MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016010	CCTG	2	8	527779	527786	0 %	25 %	25 %	50 %	346723397
11502	NC_016010	TGC	2	6	527805	527810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723397
11503	NC_016010	GTT	2	6	527972	527977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723397
11504	NC_016010	GC	3	6	528041	528046	0 %	0 %	50 %	50 %	346723397
11505	NC_016010	CTT	2	6	528130	528135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723397
11506	NC_016010	CTGC	2	8	528223	528230	0 %	25 %	25 %	50 %	346723397
11507	NC_016010	AGC	2	6	528231	528236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723397
11508	NC_016010	GTGTT	2	10	528444	528453	0 %	60 %	40 %	0 %	346723398
11509	NC_016010	GTC	2	6	528536	528541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723398
11510	NC_016010	CG	3	6	528553	528558	0 %	0 %	50 %	50 %	346723398
11511	NC_016010	GAGATG	2	12	528567	528578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	346723398
11512	NC_016010	CG	3	6	528598	528603	0 %	0 %	50 %	50 %	346723398
11513	NC_016010	CCG	2	6	528630	528635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723398
11514	NC_016010	CAG	3	9	528704	528712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723398
11515	NC_016010	CGG	2	6	528758	528763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723398
11516	NC_016010	CGC	2	6	528808	528813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723398
11517	NC_016010	CTG	2	6	528838	528843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723398
11518	NC_016010	CTGC	2	8	528970	528977	0 %	25 %	25 %	50 %	346723398
11519	NC_016010	GTC	2	6	529117	529122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723399
11520	NC_016010	CGC	2	6	529176	529181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723399
11521	NC_016010	GATC	2	8	529344	529351	25 %	25 %	25 %	25 %	346723399
11522	NC_016010	CGG	2	6	529434	529439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723399
11523	NC_016010	GTC	2	6	529448	529453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723399
11524	NC_016010	GGC	2	6	529492	529497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723399
11525	NC_016010	CTG	2	6	529518	529523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723399
11526	NC_016010	GC	3	6	529963	529968	0 %	0 %	50 %	50 %	346723400
11527	NC_016010	TGC	2	6	529991	529996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723400
11528	NC_016010	GCG	2	6	530106	530111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723400
11529	NC_016010	GTA	2	6	530114	530119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723400
11530	NC_016010	GCT	2	6	530201	530206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723400
11531	NC_016010	GAA	2	6	530264	530269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723400
11532	NC_016010	CTG	2	6	530332	530337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723400
11533	NC_016010	TGC	2	6	530420	530425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723400
11534	NC_016010	GTT	2	6	530432	530437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723400
11535	NC_016010	TGA	2	6	530459	530464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723400
11536	NC_016010	TGCGC	2	10	530534	530543	0 %	20 %	40 %	40 %	346723400
11537	NC_016010	AGGC	2	8	530545	530552	25 %	0 %	50 %	25 %	346723400
11538	NC_016010	AATC	2	8	530798	530805	50 %	25 %	0 %	25 %	346723401
11539	NC_016010	CGAT	2	8	530858	530865	25 %	25 %	25 %	25 %	346723401
11540	NC_016010	CGGC	2	8	530871	530878	0 %	0 %	50 %	50 %	346723401
11541	NC_016010	CGGGC	2	10	530884	530893	0 %	0 %	60 %	40 %	346723401
11542	NC_016010	CGG	2	6	530953	530958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723401
11543	NC_016010	CGGC	2	8	530982	530989	0 %	0 %	50 %	50 %	346723401
11544	NC_016010	ATG	2	6	531026	531031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723401
11545	NC_016010	GGC	2	6	531036	531041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723401
11546	NC_016010	CATCGG	2	12	531042	531053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	346723401
11547	NC_016010	GCA	2	6	531098	531103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723401
11548	NC_016010	TCG	2	6	531203	531208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723401
11549	NC_016010	CACCGG	2	12	531367	531378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	346723401
11550	NC_016010	CCA	2	6	531462	531467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723401
11551	NC_016010	GGT	2	6	531468	531473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723401
11552	NC_016010	TCGGG	2	10	531546	531555	0 %	20 %	60 %	20 %	346723401
11553	NC_016010	CAC	2	6	531559	531564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723401
11554	NC_016010	CGGT	2	8	531581	531588	0 %	25 %	50 %	25 %	346723401
11555	NC_016010	CCA	2	6	531591	531596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723401
11556	NC_016010	CGG	2	6	531624	531629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723401
11557	NC_016010	GGT	2	6	531998	532003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723402
11558	NC_016010	GCT	2	6	532007	532012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723402
11559	NC_016010	GC	3	6	532061	532066	0 %	0 %	50 %	50 %	346723402
11560	NC_016010	CCA	2	6	532105	532110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723402
11561	NC_016010	ACC	2	6	532153	532158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723402
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11563	NC_016010	GCCA	2	8	532212	532219	25 %	0 %	25 %	50 %	346723402
11564	NC_016010	CGC	2	6	532226	532231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723402
11565	NC_016010	CCG	2	6	532455	532460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723403
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11568	NC_016010	AGCC	2	8	532702	532709	25 %	0 %	25 %	50 %	346723403
11569	NC_016010	TGC	2	6	532806	532811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723403
11570	NC_016010	GC	3	6	532894	532899	0 %	0 %	50 %	50 %	346723403
11571	NC_016010	CCG	2	6	532903	532908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723403
11572	NC_016010	CGACG	2	10	532915	532924	20 %	0 %	40 %	40 %	346723403
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11574	NC_016010	CGGC	2	8	532989	532996	0 %	0 %	50 %	50 %	346723403
11575	NC_016010	TCG	2	6	533007	533012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723403
11576	NC_016010	GC	3	6	533065	533070	0 %	0 %	50 %	50 %	346723403
11577	NC_016010	CGC	2	6	533102	533107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723404
11578	NC_016010	GCT	2	6	533139	533144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723404
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11580	NC_016010	GGCC	2	8	533199	533206	0 %	0 %	50 %	50 %	346723404
11581	NC_016010	GGA	2	6	533208	533213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723404
11582	NC_016010	GC	3	6	533217	533222	0 %	0 %	50 %	50 %	346723404
11583	NC_016010	ACT	2	6	533309	533314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723404
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11585	NC_016010	CCGG	2	8	533361	533368	0 %	0 %	50 %	50 %	346723404
11586	NC_016010	GC	3	6	533371	533376	0 %	0 %	50 %	50 %	346723404
11587	NC_016010	GCGG	2	8	533438	533445	0 %	0 %	75 %	25 %	346723404
11588	NC_016010	CTGGA	2	10	533461	533470	20 %	20 %	40 %	20 %	346723404
11589	NC_016010	GC	3	6	533506	533511	0 %	0 %	50 %	50 %	346723404
11590	NC_016010	CTG	2	6	533520	533525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723404
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11592	NC_016010	GGT	2	6	533992	533997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723405
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11594	NC_016010	GCC	3	9	534032	534040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723405
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11601	NC_016010	TCA	2	6	534321	534326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723405
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11603	NC_016010	CGA	2	6	534475	534480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723405
11604	NC_016010	CTG	2	6	534485	534490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723405
11605	NC_016010	GCC	2	6	534527	534532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723405
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11608	NC_016010	CAT	2	6	535167	535172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723406
11609	NC_016010	CGGCG	2	10	535181	535190	0 %	0 %	60 %	40 %	346723406
11610	NC_016010	GTC	2	6	535240	535245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723406
11611	NC_016010	GC	3	6	535290	535295	0 %	0 %	50 %	50 %	346723406
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11615	NC_016010	GC	3	6	535536	535541	0 %	0 %	50 %	50 %	346723406
11616	NC_016010	GCG	2	6	535583	535588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723406
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11620	NC_016010	GC	3	6	535698	535703	0 %	0 %	50 %	50 %	346723406
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11737	NC_016010	GCCG	2	8	541221	541228	0 %	0 %	50 %	50 %	346723412
11738	NC_016010	TTC	2	6	541291	541296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723412
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11860	NC_016010	GCG	2	6	547972	547977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723420
11861	NC_016010	CG	3	6	548023	548028	0 %	0 %	50 %	50 %	346723420
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11883	NC_016010	GCGG	2	8	549609	549616	0 %	0 %	75 %	25 %	346723423
11884	NC_016010	GGA	2	6	549672	549677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723423
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11892	NC_016010	GCT	2	6	549909	549914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723423
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11976	NC_016010	GCA	2	6	552434	552439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11977	NC_016010	CGC	2	6	552461	552466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723424
11978	NC_016010	CGGCCA	2	12	552467	552478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	346723424
11979	NC_016010	GTT	2	6	552524	552529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723424
11980	NC_016010	CTG	2	6	552531	552536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11981	NC_016010	CTGG	2	8	552543	552550	0 %	25 %	50 %	25 %	346723424
11982	NC_016010	AGGT	2	8	552556	552563	25 %	25 %	50 %	0 %	346723424
11983	NC_016010	GC	3	6	552620	552625	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
11984	NC_016010	GTC	2	6	552633	552638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11985	NC_016010	GCGCA	2	10	552670	552679	20 %	0 %	40 %	40 %	346723424
11986	NC_016010	TTC	3	9	552690	552698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723424
11987	NC_016010	CTG	2	6	552747	552752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11988	NC_016010	GGCT	2	8	552758	552765	0 %	25 %	50 %	25 %	346723424
11989	NC_016010	CAG	3	9	552783	552791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11990	NC_016010	TGT	2	6	552797	552802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723424
11991	NC_016010	GC	3	6	552810	552815	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
11992	NC_016010	GCG	2	6	552832	552837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
11993	NC_016010	TCA	2	6	552863	552868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723424
11994	NC_016010	GGC	2	6	552879	552884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723424
11995	NC_016010	GC	3	6	552911	552916	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
11996	NC_016010	GAA	2	6	552930	552935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723424
11997	NC_016010	GCC	2	6	552939	552944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723424
11998	NC_016010	TGC	2	6	553019	553024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424
11999	NC_016010	GC	4	8	553023	553030	0 %	0 %	50 %	50 %	346723424
12000	NC_016010	TGC	2	6	553048	553053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723424

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