MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020798	CGG	2	6	50	55	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020798	GCG	2	6	109	114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020798	GT	3	6	121	126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020798	CTCG	2	8	131	138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020798	CCG	2	6	142	147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020798	GCT	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020798	TGC	2	6	187	192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020798	GC	4	8	206	213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020798	CCG	2	6	224	229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020798	GGC	2	6	232	237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020798	GCG	2	6	321	326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020798	CCA	2	6	331	336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020798	CCGC	2	8	397	404	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_020798	GAGC	2	8	424	431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020798	CCG	2	6	453	458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020798	AGC	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020798	GCA	2	6	526	531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020798	TGC	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020798	GCG	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020798	CAGC	2	8	631	638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020798	GCG	2	6	685	690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020798	CAG	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020798	TG	3	6	714	719	0 %	50 %	50 %	0 %	470464929
24	NC_020798	CG	3	6	723	728	0 %	0 %	50 %	50 %	470464929
25	NC_020798	CGA	3	9	912	920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464929
26	NC_020798	TGAC	2	8	956	963	25 %	25 %	25 %	25 %	470464929
27	NC_020798	CGC	2	6	983	988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464929
28	NC_020798	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464929
29	NC_020798	CGC	2	6	1041	1046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464929
30	NC_020798	ACGG	2	8	1050	1057	25 %	0 %	50 %	25 %	470464929
31	NC_020798	CAA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464929
32	NC_020798	AGC	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464929
33	NC_020798	GCT	2	6	1188	1193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464929
34	NC_020798	CGC	2	6	1248	1253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464929
35	NC_020798	ACG	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020798	CTT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020798	AAC	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020798	TGA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020798	CTG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020798	GCC	2	6	1425	1430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020798	GTG	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020798	AGGA	2	8	1495	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020798	AGC	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020798	CG	3	6	1614	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	470464930
45	NC_020798	GCC	2	6	1626	1631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464930
46	NC_020798	GCTC	2	8	1645	1652	0 %	25 %	25 %	50 %	470464930
47	NC_020798	CG	3	6	1666	1671	0 %	0 %	50 %	50 %	470464930
48	NC_020798	GCC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464930
49	NC_020798	CGCA	2	8	1834	1841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020798	TCCAG	2	10	1967	1976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_020798	TGC	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020798	GC	3	6	2071	2076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020798	CGG	2	6	2155	2160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020798	CCG	2	6	2260	2265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020798	GCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020798	CGA	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020798	G	6	6	2305	2310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020798	CGC	2	6	2373	2378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020798	CGGC	2	8	2455	2462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020798	GC	3	6	2461	2466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020798	GCC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020798	GGGC	2	8	2533	2540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020798	CGC	2	6	2554	2559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020798	CGC	2	6	2579	2584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020798	GC	3	6	2600	2605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020798	GCC	2	6	2646	2651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_020798	CCA	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020798	GACGC	2	10	2766	2775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020798	TGC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020798	CTGCG	2	10	2915	2924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_020798	TC	3	6	2945	2950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020798	C	6	6	3024	3029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_020798	ACA	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020798	AGCAA	2	10	3116	3125	60 %	0 %	20 %	20 %	470464931
75	NC_020798	TG	3	6	3126	3131	0 %	50 %	50 %	0 %	470464931
76	NC_020798	CCG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464931
77	NC_020798	CTG	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464931
78	NC_020798	GGC	3	9	3424	3432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464931
79	NC_020798	G	8	8	3442	3449	0 %	0 %	100 %	0 %	470464931
80	NC_020798	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464931
81	NC_020798	GGA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470464931
82	NC_020798	GCC	2	6	3614	3619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464931
83	NC_020798	CAA	2	6	3676	3681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464931
84	NC_020798	GCG	2	6	3754	3759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464931
85	NC_020798	GCT	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464931
86	NC_020798	AAC	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464931
87	NC_020798	TTC	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464931
88	NC_020798	AGG	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020798	GAC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464932
90	NC_020798	GGC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464932
91	NC_020798	CTG	3	9	4180	4188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464932
92	NC_020798	CGCT	2	8	4190	4197	0 %	25 %	25 %	50 %	470464932
93	NC_020798	TGCT	2	8	4223	4230	0 %	50 %	25 %	25 %	470464932
94	NC_020798	CGT	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464932
95	NC_020798	ACC	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020798	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020798	CTG	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464933
98	NC_020798	AT	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	470464933
99	NC_020798	GATGC	2	10	4503	4512	20 %	20 %	40 %	20 %	470464933
100	NC_020798	CGAG	2	8	4543	4550	25 %	0 %	50 %	25 %	470464933
101	NC_020798	GCGTGC	2	12	4611	4622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470464933
102	NC_020798	GTG	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464933
103	NC_020798	GAC	2	6	4690	4695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020798	CGAT	2	8	4730	4737	25 %	25 %	25 %	25 %	470464934
105	NC_020798	CGAT	2	8	4742	4749	25 %	25 %	25 %	25 %	470464934
106	NC_020798	GCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464934
107	NC_020798	CGC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464934
108	NC_020798	GCG	2	6	4838	4843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464934
109	NC_020798	GCGA	2	8	4858	4865	25 %	0 %	50 %	25 %	470464934
110	NC_020798	CG	3	6	4914	4919	0 %	0 %	50 %	50 %	470464934
111	NC_020798	GCT	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464934
112	NC_020798	GCG	2	6	4935	4940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464934
113	NC_020798	CAT	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464934
114	NC_020798	GCA	2	6	4954	4959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464934
115	NC_020798	CG	3	6	4983	4988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020798	GAT	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020798	GCT	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020798	GCT	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020798	A	6	6	5122	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020798	T	6	6	5146	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020798	CCG	2	6	5210	5215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020798	CAG	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464935
123	NC_020798	ACCG	2	8	5338	5345	25 %	0 %	25 %	50 %	470464935
124	NC_020798	CCA	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464935
125	NC_020798	CGGC	2	8	5353	5360	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
126	NC_020798	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464935
127	NC_020798	AAG	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464935
128	NC_020798	GCCG	3	12	5412	5423	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
129	NC_020798	AAC	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464935
130	NC_020798	GC	3	6	5548	5553	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
131	NC_020798	GCG	2	6	5652	5657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464935
132	NC_020798	TCGA	2	8	5744	5751	25 %	25 %	25 %	25 %	470464935
133	NC_020798	ATG	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464935
134	NC_020798	CCA	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464935
135	NC_020798	CCG	2	6	5794	5799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464935
136	NC_020798	GTG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464935
137	NC_020798	GCAC	2	8	5965	5972	25 %	0 %	25 %	50 %	470464935
138	NC_020798	GCAGCC	2	12	5977	5988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470464935
139	NC_020798	CCA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464935
140	NC_020798	CG	4	8	6012	6019	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
141	NC_020798	GCCC	2	8	6026	6033	0 %	0 %	25 %	75 %	470464935
142	NC_020798	GCG	2	6	6035	6040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464935
143	NC_020798	GCA	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464935
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149	NC_020798	CGC	3	9	6392	6400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_020798	CGA	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_020798	CG	3	6	12279	12284	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
279	NC_020798	GCC	3	9	12354	12362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464942
280	NC_020798	GAC	2	6	12363	12368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464942
281	NC_020798	TGCG	2	8	12395	12402	0 %	25 %	50 %	25 %	470464942
282	NC_020798	GCGGA	2	10	12428	12437	20 %	0 %	60 %	20 %	470464942
283	NC_020798	GCAGG	2	10	12465	12474	20 %	0 %	60 %	20 %	470464942
284	NC_020798	A	8	8	12487	12494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_020798	T	6	6	12513	12518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020798	ACT	2	6	12521	12526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_020798	TCC	2	6	13144	13149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
301	NC_020798	TGA	2	6	13174	13179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464944
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321	NC_020798	TGG	3	9	13870	13878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_020798	A	8	8	13887	13894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_020798	CG	3	6	17758	17763	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
402	NC_020798	GGC	2	6	17775	17780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464947
403	NC_020798	GCG	2	6	17811	17816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464947
404	NC_020798	ATG	2	6	17905	17910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464947
405	NC_020798	GTC	2	6	17932	17937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464947
406	NC_020798	CGA	2	6	17967	17972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464947
407	NC_020798	GCG	2	6	17975	17980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464947
408	NC_020798	CGGC	2	8	18083	18090	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
409	NC_020798	ATG	2	6	18166	18171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464947
410	NC_020798	CTC	2	6	18192	18197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464947
411	NC_020798	ATG	2	6	18214	18219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464947
412	NC_020798	TGA	2	6	18248	18253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464947
413	NC_020798	CTTGCC	2	12	18279	18290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470464947
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426	NC_020798	CTT	2	6	18720	18725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464947
427	NC_020798	CGA	2	6	18734	18739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464947
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429	NC_020798	GGC	2	6	18843	18848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464947
430	NC_020798	AT	3	6	18861	18866	50 %	50 %	0 %	0 %	470464947
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435	NC_020798	CGC	2	6	19007	19012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464947
436	NC_020798	GAC	2	6	19020	19025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464947
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438	NC_020798	GCC	2	6	19136	19141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_020798	TGA	2	6	19191	19196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_020798	CGA	2	6	19260	19265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_020798	CGG	2	6	19427	19432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464948
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481	NC_020798	TCA	2	6	21520	21525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464950
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499	NC_020798	CATC	2	8	22338	22345	25 %	25 %	0 %	50 %	470464950
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