MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_017562	AGT	2	6	2477763	2477768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085273
52003	NC_017562	GGGT	2	8	2477791	2477798	0 %	25 %	75 %	0 %	386085273
52004	NC_017562	GT	4	8	2477812	2477819	0 %	50 %	50 %	0 %	386085273
52005	NC_017562	TGC	2	6	2477829	2477834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085273
52006	NC_017562	CTG	2	6	2477886	2477891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085273
52007	NC_017562	ATGGC	2	10	2477918	2477927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52008	NC_017562	GCG	2	6	2477996	2478001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085274
52009	NC_017562	TCC	2	6	2478029	2478034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085274
52010	NC_017562	TGA	2	6	2478081	2478086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085274
52011	NC_017562	GT	3	6	2478190	2478195	0 %	50 %	50 %	0 %	386085274
52012	NC_017562	GGT	2	6	2478250	2478255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085274
52013	NC_017562	GCGGTG	2	12	2478281	2478292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386085274
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52015	NC_017562	GC	3	6	2478375	2478380	0 %	0 %	50 %	50 %	386085274
52016	NC_017562	ATC	2	6	2478439	2478444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085274
52017	NC_017562	TGC	2	6	2478575	2478580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085275
52018	NC_017562	GCGG	2	8	2478600	2478607	0 %	0 %	75 %	25 %	386085275
52019	NC_017562	TC	3	6	2478641	2478646	0 %	50 %	0 %	50 %	386085275
52020	NC_017562	GTTT	2	8	2478659	2478666	0 %	75 %	25 %	0 %	386085275
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52054	NC_017562	GT	4	8	2480594	2480601	0 %	50 %	50 %	0 %	386085278
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52090	NC_017562	GT	3	6	2482592	2482597	0 %	50 %	50 %	0 %	386085282
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52102	NC_017562	CT	3	6	2483255	2483260	0 %	50 %	0 %	50 %	386085282
52103	NC_017562	TAC	2	6	2483289	2483294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52115	NC_017562	CGG	3	9	2483755	2483763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085284
52116	NC_017562	CGG	2	6	2483788	2483793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085284
52117	NC_017562	CGGG	2	8	2483844	2483851	0 %	0 %	75 %	25 %	386085284
52118	NC_017562	GGC	2	6	2483855	2483860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085284
52119	NC_017562	AGC	2	6	2483864	2483869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085284
52120	NC_017562	GTC	2	6	2483883	2483888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52121	NC_017562	GGC	2	6	2483891	2483896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52122	NC_017562	ACGGT	2	10	2484018	2484027	20 %	20 %	40 %	20 %	386085285
52123	NC_017562	GCG	2	6	2484066	2484071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52124	NC_017562	GGT	2	6	2484185	2484190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085285
52125	NC_017562	GGC	4	12	2484194	2484205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52126	NC_017562	GT	3	6	2484219	2484224	0 %	50 %	50 %	0 %	386085285
52127	NC_017562	TGGA	2	8	2484225	2484232	25 %	25 %	50 %	0 %	386085285
52128	NC_017562	GTG	2	6	2484249	2484254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085285
52129	NC_017562	ACT	2	6	2484348	2484353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085285
52130	NC_017562	GCCA	2	8	2484426	2484433	25 %	0 %	25 %	50 %	386085285
52131	NC_017562	GGC	2	6	2484463	2484468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52132	NC_017562	CAC	2	6	2484479	2484484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085285
52133	NC_017562	GC	3	6	2484561	2484566	0 %	0 %	50 %	50 %	386085285
52134	NC_017562	CCG	2	6	2484615	2484620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085285
52135	NC_017562	AGGT	2	8	2484624	2484631	25 %	25 %	50 %	0 %	386085285
52136	NC_017562	CAG	2	6	2484731	2484736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52137	NC_017562	CGC	2	6	2484737	2484742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085285
52138	NC_017562	CCAA	2	8	2484746	2484753	50 %	0 %	0 %	50 %	386085285
52139	NC_017562	TGGTT	2	10	2484754	2484763	0 %	60 %	40 %	0 %	386085285
52140	NC_017562	CACGG	2	10	2484776	2484785	20 %	0 %	40 %	40 %	386085285
52141	NC_017562	CGG	2	6	2484799	2484804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52142	NC_017562	GAC	2	6	2484827	2484832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52143	NC_017562	CAC	2	6	2484953	2484958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085285
52144	NC_017562	CATCG	2	10	2484971	2484980	20 %	20 %	20 %	40 %	386085285
52145	NC_017562	TGA	2	6	2485015	2485020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085285
52146	NC_017562	CTC	2	6	2485058	2485063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085285
52147	NC_017562	GCA	2	6	2485084	2485089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52148	NC_017562	CTG	2	6	2485124	2485129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52149	NC_017562	GGC	2	6	2485264	2485269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52150	NC_017562	T	6	6	2485278	2485283	0 %	100 %	0 %	0 %	386085285
52151	NC_017562	GAG	2	6	2485322	2485327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085285
52152	NC_017562	CGC	2	6	2485339	2485344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085285
52153	NC_017562	GGCT	2	8	2485371	2485378	0 %	25 %	50 %	25 %	386085285
52154	NC_017562	GCTG	2	8	2485386	2485393	0 %	25 %	50 %	25 %	386085285
52155	NC_017562	ATTC	2	8	2485441	2485448	25 %	50 %	0 %	25 %	386085285
52156	NC_017562	GGC	4	12	2485468	2485479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085285
52157	NC_017562	TCG	2	6	2485571	2485576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085285
52158	NC_017562	ATC	2	6	2485580	2485585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085285
52159	NC_017562	CCA	2	6	2485624	2485629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085285
52160	NC_017562	GTT	2	6	2485678	2485683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085285
52161	NC_017562	GCC	2	6	2485775	2485780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085286
52162	NC_017562	GCC	2	6	2485783	2485788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085286
52163	NC_017562	A	6	6	2485793	2485798	100 %	0 %	0 %	0 %	386085286
52164	NC_017562	GCA	2	6	2485836	2485841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085286
52165	NC_017562	GCG	2	6	2485849	2485854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085286
52166	NC_017562	GGT	2	6	2485897	2485902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52167	NC_017562	CATC	2	8	2486037	2486044	25 %	25 %	0 %	50 %	386085287
52168	NC_017562	GCA	3	9	2486049	2486057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085287
52169	NC_017562	GCC	2	6	2486084	2486089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085287
52170	NC_017562	TCA	2	6	2486106	2486111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085287
52171	NC_017562	G	10	10	2486248	2486257	0 %	0 %	100 %	0 %	386085287
52172	NC_017562	CAC	2	6	2486280	2486285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085287
52173	NC_017562	CGC	2	6	2486342	2486347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085287
52174	NC_017562	TGC	2	6	2486350	2486355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52175	NC_017562	GCTGT	2	10	2486388	2486397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52176	NC_017562	GATC	2	8	2486422	2486429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52177	NC_017562	CGGCAT	2	12	2486480	2486491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52178	NC_017562	AGC	2	6	2486551	2486556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52179	NC_017562	GAT	2	6	2486613	2486618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52180	NC_017562	ATGG	2	8	2486631	2486638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52181	NC_017562	CCG	2	6	2486895	2486900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085288
52182	NC_017562	CGA	2	6	2486906	2486911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085289
52183	NC_017562	TTC	2	6	2486963	2486968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085289
52184	NC_017562	CCA	2	6	2487108	2487113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085290
52185	NC_017562	ACA	2	6	2487124	2487129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085290
52186	NC_017562	CGC	2	6	2487133	2487138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085290
52187	NC_017562	GCC	2	6	2487153	2487158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085290
52188	NC_017562	A	6	6	2487166	2487171	100 %	0 %	0 %	0 %	386085290
52189	NC_017562	TGC	2	6	2487313	2487318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085290
52190	NC_017562	TGGCTT	2	12	2487345	2487356	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386085290
52191	NC_017562	AC	3	6	2487390	2487395	50 %	0 %	0 %	50 %	386085290
52192	NC_017562	CAG	2	6	2487421	2487426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085290
52193	NC_017562	AC	3	6	2487486	2487491	50 %	0 %	0 %	50 %	386085290
52194	NC_017562	GAATGC	2	12	2487663	2487674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386085290
52195	NC_017562	GAA	2	6	2487766	2487771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085290
52196	NC_017562	GAT	2	6	2487796	2487801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085290
52197	NC_017562	CCAT	2	8	2487834	2487841	25 %	25 %	0 %	50 %	386085290
52198	NC_017562	GCC	2	6	2487873	2487878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085290
52199	NC_017562	TGA	2	6	2488142	2488147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085291
52200	NC_017562	TCT	2	6	2488171	2488176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085291
52201	NC_017562	CAA	2	6	2488266	2488271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085292
52202	NC_017562	TGA	2	6	2488286	2488291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085292
52203	NC_017562	TGA	2	6	2488312	2488317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085292
52204	NC_017562	AAG	2	6	2488325	2488330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085292
52205	NC_017562	CTT	2	6	2488343	2488348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085292
52206	NC_017562	ATC	2	6	2488445	2488450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085292
52207	NC_017562	GCG	2	6	2488550	2488555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085293
52208	NC_017562	CCG	2	6	2488560	2488565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085293
52209	NC_017562	CGA	2	6	2488576	2488581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085293
52210	NC_017562	GCCAAT	2	12	2488641	2488652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386085293
52211	NC_017562	AGG	2	6	2488655	2488660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085293
52212	NC_017562	ACC	2	6	2488691	2488696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085293
52213	NC_017562	GC	3	6	2488749	2488754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52214	NC_017562	CTG	2	6	2488848	2488853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085294
52215	NC_017562	CTGCGT	2	12	2488885	2488896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085294
52216	NC_017562	TAC	2	6	2488918	2488923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085294
52217	NC_017562	GC	3	6	2488949	2488954	0 %	0 %	50 %	50 %	386085294
52218	NC_017562	CAC	2	6	2489001	2489006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085294
52219	NC_017562	CGG	2	6	2489010	2489015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085294
52220	NC_017562	GCC	2	6	2489062	2489067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085294
52221	NC_017562	CCG	2	6	2489087	2489092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085294
52222	NC_017562	ACG	2	6	2489117	2489122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085294
52223	NC_017562	CGC	2	6	2489148	2489153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085294
52224	NC_017562	C	6	6	2489194	2489199	0 %	0 %	0 %	100 %	386085294
52225	NC_017562	GCG	2	6	2489221	2489226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085294
52226	NC_017562	ATG	2	6	2489259	2489264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085294
52227	NC_017562	G	7	7	2489347	2489353	0 %	0 %	100 %	0 %	386085294
52228	NC_017562	CAG	2	6	2489430	2489435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085294
52229	NC_017562	CGTGGT	2	12	2489489	2489500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386085295
52230	NC_017562	TGA	2	6	2489553	2489558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085295
52231	NC_017562	GCA	2	6	2489564	2489569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085295
52232	NC_017562	CGCC	2	8	2489571	2489578	0 %	0 %	25 %	75 %	386085295
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