MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017562	GC	3	6	337317	337322	0 %	0 %	50 %	50 %	386083414
5502	NC_017562	GCG	2	6	337367	337372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083414
5503	NC_017562	GCA	2	6	337398	337403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083414
5504	NC_017562	GCC	2	6	337436	337441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083414
5505	NC_017562	AAC	2	6	337496	337501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083414
5506	NC_017562	GCGCT	2	10	337522	337531	0 %	20 %	40 %	40 %	386083414
5507	NC_017562	GTCCA	2	10	337532	337541	20 %	20 %	20 %	40 %	386083414
5508	NC_017562	TGC	2	6	337550	337555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083414
5509	NC_017562	GCCA	2	8	337706	337713	25 %	0 %	25 %	50 %	386083414
5510	NC_017562	ACA	2	6	337771	337776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083414
5511	NC_017562	GTT	2	6	337827	337832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083415
5512	NC_017562	CGC	2	6	337915	337920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083415
5513	NC_017562	GCC	2	6	337925	337930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083415
5514	NC_017562	CCG	2	6	338045	338050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083415
5515	NC_017562	TTG	2	6	338117	338122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083415
5516	NC_017562	CAT	2	6	338167	338172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083415
5517	NC_017562	AAT	2	6	338287	338292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083415
5518	NC_017562	ACA	2	6	338427	338432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083415
5519	NC_017562	TTCA	2	8	338461	338468	25 %	50 %	0 %	25 %	386083415
5520	NC_017562	GCAA	2	8	338498	338505	50 %	0 %	25 %	25 %	386083416
5521	NC_017562	TGA	2	6	338629	338634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083416
5522	NC_017562	TGG	2	6	338646	338651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083416
5523	NC_017562	CAC	2	6	338672	338677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083416
5524	NC_017562	CACC	2	8	338686	338693	25 %	0 %	0 %	75 %	386083416
5525	NC_017562	ACAA	2	8	338736	338743	75 %	0 %	0 %	25 %	386083416
5526	NC_017562	CGC	2	6	338786	338791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083416
5527	NC_017562	GTT	2	6	338848	338853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083416
5528	NC_017562	AGCA	2	8	338855	338862	50 %	0 %	25 %	25 %	386083416
5529	NC_017562	GC	3	6	338978	338983	0 %	0 %	50 %	50 %	386083416
5530	NC_017562	AC	3	6	339046	339051	50 %	0 %	0 %	50 %	386083416
5531	NC_017562	ACCA	2	8	339121	339128	50 %	0 %	0 %	50 %	386083416
5532	NC_017562	GAG	2	6	339192	339197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083416
5533	NC_017562	CAG	2	6	339281	339286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083417
5534	NC_017562	TGC	2	6	339287	339292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083417
5535	NC_017562	TGGC	2	8	339329	339336	0 %	25 %	50 %	25 %	386083417
5536	NC_017562	CA	3	6	339345	339350	50 %	0 %	0 %	50 %	386083417
5537	NC_017562	GC	3	6	339421	339426	0 %	0 %	50 %	50 %	386083417
5538	NC_017562	GCTT	2	8	339450	339457	0 %	50 %	25 %	25 %	386083417
5539	NC_017562	CGC	2	6	339518	339523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083417
5540	NC_017562	GGT	2	6	339530	339535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083417
5541	NC_017562	TGCGA	2	10	339587	339596	20 %	20 %	40 %	20 %	386083417
5542	NC_017562	GTT	2	6	339620	339625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083417
5543	NC_017562	CGC	2	6	340015	340020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083417
5544	NC_017562	TCA	2	6	340059	340064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083417
5545	NC_017562	ATG	2	6	340095	340100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083417
5546	NC_017562	CGG	2	6	340141	340146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083417
5547	NC_017562	A	6	6	340161	340166	100 %	0 %	0 %	0 %	386083417
5548	NC_017562	GGT	2	6	340184	340189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083417
5549	NC_017562	CCA	2	6	340191	340196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083417
5550	NC_017562	GCA	2	6	340198	340203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083417
5551	NC_017562	CGG	2	6	340255	340260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083417
5552	NC_017562	TGT	2	6	340278	340283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083417
5553	NC_017562	GTA	2	6	340324	340329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083417
5554	NC_017562	TAA	2	6	340370	340375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083417
5555	NC_017562	GGC	2	6	340376	340381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083417
5556	NC_017562	GGC	2	6	340387	340392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083417
5557	NC_017562	TGT	2	6	340479	340484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083417
5558	NC_017562	AGCC	2	8	340522	340529	25 %	0 %	25 %	50 %	386083417
5559	NC_017562	CAG	2	6	340552	340557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083417
5560	NC_017562	GA	3	6	340559	340564	50 %	0 %	50 %	0 %	386083417
5561	NC_017562	TGA	2	6	340758	340763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083418
5562	NC_017562	GCC	4	12	340828	340839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083418
5563	NC_017562	CGA	2	6	340887	340892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083418
5564	NC_017562	CA	3	6	340939	340944	50 %	0 %	0 %	50 %	386083418
5565	NC_017562	TTC	2	6	340948	340953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083418
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5569	NC_017562	GCC	2	6	341436	341441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083419
5570	NC_017562	GCA	2	6	341448	341453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083419
5571	NC_017562	CG	3	6	341480	341485	0 %	0 %	50 %	50 %	386083419
5572	NC_017562	TGAG	2	8	341528	341535	25 %	25 %	50 %	0 %	386083419
5573	NC_017562	GCG	3	9	341536	341544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083419
5574	NC_017562	AGATC	2	10	341649	341658	40 %	20 %	20 %	20 %	386083419
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5580	NC_017562	GCT	2	6	342027	342032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083419
5581	NC_017562	GGC	2	6	342123	342128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083419
5582	NC_017562	TCAA	2	8	342155	342162	50 %	25 %	0 %	25 %	386083419
5583	NC_017562	GCT	2	6	342229	342234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083419
5584	NC_017562	GGA	2	6	342297	342302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083419
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5586	NC_017562	CGTG	2	8	342369	342376	0 %	25 %	50 %	25 %	386083419
5587	NC_017562	CAG	2	6	342390	342395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083419
5588	NC_017562	GC	3	6	342669	342674	0 %	0 %	50 %	50 %	386083420
5589	NC_017562	TGGC	2	8	342741	342748	0 %	25 %	50 %	25 %	386083420
5590	NC_017562	CAG	2	6	342874	342879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083420
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5593	NC_017562	CTG	2	6	342964	342969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083420
5594	NC_017562	GCT	2	6	342999	343004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083420
5595	NC_017562	GCGT	2	8	343036	343043	0 %	25 %	50 %	25 %	386083420
5596	NC_017562	GGC	2	6	343106	343111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083420
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5599	NC_017562	TGC	2	6	343317	343322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083420
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5602	NC_017562	A	6	6	343511	343516	100 %	0 %	0 %	0 %	386083421
5603	NC_017562	ATC	2	6	343634	343639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083421
5604	NC_017562	TGAT	2	8	343652	343659	25 %	50 %	25 %	0 %	386083421
5605	NC_017562	GTG	2	6	343793	343798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083421
5606	NC_017562	CAC	2	6	343880	343885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083421
5607	NC_017562	CCG	2	6	343953	343958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083421
5608	NC_017562	TGT	2	6	344057	344062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083421
5609	NC_017562	GAT	2	6	344122	344127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083421
5610	NC_017562	CAA	2	6	344185	344190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083421
5611	NC_017562	CAG	2	6	344199	344204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083421
5612	NC_017562	CGGG	2	8	344211	344218	0 %	0 %	75 %	25 %	386083421
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5616	NC_017562	CG	3	6	344507	344512	0 %	0 %	50 %	50 %	386083422
5617	NC_017562	AGC	2	6	344590	344595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083422
5618	NC_017562	GCCT	2	8	344608	344615	0 %	25 %	25 %	50 %	386083422
5619	NC_017562	CGC	2	6	344644	344649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083422
5620	NC_017562	TGG	3	9	344745	344753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083422
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5622	NC_017562	CGT	2	6	344833	344838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083422
5623	NC_017562	GTC	2	6	344843	344848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083422
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5631	NC_017562	TGG	2	6	345432	345437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083423
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5743	NC_017562	ACCGA	2	10	351947	351956	40 %	0 %	20 %	40 %	386083430
5744	NC_017562	GCA	2	6	351992	351997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083430
5745	NC_017562	ACC	2	6	352027	352032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083430
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5747	NC_017562	ACCAC	2	10	352432	352441	40 %	0 %	0 %	60 %	386083431
5748	NC_017562	CT	3	6	352452	352457	0 %	50 %	0 %	50 %	386083431
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5847	NC_017562	CAG	2	6	357853	357858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083433
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5850	NC_017562	TGC	2	6	357924	357929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083433
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5854	NC_017562	TTG	2	6	358175	358180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083433
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5983	NC_017562	ATG	2	6	364323	364328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083438
5984	NC_017562	GCA	2	6	364330	364335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083438
5985	NC_017562	AT	3	6	364336	364341	50 %	50 %	0 %	0 %	386083438
5986	NC_017562	AC	3	6	364413	364418	50 %	0 %	0 %	50 %	386083438
5987	NC_017562	G	6	6	365057	365062	0 %	0 %	100 %	0 %	386083439
5988	NC_017562	CAG	2	6	365145	365150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083439
5989	NC_017562	CTG	2	6	365169	365174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083439
5990	NC_017562	GTT	2	6	365204	365209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083439
5991	NC_017562	GTC	2	6	365235	365240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083439
5992	NC_017562	TCC	2	6	365296	365301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083439
5993	NC_017562	GCCA	2	8	365313	365320	25 %	0 %	25 %	50 %	386083439
5994	NC_017562	CGG	2	6	365336	365341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083439
5995	NC_017562	GCAT	2	8	365368	365375	25 %	25 %	25 %	25 %	386083439
5996	NC_017562	GCC	2	6	365433	365438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083439
5997	NC_017562	GCG	2	6	365458	365463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083439
5998	NC_017562	TCG	2	6	365575	365580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083439
5999	NC_017562	GTC	2	6	365619	365624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083439
6000	NC_017562	TCA	2	6	365641	365646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083439

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