MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_017562	TATT	2	8	2260015	2260022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47502	NC_017562	ATCA	2	8	2260034	2260041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47503	NC_017562	C	6	6	2260145	2260150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47504	NC_017562	GCC	2	6	2260241	2260246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47505	NC_017562	CA	3	6	2260475	2260480	50 %	0 %	0 %	50 %	386085030
47506	NC_017562	T	6	6	2260533	2260538	0 %	100 %	0 %	0 %	386085030
47507	NC_017562	CG	3	6	2260582	2260587	0 %	0 %	50 %	50 %	386085030
47508	NC_017562	GCTC	2	8	2260607	2260614	0 %	25 %	25 %	50 %	386085030
47509	NC_017562	AAT	2	6	2260617	2260622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085030
47510	NC_017562	TGC	2	6	2260634	2260639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085030
47511	NC_017562	TC	3	6	2260642	2260647	0 %	50 %	0 %	50 %	386085030
47512	NC_017562	TAA	2	6	2260690	2260695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47513	NC_017562	GCT	2	6	2260783	2260788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47514	NC_017562	AGA	2	6	2260872	2260877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47515	NC_017562	AT	3	6	2260920	2260925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47516	NC_017562	CTG	2	6	2261007	2261012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47517	NC_017562	CAA	2	6	2261014	2261019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47518	NC_017562	ACAA	2	8	2261031	2261038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47519	NC_017562	AC	3	6	2261076	2261081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47520	NC_017562	GGTTA	2	10	2261090	2261099	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47521	NC_017562	AGCA	2	8	2261142	2261149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47522	NC_017562	TGG	2	6	2261218	2261223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47523	NC_017562	TCG	2	6	2261242	2261247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47524	NC_017562	AGC	2	6	2261274	2261279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47525	NC_017562	C	7	7	2261379	2261385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47526	NC_017562	CCA	2	6	2261392	2261397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47527	NC_017562	GCCTG	2	10	2261436	2261445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47528	NC_017562	CCT	2	6	2261497	2261502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47529	NC_017562	CATA	2	8	2261522	2261529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47530	NC_017562	TGG	2	6	2261547	2261552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47531	NC_017562	GAA	2	6	2261556	2261561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47532	NC_017562	GCA	2	6	2261617	2261622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47533	NC_017562	A	6	6	2261626	2261631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47534	NC_017562	TCT	2	6	2261647	2261652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47535	NC_017562	ACC	2	6	2261671	2261676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47536	NC_017562	CCTG	2	8	2261764	2261771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47537	NC_017562	GCA	2	6	2261797	2261802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47538	NC_017562	TCG	2	6	2261819	2261824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47539	NC_017562	CAT	2	6	2261894	2261899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47540	NC_017562	TGTT	2	8	2261963	2261970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47541	NC_017562	AAT	2	6	2261989	2261994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47542	NC_017562	AGC	2	6	2261999	2262004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47543	NC_017562	CTC	2	6	2262011	2262016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47544	NC_017562	ACA	3	9	2262073	2262081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47545	NC_017562	CAAG	2	8	2262082	2262089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47546	NC_017562	AAC	2	6	2262095	2262100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47547	NC_017562	TAT	2	6	2262197	2262202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47548	NC_017562	TCA	2	6	2262205	2262210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47549	NC_017562	T	6	6	2262223	2262228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47550	NC_017562	ACA	2	6	2262248	2262253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47551	NC_017562	A	7	7	2262255	2262261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47552	NC_017562	TA	3	6	2262309	2262314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47553	NC_017562	TA	4	8	2262321	2262328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47554	NC_017562	GCT	2	6	2262373	2262378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085031
47555	NC_017562	TAA	2	6	2262453	2262458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085031
47556	NC_017562	GTT	2	6	2262533	2262538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085031
47557	NC_017562	ACA	2	6	2262581	2262586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085031
47558	NC_017562	TAT	2	6	2262627	2262632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085031
47559	NC_017562	ATC	2	6	2262641	2262646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085031
47560	NC_017562	CTT	2	6	2262763	2262768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47561	NC_017562	TG	3	6	2262773	2262778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47562	NC_017562	CCA	2	6	2262789	2262794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085032
47563	NC_017562	TGCC	2	8	2262861	2262868	0 %	25 %	25 %	50 %	386085032
47564	NC_017562	CAT	2	6	2263051	2263056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085032
47565	NC_017562	TCT	2	6	2263065	2263070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085032
47566	NC_017562	ATA	2	6	2263097	2263102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085032
47567	NC_017562	TAA	2	6	2263118	2263123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085032
47568	NC_017562	CGA	2	6	2263210	2263215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085032
47569	NC_017562	CCG	2	6	2263266	2263271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085032
47570	NC_017562	AT	3	6	2263280	2263285	50 %	50 %	0 %	0 %	386085032
47571	NC_017562	ATT	2	6	2263322	2263327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085032
47572	NC_017562	ATTTT	2	10	2263329	2263338	20 %	80 %	0 %	0 %	386085032
47573	NC_017562	TTCT	2	8	2263411	2263418	0 %	75 %	0 %	25 %	386085032
47574	NC_017562	CTT	2	6	2263438	2263443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085032
47575	NC_017562	CTT	2	6	2263447	2263452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085032
47576	NC_017562	CAT	2	6	2263480	2263485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085032
47577	NC_017562	GGAA	2	8	2263562	2263569	50 %	0 %	50 %	0 %	386085032
47578	NC_017562	TAA	2	6	2263592	2263597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085032
47579	NC_017562	TTA	2	6	2263717	2263722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085032
47580	NC_017562	CGC	2	6	2263738	2263743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085032
47581	NC_017562	AGC	2	6	2263754	2263759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085032
47582	NC_017562	CAT	2	6	2263760	2263765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085032
47583	NC_017562	CCTG	2	8	2263793	2263800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47584	NC_017562	CAGG	2	8	2263804	2263811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47585	NC_017562	ACCGC	2	10	2263863	2263872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47586	NC_017562	TCA	2	6	2263885	2263890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47587	NC_017562	CAT	2	6	2263898	2263903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47588	NC_017562	AAGTA	2	10	2263992	2264001	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47589	NC_017562	TCA	2	6	2264023	2264028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47590	NC_017562	GCATG	2	10	2264063	2264072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47591	NC_017562	GGA	2	6	2264091	2264096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47592	NC_017562	A	7	7	2264111	2264117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47593	NC_017562	TGCC	3	12	2264225	2264236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47594	NC_017562	CTG	2	6	2264271	2264276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47596	NC_017562	TGC	2	6	2264493	2264498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085033
47597	NC_017562	TCG	2	6	2264522	2264527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085033
47598	NC_017562	GAT	2	6	2264544	2264549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085033
47599	NC_017562	CGC	2	6	2264554	2264559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085033
47600	NC_017562	TGC	2	6	2264560	2264565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085033
47601	NC_017562	GT	3	6	2264575	2264580	0 %	50 %	50 %	0 %	386085033
47602	NC_017562	GGC	2	6	2264583	2264588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085033
47603	NC_017562	CTC	2	6	2264629	2264634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085033
47604	NC_017562	CGG	2	6	2264700	2264705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085033
47605	NC_017562	CA	3	6	2264835	2264840	50 %	0 %	0 %	50 %	386085033
47606	NC_017562	GTT	2	6	2264950	2264955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085033
47607	NC_017562	CGG	2	6	2265057	2265062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085033
47608	NC_017562	TGA	2	6	2265063	2265068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085033
47609	NC_017562	GTG	2	6	2265107	2265112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085033
47610	NC_017562	GCA	2	6	2265120	2265125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085033
47611	NC_017562	AGT	2	6	2265288	2265293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085033
47612	NC_017562	GGGT	2	8	2265316	2265323	0 %	25 %	75 %	0 %	386085033
47613	NC_017562	GT	4	8	2265337	2265344	0 %	50 %	50 %	0 %	386085033
47614	NC_017562	TGC	2	6	2265354	2265359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085033
47615	NC_017562	CTG	2	6	2265411	2265416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47616	NC_017562	ATGGC	2	10	2265443	2265452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47617	NC_017562	GCG	2	6	2265521	2265526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085034
47618	NC_017562	TCC	2	6	2265554	2265559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085034
47619	NC_017562	TGA	2	6	2265606	2265611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085034
47620	NC_017562	GT	3	6	2265715	2265720	0 %	50 %	50 %	0 %	386085034
47621	NC_017562	GGT	2	6	2265775	2265780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085034
47622	NC_017562	GCGGTG	2	12	2265806	2265817	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386085034
47623	NC_017562	TCAT	2	8	2265886	2265893	25 %	50 %	0 %	25 %	386085034
47624	NC_017562	GC	3	6	2265900	2265905	0 %	0 %	50 %	50 %	386085034
47625	NC_017562	ATC	2	6	2265964	2265969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085034
47626	NC_017562	TGC	2	6	2266100	2266105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085035
47627	NC_017562	GCGG	2	8	2266125	2266132	0 %	0 %	75 %	25 %	386085035
47628	NC_017562	TC	3	6	2266166	2266171	0 %	50 %	0 %	50 %	386085035
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47635	NC_017562	AAG	2	6	2266438	2266443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085035
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47724	NC_017562	CGGG	2	8	2271620	2271627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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47732	NC_017562	CGG	2	6	2271903	2271908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47735	NC_017562	GT	3	6	2271995	2272000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47736	NC_017562	TGGA	2	8	2272001	2272008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47737	NC_017562	GCA	2	6	2272016	2272021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47738	NC_017562	CAC	2	6	2272037	2272042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47858	NC_017562	CGG	2	6	2277131	2277136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085055
47859	NC_017562	ATC	2	6	2277186	2277191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085055
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47961	NC_017562	CAG	2	6	2282293	2282298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47972	NC_017562	T	6	6	2282676	2282681	0 %	100 %	0 %	0 %	386085064
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47974	NC_017562	TCA	2	6	2282730	2282735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085064
47975	NC_017562	CCA	2	6	2282823	2282828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085064
47976	NC_017562	A	6	6	2282836	2282841	100 %	0 %	0 %	0 %	386085064
47977	NC_017562	ATC	2	6	2282972	2282977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085064
47978	NC_017562	GCACC	2	10	2283186	2283195	20 %	0 %	20 %	60 %	386085064
47979	NC_017562	GC	3	6	2283236	2283241	0 %	0 %	50 %	50 %	386085064
47980	NC_017562	A	6	6	2283345	2283350	100 %	0 %	0 %	0 %	386085064
47981	NC_017562	CAC	2	6	2283445	2283450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085064
47982	NC_017562	GCCAA	2	10	2283469	2283478	40 %	0 %	20 %	40 %	386085064
47983	NC_017562	CAG	2	6	2283507	2283512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47984	NC_017562	AGC	2	6	2283540	2283545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47986	NC_017562	T	7	7	2283720	2283726	0 %	100 %	0 %	0 %	386085065
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47989	NC_017562	TA	3	6	2283827	2283832	50 %	50 %	0 %	0 %	386085066
47990	NC_017562	A	6	6	2283888	2283893	100 %	0 %	0 %	0 %	386085066
47991	NC_017562	AGC	2	6	2283983	2283988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085066
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47999	NC_017562	CAT	2	6	2284400	2284405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085066
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