MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 12338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010513	AGC	2	6	583513	583518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_010513	GTT	2	6	583524	583529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010513	TTGC	2	8	583591	583598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_010513	CTT	2	6	583647	583652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_010513	ATT	2	6	583733	583738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010513	AGG	2	6	583772	583777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010513	ATG	2	6	583886	583891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010513	GTT	2	6	583915	583920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010513	GGT	2	6	583980	583985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010513	ATT	2	6	584096	584101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010513	CAT	2	6	584132	584137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_010513	TCAT	2	8	584260	584267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_010513	CTTG	2	8	584352	584359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_010513	TGT	2	6	584372	584377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010513	GAC	2	6	584393	584398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010513	GTA	2	6	584418	584423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010513	CTA	2	6	584469	584474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010513	TGT	2	6	584492	584497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010513	GT	3	6	584545	584550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010513	TGC	2	6	584628	584633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_010513	TG	4	8	584651	584658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010513	GAC	2	6	584659	584664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010513	T	6	6	584670	584675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010513	AGC	2	6	584698	584703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_010513	AT	3	6	584706	584711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010513	AGTTT	2	10	584718	584727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3028	NC_010513	GGT	2	6	585968	585973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010513	GAT	2	6	585986	585991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3031	NC_010513	TGG	2	6	586020	586025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010513	ATTTGT	2	12	586068	586079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010513	GCGT	2	8	586101	586108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_010513	GTG	4	12	586112	586123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010513	TCC	2	6	586167	586172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_010513	GCA	2	6	586215	586220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3038	NC_010513	GAT	2	6	586240	586245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010513	GTT	2	6	586248	586253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010513	GT	3	6	586311	586316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010513	GAT	2	6	586320	586325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010513	CGC	2	6	586336	586341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_010513	GT	3	6	586356	586361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010513	TTG	2	6	586433	586438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010513	TGTC	2	8	586456	586463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_010513	CGG	2	6	586698	586703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_010513	GGC	2	6	586747	586752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_010513	GT	3	6	586863	586868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010513	CTG	2	6	586911	586916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010513	ATG	2	6	586979	586984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010513	TGA	2	6	590605	590610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010513	AAG	2	6	591404	591409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010513	ATC	2	6	591496	591501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_010513	TGCAA	2	10	591515	591524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3055	NC_010513	GAT	2	6	591534	591539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010513	TG	4	8	591552	591559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010513	TCT	2	6	591655	591660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010513	TGC	2	6	591683	591688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_010513	CAGC	2	8	591710	591717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3061	NC_010513	GAGT	2	8	591766	591773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010513	ATG	2	6	591780	591785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010513	GCAGG	2	10	591787	591796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_010513	CGT	2	6	593202	593207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010513	GT	3	6	593206	593211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010513	TGTGT	2	10	593242	593251	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010513	GT	3	6	593277	593282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010513	CTG	2	6	593328	593333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010513	GTT	2	6	593359	593364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010513	GTAGCA	9	54	593381	593434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3071	NC_010513	TGTT	2	8	593444	593451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010513	TTGCG	2	10	593458	593467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_010513	T	6	6	593554	593559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_010513	TTGGTG	2	12	593743	593754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010513	GCAG	2	8	593980	593987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_010513	GATA	2	8	594000	594007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010513	TG	3	6	594041	594046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010513	GAG	2	6	594624	594629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010513	AGG	2	6	594640	594645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010513	TGA	2	6	594669	594674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_010513	TCG	2	6	594693	594698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_010513	TATTT	2	10	594700	594709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_010513	GGTT	2	8	594715	594722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010513	CTGTG	2	10	594741	594750	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3089	NC_010513	GAT	2	6	594800	594805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010513	GAT	2	6	594849	594854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_010513	ATA	2	6	594995	595000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010513	GTC	2	6	595113	595118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_010513	TC	3	6	595129	595134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_010513	TGG	2	6	595167	595172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_010513	T	6	6	595623	595628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010513	T	7	7	595630	595636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010513	GTG	2	6	595677	595682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010513	TGG	2	6	595700	595705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010513	GTTG	2	8	595718	595725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010513	GTT	2	6	597279	597284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010513	TTGA	2	8	597354	597361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010513	CGTG	2	8	597417	597424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_010513	GCG	2	6	597442	597447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010513	CACAGA	2	12	597483	597494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_010513	AGTT	2	8	597509	597516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010513	AT	3	6	598363	598368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010513	TGG	2	6	599398	599403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010513	AAG	2	6	599451	599456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010513	A	6	6	600003	600008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010513	CTT	2	6	600068	600073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010513	TTTG	2	8	600115	600122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010513	CTT	2	6	600177	600182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_010513	TCA	2	6	602068	602073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_010513	TTC	2	6	602578	602583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_010513	TG	3	6	602586	602591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010513	TTC	2	6	602632	602637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_010513	GAA	2	6	602692	602697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010513	TAA	2	6	602758	602763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010513	TCA	2	6	602776	602781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_010513	AT	3	6	604080	604085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010513	T	6	6	604098	604103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010513	ATTAT	2	10	604115	604124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010513	ATGA	2	8	604143	604150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010513	TTTA	2	8	604204	604211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010513	AATTA	2	10	604248	604257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_010513	GCA	2	6	604546	604551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_010513	AGGA	2	8	604568	604575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010513	AGGG	2	8	604589	604596	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010513	G	6	6	604594	604599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010513	AAAC	2	8	604614	604621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_010513	TCT	2	6	604632	604637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_010513	ACC	2	6	604667	604672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_010513	T	7	7	605019	605025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_010513	TCTT	2	8	605030	605037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3269	NC_010513	A	6	6	631572	631577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3408	NC_010513	GAAA	2	8	665658	665665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3409	NC_010513	CGCATC	2	12	665727	665738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3410	NC_010513	TAC	2	6	665899	665904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3411	NC_010513	ATGG	2	8	667449	667456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_010513	GTT	2	6	667457	667462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3414	NC_010513	CGC	2	6	667502	667507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3426	NC_010513	GGAG	2	8	669466	669473	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3442	NC_010513	TGT	3	9	672216	672224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3443	NC_010513	ATGG	2	8	672356	672363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3444	NC_010513	GTT	2	6	674718	674723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3451	NC_010513	GA	3	6	676614	676619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_010513	TGCGT	2	10	676627	676636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3453	NC_010513	T	7	7	676643	676649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3454	NC_010513	TTTGG	2	10	677544	677553	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3455	NC_010513	ATGG	2	8	677554	677561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3456	NC_010513	TG	3	6	677586	677591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_010513	T	7	7	691255	691261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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