MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 1819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003134	CGT	2	6	80766	80771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082872
1502	NC_003134	GTT	2	6	81001	81006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_003134	GGTT	2	8	81066	81073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_003134	CATTC	2	10	81078	81087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1505	NC_003134	CAT	2	6	81088	81093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_003134	CAGC	2	8	81102	81109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_003134	GCG	2	6	81169	81174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_003134	GGCT	2	8	81184	81191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_003134	T	6	6	81224	81229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003134	AAT	2	6	81329	81334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082873
1511	NC_003134	ATT	2	6	81382	81387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082873
1512	NC_003134	TCA	2	6	81422	81427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082873
1513	NC_003134	CAAT	2	8	81452	81459	50 %	25 %	0 %	25 %	16082873
1514	NC_003134	AT	3	6	81541	81546	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
1515	NC_003134	TGA	2	6	81557	81562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082873
1516	NC_003134	GAA	2	6	81586	81591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082873
1517	NC_003134	A	6	6	81590	81595	100 %	0 %	0 %	0 %	16082873
1518	NC_003134	AAC	2	6	81658	81663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082873
1519	NC_003134	AAT	2	6	81673	81678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082873
1520	NC_003134	TTC	2	6	81734	81739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082873
1521	NC_003134	TC	3	6	81832	81837	0 %	50 %	0 %	50 %	16082873
1522	NC_003134	CAA	2	6	81892	81897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082873
1523	NC_003134	ATC	2	6	81920	81925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082873
1524	NC_003134	A	6	6	81993	81998	100 %	0 %	0 %	0 %	16082873
1525	NC_003134	TAT	2	6	82015	82020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082873
1526	NC_003134	GCA	2	6	82046	82051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082873
1527	NC_003134	CTA	2	6	82055	82060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082873
1528	NC_003134	AT	3	6	82076	82081	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
1529	NC_003134	CTG	2	6	82133	82138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082873
1530	NC_003134	TCT	2	6	82193	82198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082873
1531	NC_003134	AT	3	6	82199	82204	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
1532	NC_003134	AAT	2	6	82207	82212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082873
1533	NC_003134	ATA	2	6	82259	82264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_003134	CAA	2	6	82374	82379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_003134	TG	3	6	82409	82414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_003134	TAAA	2	8	82421	82428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_003134	TCG	2	6	82499	82504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_003134	ATG	2	6	82512	82517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_003134	AGG	2	6	82553	82558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_003134	ATT	2	6	82597	82602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082874
1541	NC_003134	TGC	2	6	82623	82628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082874
1542	NC_003134	GCAA	2	8	82657	82664	50 %	0 %	25 %	25 %	16082874
1543	NC_003134	TGC	2	6	82713	82718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082874
1544	NC_003134	ACG	2	6	82781	82786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082874
1545	NC_003134	AAAGAA	2	12	82792	82803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16082874
1546	NC_003134	CAA	2	6	82855	82860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082874
1547	NC_003134	AG	3	6	82908	82913	50 %	0 %	50 %	0 %	16082874
1548	NC_003134	CCA	2	6	82942	82947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082874
1549	NC_003134	AT	3	6	82958	82963	50 %	50 %	0 %	0 %	16082874
1550	NC_003134	TGA	2	6	82968	82973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082874
1551	NC_003134	TAA	2	6	83037	83042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082874
1552	NC_003134	GAAT	2	8	83067	83074	50 %	25 %	25 %	0 %	16082874
1553	NC_003134	G	6	6	83125	83130	0 %	0 %	100 %	0 %	16082874
1554	NC_003134	AAT	2	6	83286	83291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082874
1555	NC_003134	AGGG	2	8	83300	83307	25 %	0 %	75 %	0 %	16082874
1556	NC_003134	ATG	3	9	83340	83348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082874
1557	NC_003134	AAT	2	6	83364	83369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1558	NC_003134	TG	3	6	83390	83395	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
1559	NC_003134	TTG	2	6	83421	83426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082875
1560	NC_003134	CTA	2	6	83450	83455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082875
1561	NC_003134	GA	3	6	83474	83479	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
1562	NC_003134	ATT	2	6	83525	83530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082875
1563	NC_003134	CTT	2	6	83611	83616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082875
1564	NC_003134	ATC	2	6	83628	83633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082875
1565	NC_003134	TAA	2	6	83681	83686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1566	NC_003134	TTA	2	6	83713	83718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082875
1567	NC_003134	TTTTA	2	10	83743	83752	20 %	80 %	0 %	0 %	16082875
1568	NC_003134	CAG	2	6	83755	83760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082875
1569	NC_003134	CCA	2	6	83779	83784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082875
1570	NC_003134	AGG	2	6	83898	83903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082875
1571	NC_003134	TTA	2	6	83919	83924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082875
1572	NC_003134	TGG	2	6	83983	83988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082875
1573	NC_003134	ACA	2	6	83991	83996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082875
1574	NC_003134	CGAG	2	8	84024	84031	25 %	0 %	50 %	25 %	16082875
1575	NC_003134	TTA	2	6	84147	84152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082875
1576	NC_003134	GTT	2	6	84172	84177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082875
1577	NC_003134	GTAA	2	8	84232	84239	50 %	25 %	25 %	0 %	16082875
1578	NC_003134	TGGG	2	8	84284	84291	0 %	25 %	75 %	0 %	16082875
1579	NC_003134	G	6	6	84289	84294	0 %	0 %	100 %	0 %	16082875
1580	NC_003134	GTG	2	6	84296	84301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082875
1581	NC_003134	TCA	2	6	84311	84316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082875
1582	NC_003134	AC	3	6	84362	84367	50 %	0 %	0 %	50 %	16082875
1583	NC_003134	CAG	2	6	84368	84373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082875
1584	NC_003134	ATG	2	6	84406	84411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082875
1585	NC_003134	G	6	6	84411	84416	0 %	0 %	100 %	0 %	16082875
1586	NC_003134	TGG	2	6	84507	84512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082875
1587	NC_003134	A	8	8	84626	84633	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1588	NC_003134	ATA	2	6	84662	84667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1589	NC_003134	CAATT	2	10	84820	84829	40 %	40 %	0 %	20 %	16082875
1590	NC_003134	A	6	6	84879	84884	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1591	NC_003134	CTT	2	6	84911	84916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082875
1592	NC_003134	T	7	7	84936	84942	0 %	100 %	0 %	0 %	16082875
1593	NC_003134	A	6	6	85004	85009	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1594	NC_003134	TAT	2	6	85019	85024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082875
1595	NC_003134	TAA	2	6	85065	85070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1596	NC_003134	AGGT	2	8	85127	85134	25 %	25 %	50 %	0 %	16082875
1597	NC_003134	GT	3	6	85133	85138	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
1598	NC_003134	TGAATT	2	12	85223	85234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082875
1599	NC_003134	TAA	2	6	85322	85327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1600	NC_003134	A	6	6	85352	85357	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1601	NC_003134	AG	3	6	85477	85482	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
1602	NC_003134	ATG	2	6	85517	85522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082875
1603	NC_003134	ATA	2	6	85535	85540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1604	NC_003134	GTA	2	6	85570	85575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082875
1605	NC_003134	TGG	2	6	85599	85604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082875
1606	NC_003134	ATC	2	6	85680	85685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082875
1607	NC_003134	ATA	2	6	85706	85711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082875
1608	NC_003134	A	6	6	85738	85743	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1609	NC_003134	GA	3	6	85767	85772	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
1610	NC_003134	ATCA	2	8	85778	85785	50 %	25 %	0 %	25 %	16082875
1611	NC_003134	A	6	6	85811	85816	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
1612	NC_003134	CT	3	6	85902	85907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_003134	TGGAT	2	10	85921	85930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_003134	AT	3	6	85946	85951	50 %	50 %	0 %	0 %	16082876
1615	NC_003134	A	7	7	85953	85959	100 %	0 %	0 %	0 %	16082876
1616	NC_003134	ATT	2	6	85982	85987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082876
1617	NC_003134	CAC	2	6	86030	86035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082876
1618	NC_003134	TTG	2	6	86050	86055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082876
1619	NC_003134	AAGG	2	8	86082	86089	50 %	0 %	50 %	0 %	16082876
1620	NC_003134	CAATTA	2	12	86095	86106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16082876
1621	NC_003134	TTG	2	6	86137	86142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082876
1622	NC_003134	GGC	2	6	86157	86162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082876
1623	NC_003134	ACC	2	6	86254	86259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082876
1624	NC_003134	TC	3	6	86305	86310	0 %	50 %	0 %	50 %	16082876
1625	NC_003134	CGT	2	6	86345	86350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082876
1626	NC_003134	GCA	2	6	86412	86417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082876
1627	NC_003134	GTAACC	2	12	86436	86447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082876
1628	NC_003134	AAT	2	6	86458	86463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082876
1629	NC_003134	ATA	2	6	86472	86477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_003134	TAT	2	6	86491	86496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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