MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_002488	CTC	2	6	645936	645941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837276
13503	NC_002488	GC	3	6	645970	645975	0 %	0 %	50 %	50 %	15837276
13504	NC_002488	GCA	2	6	646030	646035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837276
13505	NC_002488	TTGA	2	8	646087	646094	25 %	50 %	25 %	0 %	15837276
13506	NC_002488	GT	4	8	646120	646127	0 %	50 %	50 %	0 %	15837276
13507	NC_002488	TGA	2	6	646154	646159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837276
13508	NC_002488	CAT	2	6	646183	646188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837276
13509	NC_002488	G	7	7	646260	646266	0 %	0 %	100 %	0 %	15837276
13510	NC_002488	TGCA	2	8	646294	646301	25 %	25 %	25 %	25 %	15837276
13511	NC_002488	CTG	2	6	646403	646408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837276
13512	NC_002488	GC	3	6	646515	646520	0 %	0 %	50 %	50 %	15837276
13513	NC_002488	CG	3	6	646562	646567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_002488	TGG	2	6	646606	646611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_002488	TGG	2	6	646639	646644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_002488	GAT	2	6	646649	646654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837277
13517	NC_002488	GC	3	6	646771	646776	0 %	0 %	50 %	50 %	15837277
13518	NC_002488	GTG	2	6	646795	646800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837277
13519	NC_002488	AGGT	2	8	646885	646892	25 %	25 %	50 %	0 %	15837277
13520	NC_002488	GC	3	6	647030	647035	0 %	0 %	50 %	50 %	15837277
13521	NC_002488	GAT	2	6	647082	647087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837277
13522	NC_002488	T	6	6	647138	647143	0 %	100 %	0 %	0 %	15837277
13523	NC_002488	CGT	2	6	647193	647198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837277
13524	NC_002488	GCA	2	6	647205	647210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837277
13525	NC_002488	GCG	2	6	647238	647243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837277
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13527	NC_002488	GAAA	2	8	647306	647313	75 %	0 %	25 %	0 %	15837277
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13532	NC_002488	GCA	3	9	647624	647632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837277
13533	NC_002488	CGG	2	6	647638	647643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837277
13534	NC_002488	AATG	2	8	647698	647705	50 %	25 %	25 %	0 %	15837277
13535	NC_002488	GAT	2	6	647731	647736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747513
13536	NC_002488	GCA	2	6	647755	647760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747513
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13540	NC_002488	CT	3	6	648032	648037	0 %	50 %	0 %	50 %	77747513
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13546	NC_002488	AGTTA	2	10	648433	648442	40 %	40 %	20 %	0 %	77747513
13547	NC_002488	GCA	2	6	648445	648450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747513
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13556	NC_002488	CCCT	2	8	648848	648855	0 %	25 %	0 %	75 %	15837279
13557	NC_002488	AGCG	2	8	648862	648869	25 %	0 %	50 %	25 %	15837279
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13565	NC_002488	CCA	2	6	649317	649322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837280
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13588	NC_002488	TGA	2	6	650388	650393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13602	NC_002488	CGA	2	6	650877	650882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837282
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13607	NC_002488	GC	3	6	651062	651067	0 %	0 %	50 %	50 %	15837282
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13610	NC_002488	CGT	2	6	651162	651167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837282
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13612	NC_002488	GCAAC	2	10	651339	651348	40 %	0 %	20 %	40 %	15837282
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13619	NC_002488	TAAT	2	8	651785	651792	50 %	50 %	0 %	0 %	15837282
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13624	NC_002488	GCG	2	6	652219	652224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837283
13625	NC_002488	AAAT	2	8	652265	652272	75 %	25 %	0 %	0 %	15837283
13626	NC_002488	GC	3	6	652318	652323	0 %	0 %	50 %	50 %	15837283
13627	NC_002488	GAAG	2	8	652338	652345	50 %	0 %	50 %	0 %	15837283
13628	NC_002488	GGCG	2	8	652545	652552	0 %	0 %	75 %	25 %	15837283
13629	NC_002488	TGC	2	6	652554	652559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837283
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13632	NC_002488	TGC	2	6	652635	652640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837284
13633	NC_002488	GCG	2	6	652646	652651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837284
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13635	NC_002488	GCA	2	6	652735	652740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837284
13636	NC_002488	GCGAT	2	10	652743	652752	20 %	20 %	40 %	20 %	15837284
13637	NC_002488	GGC	2	6	652765	652770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837284
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13639	NC_002488	TCA	2	6	652858	652863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837284
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13641	NC_002488	G	6	6	652924	652929	0 %	0 %	100 %	0 %	15837285
13642	NC_002488	GCG	2	6	652958	652963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837285
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13648	NC_002488	GTAG	2	8	653113	653120	25 %	25 %	50 %	0 %	15837285
13649	NC_002488	GC	3	6	653169	653174	0 %	0 %	50 %	50 %	15837285
13650	NC_002488	GCG	2	6	653195	653200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837285
13651	NC_002488	CGCAGC	2	12	653228	653239	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15837285
13652	NC_002488	CGG	2	6	653246	653251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837285
13653	NC_002488	GCA	2	6	653269	653274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13654	NC_002488	CGC	2	6	653338	653343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837285
13655	NC_002488	GGT	2	6	653427	653432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837285
13656	NC_002488	CTG	2	6	653464	653469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13657	NC_002488	AGC	2	6	653471	653476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13658	NC_002488	GGC	2	6	653488	653493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837285
13659	NC_002488	GCA	2	6	653540	653545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13660	NC_002488	CCG	2	6	653558	653563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837285
13661	NC_002488	GTT	2	6	653604	653609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837285
13662	NC_002488	CGAA	2	8	653637	653644	50 %	0 %	25 %	25 %	15837285
13663	NC_002488	GC	3	6	653654	653659	0 %	0 %	50 %	50 %	15837285
13664	NC_002488	GTC	2	6	653668	653673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13665	NC_002488	CGA	2	6	653678	653683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13666	NC_002488	GC	3	6	653721	653726	0 %	0 %	50 %	50 %	15837285
13667	NC_002488	CGTG	2	8	653739	653746	0 %	25 %	50 %	25 %	15837285
13668	NC_002488	GCCA	2	8	653831	653838	25 %	0 %	25 %	50 %	15837285
13669	NC_002488	GC	3	6	653919	653924	0 %	0 %	50 %	50 %	15837285
13670	NC_002488	CA	3	6	653962	653967	50 %	0 %	0 %	50 %	15837285
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13672	NC_002488	TG	3	6	654033	654038	0 %	50 %	50 %	0 %	15837285
13673	NC_002488	CGCCC	2	10	654050	654059	0 %	0 %	20 %	80 %	15837285
13674	NC_002488	GTGCA	2	10	654122	654131	20 %	20 %	40 %	20 %	15837285
13675	NC_002488	GGTGCT	2	12	654151	654162	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15837285
13676	NC_002488	CAG	2	6	654184	654189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13677	NC_002488	CG	3	6	654230	654235	0 %	0 %	50 %	50 %	15837285
13678	NC_002488	GT	3	6	654239	654244	0 %	50 %	50 %	0 %	15837285
13679	NC_002488	TGC	2	6	654245	654250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13680	NC_002488	ACGCC	2	10	654261	654270	20 %	0 %	20 %	60 %	15837285
13681	NC_002488	TGC	2	6	654287	654292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13682	NC_002488	CGC	2	6	654327	654332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837285
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13684	NC_002488	GGCGC	2	10	654583	654592	0 %	0 %	60 %	40 %	15837285
13685	NC_002488	GGGCG	2	10	654603	654612	0 %	0 %	80 %	20 %	15837285
13686	NC_002488	GCA	2	6	654678	654683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13687	NC_002488	GTA	2	6	654783	654788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837285
13688	NC_002488	CAG	2	6	654820	654825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13689	NC_002488	GCG	2	6	654845	654850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837285
13690	NC_002488	GTC	2	6	654856	654861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837285
13691	NC_002488	CGTGGC	2	12	654868	654879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15837285
13692	NC_002488	AACAGC	2	12	654926	654937	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15837285
13693	NC_002488	C	6	6	655002	655007	0 %	0 %	0 %	100 %	15837285
13694	NC_002488	GGC	2	6	655046	655051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837286
13695	NC_002488	ACC	2	6	655068	655073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837286
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13697	NC_002488	GTC	2	6	655166	655171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837286
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13700	NC_002488	CGG	2	6	655357	655362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837286
13701	NC_002488	TGGT	2	8	655596	655603	0 %	50 %	50 %	0 %	15837286
13702	NC_002488	TCT	2	6	655650	655655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837286
13703	NC_002488	GC	3	6	655735	655740	0 %	0 %	50 %	50 %	15837286
13704	NC_002488	TCG	2	6	655746	655751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837286
13705	NC_002488	GAGTG	2	10	655810	655819	20 %	20 %	60 %	0 %	15837286
13706	NC_002488	GGCA	2	8	655898	655905	25 %	0 %	50 %	25 %	15837286
13707	NC_002488	TGC	2	6	655909	655914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837286
13708	NC_002488	GAT	2	6	655946	655951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837286
13709	NC_002488	TGGT	2	8	656034	656041	0 %	50 %	50 %	0 %	15837286
13710	NC_002488	ATC	2	6	656093	656098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837286
13711	NC_002488	TG	3	6	656153	656158	0 %	50 %	50 %	0 %	15837286
13712	NC_002488	CTGCGG	2	12	656236	656247	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15837286
13713	NC_002488	TGA	2	6	656260	656265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837286
13714	NC_002488	GCC	2	6	656286	656291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837286
13715	NC_002488	TGC	2	6	656299	656304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837286
13716	NC_002488	GAT	2	6	656372	656377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837286
13717	NC_002488	GCG	2	6	656421	656426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837286
13718	NC_002488	AAC	2	6	656436	656441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837286
13719	NC_002488	TGC	2	6	656602	656607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13720	NC_002488	TCC	2	6	656691	656696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837287
13721	NC_002488	CAC	2	6	656749	656754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837287
13722	NC_002488	GTT	2	6	656783	656788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837287
13723	NC_002488	GCG	2	6	656853	656858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837287
13724	NC_002488	CAT	2	6	656959	656964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837287
13725	NC_002488	GCC	3	9	657006	657014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837287
13726	NC_002488	ACA	2	6	657148	657153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837287
13727	NC_002488	T	6	6	657174	657179	0 %	100 %	0 %	0 %	15837287
13728	NC_002488	TGAGG	2	10	657212	657221	20 %	20 %	60 %	0 %	15837288
13729	NC_002488	TGGG	2	8	657234	657241	0 %	25 %	75 %	0 %	15837288
13730	NC_002488	G	6	6	657239	657244	0 %	0 %	100 %	0 %	15837288
13731	NC_002488	G	6	6	657296	657301	0 %	0 %	100 %	0 %	15837288
13732	NC_002488	ACA	2	6	657320	657325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837288
13733	NC_002488	ATGA	2	8	657346	657353	50 %	25 %	25 %	0 %	15837288
13734	NC_002488	GAT	2	6	657385	657390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837288
13735	NC_002488	TGG	2	6	657398	657403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837288
13736	NC_002488	TGA	2	6	657426	657431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837288
13737	NC_002488	CGT	2	6	657438	657443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837288
13738	NC_002488	CGG	2	6	657486	657491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837288
13739	NC_002488	GCT	2	6	657575	657580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837288
13740	NC_002488	TCAA	2	8	657611	657618	50 %	25 %	0 %	25 %	15837288
13741	NC_002488	GTG	2	6	657647	657652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837288
13742	NC_002488	CAA	2	6	657711	657716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837288
13743	NC_002488	ATC	2	6	657718	657723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837288
13744	NC_002488	CGTG	2	8	657741	657748	0 %	25 %	50 %	25 %	15837288
13745	NC_002488	TCC	2	6	657899	657904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837288
13746	NC_002488	TCA	2	6	657929	657934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837288
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13751	NC_002488	TACG	2	8	658291	658298	25 %	25 %	25 %	25 %	15837288
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13850	NC_002488	GA	3	6	663079	663084	50 %	0 %	50 %	0 %	15837301
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13859	NC_002488	CGGG	2	8	663504	663511	0 %	0 %	75 %	25 %	15837302
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13866	NC_002488	TATG	2	8	663808	663815	25 %	50 %	25 %	0 %	15837302
13867	NC_002488	CGG	2	6	663915	663920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837303
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13996	NC_002488	CG	3	6	670748	670753	0 %	0 %	50 %	50 %	15837311
13997	NC_002488	TCTGA	2	10	670769	670778	20 %	40 %	20 %	20 %	15837311
13998	NC_002488	CA	3	6	670819	670824	50 %	0 %	0 %	50 %	15837311
13999	NC_002488	T	6	6	670855	670860	0 %	100 %	0 %	0 %	15837311
14000	NC_002488	TGCT	2	8	670889	670896	0 %	50 %	25 %	25 %	15837311

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