MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003919	TCT	2	6	138605	138610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240892
3502	NC_003919	CGG	2	6	138668	138673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240892
3503	NC_003919	TGCC	2	8	138688	138695	0 %	25 %	25 %	50 %	21240892
3504	NC_003919	AGCG	2	8	138698	138705	25 %	0 %	50 %	25 %	21240892
3505	NC_003919	CAG	2	6	138709	138714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240892
3506	NC_003919	GC	3	6	138732	138737	0 %	0 %	50 %	50 %	21240892
3507	NC_003919	CAG	2	6	138742	138747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240892
3508	NC_003919	GCC	2	6	138754	138759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240892
3509	NC_003919	CCA	2	6	138786	138791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240892
3510	NC_003919	CAC	2	6	138805	138810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240892
3511	NC_003919	GCG	2	6	138824	138829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240892
3512	NC_003919	GCG	2	6	138857	138862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240892
3513	NC_003919	GTT	2	6	138871	138876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240892
3514	NC_003919	GC	3	6	138923	138928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_003919	GC	3	6	138931	138936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_003919	CG	3	6	138961	138966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_003919	GC	3	6	138970	138975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_003919	GCG	2	6	139012	139017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_003919	TTG	2	6	139086	139091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77748508
3520	NC_003919	TTG	2	6	139125	139130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77748508
3521	NC_003919	GGC	2	6	139147	139152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748508
3522	NC_003919	GTC	2	6	139190	139195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748508
3523	NC_003919	CGG	2	6	139226	139231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748508
3524	NC_003919	GAA	2	6	139247	139252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77748508
3525	NC_003919	GTC	2	6	139367	139372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748508
3526	NC_003919	CACGAA	2	12	139373	139384	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	77748508
3527	NC_003919	GCC	2	6	139385	139390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748508
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3529	NC_003919	GC	3	6	139574	139579	0 %	0 %	50 %	50 %	77748508
3530	NC_003919	GCCG	2	8	139637	139644	0 %	0 %	50 %	50 %	77748508
3531	NC_003919	CG	6	12	139643	139654	0 %	0 %	50 %	50 %	77748508
3532	NC_003919	CCA	2	6	139680	139685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748508
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3534	NC_003919	GCG	2	6	139711	139716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748508
3535	NC_003919	GAC	2	6	139719	139724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748508
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3537	NC_003919	TGC	2	6	139784	139789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748508
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3539	NC_003919	ATC	3	9	139889	139897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240894
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3541	NC_003919	TCG	2	6	139943	139948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240894
3542	NC_003919	TGT	2	6	139950	139955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240894
3543	NC_003919	TTC	2	6	139991	139996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240894
3544	NC_003919	CAG	2	6	140056	140061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240894
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3550	NC_003919	TTG	2	6	140375	140380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240894
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3552	NC_003919	GCGCG	2	10	140420	140429	0 %	0 %	60 %	40 %	21240894
3553	NC_003919	GAA	2	6	140434	140439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240894
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3555	NC_003919	GCC	3	9	140468	140476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240894
3556	NC_003919	CGG	2	6	140580	140585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240894
3557	NC_003919	CCCA	2	8	140603	140610	25 %	0 %	0 %	75 %	21240894
3558	NC_003919	GC	3	6	140659	140664	0 %	0 %	50 %	50 %	21240894
3559	NC_003919	GCCG	2	8	140734	140741	0 %	0 %	50 %	50 %	21240894
3560	NC_003919	GCCCTT	2	12	140749	140760	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	21240894
3561	NC_003919	CGG	2	6	140778	140783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240894
3562	NC_003919	GC	3	6	140790	140795	0 %	0 %	50 %	50 %	21240894
3563	NC_003919	GATC	2	8	140805	140812	25 %	25 %	25 %	25 %	21240894
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3566	NC_003919	CGT	2	6	140943	140948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240894
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3569	NC_003919	CGA	2	6	141018	141023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240894
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3572	NC_003919	TCGA	2	8	141068	141075	25 %	25 %	25 %	25 %	21240894
3573	NC_003919	TCG	2	6	141098	141103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240894
3574	NC_003919	TGA	2	6	141117	141122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240894
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3577	NC_003919	TGA	2	6	141206	141211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240895
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3582	NC_003919	GAT	2	6	141483	141488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240895
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3585	NC_003919	CGG	2	6	141545	141550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240895
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3588	NC_003919	TCG	2	6	141721	141726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240895
3589	NC_003919	CTGC	2	8	141745	141752	0 %	25 %	25 %	50 %	21240895
3590	NC_003919	TCCAGC	2	12	141871	141882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21240895
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3593	NC_003919	GGC	2	6	142074	142079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240895
3594	NC_003919	AGCCC	2	10	142097	142106	20 %	0 %	20 %	60 %	21240895
3595	NC_003919	GCCG	2	8	142281	142288	0 %	0 %	50 %	50 %	21240895
3596	NC_003919	GGC	3	9	142293	142301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240895
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3600	NC_003919	TGG	2	6	142502	142507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240895
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3602	NC_003919	GCTC	2	8	142644	142651	0 %	25 %	25 %	50 %	21240895
3603	NC_003919	CGC	2	6	142662	142667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240895
3604	NC_003919	CTT	2	6	142692	142697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240895
3605	NC_003919	CGG	2	6	142730	142735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240895
3606	NC_003919	GCCC	2	8	142769	142776	0 %	0 %	25 %	75 %	21240895
3607	NC_003919	CG	3	6	142838	142843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_003919	GC	3	6	142844	142849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_003919	GGT	2	6	142851	142856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_003919	GTG	2	6	142857	142862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_003919	GC	3	6	142879	142884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_003919	CGA	2	6	143023	143028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_003919	CG	3	6	143036	143041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_003919	TTTC	2	8	143059	143066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_003919	CAA	2	6	143082	143087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_003919	ACC	2	6	143102	143107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_003919	AACG	2	8	143255	143262	50 %	0 %	25 %	25 %	21240896
3618	NC_003919	CG	3	6	143261	143266	0 %	0 %	50 %	50 %	21240896
3619	NC_003919	GC	3	6	143293	143298	0 %	0 %	50 %	50 %	21240896
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3623	NC_003919	TGACC	2	10	143460	143469	20 %	20 %	20 %	40 %	21240896
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3625	NC_003919	CCG	2	6	143495	143500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240896
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