MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 16012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020815	CCGT	2	8	3650363	3650370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_020815	GGA	2	6	3650374	3650379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_020815	GGA	2	6	3650390	3650395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_020815	CGCA	2	8	3650403	3650410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_020815	CG	3	6	3650416	3650421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_020815	A	6	6	3650444	3650449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_020815	GCA	2	6	3650472	3650477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_020815	TGC	2	6	3650481	3650486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_020815	TGCG	2	8	3650514	3650521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11010	NC_020815	GCC	2	6	3650619	3650624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_020815	AAC	2	6	3650658	3650663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_020815	GGAGT	2	10	3653846	3653855	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_020815	CGG	2	6	3653891	3653896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_020815	GCT	2	6	3653931	3653936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_020815	CTG	2	6	3653941	3653946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_020815	CCA	2	6	3653950	3653955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_020815	CGA	2	6	3654477	3654482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_020815	CGCGC	2	10	3654485	3654494	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11019	NC_020815	GC	3	6	3654540	3654545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11020	NC_020815	TG	3	6	3654574	3654579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_020815	CAA	2	6	3654589	3654594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_020815	AGC	2	6	3654650	3654655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_020815	G	6	6	3654677	3654682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_020815	TGC	2	6	3654719	3654724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_020815	CGAT	2	8	3654725	3654732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11026	NC_020815	GC	3	6	3654747	3654752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_020815	TGG	2	6	3654756	3654761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_020815	CGC	2	6	3654799	3654804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_020815	GCC	2	6	3654810	3654815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_020815	GCG	2	6	3656871	3656876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_020815	GCC	2	6	3656962	3656967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_020815	TGCTC	2	10	3656974	3656983	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11033	NC_020815	GCCA	2	8	3656993	3657000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_020815	CCA	2	6	3657034	3657039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_020815	AAG	2	6	3659491	3659496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_020815	GGTG	2	8	3661724	3661731	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_020815	CG	4	8	3661737	3661744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_020815	ACA	2	6	3664307	3664312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_020815	GGC	2	6	3664904	3664909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_020815	CGGCC	2	10	3665643	3665652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11041	NC_020815	CCGA	2	8	3667340	3667347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11042	NC_020815	GGCAC	2	10	3667351	3667360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11043	NC_020815	ACG	2	6	3667395	3667400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_020815	C	6	6	3667420	3667425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11045	NC_020815	CTGC	2	8	3667482	3667489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_020815	CTGC	2	8	3667492	3667499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_020815	CTGC	2	8	3667502	3667509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11048	NC_020815	CTGC	2	8	3667512	3667519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_020815	CGG	2	6	3667532	3667537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_020815	CTCG	2	8	3667545	3667552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_020815	ACG	2	6	3667581	3667586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_020815	CAG	2	6	3667634	3667639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_020815	AC	3	6	3667918	3667923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_020815	CCG	2	6	3669034	3669039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_020815	GC	3	6	3669044	3669049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11056	NC_020815	TGA	2	6	3669073	3669078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_020815	GCA	2	6	3669108	3669113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_020815	CCG	2	6	3669114	3669119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_020815	TGC	2	6	3669132	3669137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_020815	GCC	2	6	3669141	3669146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_020815	ATCA	2	8	3669357	3669364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_020815	CG	3	6	3669369	3669374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_020815	AG	3	6	3669431	3669436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_020815	TGC	2	6	3669458	3669463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_020815	AGC	2	6	3669476	3669481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_020815	CAC	2	6	3669530	3669535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_020815	CGT	2	6	3669627	3669632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_020815	GAA	2	6	3670098	3670103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_020815	CCA	2	6	3671007	3671012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_020815	GCT	2	6	3671019	3671024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_020815	GCG	2	6	3671034	3671039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_020815	ACC	2	6	3671067	3671072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_020815	C	8	8	3672399	3672406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11074	NC_020815	ACC	2	6	3672408	3672413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_020815	GGC	2	6	3672428	3672433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_020815	CGC	2	6	3674595	3674600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_020815	CAG	2	6	3674611	3674616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_020815	CAAC	2	8	3675440	3675447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_020815	GAC	2	6	3675469	3675474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_020815	TCAA	2	8	3675546	3675553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11081	NC_020815	TCG	2	6	3675567	3675572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_020815	ACCT	2	8	3675614	3675621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_020815	AAT	2	6	3675699	3675704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_020815	CGG	2	6	3675739	3675744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_020815	CAGC	2	8	3675861	3675868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_020815	CCG	2	6	3675904	3675909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_020815	TTGAT	2	10	3675989	3675998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_020815	CGACCC	2	12	3676086	3676097	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11089	NC_020815	CGGG	2	8	3676209	3676216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_020815	GAT	2	6	3676300	3676305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_020815	CCA	2	6	3676602	3676607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_020815	CGCC	2	8	3676615	3676622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11093	NC_020815	CAG	2	6	3676643	3676648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_020815	AAT	2	6	3676656	3676661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_020815	ACC	2	6	3676741	3676746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_020815	CA	3	6	3676769	3676774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11097	NC_020815	ACC	2	6	3676795	3676800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_020815	ATG	2	6	3678173	3678178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_020815	ACGC	2	8	3678230	3678237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_020815	GTA	2	6	3678254	3678259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_020815	CGC	2	6	3678310	3678315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_020815	CCAA	2	8	3678328	3678335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_020815	T	6	6	3678353	3678358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_020815	GGC	2	6	3678365	3678370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_020815	GC	3	6	3679990	3679995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_020815	GGC	2	6	3680002	3680007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_020815	CGCC	2	8	3680090	3680097	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11108	NC_020815	CGCT	2	8	3680127	3680134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_020815	AGCAA	2	10	3680174	3680183	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11110	NC_020815	CGC	2	6	3680216	3680221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_020815	CGA	2	6	3680235	3680240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_020815	ATTGG	2	10	3680265	3680274	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_020815	GCG	2	6	3680277	3680282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_020815	GCG	2	6	3680302	3680307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_020815	ACG	2	6	3680318	3680323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_020815	CGT	2	6	3680338	3680343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_020815	CG	4	8	3680367	3680374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_020815	CG	3	6	3681860	3681865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_020815	GCGCC	2	10	3681869	3681878	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11120	NC_020815	AGC	2	6	3685458	3685463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_020815	CG	3	6	3685533	3685538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_020815	GC	3	6	3685556	3685561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_020815	CAA	2	6	3685653	3685658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_020815	CCG	2	6	3685664	3685669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11125	NC_020815	CCGC	2	8	3685689	3685696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11126	NC_020815	CGC	2	6	3685792	3685797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11127	NC_020815	AC	3	6	3689498	3689503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11128	NC_020815	GC	3	6	3689508	3689513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11129	NC_020815	GAT	2	6	3689518	3689523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11499	NC_020815	TCGCG	2	10	3827812	3827821	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11500	NC_020815	GCA	2	6	3827849	3827854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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