MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009717	TC	3	6	37	42	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009717	GCG	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009717	CGTG	2	8	188	195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009717	AC	3	6	225	230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009717	GCC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009717	CGTTAA	2	12	401	412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009717	AAC	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009717	AAGC	2	8	2782	2789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009717	G	6	6	4181	4186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009717	ACG	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009717	TCC	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009717	GAC	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009717	GCG	2	6	6616	6621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009717	CTC	2	6	6663	6668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009717	G	6	6	6698	6703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009717	TGA	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009717	GCC	3	9	6763	6771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009717	CAT	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009717	CCG	2	6	6789	6794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009717	TGG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009717	CAT	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009717	GAT	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009717	GTT	2	6	6892	6897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009717	GCA	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009717	GCGCC	2	10	6963	6972	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009717	TGG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009717	CGA	2	6	7023	7028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009717	GAT	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009717	GCT	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009717	GCC	2	6	7080	7085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009717	CCG	2	6	7175	7180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009717	CGT	2	6	7230	7235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009717	CTC	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009717	GCC	2	6	7271	7276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009717	TGG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009717	GAG	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009717	GGC	2	6	7353	7358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009717	CAA	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009717	CGG	2	6	7513	7518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009717	GGC	2	6	7557	7562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009717	GCC	2	6	7573	7578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009717	CCA	2	6	7598	7603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009717	CG	5	10	7631	7640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009717	GC	4	8	7677	7684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009717	CAAT	2	8	8684	8691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009717	ATCG	2	8	8729	8736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009717	GGC	2	6	8754	8759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009717	TTCT	2	8	12749	12756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009717	GCT	2	6	12872	12877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009717	ACG	3	9	13318	13326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009717	TTC	2	6	13333	13338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009717	CCTT	2	8	13405	13412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009717	AGGA	2	8	13462	13469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009717	AGT	2	6	13530	13535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009717	GGA	2	6	13562	13567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009717	TCG	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009717	GGT	2	6	13591	13596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009717	CCG	2	6	13603	13608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009717	CAG	2	6	13633	13638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009717	GGT	2	6	13673	13678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009717	CGG	2	6	13707	13712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009717	CGG	2	6	13748	13753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009717	TC	3	6	13817	13822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009717	CGC	2	6	13839	13844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009717	TGC	2	6	13858	13863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009717	T	6	6	17468	17473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009717	AGGT	2	8	17481	17488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009717	CGT	2	6	17509	17514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009717	CGGC	2	8	17527	17534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009717	GCGA	2	8	17606	17613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009717	TTGC	2	8	17639	17646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009717	CTC	2	6	17660	17665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009717	CG	3	6	17730	17735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009717	TCG	2	6	17769	17774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009717	GCC	2	6	17811	17816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009717	TTCTCC	2	12	17859	17870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009717	GC	5	10	17917	17926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009717	AAG	2	6	17951	17956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009717	GA	3	6	19085	19090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009717	GTG	2	6	19157	19162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009717	GAT	2	6	22631	22636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009717	TCG	2	6	22692	22697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009717	CGG	2	6	22785	22790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009717	GAT	2	6	22796	22801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009717	TGAC	2	8	22841	22848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009717	CGGGA	2	10	22925	22934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009717	GAC	2	6	22963	22968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009717	ATCC	2	8	23008	23015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009717	CG	3	6	23245	23250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009717	CGA	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009717	GCG	2	6	23262	23267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009717	CCT	2	6	23786	23791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009717	TCGG	2	8	23803	23810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009717	CCG	2	6	23811	23816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009717	GCG	2	6	23822	23827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009717	AAG	2	6	23918	23923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009717	GGC	2	6	23933	23938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009717	GC	3	6	23949	23954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009717	GCC	2	6	23961	23966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009717	GCG	2	6	24073	24078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009717	GAT	2	6	24226	24231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009717	G	6	6	24307	24312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009717	CGAG	2	8	24330	24337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009717	G	6	6	24352	24357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009717	GC	3	6	24502	24507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009717	GC	3	6	24513	24518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009717	CG	3	6	24561	24566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009717	CTT	2	6	24588	24593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009717	CCA	2	6	24870	24875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009717	GCC	2	6	24888	24893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009717	GTC	2	6	24934	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009717	GCC	2	6	24961	24966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009717	CGG	2	6	24978	24983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009717	GTG	2	6	25039	25044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009717	CTT	2	6	25153	25158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009717	CAG	2	6	25165	25170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009717	CGA	2	6	25173	25178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009717	AGT	2	6	25287	25292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009717	T	6	6	25314	25319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009717	TCA	2	6	25388	25393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009717	CAA	2	6	25440	25445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009717	CCG	2	6	25455	25460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009717	GCC	2	6	25510	25515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009717	GGA	2	6	26364	26369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009717	CCT	2	6	26401	26406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009717	CCG	2	6	28059	28064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009717	TCGC	2	8	28071	28078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009717	GCC	2	6	28079	28084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009717	CGA	2	6	28099	28104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009717	AGC	2	6	28128	28133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009717	GGA	2	6	28141	28146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009717	AGG	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009717	TCC	2	6	28780	28785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009717	GAGT	2	8	30051	30058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009717	TAC	2	6	30124	30129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009717	CGG	2	6	30189	30194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009717	CGG	2	6	30240	30245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009717	GAG	2	6	30340	30345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009717	AAG	2	6	30347	30352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009717	CCT	2	6	34106	34111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009717	AGG	2	6	34258	34263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009717	GA	3	6	34277	34282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009717	AGG	2	6	34301	34306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009717	GA	3	6	34318	34323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009717	GC	3	6	34378	34383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009717	CG	3	6	34402	34407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009717	GAG	2	6	34491	34496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_009717	C	7	7	34775	34781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_009717	TGATCG	2	12	34786	34797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_009717	GAT	2	6	35055	35060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009717	TGT	2	6	35327	35332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009717	ATG	2	6	44533	44538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009717	GGC	2	6	44539	44544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_009717	TGA	2	6	72654	72659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_009717	CCA	2	6	72806	72811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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