MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 chromosome

Total Repeats: 111163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007086	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	66766353
2	NC_007086	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	66766353
3	NC_007086	TTG	2	6	175	180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766353
4	NC_007086	CGG	2	6	322	327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
5	NC_007086	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
6	NC_007086	CA	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	66766353
7	NC_007086	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
8	NC_007086	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
9	NC_007086	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
10	NC_007086	CGG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
11	NC_007086	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766353
12	NC_007086	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766353
13	NC_007086	CG	3	6	600	605	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
14	NC_007086	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
15	NC_007086	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
16	NC_007086	T	6	6	681	686	0 %	100 %	0 %	0 %	66766353
17	NC_007086	CGCA	2	8	699	706	25 %	0 %	25 %	50 %	66766353
18	NC_007086	GGA	2	6	707	712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766353
19	NC_007086	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766353
20	NC_007086	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766353
21	NC_007086	CG	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
22	NC_007086	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	66766353
23	NC_007086	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766353
24	NC_007086	GCG	2	6	873	878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
25	NC_007086	GC	3	6	894	899	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
26	NC_007086	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
27	NC_007086	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
28	NC_007086	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766353
29	NC_007086	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766353
30	NC_007086	TGCG	2	8	1066	1073	0 %	25 %	50 %	25 %	66766353
31	NC_007086	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766353
32	NC_007086	ACT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766353
33	NC_007086	GC	3	6	1176	1181	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
34	NC_007086	GCCG	2	8	1254	1261	0 %	0 %	50 %	50 %	66766353
35	NC_007086	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	66766353
36	NC_007086	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
37	NC_007086	GGT	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766354
38	NC_007086	GTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
39	NC_007086	AAC	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766354
40	NC_007086	GACC	2	8	1783	1790	25 %	0 %	25 %	50 %	66766354
41	NC_007086	GC	3	6	1856	1861	0 %	0 %	50 %	50 %	66766354
42	NC_007086	CCTG	2	8	1885	1892	0 %	25 %	25 %	50 %	66766354
43	NC_007086	CAG	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
44	NC_007086	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66766354
45	NC_007086	CTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
46	NC_007086	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
47	NC_007086	ATC	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766354
48	NC_007086	GCT	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
49	NC_007086	CTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
50	NC_007086	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
51	NC_007086	GAGCTG	2	12	2288	2299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66766354
52	NC_007086	GCG	2	6	2325	2330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
53	NC_007086	TCACCT	2	12	2334	2345	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	66766354
54	NC_007086	TGCG	2	8	2433	2440	0 %	25 %	50 %	25 %	66766354
55	NC_007086	GCG	2	6	2453	2458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
56	NC_007086	CGAA	2	8	2466	2473	50 %	0 %	25 %	25 %	66766354
57	NC_007086	GC	3	6	2523	2528	0 %	0 %	50 %	50 %	66766354
58	NC_007086	GAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766354
59	NC_007086	GAT	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766354
60	NC_007086	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
61	NC_007086	CT	3	6	2627	2632	0 %	50 %	0 %	50 %	66766354
62	NC_007086	CGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
63	NC_007086	TCG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
64	NC_007086	AGC	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
65	NC_007086	CGT	2	6	2722	2727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
66	NC_007086	CGAT	2	8	3627	3634	25 %	25 %	25 %	25 %	66766355
67	NC_007086	TCCA	2	8	3651	3658	25 %	25 %	0 %	50 %	66766355
68	NC_007086	TCG	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766355
69	NC_007086	CCAG	2	8	3693	3700	25 %	0 %	25 %	50 %	66766355
70	NC_007086	GCC	2	6	3928	3933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766355
71	NC_007086	TG	3	6	3967	3972	0 %	50 %	50 %	0 %	66766355
72	NC_007086	GGT	2	6	3983	3988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766355
73	NC_007086	GGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766355
74	NC_007086	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766355
75	NC_007086	CG	4	8	4106	4113	0 %	0 %	50 %	50 %	66766355
76	NC_007086	GCC	2	6	4321	4326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766355
77	NC_007086	CTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766355
78	NC_007086	GTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766355
79	NC_007086	GCCT	2	8	4488	4495	0 %	25 %	25 %	50 %	66766355
80	NC_007086	GGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766355
81	NC_007086	CAT	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766355
82	NC_007086	GAT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766355
83	NC_007086	TCA	3	9	4580	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766355
84	NC_007086	C	6	6	4653	4658	0 %	0 %	0 %	100 %	66766355
85	NC_007086	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
86	NC_007086	TGC	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
87	NC_007086	ACG	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
88	NC_007086	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
89	NC_007086	GGT	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
90	NC_007086	CGA	2	6	5026	5031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
91	NC_007086	GAA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766356
92	NC_007086	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
93	NC_007086	CGG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
94	NC_007086	CGA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
95	NC_007086	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
96	NC_007086	GGT	2	6	5245	5250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
97	NC_007086	CAG	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
98	NC_007086	AGC	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
99	NC_007086	CAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
100	NC_007086	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
101	NC_007086	GC	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
102	NC_007086	CGA	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
103	NC_007086	GCG	2	6	5505	5510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
104	NC_007086	CGA	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
105	NC_007086	GGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
106	NC_007086	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
107	NC_007086	GGC	2	6	5714	5719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
108	NC_007086	CG	3	6	5751	5756	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
109	NC_007086	CGA	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
110	NC_007086	CGG	2	6	5922	5927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
111	NC_007086	GC	3	6	5945	5950	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
112	NC_007086	CGAA	2	8	5976	5983	50 %	0 %	25 %	25 %	66766356
113	NC_007086	TCG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
114	NC_007086	GCC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
115	NC_007086	GCC	2	6	6032	6037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
116	NC_007086	GC	3	6	6044	6049	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
117	NC_007086	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
118	NC_007086	GC	3	6	6069	6074	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
119	NC_007086	TCG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
120	NC_007086	CCGCAA	2	12	6187	6198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	66766356
121	NC_007086	TGC	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
122	NC_007086	CG	4	8	6245	6252	0 %	0 %	50 %	50 %	66766356
123	NC_007086	CGA	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
124	NC_007086	ACC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
125	NC_007086	CAT	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766356
126	NC_007086	TGA	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766356
127	NC_007086	CCGACG	2	12	6372	6383	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	66766356
128	NC_007086	GCT	3	9	6406	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
129	NC_007086	TTC	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766356
130	NC_007086	CTACAT	2	12	6457	6468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766356
131	NC_007086	GCC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
132	NC_007086	GAC	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
133	NC_007086	CAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
134	NC_007086	CGA	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
135	NC_007086	GCC	2	6	6598	6603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
136	NC_007086	CTG	3	9	6629	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
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263	NC_007086	CGC	3	9	11335	11343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766361
264	NC_007086	CCT	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66766361
265	NC_007086	TCA	2	6	11496	11501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766361
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267	NC_007086	AGC	2	6	11601	11606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766361
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396	NC_007086	CTG	2	6	17932	17937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766367
397	NC_007086	GC	3	6	17938	17943	0 %	0 %	50 %	50 %	66766367
398	NC_007086	CGC	2	6	17983	17988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766367
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