MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002488	GC	3	6	597515	597520	0 %	0 %	50 %	50 %	15837221
12502	NC_002488	ACTTG	2	10	597581	597590	20 %	40 %	20 %	20 %	15837221
12503	NC_002488	CT	3	6	597618	597623	0 %	50 %	0 %	50 %	15837221
12504	NC_002488	CAT	2	6	597759	597764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837222
12505	NC_002488	TTA	2	6	597794	597799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15837222
12506	NC_002488	TGCGG	2	10	597818	597827	0 %	20 %	60 %	20 %	15837222
12507	NC_002488	ATG	2	6	597835	597840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837222
12508	NC_002488	AAG	2	6	597885	597890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837222
12509	NC_002488	GT	4	8	598018	598025	0 %	50 %	50 %	0 %	15837222
12510	NC_002488	CGC	2	6	598030	598035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837222
12511	NC_002488	GTTGC	2	10	598053	598062	0 %	40 %	40 %	20 %	15837222
12512	NC_002488	TGG	2	6	598067	598072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837222
12513	NC_002488	CG	3	6	598130	598135	0 %	0 %	50 %	50 %	15837222
12514	NC_002488	ATC	2	6	598228	598233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837222
12515	NC_002488	TAC	2	6	598263	598268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837222
12516	NC_002488	AGTA	2	8	598347	598354	50 %	25 %	25 %	0 %	15837222
12517	NC_002488	TCAA	2	8	598390	598397	50 %	25 %	0 %	25 %	15837222
12518	NC_002488	TGC	2	6	598408	598413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837222
12519	NC_002488	ATT	2	6	598426	598431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15837222
12520	NC_002488	CCG	2	6	598500	598505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837222
12521	NC_002488	TCG	2	6	598511	598516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837222
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12523	NC_002488	CCG	2	6	598635	598640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837222
12524	NC_002488	CAGT	2	8	598649	598656	25 %	25 %	25 %	25 %	15837222
12525	NC_002488	CGT	2	6	598693	598698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837222
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12528	NC_002488	GCCAT	2	10	598843	598852	20 %	20 %	20 %	40 %	15837222
12529	NC_002488	CGG	2	6	598892	598897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837222
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12533	NC_002488	GC	3	6	599055	599060	0 %	0 %	50 %	50 %	15837222
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12539	NC_002488	CGT	2	6	599256	599261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837222
12540	NC_002488	GTTG	2	8	599387	599394	0 %	50 %	50 %	0 %	15837222
12541	NC_002488	TATTGT	2	12	599479	599490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15837222
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12549	NC_002488	TGCT	2	8	599914	599921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12550	NC_002488	AATG	2	8	599928	599935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_002488	CTT	2	6	599957	599962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_002488	TGT	2	6	600031	600036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_002488	GT	3	6	600035	600040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_002488	TTG	2	6	600042	600047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_002488	GT	3	6	600062	600067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_002488	TGG	2	6	600083	600088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837223
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12580	NC_002488	ATG	2	6	601187	601192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_002488	TG	4	8	601191	601198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_002488	CA	3	6	601202	601207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12586	NC_002488	TGA	2	6	601426	601431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_002488	TGC	2	6	601518	601523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_002488	AG	3	6	601607	601612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_002488	A	6	6	601614	601619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_002488	GCC	2	6	601621	601626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12592	NC_002488	GGC	2	6	601631	601636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_002488	GTGA	2	8	601657	601664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_002488	AGTTT	2	10	601772	601781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_002488	CAGT	2	8	601786	601793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12596	NC_002488	TTGA	2	8	601794	601801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_002488	TGA	3	9	601815	601823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_002488	CTCA	2	8	601824	601831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12599	NC_002488	TGA	2	6	601840	601845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837225
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12603	NC_002488	GTG	2	6	601990	601995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837225
12604	NC_002488	AAGAG	2	10	602027	602036	60 %	0 %	40 %	0 %	15837225
12605	NC_002488	CTG	2	6	602046	602051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837225
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12607	NC_002488	GT	3	6	602119	602124	0 %	50 %	50 %	0 %	15837225
12608	NC_002488	GGC	2	6	602158	602163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837225
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12611	NC_002488	TTG	2	6	602289	602294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_002488	TGC	2	6	602361	602366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_002488	GAT	2	6	602384	602389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_002488	ATT	2	6	602394	602399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_002488	GAT	2	6	602410	602415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_002488	TTG	2	6	602713	602718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837226
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12618	NC_002488	GTGCAC	2	12	602791	602802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15837226
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12620	NC_002488	TGC	2	6	602932	602937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837226
12621	NC_002488	TGG	2	6	602945	602950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837226
12622	NC_002488	GTG	2	6	602959	602964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837226
12623	NC_002488	TC	3	6	603166	603171	0 %	50 %	0 %	50 %	15837226
12624	NC_002488	CGTT	2	8	603177	603184	0 %	50 %	25 %	25 %	15837226
12625	NC_002488	GCG	2	6	603201	603206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837226
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12629	NC_002488	TC	4	8	603322	603329	0 %	50 %	0 %	50 %	15837226
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12635	NC_002488	TG	3	6	603555	603560	0 %	50 %	50 %	0 %	15837227
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12751	NC_002488	CCG	2	6	608996	609001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12854	NC_002488	CG	3	6	613569	613574	0 %	0 %	50 %	50 %	15837241
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12857	NC_002488	GCGG	2	8	613633	613640	0 %	0 %	75 %	25 %	15837241
12858	NC_002488	CGA	2	6	613647	613652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837241
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12863	NC_002488	AAC	2	6	613843	613848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837242
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12868	NC_002488	CG	4	8	614237	614244	0 %	0 %	50 %	50 %	15837242
12869	NC_002488	CGT	2	6	614292	614297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837242
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12992	NC_002488	ATCGAC	2	12	622161	622172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15837254
12993	NC_002488	ACC	2	6	622231	622236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837254
12994	NC_002488	CTT	3	9	622269	622277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837254
12995	NC_002488	GC	3	6	622357	622362	0 %	0 %	50 %	50 %	15837254
12996	NC_002488	ATG	2	6	622393	622398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837254
12997	NC_002488	ACA	2	6	622492	622497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837254
12998	NC_002488	GTGC	2	8	622580	622587	0 %	25 %	50 %	25 %	15837255
12999	NC_002488	TGA	2	6	622600	622605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837255
13000	NC_002488	GGA	2	6	622674	622679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837255

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