MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 127445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	GAATG	2	10	328	337	40 %	20 %	40 %	0 %	154243959
2	NC_009720	CGA	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
3	NC_009720	ACC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
4	NC_009720	CGTC	2	8	368	375	0 %	25 %	25 %	50 %	154243959
5	NC_009720	GAG	2	6	399	404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
6	NC_009720	CCG	2	6	448	453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
7	NC_009720	GAG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
8	NC_009720	GCG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
9	NC_009720	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
10	NC_009720	CCCGT	2	10	592	601	0 %	20 %	20 %	60 %	154243959
11	NC_009720	GGT	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
12	NC_009720	CAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
13	NC_009720	CGG	2	6	766	771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
14	NC_009720	C	6	6	814	819	0 %	0 %	0 %	100 %	154243959
15	NC_009720	CG	3	6	824	829	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
16	NC_009720	GTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
17	NC_009720	CGC	3	9	878	886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
18	NC_009720	CGGC	2	8	1010	1017	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
19	NC_009720	CAC	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
20	NC_009720	CCG	2	6	1033	1038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
21	NC_009720	GCC	2	6	1062	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
22	NC_009720	CGA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
23	NC_009720	CAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243959
24	NC_009720	CAG	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
25	NC_009720	CTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
26	NC_009720	CGG	2	6	1202	1207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
27	NC_009720	GGT	3	9	1214	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
28	NC_009720	GGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
29	NC_009720	CGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
30	NC_009720	CGG	2	6	1286	1291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
31	NC_009720	TGG	3	9	1294	1302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
32	NC_009720	GGA	3	9	1316	1324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
33	NC_009720	AGC	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
34	NC_009720	GC	3	6	1416	1421	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
35	NC_009720	GC	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
36	NC_009720	GCT	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
37	NC_009720	GCGGGT	2	12	1559	1570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	154243959
38	NC_009720	GAC	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
39	NC_009720	GTG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
40	NC_009720	CG	4	8	1612	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
41	NC_009720	CTG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
42	NC_009720	GTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
43	NC_009720	GCC	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
44	NC_009720	ACCAC	2	10	1741	1750	40 %	0 %	0 %	60 %	154243959
45	NC_009720	TGC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
46	NC_009720	GC	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	154243960
47	NC_009720	CGT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
48	NC_009720	GCG	2	6	2338	2343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
49	NC_009720	CGACCT	2	12	2413	2424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154243960
50	NC_009720	GGT	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
51	NC_009720	CCA	2	6	2469	2474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
52	NC_009720	GCCC	2	8	2479	2486	0 %	0 %	25 %	75 %	154243960
53	NC_009720	GGCG	2	8	2542	2549	0 %	0 %	75 %	25 %	154243960
54	NC_009720	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
55	NC_009720	TGG	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
56	NC_009720	GAG	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
57	NC_009720	ATCT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	0 %	25 %	154243960
58	NC_009720	CGG	2	6	2773	2778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
59	NC_009720	TGC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
60	NC_009720	CGG	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
61	NC_009720	CGGC	2	8	2853	2860	0 %	0 %	50 %	50 %	154243960
62	NC_009720	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
63	NC_009720	GGA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
64	NC_009720	AGG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
65	NC_009720	CCA	3	9	2949	2957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
66	NC_009720	CGC	3	9	3082	3090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
67	NC_009720	AGCG	2	8	3116	3123	25 %	0 %	50 %	25 %	154243960
68	NC_009720	CGGG	2	8	3124	3131	0 %	0 %	75 %	25 %	154243960
69	NC_009720	CCG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
70	NC_009720	CTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
71	NC_009720	CTGAA	2	10	3300	3309	40 %	20 %	20 %	20 %	154243960
72	NC_009720	CCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
73	NC_009720	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
74	NC_009720	GGT	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
75	NC_009720	TCCT	2	8	3718	3725	0 %	50 %	0 %	50 %	154243961
76	NC_009720	CT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	0 %	50 %	154243961
77	NC_009720	CCGG	2	8	3731	3738	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
78	NC_009720	GCG	2	6	3744	3749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
79	NC_009720	CG	3	6	3775	3780	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
80	NC_009720	GCC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
81	NC_009720	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
82	NC_009720	GATG	2	8	3972	3979	25 %	25 %	50 %	0 %	154243961
83	NC_009720	GCC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
84	NC_009720	CGG	2	6	4006	4011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
85	NC_009720	GCGCT	2	10	4081	4090	0 %	20 %	40 %	40 %	154243961
86	NC_009720	GGA	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243961
87	NC_009720	GC	3	6	4123	4128	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
88	NC_009720	GTGGCG	2	12	4168	4179	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	154243961
89	NC_009720	GCG	3	9	4177	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
90	NC_009720	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
91	NC_009720	CGA	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
92	NC_009720	TGGAGG	2	12	4313	4324	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	154243961
93	NC_009720	CCT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243961
94	NC_009720	GCG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
95	NC_009720	CGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
96	NC_009720	GC	3	6	4444	4449	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
97	NC_009720	TGG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
98	NC_009720	GAC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
99	NC_009720	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
100	NC_009720	CGC	2	6	4572	4577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
101	NC_009720	GC	3	6	4576	4581	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
102	NC_009720	GC	3	6	4616	4621	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
103	NC_009720	CGGG	2	8	4704	4711	0 %	0 %	75 %	25 %	154243961
104	NC_009720	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243962
105	NC_009720	CGG	3	9	4902	4910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
106	NC_009720	TGC	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
107	NC_009720	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
108	NC_009720	CCA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243962
109	NC_009720	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
110	NC_009720	CGG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
111	NC_009720	CCTC	2	8	5064	5071	0 %	25 %	0 %	75 %	154243962
112	NC_009720	GAAGCT	2	12	5080	5091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154243962
113	NC_009720	CTG	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
114	NC_009720	ACA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243962
115	NC_009720	CAA	3	9	5308	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243962
116	NC_009720	ACG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
117	NC_009720	CG	4	8	5329	5336	0 %	0 %	50 %	50 %	154243962
118	NC_009720	AGC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
119	NC_009720	TCT	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243962
120	NC_009720	GAA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243962
121	NC_009720	CGC	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243962
122	NC_009720	AAG	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243962
123	NC_009720	CGA	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
124	NC_009720	CG	3	6	5540	5545	0 %	0 %	50 %	50 %	154243962
125	NC_009720	GTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243962
126	NC_009720	ACC	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243962
127	NC_009720	GCG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
128	NC_009720	ACCGAC	2	12	5753	5764	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	154243962
129	NC_009720	CG	3	6	5766	5771	0 %	0 %	50 %	50 %	154243962
130	NC_009720	TGG	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243962
131	NC_009720	ATCT	2	8	5849	5856	25 %	50 %	0 %	25 %	154243962
132	NC_009720	TCCGCC	2	12	5879	5890	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	154243962
133	NC_009720	CGC	2	6	5917	5922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243962
134	NC_009720	TCG	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
135	NC_009720	CGG	2	6	6028	6033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
136	NC_009720	TCA	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243963
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248	NC_009720	GAGG	2	8	10621	10628	25 %	0 %	75 %	0 %	154243968
249	NC_009720	GCTTGC	2	12	10632	10643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243968
250	NC_009720	CGGG	2	8	10644	10651	0 %	0 %	75 %	25 %	154243968
251	NC_009720	CCAG	2	8	10668	10675	25 %	0 %	25 %	50 %	154243968
252	NC_009720	CTG	2	6	10705	10710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243968
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255	NC_009720	GGT	2	6	10773	10778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243968
256	NC_009720	GCG	2	6	10797	10802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
257	NC_009720	GTGGA	2	10	10808	10817	20 %	20 %	60 %	0 %	154243968
258	NC_009720	AGC	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243968
259	NC_009720	AGC	2	6	10871	10876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243968
260	NC_009720	TTC	2	6	10919	10924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243968
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262	NC_009720	TGG	2	6	10944	10949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243968
263	NC_009720	CGG	2	6	10950	10955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
264	NC_009720	CGG	2	6	10988	10993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
265	NC_009720	GCG	2	6	11018	11023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
266	NC_009720	GGC	2	6	11032	11037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
267	NC_009720	TGGCGG	2	12	11106	11117	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	154243968
268	NC_009720	GCTC	2	8	11136	11143	0 %	25 %	25 %	50 %	154243968
269	NC_009720	CGG	2	6	11255	11260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
270	NC_009720	GGTGC	2	10	11375	11384	0 %	20 %	60 %	20 %	154243969
271	NC_009720	TGCAT	2	10	11402	11411	20 %	40 %	20 %	20 %	154243969
272	NC_009720	CTC	2	6	11440	11445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243969
273	NC_009720	GC	3	6	11459	11464	0 %	0 %	50 %	50 %	154243969
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277	NC_009720	GGC	2	6	11602	11607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243969
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282	NC_009720	CGG	2	6	11721	11726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243969
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287	NC_009720	CGG	2	6	11847	11852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243969
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300	NC_009720	TGG	2	6	12159	12164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243969
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303	NC_009720	GCGGGG	2	12	12249	12260	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	154243969
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332	NC_009720	GCC	2	6	13533	13538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243971
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379	NC_009720	CG	3	6	15315	15320	0 %	0 %	50 %	50 %	154243972
380	NC_009720	TGC	2	6	15350	15355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243972
381	NC_009720	GCT	2	6	15357	15362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243972
382	NC_009720	TGG	2	6	15365	15370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243972
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384	NC_009720	CTT	2	6	15450	15455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243972
385	NC_009720	CGC	2	6	15462	15467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243972
386	NC_009720	GC	3	6	15471	15476	0 %	0 %	50 %	50 %	154243972
387	NC_009720	GTG	2	6	15514	15519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243972
388	NC_009720	CTG	3	9	15526	15534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243972
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