MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 14407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	TTGCG	2	10	25	34	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009720	TCG	2	6	41	46	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009720	CTC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009720	GC	3	6	177	182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009720	GCCG	2	8	269	276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009720	CG	3	6	275	280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009720	CCG	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009720	GTC	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009720	GCCG	2	8	1921	1928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009720	CG	3	6	1962	1967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009720	GCG	3	9	1997	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009720	AGCC	2	8	2022	2029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009720	GC	3	6	2042	2047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009720	GGC	2	6	2052	2057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009720	TCC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009720	CGG	2	6	2086	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009720	GC	3	6	2135	2140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009720	ACG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009720	CGG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009720	CG	3	6	3439	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009720	CTG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009720	CTC	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009720	AAC	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009720	CTCC	2	8	4804	4811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009720	CAT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009720	AT	3	6	4824	4829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009720	CATA	2	8	4830	4837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009720	TAA	2	6	4839	4844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009720	GAC	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009720	GGGA	2	8	4855	4862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009720	GC	4	8	6120	6127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009720	GC	3	6	6129	6134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009720	GCA	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009720	GCA	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009720	CTGG	2	8	6155	6162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009720	TCCCCG	2	12	6197	6208	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009720	CG	3	6	6230	6235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009720	CGC	2	6	9690	9695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009720	CGC	2	6	10445	10450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009720	CCG	2	6	10454	10459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009720	CTTGG	2	10	10466	10475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009720	CGC	2	6	10491	10496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009720	TG	3	6	10505	10510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009720	GGC	2	6	10513	10518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009720	GCC	2	6	10530	10535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009720	TCC	2	6	10543	10548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009720	GGA	2	6	10558	10563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009720	GGTG	2	8	10568	10575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009720	GGT	2	6	10589	10594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009720	TCCTG	2	10	12520	12529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009720	GC	3	6	12541	12546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009720	CGT	2	6	12554	12559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009720	AT	3	6	12570	12575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009720	ATG	2	6	12581	12586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009720	CGG	2	6	12605	12610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009720	GGCA	2	8	12628	12635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009720	CCT	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009720	G	6	6	14131	14136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009720	CGG	2	6	14141	14146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009720	GCG	2	6	14155	14160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009720	GGC	2	6	14198	14203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009720	GC	3	6	14322	14327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009720	GCCT	2	8	14336	14343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009720	GCT	2	6	14351	14356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009720	CACCG	2	10	16077	16086	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009720	GCC	2	6	17266	17271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009720	GGA	2	6	17272	17277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009720	GGC	2	6	18359	18364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009720	CG	3	6	18378	18383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009720	CG	3	6	18393	18398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009720	GCG	2	6	18484	18489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009720	CGT	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009720	GCGG	2	8	18551	18558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009720	GCG	2	6	19272	19277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009720	CGA	2	6	19297	19302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009720	GCG	2	6	20693	20698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009720	AG	3	6	20762	20767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009720	CGC	2	6	20771	20776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009720	GC	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009720	CCGG	2	8	23402	23409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009720	GACG	2	8	23428	23435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009720	CG	4	8	23460	23467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009720	GAG	2	6	23468	23473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009720	CGGC	2	8	23506	23513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009720	CG	3	6	24153	24158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009720	CG	3	6	24187	24192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009720	GCC	2	6	26531	26536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009720	CGGC	2	8	26574	26581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009720	GCC	2	6	26638	26643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009720	GGCC	2	8	26699	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009720	CGT	2	6	26769	26774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009720	TCC	2	6	27781	27786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009720	CG	3	6	27804	27809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009720	CCG	2	6	29846	29851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009720	GGA	2	6	29907	29912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009720	TCG	2	6	31447	31452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009720	CGG	2	6	31527	31532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009720	ACTT	2	8	31554	31561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009720	GGC	2	6	31574	31579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009720	CGC	2	6	31618	31623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009720	GGT	2	6	31633	31638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009720	CCCT	2	8	32162	32169	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009720	GCC	2	6	32223	32228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_009720	TTG	2	6	32234	32239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009720	GCG	2	6	32279	32284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009720	GCCG	2	8	32316	32323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009720	GTT	2	6	32357	32362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009720	TGC	2	6	32392	32397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009720	AGA	2	6	32412	32417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009720	C	6	6	32432	32437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_009720	AG	3	6	32541	32546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009720	AGC	2	6	32558	32563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009720	TTTGC	2	10	32580	32589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009720	AAG	2	6	32611	32616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009720	CGG	2	6	32619	32624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009720	ATA	2	6	32634	32639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009720	CGGC	2	8	32949	32956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009720	CT	3	6	33008	33013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009720	GCC	2	6	33040	33045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009720	GGA	2	6	33083	33088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009720	CCGC	2	8	34106	34113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_009720	GCG	2	6	34122	34127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009720	GC	3	6	34156	34161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009720	GCCC	2	8	36999	37006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009720	CAC	2	6	37012	37017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009720	CGG	2	6	37037	37042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009720	CAC	2	6	37051	37056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009720	GGT	2	6	37064	37069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009720	GC	3	6	37132	37137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009720	GGCG	2	8	37152	37159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009720	GA	3	6	38553	38558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009720	TGC	2	6	38634	38639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009720	CGC	2	6	38666	38671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009720	GC	3	6	40137	40142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009720	TCT	2	6	44222	44227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009720	GAA	2	6	44945	44950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009720	AGG	2	6	44976	44981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009720	GCCG	2	8	44987	44994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009720	TG	3	6	46220	46225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009720	CG	3	6	46227	46232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009720	CTTCA	2	10	46255	46264	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009720	GCCA	2	8	49611	49618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009720	GCCC	2	8	51663	51670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_009720	CGGG	2	8	51677	51684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009720	A	7	7	52632	52638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009720	GGC	2	6	52707	52712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009720	GC	3	6	52711	52716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009720	GCC	2	6	54453	54458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_009720	AGC	2	6	54481	54486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009720	GCCCG	2	10	54552	54561	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
151	NC_009720	ATG	2	6	54617	54622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009720	GCCG	2	8	54646	54653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009720	CACC	2	8	55427	55434	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_009720	TCTG	2	8	55450	55457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009720	CGCC	2	8	55521	55528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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161	NC_009720	CTGGC	2	10	56585	56594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_009720	CGG	3	9	58565	58573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_009720	CG	3	6	61179	61184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_009720	TGA	2	6	61306	61311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009720	GGC	2	6	61688	61693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_009720	G	6	6	106314	106319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
283	NC_009720	CGG	2	6	106375	106380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009720	CGGGC	2	10	106418	106427	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_009720	TC	3	6	107924	107929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_009720	CCG	2	6	107965	107970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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289	NC_009720	GCC	2	6	108656	108661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_009720	GTC	2	6	108671	108676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_009720	GGC	2	6	108677	108682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_009720	A	6	6	111871	111876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_009720	CCG	2	6	111962	111967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_009720	GCC	2	6	111983	111988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_009720	CCA	2	6	112010	112015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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433	NC_009720	CTT	2	6	142353	142358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_009720	CCCG	2	8	142374	142381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
435	NC_009720	GCG	2	6	142427	142432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_009720	GTT	2	6	143358	143363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_009720	CGC	2	6	143385	143390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_009720	CA	3	6	143475	143480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_009720	GGAC	2	8	143604	143611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
440	NC_009720	TTCA	2	8	143962	143969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
441	NC_009720	CGGCG	2	10	143978	143987	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
442	NC_009720	G	6	6	143987	143992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009720	AGG	2	6	146068	146073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
444	NC_009720	TGG	2	6	146464	146469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
445	NC_009720	CCG	2	6	146494	146499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_009720	GTTT	2	8	146559	146566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
448	NC_009720	T	6	6	146616	146621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_009720	AAC	2	6	146623	146628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_009720	CAGC	2	8	146710	146717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_009720	CCT	2	6	146746	146751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_009720	TGG	2	6	146767	146772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_009720	CGA	2	6	146783	146788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_009720	GCG	2	6	146833	146838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_009720	CGC	2	6	146841	146846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_009720	CTG	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_009720	GGC	2	6	146924	146929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_009720	CCT	2	6	146934	146939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_009720	GGC	2	6	147133	147138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_009720	CGA	2	6	147145	147150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_009720	AGT	2	6	147316	147321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
468	NC_009720	GCG	2	6	147341	147346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_009720	CCG	2	6	147362	147367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
470	NC_009720	GC	3	6	148373	148378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
471	NC_009720	CGG	2	6	148402	148407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_009720	GCG	2	6	148503	148508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_009720	CCG	2	6	150746	150751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
476	NC_009720	CGC	2	6	150764	150769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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