MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_002488	TTG	2	6	527177	527182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837135
11003	NC_002488	TGC	2	6	527295	527300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837135
11004	NC_002488	GCG	2	6	527435	527440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_002488	ATG	2	6	527482	527487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_002488	AGC	2	6	527512	527517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_002488	T	6	6	527569	527574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_002488	TATTG	2	10	527603	527612	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_002488	GCA	2	6	527788	527793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837136
11010	NC_002488	CCA	2	6	527819	527824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837136
11011	NC_002488	CAG	3	9	527825	527833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837136
11012	NC_002488	GGA	2	6	527927	527932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837136
11013	NC_002488	TCA	2	6	527957	527962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837136
11014	NC_002488	T	6	6	527965	527970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_002488	TGAT	2	8	528059	528066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_002488	TTG	2	6	528107	528112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_002488	TTAT	2	8	528214	528221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_002488	ATT	2	6	528225	528230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_002488	TAA	2	6	528241	528246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_002488	TTG	2	6	528286	528291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_002488	TCT	2	6	528296	528301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_002488	A	6	6	528390	528395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_002488	AAT	2	6	528437	528442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_002488	GTAA	2	8	528474	528481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_002488	ATTT	2	8	528530	528537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_002488	T	6	6	528568	528573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_002488	TAA	2	6	528590	528595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_002488	GTT	2	6	528607	528612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_002488	ATG	2	6	528651	528656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837137
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11031	NC_002488	CGG	2	6	528704	528709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837137
11032	NC_002488	CGC	2	6	528714	528719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837137
11033	NC_002488	GAA	2	6	528834	528839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837137
11034	NC_002488	GCAT	2	8	529085	529092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_002488	GCG	2	6	529136	529141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77747504
11036	NC_002488	ATC	2	6	529215	529220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77747504
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11038	NC_002488	GCAT	2	8	529288	529295	25 %	25 %	25 %	25 %	77747504
11039	NC_002488	CGCATT	2	12	529341	529352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77747504
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11041	NC_002488	GGTG	2	8	529508	529515	0 %	25 %	75 %	0 %	77747504
11042	NC_002488	GT	3	6	529525	529530	0 %	50 %	50 %	0 %	77747504
11043	NC_002488	GCT	2	6	529589	529594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747504
11044	NC_002488	GT	3	6	529621	529626	0 %	50 %	50 %	0 %	77747504
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11047	NC_002488	AC	3	6	529723	529728	50 %	0 %	0 %	50 %	77747504
11048	NC_002488	T	6	6	529836	529841	0 %	100 %	0 %	0 %	77747504
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11052	NC_002488	TGG	2	6	529894	529899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747504
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11055	NC_002488	TCG	2	6	530096	530101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747504
11056	NC_002488	GGTG	2	8	530111	530118	0 %	25 %	75 %	0 %	77747504
11057	NC_002488	GC	4	8	530176	530183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_002488	GTG	2	6	530227	530232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_002488	TGA	2	6	530261	530266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837139
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11061	NC_002488	TCGC	2	8	530300	530307	0 %	25 %	25 %	50 %	15837139
11062	NC_002488	GCA	2	6	530406	530411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837139
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11064	NC_002488	GGC	2	6	530451	530456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837139
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11069	NC_002488	GATA	2	8	530552	530559	50 %	25 %	25 %	0 %	15837139
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11074	NC_002488	G	6	6	530750	530755	0 %	0 %	100 %	0 %	15837140
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11098	NC_002488	TAA	2	6	531834	531839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_002488	AG	4	8	531888	531895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11101	NC_002488	A	8	8	532007	532014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_002488	C	6	6	532065	532070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11103	NC_002488	CGCT	2	8	532081	532088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_002488	AGGC	2	8	532100	532107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11105	NC_002488	AG	3	6	532109	532114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_002488	TACC	2	8	532258	532265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11107	NC_002488	GCC	2	6	532318	532323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837142
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11109	NC_002488	CGA	2	6	532429	532434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837142
11110	NC_002488	TCA	2	6	532446	532451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837142
11111	NC_002488	GCG	2	6	532607	532612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837142
11112	NC_002488	CG	3	6	532635	532640	0 %	0 %	50 %	50 %	15837142
11113	NC_002488	GTT	2	6	532712	532717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837143
11114	NC_002488	GGC	2	6	532734	532739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837143
11115	NC_002488	GCG	2	6	532821	532826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837143
11116	NC_002488	GTG	2	6	532876	532881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_002488	GCAG	2	8	532912	532919	25 %	0 %	50 %	25 %	15837144
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11121	NC_002488	GCTG	2	8	533015	533022	0 %	25 %	50 %	25 %	15837144
11122	NC_002488	TAAT	2	8	533145	533152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_002488	ATT	2	6	533168	533173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_002488	A	6	6	533227	533232	100 %	0 %	0 %	0 %	15837145
11125	NC_002488	GCGTT	2	10	533296	533305	0 %	40 %	40 %	20 %	15837145
11126	NC_002488	TGT	2	6	533308	533313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837145
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11132	NC_002488	GC	3	6	533413	533418	0 %	0 %	50 %	50 %	15837145
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11134	NC_002488	TGC	2	6	533445	533450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837145
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11147	NC_002488	CATC	2	8	534284	534291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11148	NC_002488	TGGT	2	8	534293	534300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11149	NC_002488	CGT	2	6	534327	534332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11155	NC_002488	GC	3	6	534480	534485	0 %	0 %	50 %	50 %	15837148
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11219	NC_002488	TC	3	6	537537	537542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11220	NC_002488	GT	3	6	537572	537577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11221	NC_002488	A	7	7	537594	537600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11227	NC_002488	CAGCG	2	10	537856	537865	20 %	0 %	40 %	40 %	15837152
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11229	NC_002488	TTC	2	6	537964	537969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837152
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11232	NC_002488	CTG	2	6	538148	538153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837152
11233	NC_002488	TGC	2	6	538185	538190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837152
11234	NC_002488	CGT	2	6	538212	538217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837152
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11238	NC_002488	TGA	2	6	538551	538556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837152
11239	NC_002488	GGCG	2	8	538597	538604	0 %	0 %	75 %	25 %	15837152
11240	NC_002488	CG	3	6	538603	538608	0 %	0 %	50 %	50 %	15837152
11241	NC_002488	ACC	2	6	538686	538691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837152
11242	NC_002488	GTT	2	6	538702	538707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837152
11243	NC_002488	CGG	2	6	538712	538717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837152
11244	NC_002488	GCG	2	6	538776	538781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837152
11245	NC_002488	GTG	2	6	538808	538813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837152
11246	NC_002488	GGT	2	6	538831	538836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837152
11247	NC_002488	CTT	2	6	538890	538895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837152
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11496	NC_002488	T	6	6	548960	548965	0 %	100 %	0 %	0 %	77747506
11497	NC_002488	AGT	2	6	548983	548988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747506
11498	NC_002488	GCT	2	6	548995	549000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747506
11499	NC_002488	CGTGG	2	10	549043	549052	0 %	20 %	60 %	20 %	77747506
11500	NC_002488	TGCT	2	8	549060	549067	0 %	50 %	25 %	25 %	77747506

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