MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_017562	CTT	2	6	2062600	2062605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43502	NC_017562	GC	3	6	2062720	2062725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43503	NC_017562	CGG	2	6	2062733	2062738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43504	NC_017562	GGC	2	6	2062796	2062801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084858
43505	NC_017562	GTA	2	6	2062952	2062957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084858
43506	NC_017562	AAT	2	6	2063020	2063025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386084858
43507	NC_017562	GAG	2	6	2063095	2063100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386084858
43508	NC_017562	CCTT	2	8	2063110	2063117	0 %	50 %	0 %	50 %	386084858
43509	NC_017562	TTTG	2	8	2063123	2063130	0 %	75 %	25 %	0 %	386084858
43510	NC_017562	GCG	2	6	2063193	2063198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084858
43511	NC_017562	TG	3	6	2063242	2063247	0 %	50 %	50 %	0 %	386084858
43512	NC_017562	CAA	2	6	2063279	2063284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386084858
43513	NC_017562	TTG	2	6	2063571	2063576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084858
43514	NC_017562	GTT	2	6	2063598	2063603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084858
43515	NC_017562	GCT	2	6	2063672	2063677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084858
43516	NC_017562	TGA	2	6	2063681	2063686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084858
43517	NC_017562	CGT	2	6	2063705	2063710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084858
43518	NC_017562	TGG	2	6	2063714	2063719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084858
43519	NC_017562	GCG	2	6	2063743	2063748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084858
43520	NC_017562	AC	3	6	2063774	2063779	50 %	0 %	0 %	50 %	386084858
43521	NC_017562	A	6	6	2063900	2063905	100 %	0 %	0 %	0 %	386084858
43522	NC_017562	GTT	2	6	2064155	2064160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43523	NC_017562	CG	3	6	2064211	2064216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43524	NC_017562	AG	3	6	2064253	2064258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43525	NC_017562	GCT	2	6	2064305	2064310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43526	NC_017562	TGG	2	6	2064335	2064340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43527	NC_017562	AGG	2	6	2064357	2064362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43528	NC_017562	GGCT	2	8	2064366	2064373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43529	NC_017562	TCCGT	2	10	2064464	2064473	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43530	NC_017562	GC	3	6	2064582	2064587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43531	NC_017562	GGC	2	6	2064670	2064675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084859
43532	NC_017562	GCG	2	6	2064677	2064682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084859
43533	NC_017562	ATG	2	6	2064768	2064773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084859
43534	NC_017562	TCG	2	6	2064815	2064820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084859
43535	NC_017562	CCA	2	6	2064864	2064869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386084859
43536	NC_017562	ATG	2	6	2064918	2064923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084859
43537	NC_017562	ATT	2	6	2064973	2064978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386084859
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43540	NC_017562	GC	3	6	2065133	2065138	0 %	0 %	50 %	50 %	386084859
43541	NC_017562	GGGA	2	8	2065177	2065184	25 %	0 %	75 %	0 %	386084859
43542	NC_017562	GAT	2	6	2065310	2065315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084859
43543	NC_017562	TGA	2	6	2065359	2065364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084859
43544	NC_017562	GA	3	6	2065416	2065421	50 %	0 %	50 %	0 %	386084859
43545	NC_017562	AGGTA	2	10	2065462	2065471	40 %	20 %	40 %	0 %	386084859
43546	NC_017562	GTG	2	6	2065493	2065498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084859
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43548	NC_017562	GAG	2	6	2065817	2065822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386084859
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43550	NC_017562	GTC	2	6	2065892	2065897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084859
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43552	NC_017562	TCA	2	6	2065939	2065944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084859
43553	NC_017562	GCGGAT	2	12	2065950	2065961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386084859
43554	NC_017562	AAT	2	6	2065970	2065975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386084859
43555	NC_017562	A	6	6	2066018	2066023	100 %	0 %	0 %	0 %	386084859
43556	NC_017562	C	6	6	2066083	2066088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43557	NC_017562	TTGTGC	2	12	2066138	2066149	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43558	NC_017562	CGC	2	6	2066186	2066191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43559	NC_017562	CCT	2	6	2066221	2066226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386084860
43560	NC_017562	T	6	6	2066273	2066278	0 %	100 %	0 %	0 %	386084860
43561	NC_017562	TAC	2	6	2066320	2066325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084860
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43569	NC_017562	A	6	6	2066777	2066782	100 %	0 %	0 %	0 %	386084860
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43580	NC_017562	CGC	2	6	2067464	2067469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43581	NC_017562	CG	3	6	2067476	2067481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43582	NC_017562	CAC	2	6	2067513	2067518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43583	NC_017562	GCC	2	6	2067548	2067553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43584	NC_017562	GC	3	6	2067577	2067582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43585	NC_017562	TTC	2	6	2067586	2067591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43586	NC_017562	TTGGA	2	10	2067604	2067613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43587	NC_017562	TGC	2	6	2067636	2067641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084862
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43589	NC_017562	GCA	2	6	2067696	2067701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084862
43590	NC_017562	CCA	2	6	2067744	2067749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386084862
43591	NC_017562	GTG	2	6	2067822	2067827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386084862
43592	NC_017562	TCG	2	6	2067924	2067929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084863
43593	NC_017562	TGTGG	2	10	2068030	2068039	0 %	40 %	60 %	0 %	386084863
43594	NC_017562	GGC	2	6	2068043	2068048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084863
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43598	NC_017562	CGG	2	6	2068225	2068230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084863
43599	NC_017562	GGTC	2	8	2068235	2068242	0 %	25 %	50 %	25 %	386084863
43600	NC_017562	ACA	2	6	2068251	2068256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386084863
43601	NC_017562	CAT	2	6	2068324	2068329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084863
43602	NC_017562	ATC	2	6	2068356	2068361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386084863
43603	NC_017562	ACTGC	2	10	2068383	2068392	20 %	20 %	20 %	40 %	386084863
43604	NC_017562	CCG	2	6	2068458	2068463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084863
43605	NC_017562	CGC	2	6	2068489	2068494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386084863
43606	NC_017562	CG	3	6	2068576	2068581	0 %	0 %	50 %	50 %	386084863
43607	NC_017562	ACG	2	6	2068643	2068648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084863
43608	NC_017562	GAC	2	6	2068678	2068683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084863
43609	NC_017562	CGG	2	6	2068686	2068691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084863
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43612	NC_017562	TTG	2	6	2068754	2068759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084863
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43614	NC_017562	CGG	2	6	2068954	2068959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084863
43615	NC_017562	CG	3	6	2068971	2068976	0 %	0 %	50 %	50 %	386084863
43616	NC_017562	ACGG	2	8	2068982	2068989	25 %	0 %	50 %	25 %	386084863
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43618	NC_017562	ACG	2	6	2069153	2069158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084863
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43625	NC_017562	GCCT	2	8	2069469	2069476	0 %	25 %	25 %	50 %	386084863
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43631	NC_017562	TGC	2	6	2069932	2069937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084863
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43640	NC_017562	TGC	2	6	2070306	2070311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084863
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43645	NC_017562	TGC	2	6	2070484	2070489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084863
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43649	NC_017562	CGG	2	6	2070620	2070625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084863
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43654	NC_017562	ACG	2	6	2070958	2070963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084864
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43682	NC_017562	GCGCC	2	10	2072328	2072337	0 %	0 %	40 %	60 %	386084866
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43684	NC_017562	CGT	2	6	2072402	2072407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43687	NC_017562	GT	4	8	2072521	2072528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43688	NC_017562	TGT	2	6	2072567	2072572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386084867
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43695	NC_017562	G	6	6	2073015	2073020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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43701	NC_017562	GCA	2	6	2073306	2073311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386084868
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43715	NC_017562	GCT	2	6	2073953	2073958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084869
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43719	NC_017562	ATG	2	6	2074114	2074119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386084869
43720	NC_017562	TCG	2	6	2074264	2074269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084869
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43730	NC_017562	TGC	2	6	2074661	2074666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386084869
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43734	NC_017562	GGC	2	6	2074869	2074874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386084869
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43852	NC_017562	CTGAT	2	10	2079966	2079975	20 %	40 %	20 %	20 %	386084875
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43854	NC_017562	GCT	2	6	2080046	2080051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43855	NC_017562	GT	3	6	2080073	2080078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43856	NC_017562	GT	3	6	2080089	2080094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43857	NC_017562	GTT	3	9	2080119	2080127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43862	NC_017562	TGC	2	6	2080310	2080315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43865	NC_017562	TAA	2	6	2080441	2080446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43886	NC_017562	GGT	2	6	2081435	2081440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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