MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 91659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003143	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003143	TTA	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003143	TTA	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003143	ATT	2	6	69	74	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003143	AGG	2	6	97	102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003143	TGT	2	6	109	114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003143	GTT	2	6	191	196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003143	TTCG	2	8	246	253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003143	CG	3	6	252	257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003143	CTG	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927222
11	NC_003143	TTG	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927222
12	NC_003143	AACC	2	8	444	451	50 %	0 %	0 %	50 %	218927222
13	NC_003143	TGT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927222
14	NC_003143	TAA	2	6	502	507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927222
15	NC_003143	CTT	2	6	627	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927222
16	NC_003143	TCA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927223
17	NC_003143	TTG	2	6	886	891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927223
18	NC_003143	CTG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
19	NC_003143	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927223
20	NC_003143	GTG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927223
21	NC_003143	CTT	2	6	980	985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927223
22	NC_003143	T	6	6	999	1004	0 %	100 %	0 %	0 %	218927223
23	NC_003143	AGC	2	6	1052	1057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927223
24	NC_003143	CGT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
25	NC_003143	GTT	2	6	1073	1078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927223
26	NC_003143	GTGC	2	8	1195	1202	0 %	25 %	50 %	25 %	218927223
27	NC_003143	TGC	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
28	NC_003143	T	7	7	1276	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003143	ATT	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003143	A	6	6	1438	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	218927224
31	NC_003143	ACA	3	9	1458	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
32	NC_003143	CAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
33	NC_003143	CATT	2	8	1645	1652	25 %	50 %	0 %	25 %	218927224
34	NC_003143	ATTC	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	218927224
35	NC_003143	GCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927224
36	NC_003143	TGG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927224
37	NC_003143	ATG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927224
38	NC_003143	ATG	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927224
39	NC_003143	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927224
40	NC_003143	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927224
41	NC_003143	ATCA	2	8	2270	2277	50 %	25 %	0 %	25 %	218927224
42	NC_003143	TGC	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927224
43	NC_003143	ACA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
44	NC_003143	CTG	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927224
45	NC_003143	GGC	2	6	2506	2511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_003143	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
47	NC_003143	TGG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927225
48	NC_003143	CTG	3	9	2658	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927225
49	NC_003143	TTTA	2	8	2763	2770	25 %	75 %	0 %	0 %	218927225
50	NC_003143	GCC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218927225
51	NC_003143	ACC	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
52	NC_003143	GTTG	2	8	2816	2823	0 %	50 %	50 %	0 %	218927225
53	NC_003143	ATT	2	6	2875	2880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927225
54	NC_003143	ATG	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
55	NC_003143	GCG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
56	NC_003143	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927225
57	NC_003143	T	6	6	3068	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	218927225
58	NC_003143	GCG	2	6	3126	3131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
59	NC_003143	ACTC	2	8	3149	3156	25 %	25 %	0 %	50 %	218927225
60	NC_003143	AAT	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927225
61	NC_003143	TGA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
62	NC_003143	CCT	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218927225
63	NC_003143	CTGG	2	8	3242	3249	0 %	25 %	50 %	25 %	218927225
64	NC_003143	GCA	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927225
65	NC_003143	TGG	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927225
66	NC_003143	CAC	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
67	NC_003143	AAC	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927225
68	NC_003143	TGA	3	9	3541	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
69	NC_003143	T	6	6	3628	3633	0 %	100 %	0 %	0 %	218927225
70	NC_003143	TCC	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218927225
71	NC_003143	ATTC	2	8	3773	3780	25 %	50 %	0 %	25 %	218927225
72	NC_003143	GTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927225
73	NC_003143	A	8	8	3885	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	218927225
74	NC_003143	TGC	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927225
75	NC_003143	ACC	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
76	NC_003143	CAG	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927225
77	NC_003143	TGT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
78	NC_003143	GTT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
79	NC_003143	TTG	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
80	NC_003143	TTG	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
81	NC_003143	CCA	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927226
82	NC_003143	GCCA	2	8	4114	4121	25 %	0 %	25 %	50 %	218927226
83	NC_003143	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
84	NC_003143	TAAA	2	8	4133	4140	75 %	25 %	0 %	0 %	218927226
85	NC_003143	GTT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
86	NC_003143	CAG	3	9	4206	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927226
87	NC_003143	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
88	NC_003143	TGGC	2	8	4263	4270	0 %	25 %	50 %	25 %	218927226
89	NC_003143	ATC	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
90	NC_003143	GAT	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
91	NC_003143	CTGT	2	8	4471	4478	0 %	50 %	25 %	25 %	218927226
92	NC_003143	AGTG	2	8	4539	4546	25 %	25 %	50 %	0 %	218927226
93	NC_003143	TGG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
94	NC_003143	TGC	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
95	NC_003143	TAA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927226
96	NC_003143	CAA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927226
97	NC_003143	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
98	NC_003143	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927226
99	NC_003143	GTA	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
100	NC_003143	CTT	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
101	NC_003143	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927226
102	NC_003143	TCAA	2	8	4891	4898	50 %	25 %	0 %	25 %	218927226
103	NC_003143	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
104	NC_003143	TTC	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
105	NC_003143	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
106	NC_003143	CAG	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927226
107	NC_003143	GCT	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
108	NC_003143	CTT	3	9	5267	5275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
109	NC_003143	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
110	NC_003143	GCG	2	6	5376	5381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927226
111	NC_003143	GGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218927226
112	NC_003143	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
113	NC_003143	TTCT	2	8	5519	5526	0 %	75 %	0 %	25 %	218927226
114	NC_003143	GAT	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
115	NC_003143	TGA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003143	TTG	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003143	ATC	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_003143	ATT	2	6	5660	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003143	AAT	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003143	TCT	2	6	5771	5776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003143	GA	3	6	5918	5923	50 %	0 %	50 %	0 %	218927227
122	NC_003143	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
123	NC_003143	GTC	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927227
124	NC_003143	AGG	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218927227
125	NC_003143	TGG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
126	NC_003143	TGG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
127	NC_003143	CTT	2	6	6155	6160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927227
128	NC_003143	CGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218927227
129	NC_003143	TAT	2	6	6383	6388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
130	NC_003143	T	6	6	6438	6443	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
131	NC_003143	T	6	6	6465	6470	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
132	NC_003143	CGT	2	6	6580	6585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927227
133	NC_003143	ATT	2	6	6595	6600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
134	NC_003143	TTA	2	6	6615	6620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
135	NC_003143	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927227
136	NC_003143	ACC	2	6	6785	6790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927227
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159	NC_003143	CAT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_003143	TAT	2	6	12001	12006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_003143	TAC	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_003143	TAG	2	6	12513	12518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_003143	CGA	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_003143	GCA	2	6	12615	12620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_003143	CAG	2	6	12783	12788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_003143	G	6	6	12930	12935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
271	NC_003143	GGA	2	6	12974	12979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_003143	GGC	2	6	12994	12999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_003143	GAA	2	6	13237	13242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_003143	TGC	2	6	13313	13318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_003143	GTC	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_003143	TTG	2	6	13386	13391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_003143	TGG	2	6	13403	13408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_003143	GGA	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_003143	TCA	2	6	13464	13469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_003143	AC	3	6	13490	13495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_003143	AC	3	6	13659	13664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_003143	GTAG	2	8	13700	13707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003143	CCT	2	6	13800	13805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_003143	CA	3	6	13834	13839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
285	NC_003143	TGA	2	6	13847	13852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_003143	TC	3	6	14209	14214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_003143	AAT	2	6	14216	14221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_003143	CGA	2	6	14377	14382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_003143	G	6	6	14677	14682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
294	NC_003143	TCC	2	6	14687	14692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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296	NC_003143	GTAC	2	8	14791	14798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
297	NC_003143	GTG	2	6	14818	14823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_003143	GGA	2	6	14995	15000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_003143	CGTC	2	8	15231	15238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
302	NC_003143	AAC	2	6	15250	15255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_003143	AGC	2	6	15340	15345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_003143	CAT	2	6	15346	15351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_003143	AAAG	2	8	15354	15361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_003143	G	6	6	15691	15696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_003143	GCTG	2	8	16035	16042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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401	NC_003143	GAA	2	6	22112	22117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927237
402	NC_003143	A	6	6	22116	22121	100 %	0 %	0 %	0 %	218927237
403	NC_003143	AGA	2	6	22149	22154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927237
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422	NC_003143	CAT	2	6	22699	22704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_003143	GAA	2	6	22910	22915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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