MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_003919	CGT	2	6	4450371	4450376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109002	NC_003919	GCG	2	6	4450422	4450427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244500
109003	NC_003919	CCA	2	6	4450502	4450507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244500
109004	NC_003919	CG	3	6	4450550	4450555	0 %	0 %	50 %	50 %	21244500
109005	NC_003919	GC	3	6	4450556	4450561	0 %	0 %	50 %	50 %	21244500
109006	NC_003919	CAG	2	6	4450565	4450570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244500
109007	NC_003919	CGT	3	9	4450579	4450587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244500
109008	NC_003919	GGC	2	6	4450595	4450600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21244500
109009	NC_003919	CG	3	6	4450607	4450612	0 %	0 %	50 %	50 %	21244500
109010	NC_003919	GCAC	2	8	4450644	4450651	25 %	0 %	25 %	50 %	21244500
109011	NC_003919	GC	3	6	4450687	4450692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109012	NC_003919	CGT	2	6	4450720	4450725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109013	NC_003919	CGG	2	6	4450786	4450791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109014	NC_003919	GC	3	6	4450793	4450798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109015	NC_003919	AGCG	2	8	4450821	4450828	25 %	0 %	50 %	25 %	21244501
109016	NC_003919	CGA	2	6	4450857	4450862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244501
109017	NC_003919	GCT	2	6	4450939	4450944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244501
109018	NC_003919	CAC	2	6	4450948	4450953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244501
109019	NC_003919	GCC	2	6	4450972	4450977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109020	NC_003919	CGG	2	6	4451017	4451022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109021	NC_003919	GCC	2	6	4451114	4451119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109022	NC_003919	CGGC	2	8	4451156	4451163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109023	NC_003919	CCG	2	6	4451169	4451174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109024	NC_003919	GCC	2	6	4451183	4451188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109025	NC_003919	CGG	2	6	4451208	4451213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109026	NC_003919	GCG	2	6	4451222	4451227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109027	NC_003919	GCA	2	6	4451286	4451291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109028	NC_003919	TCT	2	6	4451325	4451330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21244502
109029	NC_003919	TCG	2	6	4451337	4451342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244502
109030	NC_003919	GTC	4	12	4451366	4451377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244502
109031	NC_003919	GCA	2	6	4451407	4451412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244502
109032	NC_003919	GTT	2	6	4451486	4451491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21244502
109033	NC_003919	AGA	2	6	4451514	4451519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109034	NC_003919	CTC	2	6	4451533	4451538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109035	NC_003919	CGG	2	6	4451540	4451545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109036	NC_003919	CGCA	2	8	4451564	4451571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109037	NC_003919	A	6	6	4451571	4451576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109038	NC_003919	CGC	2	6	4451625	4451630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109039	NC_003919	CCT	2	6	4451731	4451736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109040	NC_003919	GCAC	2	8	4451748	4451755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109041	NC_003919	TCG	2	6	4451807	4451812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244503
109042	NC_003919	CCG	2	6	4451853	4451858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244503
109043	NC_003919	GCTG	2	8	4451867	4451874	0 %	25 %	50 %	25 %	21244503
109044	NC_003919	AAC	2	6	4451881	4451886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244503
109045	NC_003919	CG	3	6	4451911	4451916	0 %	0 %	50 %	50 %	21244503
109046	NC_003919	GCCA	2	8	4451973	4451980	25 %	0 %	25 %	50 %	21244504
109047	NC_003919	CG	5	10	4451996	4452005	0 %	0 %	50 %	50 %	21244504
109048	NC_003919	ACC	2	6	4452016	4452021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21244504
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109050	NC_003919	CACG	2	8	4452073	4452080	25 %	0 %	25 %	50 %	21244504
109051	NC_003919	CTC	2	6	4452126	4452131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109052	NC_003919	GCA	2	6	4452186	4452191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109053	NC_003919	GTCAG	2	10	4452210	4452219	20 %	20 %	40 %	20 %	21244505
109054	NC_003919	AAC	2	6	4452288	4452293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21244505
109055	NC_003919	GC	3	6	4452300	4452305	0 %	0 %	50 %	50 %	21244505
109056	NC_003919	GCGG	2	8	4452375	4452382	0 %	0 %	75 %	25 %	21244505
109057	NC_003919	GTC	2	6	4452387	4452392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244505
109058	NC_003919	T	6	6	4452429	4452434	0 %	100 %	0 %	0 %	21244505
109059	NC_003919	TCCC	2	8	4452465	4452472	0 %	25 %	0 %	75 %	21244505
109060	NC_003919	CAG	2	6	4452573	4452578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109061	NC_003919	CGC	2	6	4452579	4452584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109062	NC_003919	GCA	2	6	4452640	4452645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109063	NC_003919	CAC	2	6	4452656	4452661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109064	NC_003919	TGCGT	2	10	4452697	4452706	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109065	NC_003919	CCG	2	6	4452722	4452727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109066	NC_003919	CG	4	8	4452751	4452758	0 %	0 %	50 %	50 %	21244506
109067	NC_003919	CAT	2	6	4452778	4452783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21244506
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109074	NC_003919	CG	3	6	4453025	4453030	0 %	0 %	50 %	50 %	21244506
109075	NC_003919	CGC	2	6	4453065	4453070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21244507
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109080	NC_003919	TCG	2	6	4453480	4453485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244507
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109085	NC_003919	GC	3	6	4453734	4453739	0 %	0 %	50 %	50 %	21244508
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109091	NC_003919	CGTAT	2	10	4453929	4453938	20 %	40 %	20 %	20 %	21244509
109092	NC_003919	GC	3	6	4453954	4453959	0 %	0 %	50 %	50 %	21244509
109093	NC_003919	CGGCG	2	10	4453968	4453977	0 %	0 %	60 %	40 %	21244509
109094	NC_003919	CG	3	6	4453976	4453981	0 %	0 %	50 %	50 %	21244509
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109104	NC_003919	CGC	2	6	4454371	4454376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109105	NC_003919	GCA	2	6	4454441	4454446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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109107	NC_003919	GTCGTT	2	12	4454567	4454578	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21244510
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109111	NC_003919	GA	3	6	4454651	4454656	50 %	0 %	50 %	0 %	21244510
109112	NC_003919	GTC	2	6	4454703	4454708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244510
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109119	NC_003919	TCA	2	6	4454972	4454977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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109472	NC_003919	GAT	2	6	4468776	4468781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21244522
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109494	NC_003919	CG	3	6	4469539	4469544	0 %	0 %	50 %	50 %	21244523
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109497	NC_003919	TCG	2	6	4469646	4469651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21244523
109498	NC_003919	GC	3	6	4469652	4469657	0 %	0 %	50 %	50 %	21244523
109499	NC_003919	GCA	3	9	4469662	4469670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21244523
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