MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017562	GCC	2	6	365763	365768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083439
6002	NC_017562	ATCGC	2	10	365783	365792	20 %	20 %	20 %	40 %	386083439
6003	NC_017562	TGGG	2	8	365815	365822	0 %	25 %	75 %	0 %	386083439
6004	NC_017562	CGTT	2	8	365832	365839	0 %	50 %	25 %	25 %	386083439
6005	NC_017562	TGT	3	9	366197	366205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083441
6006	NC_017562	GTG	2	6	366254	366259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083441
6007	NC_017562	CGC	2	6	366325	366330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083441
6008	NC_017562	G	7	7	366333	366339	0 %	0 %	100 %	0 %	386083441
6009	NC_017562	CTC	2	6	366407	366412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083441
6010	NC_017562	CGG	2	6	366415	366420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083441
6011	NC_017562	GCAC	2	8	366421	366428	25 %	0 %	25 %	50 %	386083441
6012	NC_017562	CT	3	6	366472	366477	0 %	50 %	0 %	50 %	386083441
6013	NC_017562	CCA	2	6	366490	366495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083441
6014	NC_017562	CAGG	2	8	366497	366504	25 %	0 %	50 %	25 %	386083441
6015	NC_017562	GCGGT	2	10	366509	366518	0 %	20 %	60 %	20 %	386083441
6016	NC_017562	AGGCGC	2	12	366577	366588	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386083441
6017	NC_017562	GGC	2	6	366624	366629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083441
6018	NC_017562	GGCA	2	8	366642	366649	25 %	0 %	50 %	25 %	386083441
6019	NC_017562	GC	3	6	366718	366723	0 %	0 %	50 %	50 %	386083441
6020	NC_017562	GC	3	6	366733	366738	0 %	0 %	50 %	50 %	386083441
6021	NC_017562	GGGT	2	8	366744	366751	0 %	25 %	75 %	0 %	386083441
6022	NC_017562	GCA	2	6	366803	366808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083441
6023	NC_017562	GAG	2	6	366828	366833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083441
6024	NC_017562	CAATC	2	10	366971	366980	40 %	20 %	0 %	40 %	386083441
6025	NC_017562	TGC	2	6	366985	366990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083441
6026	NC_017562	TGT	2	6	366991	366996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083441
6027	NC_017562	AAT	2	6	367006	367011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083441
6028	NC_017562	CAG	2	6	367029	367034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083441
6029	NC_017562	GGC	2	6	367080	367085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083441
6030	NC_017562	AAC	2	6	367117	367122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083441
6031	NC_017562	ATG	2	6	367146	367151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083441
6032	NC_017562	GCG	2	6	367195	367200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083441
6033	NC_017562	GC	3	6	367203	367208	0 %	0 %	50 %	50 %	386083441
6034	NC_017562	GCGG	2	8	367212	367219	0 %	0 %	75 %	25 %	386083441
6035	NC_017562	TGT	2	6	367241	367246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083441
6036	NC_017562	CG	3	6	367261	367266	0 %	0 %	50 %	50 %	386083441
6037	NC_017562	TG	3	6	367288	367293	0 %	50 %	50 %	0 %	386083441
6038	NC_017562	GGC	2	6	367299	367304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083441
6039	NC_017562	ATG	2	6	367344	367349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083441
6040	NC_017562	TGGC	3	12	367386	367397	0 %	25 %	50 %	25 %	386083441
6041	NC_017562	GCA	2	6	367406	367411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083441
6042	NC_017562	AATCC	2	10	367421	367430	40 %	20 %	0 %	40 %	386083441
6043	NC_017562	G	6	6	367504	367509	0 %	0 %	100 %	0 %	386083441
6044	NC_017562	ACAGGC	7	42	367592	367633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083442
6045	NC_017562	ATG	2	6	367638	367643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083442
6046	NC_017562	GTT	2	6	367710	367715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083442
6047	NC_017562	GCG	2	6	367987	367992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083443
6048	NC_017562	CA	3	6	368009	368014	50 %	0 %	0 %	50 %	386083443
6049	NC_017562	TGT	2	6	368065	368070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083443
6050	NC_017562	CGC	2	6	368078	368083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083443
6051	NC_017562	GCA	2	6	368089	368094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083443
6052	NC_017562	CGC	2	6	368129	368134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083443
6053	NC_017562	CTT	2	6	368145	368150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083443
6054	NC_017562	CTT	2	6	368165	368170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083443
6055	NC_017562	GGC	2	6	368286	368291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083443
6056	NC_017562	GCT	3	9	368382	368390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083443
6057	NC_017562	CAA	2	6	368432	368437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083443
6058	NC_017562	AAT	2	6	368469	368474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083443
6059	NC_017562	CTGT	2	8	368492	368499	0 %	50 %	25 %	25 %	386083443
6060	NC_017562	CGG	2	6	368501	368506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083443
6061	NC_017562	ATG	2	6	368565	368570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083443
6062	NC_017562	CCT	2	6	368587	368592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083443
6063	NC_017562	GTCG	2	8	368684	368691	0 %	25 %	50 %	25 %	386083443
6064	NC_017562	CAG	2	6	368733	368738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083443
6065	NC_017562	TGG	2	6	368767	368772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083443
6066	NC_017562	CA	3	6	368779	368784	50 %	0 %	0 %	50 %	386083443
6067	NC_017562	TTC	2	6	368814	368819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083443
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6069	NC_017562	ACC	3	9	368904	368912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083443
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6071	NC_017562	GAG	2	6	368952	368957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083443
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6075	NC_017562	CAGG	2	8	368999	369006	25 %	0 %	50 %	25 %	386083443
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6081	NC_017562	GCCA	2	8	369429	369436	25 %	0 %	25 %	50 %	386083443
6082	NC_017562	GCA	2	6	369451	369456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083443
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6086	NC_017562	GTTG	2	8	369843	369850	0 %	50 %	50 %	0 %	386083444
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6094	NC_017562	ACG	2	6	370230	370235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083444
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6101	NC_017562	TGC	2	6	370619	370624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083444
6102	NC_017562	CG	3	6	370641	370646	0 %	0 %	50 %	50 %	386083444
6103	NC_017562	GTA	2	6	370702	370707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083444
6104	NC_017562	TG	3	6	370747	370752	0 %	50 %	50 %	0 %	386083444
6105	NC_017562	CGG	2	6	370861	370866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083444
6106	NC_017562	GTG	2	6	370881	370886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083444
6107	NC_017562	ATG	2	6	370953	370958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083444
6108	NC_017562	TGG	2	6	371002	371007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083444
6109	NC_017562	TGC	2	6	371250	371255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083445
6110	NC_017562	GGAT	2	8	371298	371305	25 %	25 %	50 %	0 %	386083445
6111	NC_017562	AGG	2	6	371407	371412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083445
6112	NC_017562	GCGATG	2	12	371432	371443	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386083445
6113	NC_017562	GCA	3	9	371444	371452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083445
6114	NC_017562	TTA	2	6	371487	371492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083445
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6117	NC_017562	CCT	2	6	371999	372004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083446
6118	NC_017562	CG	3	6	372056	372061	0 %	0 %	50 %	50 %	386083446
6119	NC_017562	ACT	2	6	372184	372189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083446
6120	NC_017562	ATCGT	2	10	372310	372319	20 %	40 %	20 %	20 %	386083446
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6243	NC_017562	CAC	2	6	382352	382357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083460
6244	NC_017562	AGC	2	6	382379	382384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083460
6245	NC_017562	CAA	2	6	382443	382448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083460
6246	NC_017562	AG	4	8	383062	383069	50 %	0 %	50 %	0 %	386083461
6247	NC_017562	CAAC	2	8	383089	383096	50 %	0 %	0 %	50 %	386083461
6248	NC_017562	CCAGG	2	10	383141	383150	20 %	0 %	40 %	40 %	386083461
6249	NC_017562	CTG	2	6	383158	383163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083461
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6251	NC_017562	CAA	2	6	383204	383209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083461
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6253	NC_017562	CAC	2	6	383428	383433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083461
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6255	NC_017562	AGC	2	6	383454	383459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083461
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6261	NC_017562	CAA	2	6	384222	384227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083462
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6270	NC_017562	TCA	2	6	384550	384555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083463
6271	NC_017562	TCA	3	9	384571	384579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083463
6272	NC_017562	TCAA	2	8	384593	384600	50 %	25 %	0 %	25 %	386083463
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6274	NC_017562	AAACT	2	10	384613	384622	60 %	20 %	0 %	20 %	386083463
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6276	NC_017562	CGC	2	6	385608	385613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083464
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6485	NC_017562	CAT	2	6	396452	396457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083473
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