_004088	GAG	2	6	524719	524724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_004088	TG	3	6	524744	524749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_004088	G	6	6	524864	524869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_004088	TCC	2	6	524874	524879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_004088	CTGA	2	8	524894	524901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_004088	GTAC	2	8	524978	524985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_004088	GTG	2	6	525005	525010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_004088	GGA	2	6	525182	525187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_004088	GAA	2	6	525380	525385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_004088	AC	3	6	525400	525405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_004088	CGTC	2	8	525418	525425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_004088	AAC	2	6	525437	525442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_004088	AGC	2	6	525527	525532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_004088	CAT	2	6	525533	525538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_004088	AAAG	2	8	525541	525548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_004088	GTT	2	6	525636	525641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_004088	G	6	6	525878	525883	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_004088	AGGCT	2	10	525891	525900	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10080	NC_004088	TGA	2	6	525980	525985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_004088	CAC	2	6	525991	525996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_004088	GGT	2	6	526079	526084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_004088	GA	3	6	526109	526114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_004088	GCTG	2	8	526222	526229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_004088	TAA	2	6	526238	526243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_004088	CGG	2	6	526363	526368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_004088	ATG	2	6	526439	526444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_004088	ACC	2	6	526634	526639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_004088	TGG	2	6	526694	526699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_004088	GGA	2	6	526737	526742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_004088	AGCT	2	8	526797	526804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_004088	GGT	2	6	526857	526862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_004088	CGG	2	6	526944	526949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10096	NC_004088	CGT	2	6	527052	527057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_004088	GCT	2	6	527106	527111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_004088	GT	3	6	527305	527310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_004088	ACA	2	6	527366	527371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_004088	GA	4	8	527390	527397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_004088	CGT	2	6	527405	527410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_004088	GGC	2	6	527478	527483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_004088	GGT	2	6	527492	527497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_004088	T	6	6	527628	527633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_004088	TG	3	6	527636	527641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_004088	A	6	6	527737	527742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_004088	GAC	2	6	527813	527818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_004088	GTA	2	6	527887	527892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_004088	CTT	2	6	527899	527904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004088	TGA	2	6	527931	527936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_004088	TAG	2	6	527943	527948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_004088	ACT	2	6	527956	527961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_004088	ATT	2	6	527967	527972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_004088	A	6	6	527983	527988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_004088	TAATG	2	10	528047	528056	40 %	40 %	20 %	0 %	22124385
10117	NC_004088	CT	3	6	528071	528076	0 %	50 %	0 %	50 %	22124385
10118	NC_004088	GCAA	2	8	528111	528118	50 %	0 %	25 %	25 %	22124385
10119	NC_004088	TTAT	2	8	528219	528226	25 %	75 %	0 %	0 %	22124385
10120	NC_004088	TGC	2	6	528290	528295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124385
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10124	NC_004088	CTGT	2	8	528688	528695	0 %	50 %	25 %	25 %	22124385
10125	NC_004088	GCG	2	6	528701	528706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124385
10126	NC_004088	TTC	2	6	528750	528755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124385
10127	NC_004088	GTA	2	6	528765	528770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124385
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10129	NC_004088	GAG	2	6	528786	528791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124385
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10131	NC_004088	GCA	2	6	528852	528857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124385
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10239	NC_004088	TGA	2	6	534517	534522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10241	NC_004088	TTTC	2	8	534658	534665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10242	NC_004088	AGCA	2	8	534680	534687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10243	NC_004088	ACC	2	6	534710	534715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10244	NC_004088	CTG	2	6	534827	534832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124392
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10251	NC_004088	CTG	2	6	535102	535107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124392
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10255	NC_004088	CGA	2	6	535236	535241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124392
10256	NC_004088	GAA	2	6	535462	535467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124392
10257	NC_004088	TAT	2	6	535482	535487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124392
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10259	NC_004088	GCT	2	6	535533	535538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124392
10260	NC_004088	CTG	2	6	535573	535578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124392
10261	NC_004088	CA	3	6	535643	535648	50 %	0 %	0 %	50 %	22124392
10262	NC_004088	GGC	2	6	535690	535695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124392
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10265	NC_004088	GAT	2	6	535849	535854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124392
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10269	NC_004088	GTG	2	6	536077	536082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10270	NC_004088	AG	3	6	536089	536094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_004088	TTTGC	2	10	536119	536128	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10272	NC_004088	GTT	2	6	536142	536147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10276	NC_004088	GTA	2	6	536321	536326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484891
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10378	NC_004088	TCTG	2	8	541888	541895	0 %	50 %	25 %	25 %	22124399
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10406	NC_004088	AGAA	2	8	543648	543655	75 %	0 %	25 %	0 %	22124399
10407	NC_004088	TACATG	2	12	543758	543769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22124399
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10410	NC_004088	CAG	2	6	543839	543844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124399
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10484	NC_004088	CGA	2	6	547185	547190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124400
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10486	NC_004088	GCG	2	6	547268	547273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124400
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10488	NC_004088	TTCGC	2	10	547334	547343	0 %	40 %	20 %	40 %	22124400
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10491	NC_004088	TCT	2	6	547399	547404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124400
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10495	NC_004088	CGT	2	6	547747	547752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124400
10496	NC_004088	GAT	2	6	547794	547799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124400
10497	NC_004088	TCTGCG	2	12	547890	547901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124400
10498	NC_004088	TCGT	2	8	547997	548004	0 %	50 %	25 %	25 %	22124400
10499	NC_004088	TGC	2	6	548009	548014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124400
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