MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_003919	CAC	2	6	5010079	5010084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748768
123002	NC_003919	CGG	2	6	5010090	5010095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748768
123003	NC_003919	CAC	2	6	5010113	5010118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748768
123004	NC_003919	GCG	2	6	5010255	5010260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748768
123005	NC_003919	GCC	2	6	5010265	5010270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748768
123006	NC_003919	GTC	2	6	5010274	5010279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748768
123007	NC_003919	TGCG	2	8	5010290	5010297	0 %	25 %	50 %	25 %	77748768
123008	NC_003919	GTTGGT	2	12	5010390	5010401	0 %	50 %	50 %	0 %	21244962
123009	NC_003919	TCCAG	2	10	5010419	5010428	20 %	20 %	20 %	40 %	21244962
123010	NC_003919	CGT	2	6	5010522	5010527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123011	NC_003919	GCA	2	6	5010533	5010538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123012	NC_003919	GCA	2	6	5010545	5010550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123013	NC_003919	CG	3	6	5010587	5010592	0 %	0 %	50 %	50 %	21244962
123014	NC_003919	CGC	2	6	5010602	5010607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244962
123015	NC_003919	GC	3	6	5010606	5010611	0 %	0 %	50 %	50 %	21244962
123016	NC_003919	GATC	2	8	5010635	5010642	25 %	25 %	25 %	25 %	21244962
123017	NC_003919	CGC	2	6	5010668	5010673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244962
123018	NC_003919	ACA	2	6	5010710	5010715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244962
123019	NC_003919	CGA	2	6	5010725	5010730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123020	NC_003919	TGT	2	6	5010764	5010769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244962
123021	NC_003919	GTCG	2	8	5010786	5010793	0 %	25 %	50 %	25 %	21244962
123022	NC_003919	GCG	2	6	5010821	5010826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244962
123023	NC_003919	GC	3	6	5010834	5010839	0 %	0 %	50 %	50 %	21244962
123024	NC_003919	CCG	2	6	5010907	5010912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244962
123025	NC_003919	CTG	2	6	5010948	5010953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123026	NC_003919	CG	3	6	5011055	5011060	0 %	0 %	50 %	50 %	21244962
123027	NC_003919	TCA	2	6	5011073	5011078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244962
123028	NC_003919	GCA	2	6	5011172	5011177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244962
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123030	NC_003919	CGG	2	6	5011260	5011265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244962
123031	NC_003919	TGC	2	6	5011270	5011275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244962
123032	NC_003919	GC	4	8	5011274	5011281	0 %	0 %	50 %	50 %	21244962
123033	NC_003919	TGGC	2	8	5011304	5011311	0 %	25 %	50 %	25 %	21244963
123034	NC_003919	CG	3	6	5011387	5011392	0 %	0 %	50 %	50 %	21244963
123035	NC_003919	GTC	2	6	5011486	5011491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244963
123036	NC_003919	GC	3	6	5011501	5011506	0 %	0 %	50 %	50 %	21244963
123037	NC_003919	CAC	2	6	5011555	5011560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244963
123038	NC_003919	GGC	2	6	5011579	5011584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244963
123039	NC_003919	GCC	2	6	5011661	5011666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244963
123040	NC_003919	ACGC	2	8	5011700	5011707	25 %	0 %	25 %	50 %	21244963
123041	NC_003919	GCA	2	6	5011716	5011721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244963
123042	NC_003919	AGT	2	6	5011779	5011784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123043	NC_003919	GAT	2	6	5011802	5011807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123044	NC_003919	CTT	2	6	5011811	5011816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123045	NC_003919	GCA	2	6	5011865	5011870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123046	NC_003919	CAC	2	6	5011922	5011927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123047	NC_003919	GCCT	2	8	5011968	5011975	0 %	25 %	25 %	50 %	21244964
123048	NC_003919	CAGC	2	8	5011987	5011994	25 %	0 %	25 %	50 %	21244964
123049	NC_003919	CG	3	6	5012012	5012017	0 %	0 %	50 %	50 %	21244964
123050	NC_003919	GCT	2	6	5012024	5012029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244964
123051	NC_003919	GCG	4	12	5012044	5012055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244964
123052	NC_003919	GCG	2	6	5012077	5012082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244964
123053	NC_003919	CG	3	6	5012081	5012086	0 %	0 %	50 %	50 %	21244964
123054	NC_003919	GGC	2	6	5012125	5012130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244964
123055	NC_003919	CGA	2	6	5012132	5012137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244964
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123057	NC_003919	ACGC	2	8	5012207	5012214	25 %	0 %	25 %	50 %	21244964
123058	NC_003919	CGC	2	6	5012263	5012268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244964
123059	NC_003919	GCG	2	6	5012316	5012321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244964
123060	NC_003919	GCCA	2	8	5012353	5012360	25 %	0 %	25 %	50 %	21244964
123061	NC_003919	GCA	2	6	5012373	5012378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244964
123062	NC_003919	CGCTC	2	10	5012381	5012390	0 %	20 %	20 %	60 %	21244964
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123064	NC_003919	CATCT	2	10	5012406	5012415	20 %	40 %	0 %	40 %	21244964
123065	NC_003919	GC	3	6	5012437	5012442	0 %	0 %	50 %	50 %	21244965
123066	NC_003919	CACGCG	2	12	5012464	5012475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21244965
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123070	NC_003919	GC	3	6	5012791	5012796	0 %	0 %	50 %	50 %	21244965
123071	NC_003919	CAG	2	6	5012842	5012847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244965
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123077	NC_003919	TCT	2	6	5013030	5013035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244965
123078	NC_003919	CAG	2	6	5013085	5013090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244965
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123082	NC_003919	GCG	2	6	5013346	5013351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244965
123083	NC_003919	GCA	2	6	5013416	5013421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244965
123084	NC_003919	ACGGC	2	10	5013435	5013444	20 %	0 %	40 %	40 %	21244965
123085	NC_003919	CAG	2	6	5013448	5013453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244965
123086	NC_003919	GGC	2	6	5013458	5013463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244965
123087	NC_003919	GTC	2	6	5013650	5013655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123088	NC_003919	CGGC	2	8	5013666	5013673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123089	NC_003919	CCA	2	6	5013708	5013713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244966
123090	NC_003919	TGA	2	6	5013737	5013742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244966
123091	NC_003919	CAG	2	6	5013754	5013759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244966
123092	NC_003919	CG	3	6	5013834	5013839	0 %	0 %	50 %	50 %	21244966
123093	NC_003919	AAC	2	6	5013863	5013868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244966
123094	NC_003919	GGCA	2	8	5013913	5013920	25 %	0 %	50 %	25 %	21244966
123095	NC_003919	GAT	2	6	5013994	5013999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244966
123096	NC_003919	CCTT	2	8	5014004	5014011	0 %	50 %	0 %	50 %	21244966
123097	NC_003919	ATC	2	6	5014046	5014051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244966
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123099	NC_003919	GGCC	2	8	5014207	5014214	0 %	0 %	50 %	50 %	21244966
123100	NC_003919	GTA	2	6	5014234	5014239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244966
123101	NC_003919	GCGAAG	2	12	5014268	5014279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21244966
123102	NC_003919	ACC	2	6	5014289	5014294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244966
123103	NC_003919	GTCGCC	2	12	5014297	5014308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21244966
123104	NC_003919	TCG	2	6	5014349	5014354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244966
123105	NC_003919	GC	4	8	5014422	5014429	0 %	0 %	50 %	50 %	21244966
123106	NC_003919	GCT	2	6	5014440	5014445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244966
123107	NC_003919	CGG	2	6	5014470	5014475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244966
123108	NC_003919	GAA	2	6	5014480	5014485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244966
123109	NC_003919	GACC	2	8	5014521	5014528	25 %	0 %	25 %	50 %	21244966
123110	NC_003919	ACG	2	6	5014594	5014599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244966
123111	NC_003919	CCA	2	6	5014605	5014610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244966
123112	NC_003919	TCA	2	6	5014620	5014625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244966
123113	NC_003919	CCA	2	6	5014659	5014664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244966
123114	NC_003919	GCA	2	6	5014667	5014672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244966
123115	NC_003919	GCG	2	6	5014775	5014780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244966
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123235	NC_003919	GCT	2	6	5019867	5019872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244969
123236	NC_003919	GGC	2	6	5019878	5019883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244969
123237	NC_003919	GCT	2	6	5019903	5019908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244969
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123239	NC_003919	TGGAAC	2	12	5019929	5019940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21244969
123240	NC_003919	TCG	2	6	5019974	5019979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244969
123241	NC_003919	AGT	2	6	5020059	5020064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244969
123242	NC_003919	TTGC	2	8	5020113	5020120	0 %	50 %	25 %	25 %	21244969
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123246	NC_003919	GCT	2	6	5020309	5020314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244970
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123253	NC_003919	CGC	2	6	5020477	5020482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244970
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123258	NC_003919	GCA	2	6	5020724	5020729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244971
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123310	NC_003919	GC	3	6	5023016	5023021	0 %	0 %	50 %	50 %	21244972
123311	NC_003919	GC	3	6	5023041	5023046	0 %	0 %	50 %	50 %	21244972
123312	NC_003919	CGG	2	6	5023047	5023052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244972
123313	NC_003919	TGCA	3	12	5023067	5023078	25 %	25 %	25 %	25 %	21244972
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123315	NC_003919	TTC	2	6	5023114	5023119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244972
123316	NC_003919	CTGCAC	2	12	5023138	5023149	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21244972
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123318	NC_003919	GCA	2	6	5023220	5023225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123319	NC_003919	TGGC	2	8	5023269	5023276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123320	NC_003919	CGTC	2	8	5023359	5023366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123321	NC_003919	TCG	2	6	5023382	5023387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123322	NC_003919	CGC	2	6	5023388	5023393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123323	NC_003919	AGGGA	2	10	5023450	5023459	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123324	NC_003919	GAA	2	6	5023467	5023472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123325	NC_003919	ATCC	2	8	5023509	5023516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123326	NC_003919	CCG	2	6	5023535	5023540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244973
123327	NC_003919	CCG	2	6	5023553	5023558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244973
123328	NC_003919	TCGG	2	8	5023687	5023694	0 %	25 %	50 %	25 %	21244973
123329	NC_003919	GC	3	6	5023786	5023791	0 %	0 %	50 %	50 %	21244973
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123334	NC_003919	GC	3	6	5024030	5024035	0 %	0 %	50 %	50 %	21244973
123335	NC_003919	A	6	6	5024102	5024107	100 %	0 %	0 %	0 %	21244973
123336	NC_003919	GCA	2	6	5024189	5024194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244973
123337	NC_003919	AC	3	6	5024249	5024254	50 %	0 %	0 %	50 %	21244973
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123339	NC_003919	GGCA	2	8	5024274	5024281	25 %	0 %	50 %	25 %	21244973
123340	NC_003919	GCCA	2	8	5024283	5024290	25 %	0 %	25 %	50 %	21244973
123341	NC_003919	CCAA	2	8	5024291	5024298	50 %	0 %	0 %	50 %	21244973
123342	NC_003919	CGG	2	6	5024300	5024305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244973
123343	NC_003919	GGC	3	9	5024320	5024328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244973
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123345	NC_003919	CGC	2	6	5024397	5024402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244973
123346	NC_003919	GCT	2	6	5024406	5024411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244973
123347	NC_003919	GC	3	6	5024413	5024418	0 %	0 %	50 %	50 %	21244973
123348	NC_003919	GATCA	2	10	5024437	5024446	40 %	20 %	20 %	20 %	21244973
123349	NC_003919	ACA	2	6	5024543	5024548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244973
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123351	NC_003919	AAC	2	6	5024665	5024670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244973
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123353	NC_003919	T	6	6	5024706	5024711	0 %	100 %	0 %	0 %	21244973
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