MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111001	NC_003919	TACGTG	2	12	4528389	4528400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21244572
111002	NC_003919	ACA	2	6	4528411	4528416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244572
111003	NC_003919	GTG	2	6	4528434	4528439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244572
111004	NC_003919	GAC	2	6	4528455	4528460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244572
111005	NC_003919	GTG	2	6	4528503	4528508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244572
111006	NC_003919	GCA	2	6	4528537	4528542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244572
111007	NC_003919	GC	3	6	4528549	4528554	0 %	0 %	50 %	50 %	21244572
111008	NC_003919	CGC	2	6	4528570	4528575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244572
111009	NC_003919	ACCG	2	8	4528580	4528587	25 %	0 %	25 %	50 %	21244572
111010	NC_003919	GTG	3	9	4528624	4528632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244572
111011	NC_003919	CGG	2	6	4528637	4528642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244572
111012	NC_003919	CGT	2	6	4528644	4528649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244572
111013	NC_003919	GGC	2	6	4528650	4528655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244572
111014	NC_003919	C	6	6	4528755	4528760	0 %	0 %	0 %	100 %	21244573
111015	NC_003919	CCG	2	6	4528784	4528789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111016	NC_003919	GTT	2	6	4528805	4528810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244573
111017	NC_003919	CTG	3	9	4528824	4528832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111018	NC_003919	GTC	2	6	4528896	4528901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111019	NC_003919	ACC	2	6	4528902	4528907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111020	NC_003919	ACC	2	6	4528929	4528934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111021	NC_003919	CGC	2	6	4528954	4528959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111022	NC_003919	GAT	2	6	4528994	4528999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111023	NC_003919	TCG	2	6	4529010	4529015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111024	NC_003919	CGATAT	2	12	4529057	4529068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21244573
111025	NC_003919	GGC	2	6	4529087	4529092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111026	NC_003919	GCG	2	6	4529163	4529168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111027	NC_003919	CGCTGC	2	12	4529197	4529208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21244573
111028	NC_003919	GC	3	6	4529371	4529376	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111029	NC_003919	GCTC	2	8	4529407	4529414	0 %	25 %	25 %	50 %	21244573
111030	NC_003919	CAT	2	6	4529486	4529491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244573
111031	NC_003919	GCC	2	6	4529506	4529511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111032	NC_003919	GCC	2	6	4529568	4529573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111033	NC_003919	TGC	2	6	4529596	4529601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111034	NC_003919	CCG	2	6	4529609	4529614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111035	NC_003919	GCCG	2	8	4529687	4529694	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111036	NC_003919	TGG	3	9	4529785	4529793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111037	NC_003919	CCA	2	6	4529827	4529832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111038	NC_003919	TGG	3	9	4529929	4529937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111039	NC_003919	CGA	2	6	4529954	4529959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111040	NC_003919	TGA	2	6	4529968	4529973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111041	NC_003919	TGG	2	6	4530079	4530084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111042	NC_003919	GCT	2	6	4530098	4530103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111043	NC_003919	CGGT	2	8	4530122	4530129	0 %	25 %	50 %	25 %	21244573
111044	NC_003919	GGT	2	6	4530164	4530169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111045	NC_003919	GAT	2	6	4530203	4530208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111046	NC_003919	GC	3	6	4530263	4530268	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111047	NC_003919	CGGC	2	8	4530274	4530281	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111048	NC_003919	CCA	2	6	4530344	4530349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111049	NC_003919	CGGTG	2	10	4530374	4530383	0 %	20 %	60 %	20 %	21244573
111050	NC_003919	GGT	2	6	4530392	4530397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111051	NC_003919	TGC	2	6	4530424	4530429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111052	NC_003919	GTG	2	6	4530459	4530464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111053	NC_003919	GCC	2	6	4530519	4530524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111054	NC_003919	CGG	2	6	4530541	4530546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111055	NC_003919	CG	3	6	4530628	4530633	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111056	NC_003919	TGC	2	6	4530658	4530663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111057	NC_003919	CAG	2	6	4530788	4530793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111058	NC_003919	ACA	2	6	4530862	4530867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244573
111059	NC_003919	CGA	2	6	4530950	4530955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111060	NC_003919	CCA	2	6	4530991	4530996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111061	NC_003919	CGT	2	6	4531022	4531027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111062	NC_003919	TGA	2	6	4531066	4531071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111063	NC_003919	GCG	2	6	4531099	4531104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111064	NC_003919	CCA	2	6	4531123	4531128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111065	NC_003919	GC	3	6	4531177	4531182	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111066	NC_003919	GCA	2	6	4531210	4531215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111067	NC_003919	AC	3	6	4531255	4531260	50 %	0 %	0 %	50 %	21244573
111068	NC_003919	TGG	2	6	4531264	4531269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111069	NC_003919	CCA	2	6	4531274	4531279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111070	NC_003919	GCA	2	6	4531280	4531285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111071	NC_003919	GCCG	2	8	4531289	4531296	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111072	NC_003919	GGC	2	6	4531346	4531351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111073	NC_003919	GC	3	6	4531362	4531367	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111074	NC_003919	GAA	2	6	4531368	4531373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244573
111075	NC_003919	TCG	2	6	4531405	4531410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111076	NC_003919	GCC	2	6	4531416	4531421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111077	NC_003919	GCT	3	9	4531454	4531462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111078	NC_003919	GTG	2	6	4531473	4531478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244573
111079	NC_003919	CAT	2	6	4531529	4531534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244573
111080	NC_003919	GCC	2	6	4531544	4531549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111081	NC_003919	TGA	2	6	4531576	4531581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111082	NC_003919	TCG	2	6	4531612	4531617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111083	NC_003919	TGC	2	6	4531624	4531629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111084	NC_003919	AAG	2	6	4531644	4531649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244573
111085	NC_003919	CAT	2	6	4531655	4531660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244573
111086	NC_003919	GAT	2	6	4531661	4531666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111087	NC_003919	ACGC	2	8	4531681	4531688	25 %	0 %	25 %	50 %	21244573
111088	NC_003919	GC	3	6	4531721	4531726	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111089	NC_003919	CTGC	2	8	4531727	4531734	0 %	25 %	25 %	50 %	21244573
111090	NC_003919	ATG	2	6	4531752	4531757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244573
111091	NC_003919	ACC	2	6	4531758	4531763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
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111093	NC_003919	CGCTGG	2	12	4531789	4531800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21244573
111094	NC_003919	GCC	2	6	4531825	4531830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244573
111095	NC_003919	TCG	2	6	4531846	4531851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111096	NC_003919	CTG	3	9	4531857	4531865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244573
111097	NC_003919	ACC	2	6	4531887	4531892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244573
111098	NC_003919	GC	3	6	4531934	4531939	0 %	0 %	50 %	50 %	21244573
111099	NC_003919	GCG	2	6	4531949	4531954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111100	NC_003919	GGC	2	6	4531955	4531960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244573
111101	NC_003919	GCC	2	6	4532079	4532084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111102	NC_003919	TCA	2	6	4532188	4532193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244574
111103	NC_003919	GCT	2	6	4532213	4532218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244574
111104	NC_003919	GGC	2	6	4532270	4532275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244574
111105	NC_003919	ATC	2	6	4532298	4532303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244574
111106	NC_003919	CGC	2	6	4532362	4532367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244574
111107	NC_003919	AGC	3	9	4532427	4532435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244574
111108	NC_003919	AGC	2	6	4532457	4532462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244574
111109	NC_003919	ACG	2	6	4532569	4532574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244574
111110	NC_003919	GCT	2	6	4532645	4532650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244574
111111	NC_003919	CGTGGA	2	12	4532723	4532734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21244574
111112	NC_003919	GC	3	6	4532738	4532743	0 %	0 %	50 %	50 %	21244574
111113	NC_003919	GC	3	6	4532789	4532794	0 %	0 %	50 %	50 %	21244574
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111115	NC_003919	CAT	2	6	4532849	4532854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244574
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111468	NC_003919	GTC	3	9	4547906	4547914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244588
111469	NC_003919	CG	3	6	4547965	4547970	0 %	0 %	50 %	50 %	21244588
111470	NC_003919	GTT	2	6	4548007	4548012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244588
111471	NC_003919	TGC	3	9	4548114	4548122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244588
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111480	NC_003919	GC	3	6	4548623	4548628	0 %	0 %	50 %	50 %	21244588
111481	NC_003919	CGG	2	6	4548664	4548669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244588
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111487	NC_003919	CTG	2	6	4548827	4548832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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111491	NC_003919	CACG	2	8	4548956	4548963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111492	NC_003919	GCC	2	6	4549038	4549043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244589
111493	NC_003919	TGC	2	6	4549066	4549071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244589
111494	NC_003919	CG	3	6	4549076	4549081	0 %	0 %	50 %	50 %	21244589
111495	NC_003919	TCC	2	6	4549180	4549185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21244589
111496	NC_003919	CTG	2	6	4549186	4549191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244589
111497	NC_003919	CG	4	8	4549193	4549200	0 %	0 %	50 %	50 %	21244589
111498	NC_003919	GCC	2	6	4549203	4549208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244589
111499	NC_003919	GGT	2	6	4549212	4549217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244589
111500	NC_003919	TGG	2	6	4549228	4549233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244589

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