MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	CT	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020801	T	8	8	4457	4464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020801	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020801	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020801	TTAC	2	8	5608	5615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020801	G	7	7	8495	8501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020801	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020801	CCG	2	6	8707	8712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020801	GCC	2	6	8734	8739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020801	CGAA	2	8	8830	8837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020801	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020801	G	8	8	9364	9371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020801	CCT	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020801	CGG	2	6	9534	9539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020801	CCT	2	6	9596	9601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020801	GGT	2	6	9697	9702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020801	GGAGG	2	10	9726	9735	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020801	CGG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020801	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020801	GC	3	6	10005	10010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020801	GC	3	6	10065	10070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020801	CTTT	2	8	10972	10979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020801	T	6	6	10977	10982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020801	ACG	2	6	11000	11005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020801	A	6	6	11012	11017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020801	AAG	2	6	11807	11812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020801	TAT	2	6	11821	11826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020801	TCT	2	6	11827	11832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020801	CGG	2	6	11871	11876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020801	GCA	2	6	11881	11886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020801	TG	3	6	11891	11896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020801	CCT	2	6	11965	11970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020801	CTG	2	6	11992	11997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020801	AGG	2	6	12017	12022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020801	CCG	3	9	12026	12034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020801	GCA	2	6	12057	12062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020801	CGG	2	6	12080	12085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020801	GTC	2	6	12124	12129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020801	GCG	3	9	12138	12146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020801	ACTG	2	8	12172	12179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020801	G	6	6	12282	12287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020801	GCG	2	6	12299	12304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020801	GTG	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020801	GCC	2	6	12319	12324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020801	GGC	2	6	12333	12338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020801	CGG	2	6	13319	13324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020801	TGA	2	6	13378	13383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020801	GCC	2	6	13388	13393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020801	T	6	6	13407	13412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020801	CAG	2	6	13438	13443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020801	GTT	2	6	13452	13457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020801	CTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020801	GGT	2	6	13515	13520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020801	CCA	2	6	13595	13600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020801	GC	3	6	13650	13655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020801	CT	3	6	13748	13753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020801	CCT	2	6	13765	13770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020801	CCG	4	12	13774	13785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020801	GTAGC	2	10	13804	13813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020801	CAA	2	6	13830	13835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020801	ACCTAA	2	12	13922	13933	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020801	AAGA	2	8	14013	14020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020801	C	6	6	14028	14033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_020801	GAG	2	6	14080	14085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020801	TCCG	2	8	15797	15804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020801	CGAC	2	8	15862	15869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020801	T	6	6	15903	15908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020801	ACC	2	6	16662	16667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_020801	ATCA	2	8	16695	16702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020801	ATG	2	6	16704	16709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020801	CTG	2	6	17172	17177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020801	ACGG	2	8	17206	17213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020801	A	6	6	17451	17456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020801	CTG	2	6	17638	17643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020801	CG	3	6	17784	17789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020801	GC	3	6	17790	17795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020801	CGG	2	6	17900	17905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020801	CA	3	6	18832	18837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020801	CTG	2	6	18862	18867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020801	CGG	2	6	19485	19490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020801	TGA	2	6	19505	19510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020801	GTA	2	6	20050	20055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020801	GCT	2	6	20090	20095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020801	AGCA	2	8	20128	20135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020801	GCC	2	6	20199	20204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020801	GCG	2	6	20299	20304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020801	GTC	2	6	20313	20318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020801	GCG	2	6	20328	20333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020801	GCG	2	6	20348	20353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020801	TGC	3	9	20359	20367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020801	GTG	2	6	20394	20399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020801	GGC	2	6	20400	20405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020801	GGGC	2	8	20443	20450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020801	GC	3	6	20464	20469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020801	CGTC	2	8	20529	20536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020801	CGGC	2	8	20550	20557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020801	GCG	2	6	20562	20567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020801	CCG	2	6	20691	20696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020801	CCGC	2	8	20707	20714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_020801	CGG	2	6	20715	20720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020801	GCCGG	2	10	20818	20827	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020801	CCG	2	6	21365	21370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020801	TGGC	2	8	21374	21381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020801	TCG	2	6	21426	21431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020801	TA	5	10	21460	21469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020801	GCTT	3	12	21635	21646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020801	GGTA	2	8	21689	21696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020801	TA	5	10	21695	21704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020801	GCC	2	6	21752	21757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020801	GTAT	2	8	21771	21778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020801	ATAG	2	8	21783	21790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020801	TA	5	10	22750	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020801	TA	5	10	22770	22779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020801	CGA	2	6	22813	22818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020801	TTG	2	6	22859	22864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020801	GA	3	6	23219	23224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020801	CAG	2	6	23235	23240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020801	CAGGG	2	10	23300	23309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020801	GC	3	6	23406	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020801	TGA	2	6	23440	23445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020801	GC	3	6	24739	24744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020801	CAG	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020801	GCA	2	6	24820	24825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020801	GGC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020801	A	6	6	24949	24954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020801	TTAC	2	8	24990	24997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020801	G	7	7	27985	27991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020801	CCG	2	6	28139	28144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_020801	CCG	2	6	28197	28202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020801	GCC	2	6	28224	28229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020801	CGAA	2	8	28320	28327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020801	CGA	2	6	28445	28450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020801	GGA	2	6	28493	28498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020801	T	6	6	28557	28562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020801	TCC	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020801	GCA	2	6	29861	29866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020801	TCG	2	6	29885	29890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020801	AGC	3	9	29899	29907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020801	GAT	2	6	29952	29957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020801	AAG	2	6	30012	30017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020801	CGC	2	6	30029	30034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020801	CGC	2	6	30040	30045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_020801	TA	3	6	30716	30721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020801	CTG	2	6	30758	30763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020801	TCG	2	6	31766	31771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020801	CCG	2	6	31772	31777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.