MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_017562	GCAT	2	8	2209846	2209853	25 %	25 %	25 %	25 %	386084986
46502	NC_017562	TGA	2	6	2209891	2209896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084986
46503	NC_017562	GC	3	6	2209998	2210003	0 %	0 %	50 %	50 %	386084986
46504	NC_017562	GTA	2	6	2210038	2210043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084986
46505	NC_017562	CGC	2	6	2210048	2210053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084986
46506	NC_017562	TTC	2	6	2210061	2210066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386084986
46507	NC_017562	CCGGTT	2	12	2210080	2210091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084986
46508	NC_017562	ACA	2	6	2210124	2210129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386084986
46509	NC_017562	GTC	2	6	2210147	2210152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084986
46510	NC_017562	TGC	2	6	2210176	2210181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084986
46511	NC_017562	TGTTCC	6	36	2210184	2210219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386084986
46512	NC_017562	AAT	2	6	2210432	2210437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386084987
46513	NC_017562	TGCT	2	8	2210446	2210453	0 %	50 %	25 %	25 %	386084987
46514	NC_017562	CG	3	6	2210553	2210558	0 %	0 %	50 %	50 %	386084988
46515	NC_017562	CTG	2	6	2210570	2210575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084988
46516	NC_017562	TCA	2	6	2210606	2210611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084988
46517	NC_017562	TTGG	2	8	2210626	2210633	0 %	50 %	50 %	0 %	386084988
46518	NC_017562	GTAC	3	12	2210655	2210666	25 %	25 %	25 %	25 %	386084988
46519	NC_017562	ACAA	2	8	2210796	2210803	75 %	0 %	0 %	25 %	386084988
46520	NC_017562	ACT	2	6	2210875	2210880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084988
46521	NC_017562	T	6	6	2211041	2211046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46522	NC_017562	TCAT	2	8	2211051	2211058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46523	NC_017562	CAG	2	6	2211078	2211083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46524	NC_017562	ATC	2	6	2211132	2211137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46525	NC_017562	GAT	2	6	2211143	2211148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46526	NC_017562	GATTT	2	10	2211165	2211174	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46527	NC_017562	ATT	2	6	2211187	2211192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46528	NC_017562	CAGG	2	8	2211231	2211238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46529	NC_017562	TTG	2	6	2211290	2211295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46530	NC_017562	CAAT	2	8	2211435	2211442	50 %	25 %	0 %	25 %	386084989
46531	NC_017562	TCTT	2	8	2211566	2211573	0 %	75 %	0 %	25 %	386084989
46532	NC_017562	ACG	2	6	2211616	2211621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084989
46533	NC_017562	AGT	2	6	2211644	2211649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084989
46534	NC_017562	ATG	2	6	2211712	2211717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084989
46535	NC_017562	GTT	2	6	2211811	2211816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084989
46536	NC_017562	ATA	2	6	2211849	2211854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46537	NC_017562	ATCC	2	8	2211870	2211877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46538	NC_017562	AGT	2	6	2211941	2211946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46539	NC_017562	TAAT	2	8	2212030	2212037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46540	NC_017562	ATTTT	2	10	2212076	2212085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46541	NC_017562	T	6	6	2212082	2212087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46542	NC_017562	ATC	2	6	2212133	2212138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46543	NC_017562	TGT	2	6	2212189	2212194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46544	NC_017562	GTGA	2	8	2212214	2212221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46545	NC_017562	TGG	2	6	2212227	2212232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46546	NC_017562	CGC	2	6	2212278	2212283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46547	NC_017562	AAG	2	6	2212284	2212289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46548	NC_017562	CCA	2	6	2212291	2212296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46549	NC_017562	GCT	2	6	2212344	2212349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46550	NC_017562	CAC	2	6	2212403	2212408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386084990
46551	NC_017562	CAG	2	6	2212423	2212428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084990
46552	NC_017562	AGT	2	6	2212458	2212463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084990
46553	NC_017562	CG	3	6	2212574	2212579	0 %	0 %	50 %	50 %	386084990
46554	NC_017562	TGA	2	6	2212631	2212636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084990
46555	NC_017562	TTG	2	6	2212840	2212845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084990
46556	NC_017562	ACA	2	6	2212872	2212877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386084990
46557	NC_017562	TGC	2	6	2212949	2212954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084990
46558	NC_017562	TGC	2	6	2213030	2213035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084990
46559	NC_017562	ATG	2	6	2213047	2213052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084990
46560	NC_017562	AGC	2	6	2213060	2213065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084990
46561	NC_017562	GCC	2	6	2213107	2213112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084990
46562	NC_017562	CCG	2	6	2213153	2213158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084990
46563	NC_017562	GCACC	2	10	2213179	2213188	20 %	0 %	20 %	60 %	386084990
46564	NC_017562	TAC	2	6	2213216	2213221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084990
46565	NC_017562	TGC	2	6	2213258	2213263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084990
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46568	NC_017562	T	7	7	2213396	2213402	0 %	100 %	0 %	0 %	386084990
46569	NC_017562	CAT	2	6	2213610	2213615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46570	NC_017562	GCA	2	6	2213624	2213629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46571	NC_017562	GCA	2	6	2213672	2213677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46572	NC_017562	GCA	3	9	2213748	2213756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084991
46573	NC_017562	TAC	2	6	2213796	2213801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084991
46574	NC_017562	CGC	2	6	2213825	2213830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084991
46575	NC_017562	TGG	2	6	2213852	2213857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084991
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46577	NC_017562	TCAA	2	8	2214020	2214027	50 %	25 %	0 %	25 %	386084991
46578	NC_017562	TGC	2	6	2214067	2214072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084991
46579	NC_017562	ATG	3	9	2214280	2214288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084991
46580	NC_017562	TTA	2	6	2214610	2214615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084991
46581	NC_017562	CAT	2	6	2214648	2214653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084991
46582	NC_017562	GGCTG	2	10	2214751	2214760	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46583	NC_017562	TTGG	2	8	2214762	2214769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46584	NC_017562	AGCGC	2	10	2214866	2214875	20 %	0 %	40 %	40 %	386084992
46585	NC_017562	ATT	2	6	2214921	2214926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084992
46586	NC_017562	TAT	2	6	2214946	2214951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084992
46587	NC_017562	TAT	2	6	2214982	2214987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084992
46588	NC_017562	TAT	2	6	2214993	2214998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084992
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46591	NC_017562	A	6	6	2215024	2215029	100 %	0 %	0 %	0 %	386084992
46592	NC_017562	TCA	2	6	2215030	2215035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084992
46593	NC_017562	AAAG	2	8	2215044	2215051	75 %	0 %	25 %	0 %	386084992
46594	NC_017562	TCT	2	6	2215069	2215074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46595	NC_017562	ATCGT	2	10	2215154	2215163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46596	NC_017562	TGT	2	6	2215257	2215262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46597	NC_017562	TTC	2	6	2215275	2215280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46599	NC_017562	GA	3	6	2215320	2215325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46600	NC_017562	AAG	2	6	2215333	2215338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46601	NC_017562	AAG	2	6	2215505	2215510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46602	NC_017562	GCT	2	6	2215719	2215724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46603	NC_017562	TGG	3	9	2215730	2215738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46604	NC_017562	GTG	2	6	2215767	2215772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084993
46605	NC_017562	AAG	2	6	2215827	2215832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386084993
46606	NC_017562	TTG	2	6	2215909	2215914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084993
46607	NC_017562	CTGA	2	8	2215920	2215927	25 %	25 %	25 %	25 %	386084993
46608	NC_017562	TGA	2	6	2216057	2216062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084993
46609	NC_017562	GCA	2	6	2216079	2216084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084993
46610	NC_017562	AGA	2	6	2216120	2216125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386084993
46611	NC_017562	TGA	2	6	2216126	2216131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084993
46612	NC_017562	ACT	2	6	2216145	2216150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084993
46613	NC_017562	TGG	2	6	2216245	2216250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084993
46614	NC_017562	GAT	2	6	2216304	2216309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084993
46615	NC_017562	TTC	2	6	2216428	2216433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386084993
46616	NC_017562	CAT	2	6	2216434	2216439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084993
46617	NC_017562	TAC	2	6	2216586	2216591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46618	NC_017562	AGT	2	6	2216600	2216605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46619	NC_017562	GTT	3	9	2216626	2216634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084994
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46626	NC_017562	AGGT	2	8	2216884	2216891	25 %	25 %	50 %	0 %	386084994
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46972	NC_017562	GTG	2	6	2235906	2235911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085012
46973	NC_017562	TTAC	2	8	2236042	2236049	25 %	50 %	0 %	25 %	386085012
46974	NC_017562	GCA	2	6	2236069	2236074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085012
46975	NC_017562	ACA	2	6	2236092	2236097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085012
46976	NC_017562	TTGG	2	8	2236135	2236142	0 %	50 %	50 %	0 %	386085012
46977	NC_017562	CAT	2	6	2236279	2236284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085012
46978	NC_017562	ACT	2	6	2236333	2236338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085012
46979	NC_017562	ACA	2	6	2236377	2236382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085012
46980	NC_017562	TCA	2	6	2236418	2236423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085012
46981	NC_017562	AC	3	6	2236479	2236484	50 %	0 %	0 %	50 %	386085012
46982	NC_017562	TGAT	2	8	2236554	2236561	25 %	50 %	25 %	0 %	386085012
46983	NC_017562	GGC	2	6	2236649	2236654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085012
46984	NC_017562	TGG	2	6	2236692	2236697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085012
46985	NC_017562	AGT	2	6	2236730	2236735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085012
46986	NC_017562	TGA	2	6	2236755	2236760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085012
46987	NC_017562	GCACCA	2	12	2236814	2236825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386085012
46988	NC_017562	CTA	2	6	2236829	2236834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085012
46989	NC_017562	GAATT	2	10	2236838	2236847	40 %	40 %	20 %	0 %	386085012
46990	NC_017562	CTG	2	6	2236860	2236865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085012
46991	NC_017562	CAG	2	6	2236873	2236878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085012
46992	NC_017562	GCC	2	6	2236890	2236895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085012
46993	NC_017562	GGC	2	6	2236910	2236915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085012
46994	NC_017562	CAT	2	6	2236921	2236926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085012
46995	NC_017562	TGCT	2	8	2236955	2236962	0 %	50 %	25 %	25 %	386085012
46996	NC_017562	GA	3	6	2236970	2236975	50 %	0 %	50 %	0 %	386085012
46997	NC_017562	TCT	2	6	2237026	2237031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46998	NC_017562	TAC	2	6	2237108	2237113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085013
46999	NC_017562	ATTG	2	8	2237166	2237173	25 %	50 %	25 %	0 %	386085013
47000	NC_017562	GAAA	2	8	2237184	2237191	75 %	0 %	25 %	0 %	386085013

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