MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 1329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464773
2	NC_020797	TCG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464773
3	NC_020797	GC	3	6	111	116	0 %	0 %	50 %	50 %	470464773
4	NC_020797	GCA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464773
5	NC_020797	GCCT	2	8	199	206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020797	CG	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020797	GCA	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020797	GGC	2	6	319	324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020797	GCG	2	6	331	336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020797	CCG	2	6	348	353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020797	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020797	CAA	2	6	486	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020797	TGT	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020797	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020797	TTG	2	6	768	773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020797	GATC	2	8	839	846	25 %	25 %	25 %	25 %	470464774
17	NC_020797	GGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464774
18	NC_020797	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464774
19	NC_020797	C	6	6	929	934	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_020797	A	7	7	1121	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	470464775
21	NC_020797	ACC	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464775
22	NC_020797	TCG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
23	NC_020797	ATC	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464775
24	NC_020797	GCT	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
25	NC_020797	CCA	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020797	CG	3	6	1787	1792	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
27	NC_020797	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464776
28	NC_020797	GC	3	6	1918	1923	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
29	NC_020797	GCG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
30	NC_020797	TACG	2	8	1992	1999	25 %	25 %	25 %	25 %	470464776
31	NC_020797	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464776
32	NC_020797	GGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
33	NC_020797	CG	3	6	2076	2081	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
34	NC_020797	CCG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
35	NC_020797	GCC	2	6	2102	2107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
36	NC_020797	C	6	6	2128	2133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_020797	G	6	6	2138	2143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020797	GGC	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020797	ACT	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020797	TA	3	6	2239	2244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020797	TG	3	6	2309	2314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020797	GAA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020797	CGCC	2	8	2327	2334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_020797	CGC	2	6	2374	2379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020797	CGG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
46	NC_020797	CTCG	2	8	2599	2606	0 %	25 %	25 %	50 %	470464777
47	NC_020797	CCG	3	9	2610	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
48	NC_020797	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
49	NC_020797	TGC	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
50	NC_020797	GC	3	6	2674	2679	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
51	NC_020797	CCG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
52	NC_020797	CGGC	2	8	2702	2709	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
53	NC_020797	GCCG	2	8	2776	2783	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
54	NC_020797	GCG	3	9	2786	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
55	NC_020797	CCA	2	6	2799	2804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464777
56	NC_020797	CCGC	2	8	2865	2872	0 %	0 %	25 %	75 %	470464777
57	NC_020797	CGC	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
58	NC_020797	CCG	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
59	NC_020797	CG	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
60	NC_020797	GCCAT	2	10	3092	3101	20 %	20 %	20 %	40 %	470464778
61	NC_020797	GCG	2	6	3102	3107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
62	NC_020797	CG	3	6	3106	3111	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
63	NC_020797	CCA	2	6	3145	3150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
64	NC_020797	TGG	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464778
65	NC_020797	CTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
66	NC_020797	CGC	2	6	3201	3206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
67	NC_020797	TTG	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464778
68	NC_020797	CGCC	2	8	3309	3316	0 %	0 %	25 %	75 %	470464778
69	NC_020797	GC	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
70	NC_020797	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
71	NC_020797	GGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
72	NC_020797	GCATT	2	10	3455	3464	20 %	40 %	20 %	20 %	470464778
73	NC_020797	CAC	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
74	NC_020797	GAAC	2	8	3494	3501	50 %	0 %	25 %	25 %	470464778
75	NC_020797	ACG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
76	NC_020797	CCA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464779
77	NC_020797	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464779
78	NC_020797	AGC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
79	NC_020797	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
80	NC_020797	TGC	2	6	3604	3609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464779
81	NC_020797	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
82	NC_020797	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
83	NC_020797	CAG	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
84	NC_020797	CG	3	6	3794	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	470464779
85	NC_020797	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	470464779
86	NC_020797	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020797	C	6	6	4168	4173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_020797	TGT	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020797	TGC	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020797	GC	3	6	4257	4262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020797	A	7	7	4358	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020797	ATT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020797	GTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020797	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
95	NC_020797	GCC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
96	NC_020797	CTG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
97	NC_020797	GCG	2	6	4689	4694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
98	NC_020797	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
99	NC_020797	TGC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
100	NC_020797	GGCCG	2	10	4828	4837	0 %	0 %	60 %	40 %	470464780
101	NC_020797	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464780
102	NC_020797	CTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
103	NC_020797	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464780
104	NC_020797	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
105	NC_020797	TCG	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
106	NC_020797	GAAT	2	8	5136	5143	50 %	25 %	25 %	0 %	470464780
107	NC_020797	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464780
108	NC_020797	GCGA	2	8	5184	5191	25 %	0 %	50 %	25 %	470464780
109	NC_020797	T	6	6	5199	5204	0 %	100 %	0 %	0 %	470464780
110	NC_020797	AGC	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
111	NC_020797	GTG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
112	NC_020797	TGC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
113	NC_020797	GCTG	2	8	5406	5413	0 %	25 %	50 %	25 %	470464780
114	NC_020797	CAG	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
115	NC_020797	CTG	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
116	NC_020797	TCCT	2	8	5428	5435	0 %	50 %	0 %	50 %	470464780
117	NC_020797	CG	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	470464780
118	NC_020797	GTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
119	NC_020797	CGG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
120	NC_020797	GCCA	2	8	5606	5613	25 %	0 %	25 %	50 %	470464780
121	NC_020797	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
122	NC_020797	GGA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470464780
123	NC_020797	GTT	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
124	NC_020797	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
125	NC_020797	CA	3	6	5725	5730	50 %	0 %	0 %	50 %	470464780
126	NC_020797	GGT	3	9	5790	5798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020797	TCC	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_020797	ATT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020797	A	7	7	5890	5896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020797	CGC	2	6	5923	5928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
131	NC_020797	GGCC	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
132	NC_020797	CCA	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464781
133	NC_020797	GAT	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464781
134	NC_020797	CCG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
135	NC_020797	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464781
136	NC_020797	CTC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464781
137	NC_020797	TTG	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
138	NC_020797	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
139	NC_020797	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
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141	NC_020797	GCA	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
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248	NC_020797	ATT	2	6	11624	11629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_020797	GC	3	6	12011	12016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
254	NC_020797	GGCA	2	8	12027	12034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
255	NC_020797	GGA	2	6	12084	12089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470464784
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262	NC_020797	GCC	2	6	12511	12516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464784
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267	NC_020797	ATG	2	6	12673	12678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020797	GC	3	6	12687	12692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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270	NC_020797	TGG	2	6	12812	12817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_020797	GC	3	6	13279	13284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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402	NC_020797	GTC	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020797	TA	5	10	19848	19857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020797	TA	5	10	19868	19877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_020797	GCC	2	6	19939	19944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464788
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462	NC_020797	CGC	2	6	21905	21910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
463	NC_020797	CGG	2	6	21911	21916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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