MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 1425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003131	ACC	2	6	23317	23322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082721
502	NC_003131	GAGC	2	8	23365	23372	25 %	0 %	50 %	25 %	16082721
503	NC_003131	GA	3	6	23384	23389	50 %	0 %	50 %	0 %	16082721
504	NC_003131	ATA	2	6	23423	23428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082721
505	NC_003131	GTT	2	6	23503	23508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082721
506	NC_003131	CAT	2	6	23681	23686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082721
507	NC_003131	CTG	2	6	23719	23724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082722
508	NC_003131	CGA	2	6	23792	23797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
509	NC_003131	CAG	2	6	23889	23894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
510	NC_003131	T	6	6	23946	23951	0 %	100 %	0 %	0 %	16082722
511	NC_003131	CTT	2	6	23958	23963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
512	NC_003131	AT	3	6	23985	23990	50 %	50 %	0 %	0 %	16082722
513	NC_003131	ACT	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082722
514	NC_003131	AT	3	6	24041	24046	50 %	50 %	0 %	0 %	16082722
515	NC_003131	ACG	2	6	24059	24064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
516	NC_003131	CCA	2	6	24087	24092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082722
517	NC_003131	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
518	NC_003131	CTT	2	6	24192	24197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
519	NC_003131	TAAT	2	8	24198	24205	50 %	50 %	0 %	0 %	16082722
520	NC_003131	CCT	2	6	24215	24220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082722
521	NC_003131	GA	3	6	24321	24326	50 %	0 %	50 %	0 %	16082722
522	NC_003131	CTC	2	6	24355	24360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082722
523	NC_003131	CACG	2	8	24456	24463	25 %	0 %	25 %	50 %	16082722
524	NC_003131	CTT	2	6	24504	24509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
525	NC_003131	ATA	2	6	24518	24523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082722
526	NC_003131	CAAGAT	2	12	24582	24593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082722
527	NC_003131	TCA	2	6	24620	24625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082722
528	NC_003131	ATCA	2	8	24670	24677	50 %	25 %	0 %	25 %	16082722
529	NC_003131	CTT	2	6	24702	24707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
530	NC_003131	AGC	2	6	24757	24762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
531	NC_003131	ACC	2	6	24847	24852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082722
532	NC_003131	CAG	2	6	24922	24927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
533	NC_003131	CCA	2	6	24932	24937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082722
534	NC_003131	TGA	2	6	24994	24999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082722
535	NC_003131	TCT	2	6	25001	25006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082722
536	NC_003131	ATA	2	6	25025	25030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082722
537	NC_003131	CAG	2	6	25048	25053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
538	NC_003131	CCATC	2	10	25071	25080	20 %	20 %	0 %	60 %	16082722
539	NC_003131	CGC	2	6	25155	25160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082722
540	NC_003131	AT	3	6	25164	25169	50 %	50 %	0 %	0 %	16082722
541	NC_003131	ATA	2	6	25178	25183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082722
542	NC_003131	CTTT	2	8	25250	25257	0 %	75 %	0 %	25 %	16082722
543	NC_003131	TCG	2	6	25263	25268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082722
544	NC_003131	CG	3	6	25267	25272	0 %	0 %	50 %	50 %	16082722
545	NC_003131	GCATC	2	10	25344	25353	20 %	20 %	20 %	40 %	16082722
546	NC_003131	AG	3	6	25355	25360	50 %	0 %	50 %	0 %	16082722
547	NC_003131	TGA	2	6	25425	25430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082722
548	NC_003131	CGA	2	6	25449	25454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
549	NC_003131	ACG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
550	NC_003131	GTG	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082722
551	NC_003131	AAC	2	6	25634	25639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082722
552	NC_003131	G	8	8	25686	25693	0 %	0 %	100 %	0 %	16082722
553	NC_003131	CAT	2	6	25705	25710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082722
554	NC_003131	CAG	2	6	25726	25731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
555	NC_003131	AAT	2	6	25816	25821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082723
556	NC_003131	GTT	2	6	25861	25866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082723
557	NC_003131	CTT	2	6	25930	25935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082723
558	NC_003131	TTA	3	9	25956	25964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082723
559	NC_003131	GC	3	6	26043	26048	0 %	0 %	50 %	50 %	16082723
560	NC_003131	AACC	2	8	26073	26080	50 %	0 %	0 %	50 %	16082723
561	NC_003131	AGC	2	6	26085	26090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082723
562	NC_003131	TGT	2	6	26100	26105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082723
563	NC_003131	ATT	2	6	26150	26155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082724
564	NC_003131	ATC	3	9	26167	26175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082724
565	NC_003131	TTG	2	6	26176	26181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082724
566	NC_003131	AGC	2	6	26189	26194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082724
567	NC_003131	GACT	2	8	26219	26226	25 %	25 %	25 %	25 %	16082724
568	NC_003131	GGT	2	6	26227	26232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082724
569	NC_003131	GCTT	2	8	26331	26338	0 %	50 %	25 %	25 %	16082724
570	NC_003131	GGC	2	6	26390	26395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082724
571	NC_003131	G	6	6	26469	26474	0 %	0 %	100 %	0 %	16082724
572	NC_003131	TTA	2	6	26478	26483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082724
573	NC_003131	TGC	2	6	26509	26514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082725
574	NC_003131	TCA	2	6	26569	26574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082725
575	NC_003131	ACC	2	6	26609	26614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082725
576	NC_003131	GCC	2	6	26647	26652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082725
577	NC_003131	TGT	2	6	26737	26742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082725
578	NC_003131	ATG	2	6	26839	26844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082725
579	NC_003131	ACTC	2	8	26856	26863	25 %	25 %	0 %	50 %	16082725
580	NC_003131	TTC	2	6	26866	26871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082726
581	NC_003131	ATCG	2	8	26893	26900	25 %	25 %	25 %	25 %	16082726
582	NC_003131	CTC	2	6	26935	26940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082726
583	NC_003131	A	7	7	27142	27148	100 %	0 %	0 %	0 %	16082727
584	NC_003131	TCAC	2	8	27171	27178	25 %	25 %	0 %	50 %	16082727
585	NC_003131	TAA	2	6	27211	27216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082727
586	NC_003131	TTG	2	6	27248	27253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082727
587	NC_003131	AAT	2	6	27288	27293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082727
588	NC_003131	GGTA	2	8	27382	27389	25 %	25 %	50 %	0 %	16082727
589	NC_003131	TTC	2	6	27596	27601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082727
590	NC_003131	AGC	2	6	27669	27674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082727
591	NC_003131	TCAC	2	8	27675	27682	25 %	25 %	0 %	50 %	16082727
592	NC_003131	CTC	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082727
593	NC_003131	ACT	2	6	27917	27922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082727
594	NC_003131	CGT	2	6	27980	27985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082727
595	NC_003131	ACT	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_003131	AATTAC	2	12	28016	28027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
597	NC_003131	TGC	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_003131	T	6	6	28129	28134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003131	TCA	2	6	28209	28214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082728
600	NC_003131	GTAG	2	8	28231	28238	25 %	25 %	50 %	0 %	16082728
601	NC_003131	TTA	2	6	28285	28290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082728
602	NC_003131	TTAC	2	8	28329	28336	25 %	50 %	0 %	25 %	16082728
603	NC_003131	ACA	2	6	28346	28351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082728
604	NC_003131	TCT	2	6	28432	28437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082728
605	NC_003131	GGGT	2	8	28478	28485	0 %	25 %	75 %	0 %	16082728
606	NC_003131	CTG	2	6	28492	28497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082728
607	NC_003131	G	6	6	28534	28539	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
608	NC_003131	CGG	2	6	28553	28558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082728
609	NC_003131	TTA	2	6	28607	28612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082728
610	NC_003131	CAC	2	6	28616	28621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082728
611	NC_003131	GCC	2	6	28693	28698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082728
612	NC_003131	G	9	9	28699	28707	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
613	NC_003131	TGCT	2	8	28718	28725	0 %	50 %	25 %	25 %	16082728
614	NC_003131	GTG	2	6	28849	28854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082728
615	NC_003131	ACC	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082728
616	NC_003131	CGC	2	6	29026	29031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082728
617	NC_003131	TCC	2	6	29037	29042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082728
618	NC_003131	CT	3	6	29111	29116	0 %	50 %	0 %	50 %	16082728
619	NC_003131	CGA	2	6	29160	29165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082728
620	NC_003131	ATT	2	6	29191	29196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082728
621	NC_003131	TGA	2	6	29264	29269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082728
622	NC_003131	GAA	2	6	29335	29340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082728
623	NC_003131	CGC	2	6	29508	29513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082729
624	NC_003131	GCTT	2	8	29574	29581	0 %	50 %	25 %	25 %	16082729
625	NC_003131	GCAG	2	8	29582	29589	25 %	0 %	50 %	25 %	16082729
626	NC_003131	TCA	2	6	29600	29605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082729
627	NC_003131	TGA	2	6	29648	29653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082729
628	NC_003131	A	6	6	29678	29683	100 %	0 %	0 %	0 %	16082729
629	NC_003131	CAC	2	6	29684	29689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082729
630	NC_003131	AGG	2	6	29746	29751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082729
631	NC_003131	ATT	2	6	29777	29782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082729
632	NC_003131	TGAGCG	2	12	29798	29809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082729
633	NC_003131	TGC	2	6	29830	29835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082729
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640	NC_003131	CAT	2	6	30026	30031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082730
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645	NC_003131	GCG	2	6	30188	30193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082730
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651	NC_003131	TAT	2	6	30346	30351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082730
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665	NC_003131	TAT	2	6	31117	31122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082730
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743	NC_003131	GTG	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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760	NC_003131	TTGGTT	2	12	36002	36013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
761	NC_003131	CGCA	2	8	36036	36043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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763	NC_003131	AT	3	6	36072	36077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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