MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_003919	GC	3	6	4489834	4489839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110002	NC_003919	CGG	2	6	4489846	4489851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110003	NC_003919	AGC	2	6	4489863	4489868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110004	NC_003919	TCA	2	6	4489891	4489896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244541
110005	NC_003919	GCT	2	6	4489922	4489927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110006	NC_003919	TCA	2	6	4489954	4489959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244541
110007	NC_003919	CGG	2	6	4489976	4489981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110008	NC_003919	GGC	2	6	4490067	4490072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110009	NC_003919	GCC	2	6	4490092	4490097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244541
110010	NC_003919	TTC	2	6	4490103	4490108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244541
110011	NC_003919	GCA	2	6	4490138	4490143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110012	NC_003919	GGA	2	6	4490173	4490178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21244541
110013	NC_003919	CGG	2	6	4490188	4490193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110014	NC_003919	CCA	3	9	4490199	4490207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244541
110015	NC_003919	CAG	3	9	4490220	4490228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110016	NC_003919	GGC	2	6	4490264	4490269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110017	NC_003919	GCC	2	6	4490294	4490299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244541
110018	NC_003919	CG	6	12	4490305	4490316	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110019	NC_003919	GAC	2	6	4490324	4490329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110020	NC_003919	GCG	2	6	4490330	4490335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110021	NC_003919	CGGC	2	8	4490348	4490355	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110022	NC_003919	CGGC	2	8	4490357	4490364	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110023	NC_003919	GCC	2	6	4490461	4490466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244541
110024	NC_003919	GCG	2	6	4490506	4490511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110025	NC_003919	CG	3	6	4490513	4490518	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110026	NC_003919	GGCA	2	8	4490519	4490526	25 %	0 %	50 %	25 %	21244541
110027	NC_003919	CTT	2	6	4490585	4490590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244541
110028	NC_003919	GCA	3	9	4490609	4490617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110029	NC_003919	GCTC	2	8	4490687	4490694	0 %	25 %	25 %	50 %	21244541
110030	NC_003919	CAG	2	6	4490715	4490720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244541
110031	NC_003919	GCC	2	6	4490761	4490766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244541
110032	NC_003919	GC	3	6	4490779	4490784	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110033	NC_003919	GC	3	6	4490800	4490805	0 %	0 %	50 %	50 %	21244541
110034	NC_003919	CGG	3	9	4490807	4490815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110035	NC_003919	CGC	2	6	4490822	4490827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244541
110036	NC_003919	AAG	2	6	4490872	4490877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244541
110037	NC_003919	GCG	2	6	4490887	4490892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244541
110038	NC_003919	CGGC	2	8	4490939	4490946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110039	NC_003919	C	6	6	4490965	4490970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110040	NC_003919	TCGGC	2	10	4490988	4490997	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110041	NC_003919	GCC	2	6	4491027	4491032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110042	NC_003919	TGT	2	6	4491085	4491090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110043	NC_003919	T	6	6	4491090	4491095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110044	NC_003919	TTG	2	6	4491098	4491103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110045	NC_003919	A	6	6	4491158	4491163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110046	NC_003919	CGT	2	6	4491285	4491290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110047	NC_003919	GCC	2	6	4491357	4491362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110048	NC_003919	GTT	2	6	4491447	4491452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244542
110049	NC_003919	GCG	2	6	4491475	4491480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244542
110050	NC_003919	CCGA	2	8	4491481	4491488	25 %	0 %	25 %	50 %	21244542
110051	NC_003919	CGGGTG	2	12	4491508	4491519	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	21244542
110052	NC_003919	CG	3	6	4491530	4491535	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110053	NC_003919	TGG	2	6	4491551	4491556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244542
110054	NC_003919	GTG	2	6	4491603	4491608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244542
110055	NC_003919	GCT	2	6	4491621	4491626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244542
110056	NC_003919	CGCT	2	8	4491643	4491650	0 %	25 %	25 %	50 %	21244542
110057	NC_003919	CTGG	2	8	4491654	4491661	0 %	25 %	50 %	25 %	21244542
110058	NC_003919	GCCCG	2	10	4491708	4491717	0 %	0 %	40 %	60 %	21244542
110059	NC_003919	CGGCG	2	10	4491721	4491730	0 %	0 %	60 %	40 %	21244542
110060	NC_003919	GCCTGG	2	12	4491751	4491762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21244542
110061	NC_003919	GCCG	2	8	4491775	4491782	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110062	NC_003919	CCA	2	6	4491791	4491796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244542
110063	NC_003919	GC	3	6	4491801	4491806	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110064	NC_003919	GCC	2	6	4491812	4491817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244542
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110070	NC_003919	GCCG	2	8	4491945	4491952	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110071	NC_003919	CGC	2	6	4491983	4491988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244542
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110081	NC_003919	CG	4	8	4492243	4492250	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
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110085	NC_003919	TGATCG	2	12	4492337	4492348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21244542
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110087	NC_003919	ACG	2	6	4492358	4492363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244542
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110089	NC_003919	CG	4	8	4492398	4492405	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110090	NC_003919	GC	3	6	4492527	4492532	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
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110099	NC_003919	TGCA	2	8	4492766	4492773	25 %	25 %	25 %	25 %	21244542
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110103	NC_003919	CG	3	6	4492806	4492811	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110104	NC_003919	GAA	2	6	4492888	4492893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244542
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110110	NC_003919	CAG	2	6	4493128	4493133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244542
110111	NC_003919	GCCG	2	8	4493155	4493162	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110112	NC_003919	CCGG	2	8	4493169	4493176	0 %	0 %	50 %	50 %	21244542
110113	NC_003919	TGC	2	6	4493216	4493221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244542
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110115	NC_003919	CGCCGA	2	12	4493253	4493264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21244542
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110117	NC_003919	CCG	2	6	4493293	4493298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244542
110118	NC_003919	CCAA	2	8	4493348	4493355	50 %	0 %	0 %	50 %	21244542
110119	NC_003919	GCCT	2	8	4493406	4493413	0 %	25 %	25 %	50 %	21244542
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110128	NC_003919	GCA	2	6	4493784	4493789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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110229	NC_003919	CG	3	6	4497207	4497212	0 %	0 %	50 %	50 %	21244546
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110234	NC_003919	C	6	6	4497244	4497249	0 %	0 %	0 %	100 %	21244546
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110348	NC_003919	CGA	2	6	4501828	4501833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244552
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110468	NC_003919	CGGCG	2	10	4506384	4506393	0 %	0 %	60 %	40 %	21244555
110469	NC_003919	GAA	2	6	4506403	4506408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21244555
110470	NC_003919	GGC	2	6	4506409	4506414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244555
110471	NC_003919	CAT	2	6	4506423	4506428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244555
110472	NC_003919	TGG	2	6	4506440	4506445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21244555
110473	NC_003919	GCA	2	6	4506452	4506457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244555
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110475	NC_003919	TGC	2	6	4506608	4506613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244555
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110478	NC_003919	GCA	2	6	4506661	4506666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244555
110479	NC_003919	ACC	2	6	4506694	4506699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244555
110480	NC_003919	ACG	2	6	4506707	4506712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244555
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110483	NC_003919	GCA	2	6	4506847	4506852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110484	NC_003919	GGCA	2	8	4506899	4506906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110485	NC_003919	CTGCCG	2	12	4506930	4506941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110486	NC_003919	TGAGA	2	10	4506970	4506979	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110487	NC_003919	GCC	2	6	4506987	4506992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110488	NC_003919	TGC	2	6	4507009	4507014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110489	NC_003919	CGGCT	2	10	4507022	4507031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110490	NC_003919	GGGCT	3	15	4507032	4507046	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110491	NC_003919	GCG	2	6	4507065	4507070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110492	NC_003919	TCG	3	9	4507133	4507141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244556
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110496	NC_003919	CG	3	6	4507266	4507271	0 %	0 %	50 %	50 %	21244556
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110498	NC_003919	TCG	2	6	4507367	4507372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244556
110499	NC_003919	CG	3	6	4507387	4507392	0 %	0 %	50 %	50 %	21244556
110500	NC_003919	TTC	2	6	4507415	4507420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244556

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