MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15012	NC_016010	TCG	2	6	696653	696658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723546
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15120	NC_016010	GC	3	6	701390	701395	0 %	0 %	50 %	50 %	346723548
15121	NC_016010	CTT	2	6	701407	701412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723548
15122	NC_016010	CCA	2	6	701413	701418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723548
15123	NC_016010	GCG	2	6	701421	701426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723548
15124	NC_016010	GTG	2	6	701460	701465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723548
15125	NC_016010	ATG	2	6	701520	701525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723548
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15127	NC_016010	TGC	2	6	701566	701571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723548
15128	NC_016010	GCT	2	6	701629	701634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723548
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15131	NC_016010	GC	4	8	701721	701728	0 %	0 %	50 %	50 %	346723548
15132	NC_016010	GAT	2	6	701792	701797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723548
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15139	NC_016010	TTC	2	6	701954	701959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723548
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15141	NC_016010	TTC	2	6	701975	701980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723548
15142	NC_016010	ATC	2	6	702057	702062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723548
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15144	NC_016010	ATG	2	6	702201	702206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723548
15145	NC_016010	CTG	2	6	702236	702241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723548
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15148	NC_016010	GC	3	6	702344	702349	0 %	0 %	50 %	50 %	346723548
15149	NC_016010	CAGA	2	8	702367	702374	50 %	0 %	25 %	25 %	346723548
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15151	NC_016010	TCA	2	6	702469	702474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723548
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15154	NC_016010	CTG	2	6	702653	702658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723548
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15229	NC_016010	CGGC	2	8	706214	706221	0 %	0 %	50 %	50 %	346723550
15230	NC_016010	GTT	2	6	706229	706234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723550
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15232	NC_016010	TGC	2	6	706264	706269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723550
15233	NC_016010	GGT	2	6	706295	706300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723550
15234	NC_016010	TGG	2	6	706306	706311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723550
15235	NC_016010	ATGGTG	2	12	706317	706328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	346723550
15236	NC_016010	GTG	2	6	706365	706370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723550
15237	NC_016010	ACCC	2	8	706371	706378	25 %	0 %	0 %	75 %	346723550
15238	NC_016010	GTG	2	6	706392	706397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723550
15239	NC_016010	GGC	2	6	706439	706444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723550
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15241	NC_016010	TTC	2	6	706479	706484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723550
15242	NC_016010	TGC	2	6	706504	706509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723550
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15359	NC_016010	CGG	2	6	711799	711804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723554
15360	NC_016010	TCG	2	6	711825	711830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723554
15361	NC_016010	GCG	2	6	711833	711838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723554
15362	NC_016010	GCG	2	6	711844	711849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723554
15363	NC_016010	CGG	2	6	711850	711855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723554
15364	NC_016010	GAA	2	6	711896	711901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723554
15365	NC_016010	GCCC	2	8	711903	711910	0 %	0 %	25 %	75 %	346723554
15366	NC_016010	GACC	2	8	711916	711923	25 %	0 %	25 %	50 %	346723554
15367	NC_016010	CCG	2	6	711937	711942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723554
15368	NC_016010	GCA	2	6	711961	711966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723554
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15370	NC_016010	ATCGGC	2	12	712073	712084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	346723554
15371	NC_016010	CGG	3	9	712096	712104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723554
15372	NC_016010	CGCC	2	8	712134	712141	0 %	0 %	25 %	75 %	346723554
15373	NC_016010	GCA	2	6	712155	712160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723554
15374	NC_016010	GCT	2	6	712219	712224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723554
15375	NC_016010	TGC	2	6	712239	712244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723554
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15377	NC_016010	GC	3	6	712261	712266	0 %	0 %	50 %	50 %	346723554
15378	NC_016010	GGT	2	6	712271	712276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723554
15379	NC_016010	CTG	2	6	712301	712306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723554
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15383	NC_016010	GT	3	6	712362	712367	0 %	50 %	50 %	0 %	346723554
15384	NC_016010	CGA	2	6	712414	712419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723554
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15388	NC_016010	CGC	2	6	712610	712615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723554
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15391	NC_016010	GCGCC	2	10	712681	712690	0 %	0 %	40 %	60 %	346723554
15392	NC_016010	GAT	2	6	712861	712866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723555
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15394	NC_016010	AAT	2	6	713042	713047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	346723555
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15396	NC_016010	GC	3	6	713098	713103	0 %	0 %	50 %	50 %	346723555
15397	NC_016010	CTG	2	6	713192	713197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723555
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15402	NC_016010	GCCG	2	8	713323	713330	0 %	0 %	50 %	50 %	346723555
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15427	NC_016010	TGC	2	6	714682	714687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723557
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15431	NC_016010	GCT	2	6	714827	714832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723557
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15438	NC_016010	CATC	2	8	715196	715203	25 %	25 %	0 %	50 %	346723557
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15462	NC_016010	AGGGC	2	10	716135	716144	20 %	0 %	60 %	20 %	346723558
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15474	NC_016010	GC	3	6	716770	716775	0 %	0 %	50 %	50 %	346723559
15475	NC_016010	GTC	2	6	716882	716887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723559
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15477	NC_016010	CG	3	6	716986	716991	0 %	0 %	50 %	50 %	346723559
15478	NC_016010	TGC	2	6	716995	717000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723559
15479	NC_016010	CGT	3	9	717001	717009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723559
15480	NC_016010	TGGTGT	2	12	717010	717021	0 %	50 %	50 %	0 %	346723559
15481	NC_016010	GGT	2	6	717113	717118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723559
15482	NC_016010	CGC	2	6	717151	717156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723559
15483	NC_016010	TGC	2	6	717157	717162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723559
15484	NC_016010	GCA	2	6	717178	717183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723559
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15491	NC_016010	CGAC	2	8	717504	717511	25 %	0 %	25 %	50 %	346723560
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