MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002488	TCC	2	6	622704	622709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837255
13002	NC_002488	AAC	2	6	622998	623003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837255
13003	NC_002488	TCAC	2	8	623046	623053	25 %	25 %	0 %	50 %	15837255
13004	NC_002488	CAG	2	6	623095	623100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837255
13005	NC_002488	TGG	2	6	623101	623106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837255
13006	NC_002488	CAA	2	6	623187	623192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_002488	TCA	2	6	623193	623198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_002488	T	6	6	623224	623229	0 %	100 %	0 %	0 %	15837256
13009	NC_002488	CAT	2	6	623255	623260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837256
13010	NC_002488	C	6	6	623261	623266	0 %	0 %	0 %	100 %	15837256
13011	NC_002488	TCCA	2	8	623334	623341	25 %	25 %	0 %	50 %	15837256
13012	NC_002488	CAA	2	6	623370	623375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837256
13013	NC_002488	GTT	3	9	623377	623385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837256
13014	NC_002488	GCT	2	6	623429	623434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837256
13015	NC_002488	CTGCTA	2	12	623475	623486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15837256
13016	NC_002488	CTGTTG	2	12	623487	623498	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15837256
13017	NC_002488	TAC	2	6	623506	623511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837256
13018	NC_002488	TGC	2	6	623518	623523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837256
13019	NC_002488	TGC	2	6	623577	623582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837256
13020	NC_002488	CAA	2	6	623593	623598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837256
13021	NC_002488	AGT	2	6	623728	623733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837256
13022	NC_002488	CG	3	6	623856	623861	0 %	0 %	50 %	50 %	15837256
13023	NC_002488	TGG	2	6	623887	623892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837256
13024	NC_002488	TTC	2	6	623939	623944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837256
13025	NC_002488	GCGTC	2	10	624079	624088	0 %	20 %	40 %	40 %	15837256
13026	NC_002488	GA	3	6	624133	624138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_002488	AGA	2	6	624169	624174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_002488	ATG	2	6	624250	624255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_002488	GTC	2	6	624384	624389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_002488	ATG	2	6	624407	624412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_002488	TAA	2	6	624419	624424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_002488	TGC	3	9	624459	624467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837257
13033	NC_002488	AGG	2	6	624480	624485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837257
13034	NC_002488	CCT	2	6	624493	624498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837257
13035	NC_002488	TCCA	2	8	624597	624604	25 %	25 %	0 %	50 %	15837257
13036	NC_002488	TCC	2	6	624605	624610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837257
13037	NC_002488	GCA	2	6	624649	624654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837257
13038	NC_002488	TCCA	2	8	624677	624684	25 %	25 %	0 %	50 %	15837257
13039	NC_002488	TA	4	8	624751	624758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_002488	CTGA	2	8	624783	624790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_002488	CCA	2	6	624907	624912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837258
13042	NC_002488	CAT	2	6	624956	624961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837258
13043	NC_002488	CGAT	2	8	624972	624979	25 %	25 %	25 %	25 %	15837258
13044	NC_002488	CAC	2	6	625028	625033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837258
13045	NC_002488	CAC	2	6	625043	625048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837258
13046	NC_002488	CA	3	6	625162	625167	50 %	0 %	0 %	50 %	15837258
13047	NC_002488	CG	3	6	625268	625273	0 %	0 %	50 %	50 %	15837258
13048	NC_002488	GCA	2	6	625290	625295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837258
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13050	NC_002488	CAG	2	6	625376	625381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837258
13051	NC_002488	ACC	2	6	625395	625400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837258
13052	NC_002488	GCA	2	6	625453	625458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837258
13053	NC_002488	GCG	2	6	625513	625518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837258
13054	NC_002488	GAA	2	6	625651	625656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837258
13055	NC_002488	GCC	2	6	625671	625676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837258
13056	NC_002488	CGT	2	6	625679	625684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837258
13057	NC_002488	CAC	2	6	625745	625750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837258
13058	NC_002488	TGG	2	6	625784	625789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837258
13059	NC_002488	TGC	2	6	625796	625801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837258
13060	NC_002488	CA	4	8	625862	625869	50 %	0 %	0 %	50 %	15837258
13061	NC_002488	CGAC	2	8	625924	625931	25 %	0 %	25 %	50 %	15837258
13062	NC_002488	GAA	2	6	625970	625975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837258
13063	NC_002488	ATC	2	6	625992	625997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837258
13064	NC_002488	GGC	2	6	626045	626050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837258
13065	NC_002488	CAAC	2	8	626064	626071	50 %	0 %	0 %	50 %	15837258
13066	NC_002488	TAA	2	6	626249	626254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_002488	TTC	2	6	626322	626327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77747510
13068	NC_002488	TTTC	2	8	626352	626359	0 %	75 %	0 %	25 %	77747510
13069	NC_002488	CTG	2	6	626364	626369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747510
13070	NC_002488	TGG	2	6	626429	626434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747510
13071	NC_002488	GCG	2	6	626442	626447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77747510
13072	NC_002488	TGGC	2	8	626475	626482	0 %	25 %	50 %	25 %	77747510
13073	NC_002488	CAC	2	6	626527	626532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77747510
13074	NC_002488	CAACG	2	10	626561	626570	40 %	0 %	20 %	40 %	77747510
13075	NC_002488	ACA	2	6	626637	626642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77747510
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13080	NC_002488	GCC	2	6	626915	626920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77747510
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13082	NC_002488	CAA	2	6	626948	626953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77747510
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13092	NC_002488	CGAC	2	8	627220	627227	25 %	0 %	25 %	50 %	77747510
13093	NC_002488	CAT	2	6	627341	627346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77747510
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13104	NC_002488	TG	3	6	627897	627902	0 %	50 %	50 %	0 %	77747510
13105	NC_002488	CGC	2	6	627919	627924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77747510
13106	NC_002488	AGG	2	6	627977	627982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77747510
13107	NC_002488	C	6	6	628087	628092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13108	NC_002488	CAC	2	6	628123	628128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_002488	CA	3	6	628137	628142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_002488	ACA	2	6	628172	628177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_002488	CAT	2	6	628246	628251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837260
13112	NC_002488	CTGTGC	14	84	628252	628335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837260
13113	NC_002488	AC	3	6	628360	628365	50 %	0 %	0 %	50 %	15837260
13114	NC_002488	CCG	2	6	628372	628377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_002488	GGC	2	6	628380	628385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_002488	CAG	2	6	628395	628400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_002488	TTTCCC	2	12	628444	628455	0 %	50 %	0 %	50 %	15837261
13118	NC_002488	GCG	2	6	628496	628501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837261
13119	NC_002488	CTG	2	6	628519	628524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837261
13120	NC_002488	AGCC	3	12	628533	628544	25 %	0 %	25 %	50 %	15837261
13121	NC_002488	CATCCA	2	12	628572	628583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15837261
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13123	NC_002488	CA	3	6	628638	628643	50 %	0 %	0 %	50 %	15837261
13124	NC_002488	CG	3	6	628665	628670	0 %	0 %	50 %	50 %	15837261
13125	NC_002488	GCC	2	6	628711	628716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837261
13126	NC_002488	CG	3	6	628722	628727	0 %	0 %	50 %	50 %	15837261
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13232	NC_002488	TG	3	6	633358	633363	0 %	50 %	50 %	0 %	15837268
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13235	NC_002488	GGA	2	6	633497	633502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837268
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13237	NC_002488	TAA	2	6	633599	633604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13240	NC_002488	GTA	2	6	633716	633721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13242	NC_002488	TATT	2	8	633784	633791	25 %	75 %	0 %	0 %	15837269
13243	NC_002488	TGA	2	6	633869	633874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837269
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13245	NC_002488	GGGA	2	8	633940	633947	25 %	0 %	75 %	0 %	15837269
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13248	NC_002488	AGATG	2	10	634088	634097	40 %	20 %	40 %	0 %	15837269
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13354	NC_002488	TCG	2	6	638809	638814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747512
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13359	NC_002488	GCA	2	6	639080	639085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747512
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13369	NC_002488	C	6	6	639484	639489	0 %	0 %	0 %	100 %	77747512
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13484	NC_002488	GCG	2	6	645071	645076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13485	NC_002488	ATGGC	2	10	645085	645094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13486	NC_002488	GA	3	6	645120	645125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_002488	CAG	2	6	645283	645288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837276
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13490	NC_002488	CAGGG	2	10	645364	645373	20 %	0 %	60 %	20 %	15837276
13491	NC_002488	TGC	2	6	645428	645433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837276
13492	NC_002488	CTC	2	6	645452	645457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837276
13493	NC_002488	GTG	2	6	645464	645469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837276
13494	NC_002488	CTT	2	6	645481	645486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837276
13495	NC_002488	GCGTT	2	10	645562	645571	0 %	40 %	40 %	20 %	15837276
13496	NC_002488	GTG	2	6	645602	645607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837276
13497	NC_002488	T	7	7	645608	645614	0 %	100 %	0 %	0 %	15837276
13498	NC_002488	GCT	2	6	645670	645675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837276
13499	NC_002488	TTG	2	6	645682	645687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837276
13500	NC_002488	CAG	2	6	645851	645856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837276

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