MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_016010	GC	3	6	553069	553074	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12002	NC_016010	GCGG	2	8	553109	553116	0 %	0 %	75 %	25 %	346723424
12003	NC_016010	GTC	2	6	553134	553139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12004	NC_016010	TCCGGG	2	12	553171	553182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	346723424
12005	NC_016010	GCA	2	6	553205	553210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12006	NC_016010	CTG	2	6	553212	553217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12007	NC_016010	GCT	2	6	553223	553228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12008	NC_016010	GGC	2	6	553329	553334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
12009	NC_016010	GCAT	2	8	553351	553358	25 %	25 %	25 %	25 %	346723424
12010	NC_016010	GCA	2	6	553370	553375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12011	NC_016010	GTC	2	6	553404	553409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12012	NC_016010	CGA	2	6	553412	553417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12013	NC_016010	CGG	2	6	553439	553444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
12014	NC_016010	CGT	2	6	553460	553465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12015	NC_016010	GCG	2	6	553466	553471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
12016	NC_016010	TGC	2	6	553512	553517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12017	NC_016010	CG	3	6	553525	553530	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12018	NC_016010	GCC	2	6	553540	553545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723424
12019	NC_016010	CG	4	8	553548	553555	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12020	NC_016010	CGGCCG	2	12	553565	553576	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12021	NC_016010	CGC	2	6	553614	553619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723424
12022	NC_016010	CGGC	2	8	553682	553689	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12023	NC_016010	GTC	2	6	553728	553733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
12024	NC_016010	GTG	2	6	553738	553743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723424
12025	NC_016010	GAA	2	6	553744	553749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723424
12026	NC_016010	GGC	2	6	553761	553766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
12027	NC_016010	GCG	2	6	553842	553847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723425
12028	NC_016010	CAC	2	6	553902	553907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723425
12029	NC_016010	ACC	2	6	553908	553913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723425
12030	NC_016010	CAG	2	6	553922	553927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723425
12031	NC_016010	GCCA	2	8	553953	553960	25 %	0 %	25 %	50 %	346723425
12032	NC_016010	GCCAGT	2	12	553968	553979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	346723425
12033	NC_016010	GTG	2	6	553989	553994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723425
12034	NC_016010	GC	3	6	554061	554066	0 %	0 %	50 %	50 %	346723425
12035	NC_016010	GCC	2	6	554112	554117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723425
12036	NC_016010	GCGCCC	2	12	554121	554132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723425
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12041	NC_016010	CAC	2	6	554286	554291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723425
12042	NC_016010	CGG	2	6	554312	554317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723425
12043	NC_016010	CCAGC	2	10	554327	554336	20 %	0 %	20 %	60 %	346723425
12044	NC_016010	GGCC	2	8	554338	554345	0 %	0 %	50 %	50 %	346723425
12045	NC_016010	GCCA	2	8	554385	554392	25 %	0 %	25 %	50 %	346723425
12046	NC_016010	CAG	2	6	554396	554401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723425
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12049	NC_016010	GCT	2	6	554649	554654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723426
12050	NC_016010	TGGC	2	8	554668	554675	0 %	25 %	50 %	25 %	346723426
12051	NC_016010	GTG	2	6	554691	554696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723426
12052	NC_016010	TGG	2	6	554726	554731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723426
12053	NC_016010	GCA	2	6	554748	554753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723426
12054	NC_016010	GCA	2	6	554799	554804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723426
12055	NC_016010	CG	3	6	554842	554847	0 %	0 %	50 %	50 %	346723426
12056	NC_016010	CGA	2	6	554883	554888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723426
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12058	NC_016010	GC	3	6	554904	554909	0 %	0 %	50 %	50 %	346723426
12059	NC_016010	TGG	2	6	554933	554938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723426
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12063	NC_016010	GCC	2	6	555145	555150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723426
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12067	NC_016010	GTG	2	6	555338	555343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723427
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12072	NC_016010	GGT	2	6	555522	555527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723427
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12080	NC_016010	GCCG	2	8	555712	555719	0 %	0 %	50 %	50 %	346723427
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12098	NC_016010	CGCCA	2	10	556849	556858	20 %	0 %	20 %	60 %	346723429
12099	NC_016010	GC	5	10	556882	556891	0 %	0 %	50 %	50 %	346723429
12100	NC_016010	CGTG	2	8	556898	556905	0 %	25 %	50 %	25 %	346723429
12101	NC_016010	TGCG	2	8	556937	556944	0 %	25 %	50 %	25 %	346723429
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12105	NC_016010	TGC	2	6	557450	557455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723430
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12119	NC_016010	CAT	2	6	557946	557951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723430
12120	NC_016010	TCG	2	6	557969	557974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723430
12121	NC_016010	GCA	2	6	557979	557984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723430
12122	NC_016010	ATCT	2	8	557998	558005	25 %	50 %	0 %	25 %	346723430
12123	NC_016010	GTT	2	6	558054	558059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723430
12124	NC_016010	GCAA	2	8	558065	558072	50 %	0 %	25 %	25 %	346723430
12125	NC_016010	ATCAA	2	10	558116	558125	60 %	20 %	0 %	20 %	346723430
12126	NC_016010	GC	3	6	558196	558201	0 %	0 %	50 %	50 %	346723430
12127	NC_016010	CTG	2	6	558208	558213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723430
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12130	NC_016010	GCG	2	6	558309	558314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723430
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12132	NC_016010	TGG	2	6	558335	558340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723430
12133	NC_016010	ACGA	2	8	558391	558398	50 %	0 %	25 %	25 %	346723430
12134	NC_016010	AGC	2	6	558437	558442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723430
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12139	NC_016010	GCCA	2	8	558918	558925	25 %	0 %	25 %	50 %	346723431
12140	NC_016010	TTG	2	6	558926	558931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723431
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12142	NC_016010	GATC	2	8	559048	559055	25 %	25 %	25 %	25 %	346723431
12143	NC_016010	GCC	3	9	559064	559072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723431
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12146	NC_016010	CG	3	6	559230	559235	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12147	NC_016010	CAT	2	6	559246	559251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723431
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12149	NC_016010	TGC	2	6	559278	559283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723431
12150	NC_016010	GCCAG	2	10	559290	559299	20 %	0 %	40 %	40 %	346723431
12151	NC_016010	TCG	2	6	559335	559340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723431
12152	NC_016010	GC	3	6	559370	559375	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12153	NC_016010	GC	3	6	559425	559430	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12154	NC_016010	GC	3	6	559449	559454	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12155	NC_016010	CG	3	6	559471	559476	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12156	NC_016010	CG	3	6	559522	559527	0 %	0 %	50 %	50 %	346723431
12157	NC_016010	GCGCT	2	10	559551	559560	0 %	20 %	40 %	40 %	346723431
12158	NC_016010	GCC	2	6	559585	559590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723431
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12195	NC_016010	TGC	2	6	561109	561114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723434
12196	NC_016010	CTG	2	6	561117	561122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723434
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12214	NC_016010	GTA	2	6	562335	562340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723435
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12223	NC_016010	CCG	2	6	562664	562669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723435
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12225	NC_016010	CG	3	6	562715	562720	0 %	0 %	50 %	50 %	346723435
12226	NC_016010	CAC	2	6	562767	562772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723435
12227	NC_016010	GAT	2	6	562809	562814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723435
12228	NC_016010	GCT	2	6	562832	562837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723435
12229	NC_016010	GCGCC	2	10	562871	562880	0 %	0 %	40 %	60 %	346723435
12230	NC_016010	CAG	2	6	562902	562907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723435
12231	NC_016010	CAG	2	6	562980	562985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723435
12232	NC_016010	CAGCGC	2	12	563013	563024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	346723435
12233	NC_016010	CTG	2	6	563040	563045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723435
12234	NC_016010	GCC	2	6	563046	563051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723435
12235	NC_016010	CGA	2	6	563099	563104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723435
12236	NC_016010	GCG	2	6	563151	563156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723435
12237	NC_016010	ATG	2	6	563167	563172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723435
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12239	NC_016010	GC	3	6	563216	563221	0 %	0 %	50 %	50 %	346723435
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12477	NC_016010	GCC	2	6	572919	572924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723442
12478	NC_016010	ACG	2	6	572928	572933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723442
12479	NC_016010	TGGC	2	8	572995	573002	0 %	25 %	50 %	25 %	346723442
12480	NC_016010	GC	3	6	573008	573013	0 %	0 %	50 %	50 %	346723442
12481	NC_016010	GCCTG	2	10	573042	573051	0 %	20 %	40 %	40 %	346723442
12482	NC_016010	GGC	2	6	573066	573071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723442
12483	NC_016010	GC	3	6	573076	573081	0 %	0 %	50 %	50 %	346723442
12484	NC_016010	TGC	3	9	573306	573314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723443
12485	NC_016010	GAA	2	6	573356	573361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723443
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12489	NC_016010	CCAC	2	8	573495	573502	25 %	0 %	0 %	75 %	346723443
12490	NC_016010	GTG	2	6	573524	573529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723443
12491	NC_016010	GGT	2	6	573550	573555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723443
12492	NC_016010	GCC	2	6	573557	573562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723443
12493	NC_016010	CGC	2	6	573585	573590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723443
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12495	NC_016010	TGC	2	6	573666	573671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723443
12496	NC_016010	TGCGC	2	10	573673	573682	0 %	20 %	40 %	40 %	346723443
12497	NC_016010	GC	3	6	573737	573742	0 %	0 %	50 %	50 %	346723443
12498	NC_016010	CCCG	2	8	573774	573781	0 %	0 %	25 %	75 %	346723443
12499	NC_016010	GTG	2	6	573827	573832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723443
12500	NC_016010	AGC	2	6	573945	573950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723443

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