MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_017562	CATC	2	8	2184312	2184319	25 %	25 %	0 %	50 %	386084956
46002	NC_017562	CAC	2	6	2184324	2184329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386084956
46003	NC_017562	GCC	2	6	2184379	2184384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084956
46004	NC_017562	GGC	2	6	2184475	2184480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084956
46005	NC_017562	GCA	2	6	2184498	2184503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084956
46006	NC_017562	CAAC	2	8	2184597	2184604	50 %	0 %	0 %	50 %	386084956
46007	NC_017562	ATCA	2	8	2184640	2184647	50 %	25 %	0 %	25 %	386084956
46008	NC_017562	AGT	2	6	2184710	2184715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084956
46009	NC_017562	GCT	2	6	2184722	2184727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084956
46010	NC_017562	ATCTG	2	10	2184743	2184752	20 %	40 %	20 %	20 %	386084956
46011	NC_017562	GTT	2	6	2184930	2184935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084956
46012	NC_017562	GTAC	2	8	2184957	2184964	25 %	25 %	25 %	25 %	386084956
46013	NC_017562	GCT	2	6	2184998	2185003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084956
46014	NC_017562	GCA	2	6	2185004	2185009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084956
46015	NC_017562	T	7	7	2185040	2185046	0 %	100 %	0 %	0 %	386084956
46016	NC_017562	GGC	2	6	2185075	2185080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084956
46017	NC_017562	TG	3	6	2185100	2185105	0 %	50 %	50 %	0 %	386084956
46018	NC_017562	CT	3	6	2185115	2185120	0 %	50 %	0 %	50 %	386084956
46019	NC_017562	GTT	2	6	2185142	2185147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084956
46020	NC_017562	AAAT	2	8	2185289	2185296	75 %	25 %	0 %	0 %	386084956
46021	NC_017562	CAGC	2	8	2185311	2185318	25 %	0 %	25 %	50 %	386084956
46022	NC_017562	TTC	2	6	2185330	2185335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386084956
46023	NC_017562	A	7	7	2185382	2185388	100 %	0 %	0 %	0 %	386084956
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46028	NC_017562	GCA	2	6	2185694	2185699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084956
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46031	NC_017562	TGAT	2	8	2185837	2185844	25 %	50 %	25 %	0 %	386084956
46032	NC_017562	ATC	2	6	2185860	2185865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46033	NC_017562	TGC	2	6	2185880	2185885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46034	NC_017562	A	6	6	2185917	2185922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46035	NC_017562	TAA	2	6	2185935	2185940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46036	NC_017562	AATTG	2	10	2186051	2186060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46037	NC_017562	T	6	6	2186144	2186149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46038	NC_017562	TAT	2	6	2186187	2186192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46039	NC_017562	TAT	2	6	2186204	2186209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46040	NC_017562	T	6	6	2186209	2186214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46041	NC_017562	T	7	7	2186247	2186253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46042	NC_017562	TCT	2	6	2186265	2186270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46043	NC_017562	A	7	7	2186322	2186328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46044	NC_017562	TCA	2	6	2186406	2186411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46045	NC_017562	T	6	6	2186431	2186436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46046	NC_017562	CGGG	2	8	2186439	2186446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46047	NC_017562	GCA	2	6	2186473	2186478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46048	NC_017562	CTT	2	6	2186489	2186494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46049	NC_017562	GATT	2	8	2186504	2186511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46050	NC_017562	GGCA	2	8	2186529	2186536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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46053	NC_017562	TGG	2	6	2186726	2186731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084957
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46055	NC_017562	T	6	6	2186748	2186753	0 %	100 %	0 %	0 %	386084957
46056	NC_017562	CTT	2	6	2186760	2186765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386084957
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46061	NC_017562	A	11	11	2187033	2187043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46062	NC_017562	ATG	2	6	2187061	2187066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46063	NC_017562	ACA	2	6	2187075	2187080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46064	NC_017562	GTG	2	6	2187141	2187146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46065	NC_017562	ATA	2	6	2187184	2187189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46073	NC_017562	AGCTA	2	10	2187444	2187453	40 %	20 %	20 %	20 %	386084958
46074	NC_017562	ATAA	2	8	2187460	2187467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46075	NC_017562	GTATC	2	10	2187486	2187495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46076	NC_017562	CT	4	8	2187499	2187506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46077	NC_017562	TGC	2	6	2187627	2187632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084959
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46080	NC_017562	TGCTG	2	10	2187681	2187690	0 %	40 %	40 %	20 %	386084959
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46085	NC_017562	AACGT	2	10	2187872	2187881	40 %	20 %	20 %	20 %	386084959
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46089	NC_017562	TGA	2	6	2188123	2188128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46090	NC_017562	CCATTG	2	12	2188151	2188162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46091	NC_017562	TTCC	2	8	2188201	2188208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46092	NC_017562	GTT	2	6	2188239	2188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084960
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46097	NC_017562	TGC	2	6	2188528	2188533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084960
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46100	NC_017562	CTG	2	6	2188575	2188580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084960
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46104	NC_017562	GGGA	2	8	2188690	2188697	25 %	0 %	75 %	0 %	386084960
46105	NC_017562	AG	3	6	2188743	2188748	50 %	0 %	50 %	0 %	386084960
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46108	NC_017562	AGCC	2	8	2188816	2188823	25 %	0 %	25 %	50 %	386084960
46109	NC_017562	T	6	6	2188848	2188853	0 %	100 %	0 %	0 %	386084960
46110	NC_017562	CAG	2	6	2188898	2188903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46111	NC_017562	A	7	7	2188967	2188973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46112	NC_017562	AG	3	6	2189029	2189034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46113	NC_017562	CAGC	2	8	2189054	2189061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46114	NC_017562	CA	3	6	2189078	2189083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46115	NC_017562	GAT	2	6	2189110	2189115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46116	NC_017562	CAT	2	6	2189124	2189129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46117	NC_017562	CTTG	2	8	2189130	2189137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46118	NC_017562	GCAAG	2	10	2189160	2189169	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46119	NC_017562	ATT	2	6	2189216	2189221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46120	NC_017562	TGT	2	6	2189236	2189241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084961
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46122	NC_017562	GT	3	6	2189262	2189267	0 %	50 %	50 %	0 %	386084961
46123	NC_017562	TGA	2	6	2189325	2189330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084961
46124	NC_017562	CTG	4	12	2189337	2189348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46223	NC_017562	CAA	2	6	2195544	2195549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46225	NC_017562	GCT	2	6	2195890	2195895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084967
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46228	NC_017562	AGCCA	2	10	2196076	2196085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46229	NC_017562	CAG	3	9	2196165	2196173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084968
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46232	NC_017562	CGCAG	2	10	2196340	2196349	20 %	0 %	40 %	40 %	386084968
46233	NC_017562	GC	3	6	2196367	2196372	0 %	0 %	50 %	50 %	386084968
46234	NC_017562	CGG	2	6	2196457	2196462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46235	NC_017562	GC	3	6	2196470	2196475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46236	NC_017562	GCA	2	6	2196496	2196501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46237	NC_017562	GGC	2	6	2196527	2196532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084969
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46239	NC_017562	GGC	2	6	2196690	2196695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084969
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46241	NC_017562	ACT	2	6	2196794	2196799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46242	NC_017562	AAC	2	6	2196826	2196831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46243	NC_017562	GAT	2	6	2196858	2196863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46244	NC_017562	CAA	2	6	2196967	2196972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46245	NC_017562	CG	3	6	2197170	2197175	0 %	0 %	50 %	50 %	386084970
46246	NC_017562	GAT	2	6	2197176	2197181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084970
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46249	NC_017562	CTC	2	6	2197305	2197310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46250	NC_017562	AGCC	2	8	2197584	2197591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46251	NC_017562	GA	3	6	2197689	2197694	50 %	0 %	50 %	0 %	386084972
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46272	NC_017562	GA	3	6	2198748	2198753	50 %	0 %	50 %	0 %	386084974
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46337	NC_017562	TAT	2	6	2201840	2201845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46339	NC_017562	TGA	2	6	2201870	2201875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46344	NC_017562	CCA	2	6	2202146	2202151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46345	NC_017562	TGTACT	2	12	2202175	2202186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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46350	NC_017562	TCCC	2	8	2202430	2202437	0 %	25 %	0 %	75 %	386084977
46351	NC_017562	CAT	2	6	2202452	2202457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084977
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46354	NC_017562	GGC	2	6	2202510	2202515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084977
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46356	NC_017562	GC	3	6	2202664	2202669	0 %	0 %	50 %	50 %	386084977
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