MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_003919	CG	3	6	4658291	4658296	0 %	0 %	50 %	50 %	21244681
114002	NC_003919	GCA	2	6	4658357	4658362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244681
114003	NC_003919	CG	3	6	4658367	4658372	0 %	0 %	50 %	50 %	21244681
114004	NC_003919	TC	3	6	4658429	4658434	0 %	50 %	0 %	50 %	21244681
114005	NC_003919	GCA	2	6	4658489	4658494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244681
114006	NC_003919	GCA	2	6	4658496	4658501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244681
114007	NC_003919	GT	3	6	4658514	4658519	0 %	50 %	50 %	0 %	21244681
114008	NC_003919	AC	3	6	4658541	4658546	50 %	0 %	0 %	50 %	21244681
114009	NC_003919	CGC	2	6	4658559	4658564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244681
114010	NC_003919	CGC	2	6	4658586	4658591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114011	NC_003919	GC	3	6	4658590	4658595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114012	NC_003919	GGCT	2	8	4658598	4658605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114013	NC_003919	ACC	2	6	4658719	4658724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114014	NC_003919	AAT	2	6	4658742	4658747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114015	NC_003919	GC	3	6	4658874	4658879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114016	NC_003919	CG	3	6	4658882	4658887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114017	NC_003919	GAA	2	6	4658905	4658910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114018	NC_003919	TGC	2	6	4658997	4659002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114019	NC_003919	ACA	2	6	4659080	4659085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114020	NC_003919	GC	3	6	4659240	4659245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114021	NC_003919	TGG	2	6	4659306	4659311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114022	NC_003919	GCG	3	9	4659313	4659321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114023	NC_003919	CAC	2	6	4659355	4659360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114024	NC_003919	AGC	2	6	4659380	4659385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114025	NC_003919	CATG	2	8	4659425	4659432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114026	NC_003919	AGC	2	6	4659520	4659525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114027	NC_003919	CG	3	6	4659554	4659559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114028	NC_003919	CCG	2	6	4659564	4659569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114029	NC_003919	CGCGAC	2	12	4659572	4659583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114030	NC_003919	GCA	2	6	4659584	4659589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114031	NC_003919	GCC	2	6	4659648	4659653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114032	NC_003919	CGC	2	6	4659678	4659683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114033	NC_003919	CAG	2	6	4659706	4659711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114034	NC_003919	ACC	2	6	4659751	4659756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114035	NC_003919	GCA	2	6	4659979	4659984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244682
114036	NC_003919	CGA	2	6	4660058	4660063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244682
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114041	NC_003919	CG	3	6	4660198	4660203	0 %	0 %	50 %	50 %	21244682
114042	NC_003919	GCCG	2	8	4660223	4660230	0 %	0 %	50 %	50 %	21244682
114043	NC_003919	TCG	2	6	4660249	4660254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244682
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114046	NC_003919	GTCG	2	8	4660349	4660356	0 %	25 %	50 %	25 %	21244682
114047	NC_003919	CG	3	6	4660381	4660386	0 %	0 %	50 %	50 %	21244682
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114051	NC_003919	CG	3	6	4660509	4660514	0 %	0 %	50 %	50 %	21244682
114052	NC_003919	GTT	2	6	4660538	4660543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244682
114053	NC_003919	GCCT	2	8	4660554	4660561	0 %	25 %	25 %	50 %	21244682
114054	NC_003919	GGCGTC	2	12	4660623	4660634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21244682
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114057	NC_003919	GCA	2	6	4661002	4661007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244683
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114064	NC_003919	GGC	2	6	4661319	4661324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244683
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114069	NC_003919	GC	4	8	4661570	4661577	0 %	0 %	50 %	50 %	21244683
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114091	NC_003919	GCA	2	6	4662585	4662590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244684
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114103	NC_003919	CGAC	2	8	4663189	4663196	25 %	0 %	25 %	50 %	21244684
114104	NC_003919	CG	3	6	4663198	4663203	0 %	0 %	50 %	50 %	21244684
114105	NC_003919	CGC	2	6	4663217	4663222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114106	NC_003919	TAA	2	6	4663230	4663235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114108	NC_003919	GTG	2	6	4663293	4663298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114109	NC_003919	GCTC	2	8	4663318	4663325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114110	NC_003919	GGC	2	6	4663326	4663331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114111	NC_003919	CAAC	2	8	4663371	4663378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114112	NC_003919	CG	4	8	4663388	4663395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114113	NC_003919	GC	4	8	4663446	4663453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114114	NC_003919	GAC	2	6	4663466	4663471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244685
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114119	NC_003919	TGC	2	6	4663661	4663666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244685
114120	NC_003919	CG	3	6	4663710	4663715	0 %	0 %	50 %	50 %	21244685
114121	NC_003919	GCA	2	6	4663758	4663763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244685
114122	NC_003919	CCA	2	6	4663797	4663802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244685
114123	NC_003919	GGC	2	6	4663831	4663836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244685
114124	NC_003919	GCT	2	6	4663866	4663871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244685
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114126	NC_003919	CG	3	6	4663983	4663988	0 %	0 %	50 %	50 %	21244685
114127	NC_003919	GTC	2	6	4664092	4664097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244685
114128	NC_003919	ATGCAG	2	12	4664168	4664179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21244685
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114130	NC_003919	CG	3	6	4664196	4664201	0 %	0 %	50 %	50 %	21244685
114131	NC_003919	GCC	2	6	4664227	4664232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244685
114132	NC_003919	AAC	2	6	4664246	4664251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244685
114133	NC_003919	CGT	2	6	4664295	4664300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244685
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114153	NC_003919	CGCC	2	8	4665587	4665594	0 %	0 %	25 %	75 %	21244687
114154	NC_003919	CAA	2	6	4665604	4665609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244687
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114162	NC_003919	GTG	2	6	4665915	4665920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114163	NC_003919	TGC	2	6	4666007	4666012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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114165	NC_003919	GTTT	2	8	4666069	4666076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114166	NC_003919	ATCC	2	8	4666107	4666114	25 %	25 %	0 %	50 %	21244688
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114168	NC_003919	ATCT	2	8	4666226	4666233	25 %	50 %	0 %	25 %	21244688
114169	NC_003919	TCATC	2	10	4666299	4666308	20 %	40 %	0 %	40 %	21244688
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114173	NC_003919	CCGC	2	8	4666588	4666595	0 %	0 %	25 %	75 %	21244689
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114178	NC_003919	CT	4	8	4666812	4666819	0 %	50 %	0 %	50 %	21244690
114179	NC_003919	CTGC	2	8	4666822	4666829	0 %	25 %	25 %	50 %	21244690
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114186	NC_003919	GGC	2	6	4667135	4667140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244690
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114190	NC_003919	GC	3	6	4667278	4667283	0 %	0 %	50 %	50 %	21244690
114191	NC_003919	CGC	2	6	4667310	4667315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244690
114192	NC_003919	GTC	3	9	4667351	4667359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244690
114193	NC_003919	GGC	2	6	4667366	4667371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244690
114194	NC_003919	TGGG	2	8	4667423	4667430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114195	NC_003919	CGC	2	6	4667438	4667443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114196	NC_003919	GTC	2	6	4667445	4667450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114197	NC_003919	CGC	2	6	4667466	4667471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114198	NC_003919	GCGCA	2	10	4667481	4667490	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114199	NC_003919	TGCA	2	8	4667570	4667577	25 %	25 %	25 %	25 %	21244691
114200	NC_003919	TCA	2	6	4667583	4667588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244691
114201	NC_003919	CGG	2	6	4667590	4667595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244691
114202	NC_003919	TGC	2	6	4667631	4667636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114203	NC_003919	GGCC	2	8	4667638	4667645	0 %	0 %	50 %	50 %	21244691
114204	NC_003919	CCGCG	2	10	4667677	4667686	0 %	0 %	40 %	60 %	21244691
114205	NC_003919	AC	4	8	4667713	4667720	50 %	0 %	0 %	50 %	21244691
114206	NC_003919	TCA	2	6	4667745	4667750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244691
114207	NC_003919	CTGG	2	8	4667753	4667760	0 %	25 %	50 %	25 %	21244691
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114210	NC_003919	GCA	2	6	4667857	4667862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114211	NC_003919	GCCG	2	8	4667863	4667870	0 %	0 %	50 %	50 %	21244691
114212	NC_003919	CGG	2	6	4667901	4667906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244691
114213	NC_003919	CTA	2	6	4667911	4667916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244691
114214	NC_003919	CCG	2	6	4667955	4667960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244691
114215	NC_003919	GAAGCC	2	12	4667996	4668007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114216	NC_003919	CGC	2	6	4668016	4668021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244691
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114218	NC_003919	GC	3	6	4668078	4668083	0 %	0 %	50 %	50 %	21244691
114219	NC_003919	TGC	2	6	4668093	4668098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114220	NC_003919	CGG	3	9	4668112	4668120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244691
114221	NC_003919	GGCA	2	8	4668137	4668144	25 %	0 %	50 %	25 %	21244691
114222	NC_003919	TGC	2	6	4668195	4668200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114223	NC_003919	CGCA	2	8	4668262	4668269	25 %	0 %	25 %	50 %	21244691
114224	NC_003919	TGC	2	6	4668282	4668287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114225	NC_003919	CCGCC	2	10	4668289	4668298	0 %	0 %	20 %	80 %	21244691
114226	NC_003919	TGC	2	6	4668321	4668326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114227	NC_003919	CTG	3	9	4668353	4668361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114228	NC_003919	CAGC	2	8	4668364	4668371	25 %	0 %	25 %	50 %	21244691
114229	NC_003919	TGC	2	6	4668375	4668380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244691
114230	NC_003919	CG	3	6	4668386	4668391	0 %	0 %	50 %	50 %	21244691
114231	NC_003919	CGCTG	2	10	4668430	4668439	0 %	20 %	40 %	40 %	21244691
114232	NC_003919	GCAT	2	8	4668493	4668500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114233	NC_003919	GGCCT	2	10	4668501	4668510	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114234	NC_003919	TCA	2	6	4668549	4668554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114235	NC_003919	CTC	2	6	4668613	4668618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21244692
114236	NC_003919	GAC	2	6	4668625	4668630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244692
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114418	NC_003919	GC	3	6	4676709	4676714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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114459	NC_003919	CG	3	6	4678429	4678434	0 %	0 %	50 %	50 %	21244704
114460	NC_003919	CCCGA	2	10	4678452	4678461	20 %	0 %	20 %	60 %	21244704
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114463	NC_003919	CACCC	2	10	4678608	4678617	20 %	0 %	0 %	80 %	21244704
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114466	NC_003919	GC	3	6	4678731	4678736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114467	NC_003919	CGC	2	6	4678791	4678796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244705
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114491	NC_003919	GCC	2	6	4680056	4680061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244705
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114493	NC_003919	TGC	2	6	4680104	4680109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244705
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114497	NC_003919	CAA	2	6	4680203	4680208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244706
114498	NC_003919	TGCG	2	8	4680358	4680365	0 %	25 %	50 %	25 %	21244706
114499	NC_003919	CCG	2	6	4680366	4680371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244706
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