MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_002488	TGA	2	6	549091	549096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747506
11503	NC_002488	GCT	2	6	549104	549109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747506
11504	NC_002488	TAG	2	6	549110	549115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747506
11505	NC_002488	GGGT	2	8	549193	549200	0 %	25 %	75 %	0 %	15837164
11506	NC_002488	GGC	2	6	549210	549215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837164
11507	NC_002488	AGG	2	6	549235	549240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837164
11508	NC_002488	GAC	2	6	549270	549275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837164
11509	NC_002488	CTG	2	6	549293	549298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837164
11510	NC_002488	AAGATG	2	12	549301	549312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15837164
11511	NC_002488	GTTGG	2	10	549344	549353	0 %	40 %	60 %	0 %	15837164
11512	NC_002488	GAA	2	6	549420	549425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837164
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11514	NC_002488	ACA	2	6	549644	549649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837164
11515	NC_002488	AGAA	2	8	549676	549683	75 %	0 %	25 %	0 %	15837164
11516	NC_002488	GTG	2	6	549695	549700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837164
11517	NC_002488	GAT	2	6	549759	549764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837164
11518	NC_002488	CCAA	2	8	549773	549780	50 %	0 %	0 %	50 %	15837164
11519	NC_002488	GCA	2	6	549803	549808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837164
11520	NC_002488	GC	3	6	549809	549814	0 %	0 %	50 %	50 %	15837164
11521	NC_002488	ACC	2	6	549817	549822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837164
11522	NC_002488	CT	3	6	549895	549900	0 %	50 %	0 %	50 %	15837164
11523	NC_002488	TTG	2	6	549939	549944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837165
11524	NC_002488	G	10	10	549963	549972	0 %	0 %	100 %	0 %	15837165
11525	NC_002488	CGG	2	6	549994	549999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837165
11526	NC_002488	TATGGA	2	12	550064	550075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837165
11527	NC_002488	TTG	2	6	550094	550099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837165
11528	NC_002488	CGT	2	6	550123	550128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837165
11529	NC_002488	CTG	2	6	550136	550141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837165
11530	NC_002488	TG	3	6	550215	550220	0 %	50 %	50 %	0 %	15837165
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11532	NC_002488	CAA	2	6	550235	550240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837165
11533	NC_002488	GCT	2	6	550254	550259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837165
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11539	NC_002488	T	7	7	550449	550455	0 %	100 %	0 %	0 %	15837166
11540	NC_002488	CCAG	2	8	550542	550549	25 %	0 %	25 %	50 %	15837166
11541	NC_002488	GGA	2	6	550551	550556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837166
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11543	NC_002488	CTGG	2	8	550691	550698	0 %	25 %	50 %	25 %	15837167
11544	NC_002488	TTG	2	6	550704	550709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837167
11545	NC_002488	GCG	2	6	550720	550725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837167
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11550	NC_002488	TTA	2	6	550852	550857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15837167
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11552	NC_002488	GGAG	2	8	550920	550927	25 %	0 %	75 %	0 %	15837167
11553	NC_002488	CGG	2	6	550931	550936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837167
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11555	NC_002488	GTC	2	6	550998	551003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837167
11556	NC_002488	CG	3	6	551048	551053	0 %	0 %	50 %	50 %	15837167
11557	NC_002488	TGC	2	6	551097	551102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837167
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11560	NC_002488	ATG	2	6	551368	551373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837167
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11562	NC_002488	GC	3	6	551464	551469	0 %	0 %	50 %	50 %	15837167
11563	NC_002488	TCT	2	6	551473	551478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837167
11564	NC_002488	CAG	2	6	551501	551506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837167
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11566	NC_002488	GTAGG	2	10	551535	551544	20 %	20 %	60 %	0 %	15837167
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11573	NC_002488	CCG	2	6	551967	551972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837168
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11587	NC_002488	TGT	2	6	552718	552723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_002488	TGC	2	6	552740	552745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_002488	GCG	2	6	552766	552771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_002488	GATT	2	8	552788	552795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_002488	GCA	2	6	552844	552849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_002488	TTGC	2	8	552931	552938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11593	NC_002488	GT	3	6	552984	552989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_002488	GTGTC	2	10	553011	553020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11595	NC_002488	GCA	2	6	553034	553039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837169
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11599	NC_002488	CT	3	6	553374	553379	0 %	50 %	0 %	50 %	15837169
11600	NC_002488	GT	3	6	553382	553387	0 %	50 %	50 %	0 %	15837169
11601	NC_002488	GT	3	6	553394	553399	0 %	50 %	50 %	0 %	15837169
11602	NC_002488	GT	4	8	553408	553415	0 %	50 %	50 %	0 %	15837169
11603	NC_002488	TA	3	6	553419	553424	50 %	50 %	0 %	0 %	15837169
11604	NC_002488	GT	3	6	553457	553462	0 %	50 %	50 %	0 %	15837169
11605	NC_002488	GTT	2	6	553490	553495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837169
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11608	NC_002488	GC	3	6	553591	553596	0 %	0 %	50 %	50 %	15837169
11609	NC_002488	A	6	6	553606	553611	100 %	0 %	0 %	0 %	15837169
11610	NC_002488	TGG	2	6	553638	553643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837169
11611	NC_002488	TGT	2	6	553751	553756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837169
11612	NC_002488	G	8	8	553777	553784	0 %	0 %	100 %	0 %	15837169
11613	NC_002488	GTT	2	6	553858	553863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837170
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11617	NC_002488	GTC	2	6	554029	554034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837170
11618	NC_002488	GTC	2	6	554056	554061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837170
11619	NC_002488	CTTG	2	8	554085	554092	0 %	50 %	25 %	25 %	15837170
11620	NC_002488	TTC	2	6	554116	554121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837170
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11995	NC_002488	CGT	2	6	573454	573459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837196
11996	NC_002488	GTA	2	6	573547	573552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837196
11997	NC_002488	CTG	2	6	573589	573594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837196
11998	NC_002488	GT	3	6	573681	573686	0 %	50 %	50 %	0 %	15837196
11999	NC_002488	GTC	2	6	573703	573708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837196
12000	NC_002488	GTG	2	6	573709	573714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837196

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