MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_016010	ACC	2	6	764116	764121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723599
16503	NC_016010	CGGTG	2	10	764136	764145	0 %	20 %	60 %	20 %	346723599
16504	NC_016010	GGCGCA	2	12	764819	764830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	346723600
16505	NC_016010	TCA	2	6	764908	764913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723600
16506	NC_016010	GC	3	6	764919	764924	0 %	0 %	50 %	50 %	346723600
16507	NC_016010	GGC	2	6	764931	764936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723600
16508	NC_016010	GCC	2	6	764982	764987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723600
16509	NC_016010	CAT	2	6	765017	765022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723600
16510	NC_016010	GCA	2	6	765043	765048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723600
16511	NC_016010	GCG	2	6	765109	765114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723600
16512	NC_016010	CGA	2	6	765161	765166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723600
16513	NC_016010	GTT	2	6	765176	765181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723600
16514	NC_016010	ATGGGC	2	12	765243	765254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	346723600
16515	NC_016010	ACG	2	6	765334	765339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723600
16516	NC_016010	AAG	2	6	765369	765374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723600
16517	NC_016010	GGC	2	6	765375	765380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723600
16518	NC_016010	GCC	2	6	765420	765425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723600
16519	NC_016010	GAA	2	6	765432	765437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723600
16520	NC_016010	GC	3	6	765486	765491	0 %	0 %	50 %	50 %	346723600
16521	NC_016010	GGT	2	6	765512	765517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723600
16522	NC_016010	GCA	2	6	765523	765528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723600
16523	NC_016010	GAC	2	6	765549	765554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723600
16524	NC_016010	CTGG	2	8	765572	765579	0 %	25 %	50 %	25 %	346723600
16525	NC_016010	ACA	2	6	765610	765615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723600
16526	NC_016010	AAC	2	6	765689	765694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723600
16527	NC_016010	GGC	2	6	765742	765747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
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16529	NC_016010	GAA	2	6	765763	765768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723601
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16531	NC_016010	GCG	2	6	765789	765794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
16532	NC_016010	CG	3	6	765894	765899	0 %	0 %	50 %	50 %	346723601
16533	NC_016010	CCG	2	6	765909	765914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723601
16534	NC_016010	CGG	2	6	766011	766016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
16535	NC_016010	TAC	2	6	766106	766111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723601
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16537	NC_016010	CAA	2	6	766141	766146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723601
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16539	NC_016010	ACACCG	2	12	766221	766232	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	346723601
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16542	NC_016010	GATC	2	8	766288	766295	25 %	25 %	25 %	25 %	346723601
16543	NC_016010	CGC	2	6	766303	766308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723601
16544	NC_016010	CCG	2	6	766428	766433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723601
16545	NC_016010	CGCGG	2	10	766438	766447	0 %	0 %	60 %	40 %	346723601
16546	NC_016010	GCCA	2	8	766460	766467	25 %	0 %	25 %	50 %	346723601
16547	NC_016010	GCC	2	6	766507	766512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723601
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16549	NC_016010	GCGT	2	8	766677	766684	0 %	25 %	50 %	25 %	346723601
16550	NC_016010	GCCG	2	8	766699	766706	0 %	0 %	50 %	50 %	346723601
16551	NC_016010	GCC	2	6	766739	766744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723601
16552	NC_016010	GCG	2	6	766760	766765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
16553	NC_016010	CTG	2	6	766862	766867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723601
16554	NC_016010	CGG	2	6	766926	766931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
16555	NC_016010	GGCG	2	8	766967	766974	0 %	0 %	75 %	25 %	346723601
16556	NC_016010	GGC	2	6	766983	766988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723601
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16558	NC_016010	CGC	3	9	767553	767561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723602
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16560	NC_016010	GCC	2	6	767644	767649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723602
16561	NC_016010	GCC	2	6	767658	767663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723602
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16565	NC_016010	CGC	2	6	767796	767801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723602
16566	NC_016010	CGA	2	6	767829	767834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723602
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16571	NC_016010	TGA	2	6	768026	768031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723602
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16583	NC_016010	GCT	2	6	768390	768395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723602
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16587	NC_016010	GCT	2	6	768513	768518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723602
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16590	NC_016010	TGG	2	6	768727	768732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723602
16591	NC_016010	GGT	2	6	768982	768987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723603
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16602	NC_016010	GAAAT	2	10	769314	769323	60 %	20 %	20 %	0 %	346723603
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16605	NC_016010	CTTC	2	8	769474	769481	0 %	50 %	0 %	50 %	346723603
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16976	NC_016010	TGC	2	6	785196	785201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723618
16977	NC_016010	CTG	2	6	785236	785241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723618
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16979	NC_016010	TGC	2	6	785277	785282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723618
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