MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_006834	GGT	2	6	527812	527817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580134
12502	NC_006834	CGG	2	6	527863	527868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580134
12503	NC_006834	GCA	2	6	527872	527877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580134
12504	NC_006834	CGG	2	6	527928	527933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580134
12505	NC_006834	GCA	2	6	527952	527957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_006834	GCC	2	6	528022	528027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580135
12507	NC_006834	CAG	2	6	528063	528068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12508	NC_006834	GCCA	2	8	528076	528083	25 %	0 %	25 %	50 %	58580135
12509	NC_006834	CG	3	6	528127	528132	0 %	0 %	50 %	50 %	58580135
12510	NC_006834	CCA	3	9	528140	528148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580135
12511	NC_006834	GCCGC	2	10	528158	528167	0 %	0 %	40 %	60 %	58580135
12512	NC_006834	GC	3	6	528171	528176	0 %	0 %	50 %	50 %	58580135
12513	NC_006834	CGC	3	9	528200	528208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580135
12514	NC_006834	GCA	2	6	528242	528247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12515	NC_006834	GCA	2	6	528301	528306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12516	NC_006834	CG	3	6	528313	528318	0 %	0 %	50 %	50 %	58580135
12517	NC_006834	GCG	2	6	528377	528382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12518	NC_006834	GCA	2	6	528416	528421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12519	NC_006834	GGC	2	6	528444	528449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12520	NC_006834	CAG	2	6	528504	528509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12521	NC_006834	GGCCG	2	10	528516	528525	0 %	0 %	60 %	40 %	58580135
12522	NC_006834	GCG	2	6	528650	528655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12523	NC_006834	CGG	2	6	528668	528673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12524	NC_006834	CGG	3	9	528682	528690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12525	NC_006834	GTG	2	6	528703	528708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580135
12526	NC_006834	CCG	2	6	528819	528824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580135
12527	NC_006834	GCC	2	6	528859	528864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580135
12528	NC_006834	CCA	2	6	528944	528949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580135
12529	NC_006834	CGT	2	6	528981	528986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580135
12530	NC_006834	CCA	2	6	528992	528997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580135
12531	NC_006834	GCG	2	6	529005	529010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580135
12532	NC_006834	AGG	2	6	529087	529092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58580135
12533	NC_006834	GCA	2	6	529189	529194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_006834	GC	3	6	529218	529223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12535	NC_006834	CG	3	6	529237	529242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_006834	CGA	2	6	529247	529252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_006834	GCG	2	6	529258	529263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_006834	TTGC	2	8	529270	529277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_006834	CGCA	2	8	529357	529364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_006834	CAA	2	6	529373	529378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_006834	CTGCA	2	10	529383	529392	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12542	NC_006834	AGC	2	6	529466	529471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_006834	ACG	2	6	529483	529488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_006834	CCCG	2	8	529492	529499	0 %	0 %	25 %	75 %	58580136
12545	NC_006834	GC	3	6	529558	529563	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12546	NC_006834	CTGT	2	8	529575	529582	0 %	50 %	25 %	25 %	58580136
12547	NC_006834	GGC	2	6	529625	529630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580136
12548	NC_006834	GCT	2	6	529653	529658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12549	NC_006834	TGC	2	6	529748	529753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12550	NC_006834	CAC	2	6	529825	529830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580136
12551	NC_006834	ACC	2	6	529862	529867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580136
12552	NC_006834	GCCG	2	8	529876	529883	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12553	NC_006834	GGC	2	6	529903	529908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580136
12554	NC_006834	ATGC	2	8	529954	529961	25 %	25 %	25 %	25 %	58580136
12555	NC_006834	GC	3	6	529960	529965	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12556	NC_006834	CGGC	2	8	530026	530033	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12557	NC_006834	CGGC	2	8	530052	530059	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12558	NC_006834	GC	3	6	530066	530071	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12559	NC_006834	GCC	2	6	530098	530103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580136
12560	NC_006834	GGT	2	6	530104	530109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580136
12561	NC_006834	CATC	2	8	530166	530173	25 %	25 %	0 %	50 %	58580136
12562	NC_006834	TCG	2	6	530237	530242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12563	NC_006834	GCCG	2	8	530281	530288	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12564	NC_006834	CCA	2	6	530322	530327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580136
12565	NC_006834	CGT	2	6	530335	530340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12566	NC_006834	CG	3	6	530344	530349	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12567	NC_006834	TCG	2	6	530408	530413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12568	NC_006834	GC	3	6	530429	530434	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12569	NC_006834	CCT	2	6	530496	530501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58580136
12570	NC_006834	GCT	2	6	530625	530630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
12571	NC_006834	GCG	2	6	530646	530651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580136
12572	NC_006834	GC	3	6	530733	530738	0 %	0 %	50 %	50 %	58580136
12573	NC_006834	GCC	2	6	530798	530803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580136
12574	NC_006834	TGCAG	2	10	530828	530837	20 %	20 %	40 %	20 %	58580136
12575	NC_006834	TGG	2	6	530840	530845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580136
12576	NC_006834	TGC	2	6	530900	530905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580136
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12578	NC_006834	GTT	2	6	531046	531051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_006834	CGA	2	6	531090	531095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_006834	TC	3	6	531097	531102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12581	NC_006834	TGC	2	6	531236	531241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_006834	CAA	2	6	531243	531248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_006834	CAG	2	6	531262	531267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_006834	TCA	2	6	531273	531278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_006834	GCG	2	6	531470	531475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_006834	GC	3	6	531509	531514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_006834	TGA	2	6	531526	531531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_006834	CAGC	2	8	531550	531557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_006834	CCAT	2	8	531567	531574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_006834	CGG	2	6	531637	531642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_006834	CAC	2	6	531702	531707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12592	NC_006834	CTG	2	6	531728	531733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_006834	CGA	2	6	531835	531840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_006834	GATC	2	8	531856	531863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12595	NC_006834	CG	3	6	531936	531941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_006834	GC	3	6	531959	531964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_006834	ATG	2	6	531984	531989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_006834	CAGGG	2	10	532035	532044	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12599	NC_006834	CTG	2	6	532055	532060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_006834	GTG	3	9	532073	532081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_006834	CTG	2	6	532109	532114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_006834	GCC	2	6	532118	532123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_006834	CG	3	6	532169	532174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_006834	TGC	2	6	532305	532310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_006834	GGC	2	6	532313	532318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_006834	TA	3	6	532348	532353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_006834	GCG	2	6	532465	532470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_006834	ATG	2	6	532581	532586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_006834	GCTA	2	8	532591	532598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12610	NC_006834	GCG	2	6	532631	532636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_006834	GGC	2	6	532726	532731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_006834	GGC	2	6	532784	532789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_006834	AGGA	2	8	532889	532896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_006834	GGC	2	6	533052	533057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_006834	GCA	2	6	533083	533088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_006834	GGA	2	6	533216	533221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_006834	CG	3	6	533233	533238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12618	NC_006834	CCA	2	6	533284	533289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12619	NC_006834	CGA	2	6	533293	533298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_006834	GAT	2	6	533318	533323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_006834	GCA	2	6	533367	533372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_006834	GAA	2	6	533426	533431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_006834	GAAA	2	8	533462	533469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_006834	CAG	2	6	533535	533540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_006834	GCGT	2	8	533591	533598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_006834	GGT	3	9	533600	533608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_006834	TGT	2	6	533616	533621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_006834	GGA	2	6	533726	533731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12850	NC_006834	CGA	2	6	543847	543852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122879024
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12854	NC_006834	CG	4	8	543977	543984	0 %	0 %	50 %	50 %	122879024
12855	NC_006834	ATG	2	6	544038	544043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	122879024
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12857	NC_006834	CGGC	2	8	544111	544118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12858	NC_006834	GC	3	6	544128	544133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12859	NC_006834	GTC	2	6	544157	544162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12861	NC_006834	AAC	2	6	544175	544180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12862	NC_006834	CAC	2	6	544331	544336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580144
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12864	NC_006834	CAGC	2	8	544347	544354	25 %	0 %	25 %	50 %	58580144
12865	NC_006834	GCCA	2	8	544382	544389	25 %	0 %	25 %	50 %	58580144
12866	NC_006834	GCGCCA	2	12	544395	544406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58580144
12867	NC_006834	GTG	2	6	544418	544423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580144
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12870	NC_006834	GGCGCC	2	12	544549	544560	0 %	0 %	50 %	50 %	58580144
12871	NC_006834	GCA	2	6	544629	544634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580144
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12874	NC_006834	CAC	2	6	544715	544720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580144
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12980	NC_006834	GTGCA	2	10	548949	548958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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12999	NC_006834	GC	3	6	549837	549842	0 %	0 %	50 %	50 %	122879026
13000	NC_006834	GC	3	6	549861	549866	0 %	0 %	50 %	50 %	122879026

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