MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004088	GGC	2	6	260539	260544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124164
5002	NC_004088	AC	3	6	260586	260591	50 %	0 %	0 %	50 %	22124164
5003	NC_004088	CG	3	6	260650	260655	0 %	0 %	50 %	50 %	22124164
5004	NC_004088	GGTA	2	8	260695	260702	25 %	25 %	50 %	0 %	22124164
5005	NC_004088	ATT	2	6	260745	260750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124165
5006	NC_004088	GAT	2	6	260771	260776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5007	NC_004088	GAT	2	6	260831	260836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5008	NC_004088	GAT	2	6	260846	260851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5009	NC_004088	GAT	2	6	260861	260866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5010	NC_004088	TGG	2	6	260878	260883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124165
5011	NC_004088	GGCT	2	8	260902	260909	0 %	25 %	50 %	25 %	22124165
5012	NC_004088	GCA	2	6	260987	260992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5013	NC_004088	G	6	6	261025	261030	0 %	0 %	100 %	0 %	22124165
5014	NC_004088	GAT	2	6	261033	261038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5015	NC_004088	CTG	2	6	261154	261159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5016	NC_004088	CAA	2	6	261262	261267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124165
5017	NC_004088	GGC	2	6	261268	261273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124165
5018	NC_004088	TAG	2	6	261278	261283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124165
5019	NC_004088	CAG	2	6	261339	261344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5020	NC_004088	TG	3	6	261414	261419	0 %	50 %	50 %	0 %	22124165
5021	NC_004088	TTCAG	2	10	261455	261464	20 %	40 %	20 %	20 %	22124165
5022	NC_004088	CGG	2	6	261520	261525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124165
5023	NC_004088	CAG	2	6	261541	261546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5024	NC_004088	CAG	2	6	261555	261560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5025	NC_004088	G	6	6	261574	261579	0 %	0 %	100 %	0 %	22124165
5026	NC_004088	TAA	2	6	261804	261809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124165
5027	NC_004088	CGA	2	6	261857	261862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124165
5028	NC_004088	AAG	2	6	261863	261868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124165
5029	NC_004088	TTA	2	6	261894	261899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124166
5030	NC_004088	CTT	2	6	261989	261994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124166
5031	NC_004088	ACC	2	6	262045	262050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124166
5032	NC_004088	CGA	2	6	262061	262066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124166
5033	NC_004088	GCA	2	6	262076	262081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124166
5034	NC_004088	ACC	2	6	262174	262179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124166
5035	NC_004088	CT	3	6	262195	262200	0 %	50 %	0 %	50 %	22124166
5036	NC_004088	CAA	2	6	262295	262300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124166
5037	NC_004088	GCA	2	6	262334	262339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124166
5038	NC_004088	ATC	2	6	262341	262346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124166
5039	NC_004088	CTG	2	6	262389	262394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124166
5040	NC_004088	AAC	2	6	262542	262547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_004088	TTTTGA	2	12	262573	262584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_004088	GAT	2	6	262593	262598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_004088	TCG	2	6	262622	262627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_004088	GGCAG	2	10	262692	262701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_004088	TACA	2	8	262845	262852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_004088	ACAT	2	8	262872	262879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_004088	TACA	2	8	262885	262892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_004088	TGAT	2	8	262950	262957	25 %	50 %	25 %	0 %	22124167
5049	NC_004088	GCC	2	6	263072	263077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124167
5050	NC_004088	CAA	2	6	263142	263147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124167
5051	NC_004088	ACC	2	6	263174	263179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124167
5052	NC_004088	GA	3	6	263200	263205	50 %	0 %	50 %	0 %	22124167
5053	NC_004088	AAG	2	6	263214	263219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124167
5054	NC_004088	CGA	2	6	263224	263229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124167
5055	NC_004088	CCA	2	6	263240	263245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124167
5056	NC_004088	TGGG	2	8	263262	263269	0 %	25 %	75 %	0 %	22124167
5057	NC_004088	AAG	2	6	263298	263303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124167
5058	NC_004088	TTA	2	6	263361	263366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124167
5059	NC_004088	ATTG	2	8	263417	263424	25 %	50 %	25 %	0 %	22124167
5060	NC_004088	GCA	2	6	263462	263467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124167
5061	NC_004088	AGA	2	6	263473	263478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124167
5062	NC_004088	AGA	2	6	263550	263555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124167
5063	NC_004088	TGGT	2	8	263586	263593	0 %	50 %	50 %	0 %	22124167
5064	NC_004088	TTA	2	6	263644	263649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124167
5065	NC_004088	CCG	2	6	263661	263666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_004088	CTG	2	6	263711	263716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_004088	AACA	2	8	263731	263738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_004088	AACA	2	8	263755	263762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_004088	AACA	2	8	263778	263785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_004088	TGA	2	6	263805	263810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124168
5071	NC_004088	TATT	2	8	263814	263821	25 %	75 %	0 %	0 %	22124168
5072	NC_004088	TGA	2	6	263847	263852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124168
5073	NC_004088	ACCG	2	8	263855	263862	25 %	0 %	25 %	50 %	22124168
5074	NC_004088	CTGG	2	8	263870	263877	0 %	25 %	50 %	25 %	22124168
5075	NC_004088	GTC	2	6	263981	263986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124168
5076	NC_004088	TGA	2	6	263989	263994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124168
5077	NC_004088	GAA	2	6	264029	264034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124168
5078	NC_004088	TAAAGA	2	12	264097	264108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22124168
5079	NC_004088	TGG	2	6	264165	264170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124168
5080	NC_004088	CAAA	2	8	264190	264197	75 %	0 %	0 %	25 %	22124168
5081	NC_004088	CA	3	6	264211	264216	50 %	0 %	0 %	50 %	22124168
5082	NC_004088	GATT	2	8	264334	264341	25 %	50 %	25 %	0 %	22124168
5083	NC_004088	GCA	2	6	264402	264407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124168
5084	NC_004088	GA	3	6	264411	264416	50 %	0 %	50 %	0 %	22124168
5085	NC_004088	TGA	2	6	264456	264461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124168
5086	NC_004088	AC	3	6	264501	264506	50 %	0 %	0 %	50 %	22124168
5087	NC_004088	C	7	7	264514	264520	0 %	0 %	0 %	100 %	22124168
5088	NC_004088	CAT	2	6	264523	264528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124168
5089	NC_004088	GTC	2	6	264533	264538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124168
5090	NC_004088	GCTGT	2	10	264614	264623	0 %	40 %	40 %	20 %	22124168
5091	NC_004088	CGG	2	6	264636	264641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124168
5092	NC_004088	AAT	2	6	264738	264743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124169
5093	NC_004088	GCC	2	6	264775	264780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124169
5094	NC_004088	CGC	2	6	264842	264847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124169
5095	NC_004088	GAA	2	6	264934	264939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124169
5096	NC_004088	CCA	2	6	265065	265070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124169
5097	NC_004088	GTT	2	6	265078	265083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124169
5098	NC_004088	CGT	2	6	265221	265226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124169
5099	NC_004088	G	6	6	265245	265250	0 %	0 %	100 %	0 %	22124169
5100	NC_004088	TTG	2	6	265252	265257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_004088	AC	3	6	265322	265327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_004088	TGC	2	6	265355	265360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_004088	TC	3	6	265364	265369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_004088	CGTG	2	8	265380	265387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_004088	GGC	2	6	265442	265447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124170
5106	NC_004088	CCAGC	2	10	265520	265529	20 %	0 %	20 %	60 %	22124170
5107	NC_004088	TAA	2	6	265560	265565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124170
5108	NC_004088	ACG	2	6	265566	265571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124170
5109	NC_004088	AAT	2	6	265633	265638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124170
5110	NC_004088	TCA	2	6	265696	265701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124170
5111	NC_004088	CAG	2	6	265791	265796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124170
5112	NC_004088	GTT	2	6	265925	265930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124170
5113	NC_004088	TTG	2	6	265957	265962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124170
5114	NC_004088	ATT	2	6	266082	266087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124170
5115	NC_004088	A	6	6	266120	266125	100 %	0 %	0 %	0 %	22124170
5116	NC_004088	CGCA	2	8	266190	266197	25 %	0 %	25 %	50 %	22124170
5117	NC_004088	CGTT	2	8	266262	266269	0 %	50 %	25 %	25 %	22124170
5118	NC_004088	T	7	7	266275	266281	0 %	100 %	0 %	0 %	22124170
5119	NC_004088	TGA	2	6	266302	266307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124170
5120	NC_004088	AAG	2	6	266347	266352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124170
5121	NC_004088	TCA	2	6	266371	266376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_004088	TGA	2	6	266380	266385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_004088	GGAT	2	8	266499	266506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_004088	ATTA	2	8	266551	266558	50 %	50 %	0 %	0 %	22124171
5125	NC_004088	TAC	2	6	266586	266591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124171
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5372	NC_004088	ATC	3	9	278453	278461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124184
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5374	NC_004088	A	7	7	278473	278479	100 %	0 %	0 %	0 %	22124184
5375	NC_004088	TCCC	2	8	278482	278489	0 %	25 %	0 %	75 %	22124184
5376	NC_004088	TAT	2	6	278507	278512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124184
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5378	NC_004088	TCATT	2	10	278539	278548	20 %	60 %	0 %	20 %	22124184
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5385	NC_004088	TGT	2	6	278967	278972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124185
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5388	NC_004088	GATC	2	8	279203	279210	25 %	25 %	25 %	25 %	22124185
5389	NC_004088	C	7	7	279249	279255	0 %	0 %	0 %	100 %	22124185
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5480	NC_004088	TGT	2	6	284219	284224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124188
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5486	NC_004088	GGT	2	6	284510	284515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124188
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5496	NC_004088	GAT	2	6	285069	285074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124188
5497	NC_004088	TGA	2	6	285166	285171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124188
5498	NC_004088	TGC	2	6	285215	285220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124188
5499	NC_004088	CCG	2	6	285272	285277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188
5500	NC_004088	CCG	2	6	285287	285292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188

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