MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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115002	NC_003919	CTG	2	6	4698675	4698680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115003	NC_003919	CGCAG	2	10	4698681	4698690	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115004	NC_003919	GCA	2	6	4698717	4698722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244724
115005	NC_003919	CG	3	6	4698798	4698803	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
115006	NC_003919	GCGAA	2	10	4698826	4698835	40 %	0 %	40 %	20 %	21244724
115007	NC_003919	GCA	3	9	4698847	4698855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244724
115008	NC_003919	CCG	2	6	4698952	4698957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244724
115009	NC_003919	GGC	2	6	4698962	4698967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244724
115010	NC_003919	CAG	2	6	4699013	4699018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244724
115011	NC_003919	GC	5	10	4699031	4699040	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
115012	NC_003919	CAC	2	6	4699048	4699053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244724
115013	NC_003919	GC	3	6	4699056	4699061	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
115014	NC_003919	GCG	2	6	4699117	4699122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244724
115015	NC_003919	GATC	2	8	4699132	4699139	25 %	25 %	25 %	25 %	21244724
115016	NC_003919	CTG	2	6	4699151	4699156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244724
115017	NC_003919	GGC	2	6	4699202	4699207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244724
115018	NC_003919	GCG	2	6	4699216	4699221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244724
115019	NC_003919	AAC	2	6	4699245	4699250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244724
115020	NC_003919	GC	3	6	4699284	4699289	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
115021	NC_003919	CG	3	6	4699330	4699335	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
115022	NC_003919	TCG	2	6	4699413	4699418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244724
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115026	NC_003919	GC	3	6	4699657	4699662	0 %	0 %	50 %	50 %	21244724
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115029	NC_003919	GGC	2	6	4699784	4699789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244724
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115031	NC_003919	GGT	2	6	4699949	4699954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244724
115032	NC_003919	GGT	2	6	4699973	4699978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244724
115033	NC_003919	GGC	2	6	4700108	4700113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115034	NC_003919	CGT	2	6	4700115	4700120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115035	NC_003919	GCT	2	6	4700127	4700132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115036	NC_003919	GTC	2	6	4700168	4700173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244725
115037	NC_003919	GC	3	6	4700193	4700198	0 %	0 %	50 %	50 %	21244725
115038	NC_003919	TCG	3	9	4700289	4700297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244725
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115041	NC_003919	CGCGC	2	10	4700525	4700534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115042	NC_003919	GC	3	6	4700546	4700551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115043	NC_003919	A	6	6	4700554	4700559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115044	NC_003919	TGCA	2	8	4700582	4700589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115045	NC_003919	TTAC	2	8	4700598	4700605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115046	NC_003919	ACA	2	6	4700693	4700698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115047	NC_003919	CAG	2	6	4700709	4700714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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115049	NC_003919	GCG	2	6	4700754	4700759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115050	NC_003919	GATC	2	8	4700770	4700777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115051	NC_003919	CAA	2	6	4700782	4700787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115052	NC_003919	TTG	2	6	4700850	4700855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244726
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115056	NC_003919	CAG	2	6	4700945	4700950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244726
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115077	NC_003919	CCT	2	6	4702112	4702117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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115101	NC_003919	CGGC	2	8	4703316	4703323	0 %	0 %	50 %	50 %	21244730
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115109	NC_003919	TGG	2	6	4703502	4703507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244730
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115472	NC_003919	GGCA	2	8	4718531	4718538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115473	NC_003919	GC	3	6	4718545	4718550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115474	NC_003919	GC	3	6	4718554	4718559	0 %	0 %	50 %	50 %	21244745
115475	NC_003919	GTG	2	6	4718564	4718569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244745
115476	NC_003919	CGC	2	6	4718577	4718582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244745
115477	NC_003919	TGCCC	2	10	4718604	4718613	0 %	20 %	20 %	60 %	21244745
115478	NC_003919	GGC	2	6	4718641	4718646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244745
115479	NC_003919	GTT	2	6	4718710	4718715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244745
115480	NC_003919	GC	3	6	4718727	4718732	0 %	0 %	50 %	50 %	21244745
115481	NC_003919	GC	3	6	4718817	4718822	0 %	0 %	50 %	50 %	21244745
115482	NC_003919	CGGCGC	2	12	4718829	4718840	0 %	0 %	50 %	50 %	21244745
115483	NC_003919	TCG	2	6	4718909	4718914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244745
115484	NC_003919	GCGA	2	8	4718934	4718941	25 %	0 %	50 %	25 %	21244745
115485	NC_003919	GGC	2	6	4718964	4718969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244745
115486	NC_003919	CG	3	6	4718975	4718980	0 %	0 %	50 %	50 %	21244745
115487	NC_003919	GAA	2	6	4718986	4718991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244745
115488	NC_003919	GCAGCT	2	12	4719000	4719011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21244745
115489	NC_003919	GCGGAT	3	18	4719050	4719067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21244745
115490	NC_003919	ACA	2	6	4719123	4719128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244745
115491	NC_003919	A	9	9	4719150	4719158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115492	NC_003919	GAC	2	6	4719159	4719164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115493	NC_003919	GTC	2	6	4719184	4719189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115494	NC_003919	GCT	2	6	4719221	4719226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244746
115495	NC_003919	TGCT	2	8	4719313	4719320	0 %	50 %	25 %	25 %	21244746
115496	NC_003919	GGC	2	6	4719333	4719338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244746
115497	NC_003919	CTT	2	6	4719378	4719383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244746
115498	NC_003919	CTG	2	6	4719444	4719449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244746
115499	NC_003919	GC	3	6	4719480	4719485	0 %	0 %	50 %	50 %	21244746
115500	NC_003919	GGC	2	6	4719512	4719517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244746

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