MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017562	CAA	2	6	214472	214477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083311
3502	NC_017562	CGCA	2	8	214639	214646	25 %	0 %	25 %	50 %	386083312
3503	NC_017562	CGG	2	6	214777	214782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083312
3504	NC_017562	CAA	2	6	214851	214856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3505	NC_017562	A	6	6	214855	214860	100 %	0 %	0 %	0 %	386083312
3506	NC_017562	CCA	2	6	214908	214913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083312
3507	NC_017562	CTCCA	2	10	214927	214936	20 %	20 %	0 %	60 %	386083312
3508	NC_017562	ACC	2	6	214937	214942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083312
3509	NC_017562	ATC	2	6	215048	215053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083312
3510	NC_017562	CCA	2	6	215066	215071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083312
3511	NC_017562	TGAA	2	8	215078	215085	50 %	25 %	25 %	0 %	386083312
3512	NC_017562	CGGA	2	8	215092	215099	25 %	0 %	50 %	25 %	386083312
3513	NC_017562	CAA	2	6	215137	215142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3514	NC_017562	TCA	2	6	215147	215152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083312
3515	NC_017562	CAA	2	6	215158	215163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3516	NC_017562	CCACC	2	10	215175	215184	20 %	0 %	0 %	80 %	386083312
3517	NC_017562	A	7	7	215192	215198	100 %	0 %	0 %	0 %	386083312
3518	NC_017562	CTCA	2	8	215248	215255	25 %	25 %	0 %	50 %	386083312
3519	NC_017562	T	6	6	215370	215375	0 %	100 %	0 %	0 %	386083312
3520	NC_017562	CAA	2	6	215418	215423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3521	NC_017562	ACCA	2	8	215446	215453	50 %	0 %	0 %	50 %	386083312
3522	NC_017562	TCC	2	6	215457	215462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083312
3523	NC_017562	AC	3	6	215538	215543	50 %	0 %	0 %	50 %	386083312
3524	NC_017562	CAA	2	6	215581	215586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3525	NC_017562	TGC	2	6	215627	215632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083312
3526	NC_017562	GCG	2	6	215685	215690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083312
3527	NC_017562	TCA	2	6	215720	215725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083312
3528	NC_017562	CAA	2	6	215751	215756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083312
3529	NC_017562	CAC	2	6	215758	215763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083312
3530	NC_017562	GC	3	6	215775	215780	0 %	0 %	50 %	50 %	386083312
3531	NC_017562	CCTC	2	8	215801	215808	0 %	25 %	0 %	75 %	386083312
3532	NC_017562	CAT	2	6	215835	215840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083312
3533	NC_017562	AAT	2	6	215851	215856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083312
3534	NC_017562	AGA	2	6	216142	216147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083313
3535	NC_017562	CACTCA	2	12	216231	216242	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386083313
3536	NC_017562	CCA	5	15	216247	216261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083313
3537	NC_017562	GATC	2	8	216271	216278	25 %	25 %	25 %	25 %	386083313
3538	NC_017562	GGC	2	6	216293	216298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083313
3539	NC_017562	ACT	2	6	216307	216312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083313
3540	NC_017562	TCA	2	6	216314	216319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083313
3541	NC_017562	AC	3	6	216339	216344	50 %	0 %	0 %	50 %	386083313
3542	NC_017562	CTG	2	6	216360	216365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083313
3543	NC_017562	ACCCAT	2	12	216486	216497	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386083313
3544	NC_017562	ACA	2	6	216559	216564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083313
3545	NC_017562	ACTGC	2	10	216615	216624	20 %	20 %	20 %	40 %	386083313
3546	NC_017562	TTG	2	6	216702	216707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083313
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3548	NC_017562	CTG	2	6	216800	216805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083313
3549	NC_017562	A	7	7	216810	216816	100 %	0 %	0 %	0 %	386083313
3550	NC_017562	CGC	2	6	217030	217035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083314
3551	NC_017562	AC	4	8	217041	217048	50 %	0 %	0 %	50 %	386083314
3552	NC_017562	A	6	6	217051	217056	100 %	0 %	0 %	0 %	386083314
3553	NC_017562	TAA	2	6	217083	217088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083314
3554	NC_017562	CAA	3	9	217101	217109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083314
3555	NC_017562	CAC	2	6	217124	217129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083314
3556	NC_017562	ACG	2	6	217134	217139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083314
3557	NC_017562	CGC	2	6	217156	217161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083314
3558	NC_017562	CACCAA	2	12	217190	217201	50 %	0 %	0 %	50 %	386083314
3559	NC_017562	CAT	2	6	217226	217231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083314
3560	NC_017562	CAAC	2	8	217271	217278	50 %	0 %	0 %	50 %	386083314
3561	NC_017562	ACA	2	6	217385	217390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083314
3562	NC_017562	GCC	2	6	217396	217401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083314
3563	NC_017562	CAAG	2	8	217427	217434	50 %	0 %	25 %	25 %	386083314
3564	NC_017562	ACG	2	6	217509	217514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083314
3565	NC_017562	ATGA	2	8	217518	217525	50 %	25 %	25 %	0 %	386083314
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3573	NC_017562	CAA	2	6	218014	218019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083315
3574	NC_017562	CTG	2	6	218048	218053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083315
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3577	NC_017562	CCA	2	6	218086	218091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083315
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3580	NC_017562	CTG	2	6	218228	218233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083315
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3589	NC_017562	ATG	2	6	218733	218738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083315
3590	NC_017562	TGC	2	6	218778	218783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083315
3591	NC_017562	T	6	6	218933	218938	0 %	100 %	0 %	0 %	386083315
3592	NC_017562	CAA	2	6	220850	220855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083316
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3594	NC_017562	ACAT	2	8	220934	220941	50 %	25 %	0 %	25 %	386083316
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3598	NC_017562	CCA	2	6	221038	221043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083316
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3602	NC_017562	TGG	2	6	221355	221360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083317
3603	NC_017562	AATC	2	8	221379	221386	50 %	25 %	0 %	25 %	386083317
3604	NC_017562	A	6	6	221445	221450	100 %	0 %	0 %	0 %	386083317
3605	NC_017562	TGCT	2	8	221454	221461	0 %	50 %	25 %	25 %	386083317
3606	NC_017562	ATCATA	2	12	221559	221570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386083317
3607	NC_017562	AAT	2	6	221583	221588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083317
3608	NC_017562	ATACA	2	10	221613	221622	60 %	20 %	0 %	20 %	386083317
3609	NC_017562	CAA	2	6	221643	221648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083317
3610	NC_017562	CAC	2	6	221705	221710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083317
3611	NC_017562	AAC	2	6	221782	221787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083317
3612	NC_017562	ACT	2	6	221802	221807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083317
3613	NC_017562	AAT	2	6	221811	221816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083317
3614	NC_017562	GAA	2	6	221895	221900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083317
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3616	NC_017562	A	8	8	221966	221973	100 %	0 %	0 %	0 %	386083317
3617	NC_017562	GAA	2	6	222046	222051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083317
3618	NC_017562	AC	3	6	222077	222082	50 %	0 %	0 %	50 %	386083317
3619	NC_017562	TCC	2	6	222205	222210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083317
3620	NC_017562	CCA	2	6	222214	222219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083317
3621	NC_017562	AAC	2	6	222240	222245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083317
3622	NC_017562	CAC	2	6	222249	222254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083317
3623	NC_017562	CATTC	2	10	222274	222283	20 %	40 %	0 %	40 %	386083317
3624	NC_017562	A	7	7	222904	222910	100 %	0 %	0 %	0 %	386083318
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3742	NC_017562	AT	3	6	232521	232526	50 %	50 %	0 %	0 %	386083324
3743	NC_017562	CTT	2	6	232550	232555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083324
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3988	NC_017562	AC	3	6	246848	246853	50 %	0 %	0 %	50 %	386083333
3989	NC_017562	GCCC	2	8	246865	246872	0 %	0 %	25 %	75 %	386083333
3990	NC_017562	TGA	2	6	246887	246892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083333
3991	NC_017562	CAT	2	6	246936	246941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083333
3992	NC_017562	ACG	2	6	246955	246960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083333
3993	NC_017562	TA	3	6	247039	247044	50 %	50 %	0 %	0 %	386083333
3994	NC_017562	GAAGA	2	10	247314	247323	60 %	0 %	40 %	0 %	386083334
3995	NC_017562	ATG	2	6	247393	247398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083334
3996	NC_017562	ATC	2	6	247401	247406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083334
3997	NC_017562	TGCCT	2	10	247432	247441	0 %	40 %	20 %	40 %	386083334
3998	NC_017562	TAC	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083334
3999	NC_017562	AATC	2	8	247533	247540	50 %	25 %	0 %	25 %	386083334
4000	NC_017562	TCA	2	6	247594	247599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083334

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