MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	GCT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002488	CAT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002488	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002488	AGA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
5	NC_002488	GTG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
6	NC_002488	GTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
7	NC_002488	TAG	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
8	NC_002488	AGT	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
9	NC_002488	ACA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
10	NC_002488	AC	4	8	453	460	50 %	0 %	0 %	50 %	15836606
11	NC_002488	TTG	2	6	477	482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836606
12	NC_002488	CTCG	2	8	500	507	0 %	25 %	25 %	50 %	15836606
13	NC_002488	TGC	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
14	NC_002488	TGG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
15	NC_002488	TGC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
16	NC_002488	TTCG	2	8	660	667	0 %	50 %	25 %	25 %	15836606
17	NC_002488	ATTG	2	8	754	761	25 %	50 %	25 %	0 %	15836606
18	NC_002488	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
19	NC_002488	ACA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
20	NC_002488	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
21	NC_002488	AG	3	6	875	880	50 %	0 %	50 %	0 %	15836606
22	NC_002488	CGAT	2	8	936	943	25 %	25 %	25 %	25 %	15836606
23	NC_002488	CCT	2	6	944	949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836606
24	NC_002488	GTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
25	NC_002488	A	8	8	1036	1043	100 %	0 %	0 %	0 %	15836606
26	NC_002488	TAG	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
27	NC_002488	GC	3	6	1159	1164	0 %	0 %	50 %	50 %	15836606
28	NC_002488	CAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
29	NC_002488	ATT	2	6	1212	1217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
30	NC_002488	CTGA	2	8	1307	1314	25 %	25 %	25 %	25 %	15836606
31	NC_002488	ACA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
32	NC_002488	GA	3	6	1420	1425	50 %	0 %	50 %	0 %	15836606
33	NC_002488	T	6	6	1472	1477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002488	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002488	AAAT	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002488	A	6	6	1538	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002488	GAT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002488	ACA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002488	A	7	7	1678	1684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002488	ACC	8	24	1690	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_002488	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
42	NC_002488	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
43	NC_002488	AAT	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
44	NC_002488	GAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
45	NC_002488	TAT	3	9	2136	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
46	NC_002488	TTA	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
47	NC_002488	CAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836607
48	NC_002488	TTA	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
49	NC_002488	TG	3	6	2291	2296	0 %	50 %	50 %	0 %	15836607
50	NC_002488	ATT	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
51	NC_002488	TTA	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
52	NC_002488	ATTG	2	8	2463	2470	25 %	50 %	25 %	0 %	15836607
53	NC_002488	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836607
54	NC_002488	GTG	2	6	2594	2599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
55	NC_002488	AAG	3	9	2654	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836607
56	NC_002488	AGG	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836607
57	NC_002488	GTG	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
58	NC_002488	TTC	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836607
59	NC_002488	AGT	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
60	NC_002488	ATC	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002488	T	7	7	2907	2913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002488	TAA	2	6	2944	2949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002488	TG	3	6	2950	2955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002488	ATTT	2	8	3004	3011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002488	TTA	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002488	T	8	8	3047	3054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002488	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002488	TTA	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002488	T	6	6	3088	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002488	TCA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002488	TTC	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002488	GTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836608
73	NC_002488	T	7	7	3214	3220	0 %	100 %	0 %	0 %	15836608
74	NC_002488	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	15836608
75	NC_002488	TAAT	2	8	3396	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	15836608
76	NC_002488	ACGTCG	2	12	3406	3417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15836608
77	NC_002488	TGC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
78	NC_002488	AGT	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836608
79	NC_002488	TCA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836608
80	NC_002488	ACG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836608
81	NC_002488	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836608
82	NC_002488	AAC	2	6	3645	3650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
83	NC_002488	AGAA	2	8	3669	3676	75 %	0 %	25 %	0 %	15836608
84	NC_002488	GA	3	6	3758	3763	50 %	0 %	50 %	0 %	15836608
85	NC_002488	AAC	2	6	3768	3773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
86	NC_002488	ATGG	2	8	3837	3844	25 %	25 %	50 %	0 %	15836608
87	NC_002488	CGT	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
88	NC_002488	TTGA	2	8	3863	3870	25 %	50 %	25 %	0 %	15836608
89	NC_002488	TTTA	2	8	3874	3881	25 %	75 %	0 %	0 %	15836608
90	NC_002488	T	6	6	4040	4045	0 %	100 %	0 %	0 %	15836608
91	NC_002488	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002488	TCT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002488	AATTT	2	10	4398	4407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002488	GCT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002488	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002488	ATA	2	6	4490	4495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002488	AGAA	2	8	4534	4541	75 %	0 %	25 %	0 %	15836609
98	NC_002488	GT	4	8	4574	4581	0 %	50 %	50 %	0 %	15836609
99	NC_002488	GATA	2	8	4674	4681	50 %	25 %	25 %	0 %	15836609
100	NC_002488	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
101	NC_002488	GGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836610
102	NC_002488	AT	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	15836610
103	NC_002488	TAC	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
104	NC_002488	CAC	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836610
105	NC_002488	GTCT	2	8	4996	5003	0 %	50 %	25 %	25 %	15836610
106	NC_002488	AGA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
107	NC_002488	TGG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
108	NC_002488	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
109	NC_002488	TGG	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
110	NC_002488	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836610
111	NC_002488	TAC	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
112	NC_002488	TCCT	2	8	5375	5382	0 %	50 %	0 %	50 %	15836610
113	NC_002488	AGTT	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
114	NC_002488	TGAT	2	8	5406	5413	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
115	NC_002488	GTG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
116	NC_002488	GGT	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
117	NC_002488	TTG	2	6	5544	5549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
118	NC_002488	TGG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
119	NC_002488	TGC	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
120	NC_002488	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
121	NC_002488	TTC	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836610
122	NC_002488	GGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836610
123	NC_002488	TGC	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
124	NC_002488	GCT	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
125	NC_002488	TCG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
126	NC_002488	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
127	NC_002488	A	6	6	6109	6114	100 %	0 %	0 %	0 %	15836610
128	NC_002488	CT	3	6	6179	6184	0 %	50 %	0 %	50 %	15836610
129	NC_002488	CAT	3	9	6271	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
130	NC_002488	ATTG	2	8	6355	6362	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
131	NC_002488	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
132	NC_002488	TTTA	2	8	6456	6463	25 %	75 %	0 %	0 %	15836610
133	NC_002488	AT	3	6	6553	6558	50 %	50 %	0 %	0 %	15836610
134	NC_002488	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	15836610
135	NC_002488	CCT	2	6	6607	6612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836610
136	NC_002488	TGA	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
137	NC_002488	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
138	NC_002488	TTG	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
139	NC_002488	TGC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
140	NC_002488	CAAT	2	8	6932	6939	50 %	25 %	0 %	25 %	15836610
141	NC_002488	GAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
142	NC_002488	AGC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
143	NC_002488	TAC	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
144	NC_002488	TGC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
145	NC_002488	TTA	2	6	7210	7215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002488	GTT	2	6	7228	7233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002488	CG	3	6	7296	7301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002488	CAGT	2	8	7456	7463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002488	TGG	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002488	ATTG	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002488	G	6	6	7525	7530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002488	GTT	3	9	7536	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002488	TGA	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002488	CAT	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_002488	TGC	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_002488	T	6	6	7650	7655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_002488	TTTG	2	8	7752	7759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_002488	TCG	2	6	7769	7774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_002488	ATT	2	6	7800	7805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_002488	GT	3	6	7814	7819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_002488	GCCTTT	2	12	7879	7890	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_002488	GC	3	6	7922	7927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_002488	ATT	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_002488	TAC	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_002488	GAA	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
166	NC_002488	TGA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836611
167	NC_002488	A	6	6	8150	8155	100 %	0 %	0 %	0 %	15836611
168	NC_002488	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836611
169	NC_002488	GCA	3	9	8248	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
170	NC_002488	TTG	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
171	NC_002488	TGCGT	2	10	8340	8349	0 %	40 %	40 %	20 %	15836611
172	NC_002488	AAGTG	2	10	8391	8400	40 %	20 %	40 %	0 %	15836611
173	NC_002488	TGTT	2	8	8412	8419	0 %	75 %	25 %	0 %	15836611
174	NC_002488	TGCCTT	2	12	8434	8445	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15836611
175	NC_002488	A	6	6	8491	8496	100 %	0 %	0 %	0 %	15836611
176	NC_002488	AAC	2	6	8502	8507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836611
177	NC_002488	GCT	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
178	NC_002488	CGT	2	6	8539	8544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
179	NC_002488	TCA	2	6	8551	8556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836611
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183	NC_002488	TTG	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
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189	NC_002488	TCT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_002488	AT	3	6	9023	9028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_002488	TTTC	2	8	9032	9039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_002488	GGT	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836612
193	NC_002488	CTG	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
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202	NC_002488	TGC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
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213	NC_002488	GATCA	2	10	10065	10074	40 %	20 %	20 %	20 %	15836612
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220	NC_002488	TTTA	2	8	10384	10391	25 %	75 %	0 %	0 %	15836613
221	NC_002488	CTA	2	6	10466	10471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_002488	GT	3	6	10510	10515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
223	NC_002488	CAAT	2	8	10522	10529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
224	NC_002488	T	6	6	10552	10557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_002488	TGG	2	6	10587	10592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
226	NC_002488	GCG	2	6	10598	10603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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245	NC_002488	ATA	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_002488	ATC	2	6	11435	11440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_002488	AAC	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_002488	CAG	2	6	11492	11497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836615
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258	NC_002488	TTG	2	6	11977	11982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836615
259	NC_002488	TG	3	6	11988	11993	0 %	50 %	50 %	0 %	15836615
260	NC_002488	ATT	2	6	12096	12101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836615
261	NC_002488	CTT	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836615
262	NC_002488	CTT	2	6	12198	12203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836615
263	NC_002488	GAT	2	6	12224	12229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836615
264	NC_002488	ATC	2	6	12254	12259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_002488	TGC	2	6	12361	12366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836616
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270	NC_002488	AAC	2	6	12544	12549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836616
271	NC_002488	CAA	2	6	12567	12572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836616
272	NC_002488	CCT	2	6	12582	12587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836616
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274	NC_002488	CAC	2	6	12608	12613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836616
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402	NC_002488	GCA	2	6	19261	19266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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407	NC_002488	CAT	2	6	19447	19452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836626
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409	NC_002488	GTG	2	6	19482	19487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836626
410	NC_002488	GCT	2	6	19493	19498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836626
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414	NC_002488	TTG	2	6	19579	19584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836626
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436	NC_002488	GCTTG	2	10	20704	20713	0 %	40 %	40 %	20 %	15836629
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462	NC_002488	A	7	7	21707	21713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_002488	GTA	2	6	23235	23240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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