MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_017562	AGTGCG	2	12	2355205	2355216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386085142
49502	NC_017562	CGA	2	6	2355237	2355242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085142
49503	NC_017562	TTA	2	6	2355257	2355262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085142
49504	NC_017562	A	6	6	2355349	2355354	100 %	0 %	0 %	0 %	386085142
49505	NC_017562	GACG	2	8	2355365	2355372	25 %	0 %	50 %	25 %	386085142
49506	NC_017562	T	6	6	2355407	2355412	0 %	100 %	0 %	0 %	386085142
49507	NC_017562	TCT	2	6	2355426	2355431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085142
49508	NC_017562	CGA	2	6	2355433	2355438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085142
49509	NC_017562	CTT	2	6	2355461	2355466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085142
49510	NC_017562	GTA	2	6	2355473	2355478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085142
49511	NC_017562	CAG	2	6	2355484	2355489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085142
49512	NC_017562	GTG	2	6	2355494	2355499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085142
49513	NC_017562	AGC	2	6	2355545	2355550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49514	NC_017562	ACG	2	6	2355578	2355583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49515	NC_017562	A	7	7	2355667	2355673	100 %	0 %	0 %	0 %	386085143
49516	NC_017562	TCAAAT	2	12	2355680	2355691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386085143
49517	NC_017562	CTT	2	6	2355739	2355744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085143
49518	NC_017562	AAC	2	6	2355857	2355862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49519	NC_017562	CAA	2	6	2355873	2355878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49520	NC_017562	CAG	2	6	2355882	2355887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49521	NC_017562	G	6	6	2355932	2355937	0 %	0 %	100 %	0 %	386085144
49522	NC_017562	CTC	2	6	2355946	2355951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085144
49523	NC_017562	ACA	2	6	2355983	2355988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085144
49524	NC_017562	TTC	2	6	2356078	2356083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085144
49525	NC_017562	GCA	2	6	2356193	2356198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085144
49526	NC_017562	GTG	2	6	2356330	2356335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085144
49527	NC_017562	ACC	2	6	2356340	2356345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085144
49528	NC_017562	CG	3	6	2356359	2356364	0 %	0 %	50 %	50 %	386085144
49529	NC_017562	TCAA	2	8	2356366	2356373	50 %	25 %	0 %	25 %	386085144
49530	NC_017562	A	6	6	2356372	2356377	100 %	0 %	0 %	0 %	386085144
49531	NC_017562	AAT	2	6	2356386	2356391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085144
49532	NC_017562	TGG	2	6	2356417	2356422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085144
49533	NC_017562	T	6	6	2356450	2356455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49534	NC_017562	CA	3	6	2356478	2356483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49535	NC_017562	GCT	2	6	2356529	2356534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085145
49536	NC_017562	TAC	2	6	2356550	2356555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085145
49537	NC_017562	GATC	2	8	2356823	2356830	25 %	25 %	25 %	25 %	386085146
49538	NC_017562	CA	3	6	2356848	2356853	50 %	0 %	0 %	50 %	386085146
49539	NC_017562	GATC	2	8	2356910	2356917	25 %	25 %	25 %	25 %	386085146
49540	NC_017562	AAC	2	6	2356920	2356925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085146
49541	NC_017562	GGC	3	9	2356930	2356938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085146
49542	NC_017562	CCA	2	6	2356946	2356951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085146
49543	NC_017562	CAA	2	6	2357043	2357048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085146
49544	NC_017562	CTG	2	6	2357055	2357060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085146
49545	NC_017562	CACC	2	8	2357147	2357154	25 %	0 %	0 %	75 %	386085146
49546	NC_017562	GCT	2	6	2357186	2357191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085146
49547	NC_017562	TAA	2	6	2357305	2357310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085146
49548	NC_017562	GCC	2	6	2357357	2357362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085146
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49550	NC_017562	CAAGC	2	10	2357549	2357558	40 %	0 %	20 %	40 %	386085146
49551	NC_017562	GCAA	2	8	2357578	2357585	50 %	0 %	25 %	25 %	386085146
49552	NC_017562	CAAC	2	8	2357715	2357722	50 %	0 %	0 %	50 %	386085146
49553	NC_017562	GCA	2	6	2357765	2357770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085146
49554	NC_017562	ACA	2	6	2357792	2357797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085146
49555	NC_017562	CAC	2	6	2357934	2357939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085146
49556	NC_017562	GC	3	6	2358048	2358053	0 %	0 %	50 %	50 %	386085146
49557	NC_017562	CAAC	2	8	2358065	2358072	50 %	0 %	0 %	50 %	386085146
49558	NC_017562	CAA	2	6	2358078	2358083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085146
49559	NC_017562	GCC	2	6	2358129	2358134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085146
49560	NC_017562	CAA	2	6	2358233	2358238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085146
49561	NC_017562	ACCGC	2	10	2358248	2358257	20 %	0 %	20 %	60 %	386085146
49562	NC_017562	ACT	2	6	2358262	2358267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085146
49563	NC_017562	CTT	2	6	2358344	2358349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085146
49564	NC_017562	TC	3	6	2358410	2358415	0 %	50 %	0 %	50 %	386085146
49565	NC_017562	AAG	2	6	2358466	2358471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085146
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49567	NC_017562	CTG	2	6	2358492	2358497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085146
49568	NC_017562	ACC	2	6	2358543	2358548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49569	NC_017562	CTG	2	6	2358612	2358617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085147
49570	NC_017562	ACA	2	6	2358646	2358651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085147
49571	NC_017562	CAG	2	6	2358660	2358665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085147
49572	NC_017562	TCCA	2	8	2358673	2358680	25 %	25 %	0 %	50 %	386085147
49573	NC_017562	CGA	2	6	2358710	2358715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085147
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49575	NC_017562	CTG	2	6	2358750	2358755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085147
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49578	NC_017562	CTG	2	6	2358894	2358899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085147
49579	NC_017562	ACTCT	2	10	2358939	2358948	20 %	40 %	0 %	40 %	386085147
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49583	NC_017562	CAC	2	6	2359123	2359128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085147
49584	NC_017562	CTA	2	6	2359143	2359148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085147
49585	NC_017562	TGC	2	6	2359425	2359430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085147
49586	NC_017562	TTC	2	6	2359448	2359453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085147
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49588	NC_017562	ACA	4	12	2359494	2359505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085147
49589	NC_017562	GCCG	2	8	2359609	2359616	0 %	0 %	50 %	50 %	386085148
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49597	NC_017562	GCATC	2	10	2360122	2360131	20 %	20 %	20 %	40 %	386085148
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49599	NC_017562	GCT	2	6	2360244	2360249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085148
49600	NC_017562	CT	3	6	2360262	2360267	0 %	50 %	0 %	50 %	386085148
49601	NC_017562	TTTGCC	2	12	2360288	2360299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386085148
49602	NC_017562	TTA	2	6	2360355	2360360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085148
49603	NC_017562	GCA	2	6	2360541	2360546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085149
49604	NC_017562	ATG	2	6	2360547	2360552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085149
49605	NC_017562	TGCC	2	8	2360683	2360690	0 %	25 %	25 %	50 %	386085149
49606	NC_017562	GCT	2	6	2360693	2360698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085149
49607	NC_017562	CAATG	2	10	2360701	2360710	40 %	20 %	20 %	20 %	386085149
49608	NC_017562	GC	3	6	2360861	2360866	0 %	0 %	50 %	50 %	386085149
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49612	NC_017562	CGA	2	6	2360927	2360932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085149
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