MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002488	ACGTT	2	10	483000	483009	20 %	40 %	20 %	20 %	15837080
10002	NC_002488	AGC	2	6	483054	483059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10003	NC_002488	GCC	2	6	483104	483109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837080
10004	NC_002488	AGG	2	6	483128	483133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15837080
10005	NC_002488	GC	3	6	483151	483156	0 %	0 %	50 %	50 %	15837080
10006	NC_002488	CTT	2	6	483190	483195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837080
10007	NC_002488	ATG	2	6	483196	483201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10008	NC_002488	GGC	2	6	483309	483314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837080
10009	NC_002488	AATT	2	8	483322	483329	50 %	50 %	0 %	0 %	15837080
10010	NC_002488	CACCGA	2	12	483364	483375	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15837080
10011	NC_002488	GTG	2	6	483378	483383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10012	NC_002488	GAA	2	6	483417	483422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837080
10013	NC_002488	G	6	6	483431	483436	0 %	0 %	100 %	0 %	15837080
10014	NC_002488	TTA	2	6	483440	483445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15837080
10015	NC_002488	CTG	2	6	483448	483453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10016	NC_002488	GGC	2	6	483486	483491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837080
10017	NC_002488	CGTA	2	8	483500	483507	25 %	25 %	25 %	25 %	15837080
10018	NC_002488	CGC	2	6	483529	483534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837080
10019	NC_002488	ACCA	2	8	483639	483646	50 %	0 %	0 %	50 %	15837080
10020	NC_002488	TCT	2	6	483690	483695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837080
10021	NC_002488	TGG	2	6	483722	483727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10022	NC_002488	ATTA	2	8	483750	483757	50 %	50 %	0 %	0 %	15837080
10023	NC_002488	CTGT	2	8	483813	483820	0 %	50 %	25 %	25 %	15837080
10024	NC_002488	TGG	2	6	483838	483843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10025	NC_002488	CTG	2	6	483865	483870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10026	NC_002488	GCA	2	6	483871	483876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10027	NC_002488	GT	3	6	483922	483927	0 %	50 %	50 %	0 %	15837080
10028	NC_002488	TAA	2	6	483962	483967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15837080
10029	NC_002488	AGT	2	6	483978	483983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10030	NC_002488	ACA	2	6	483992	483997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837080
10031	NC_002488	CTC	2	6	484015	484020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15837080
10032	NC_002488	TAG	2	6	484196	484201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10033	NC_002488	TGG	2	6	484202	484207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10034	NC_002488	CAG	2	6	484251	484256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10035	NC_002488	CGT	2	6	484313	484318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10036	NC_002488	ATG	2	6	484375	484380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10037	NC_002488	CGT	2	6	484554	484559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10038	NC_002488	TGG	2	6	484576	484581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10039	NC_002488	AGT	2	6	484584	484589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10040	NC_002488	TGC	2	6	484610	484615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10041	NC_002488	GTG	2	6	484648	484653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10042	NC_002488	TGA	2	6	484658	484663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10043	NC_002488	CAAT	2	8	484685	484692	50 %	25 %	0 %	25 %	15837080
10044	NC_002488	TTAC	2	8	484700	484707	25 %	50 %	0 %	25 %	15837080
10045	NC_002488	GTG	2	6	484708	484713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
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10048	NC_002488	AATTC	2	10	484788	484797	40 %	40 %	0 %	20 %	15837080
10049	NC_002488	TGT	2	6	484799	484804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837080
10050	NC_002488	CGT	2	6	484812	484817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10051	NC_002488	TGGG	2	8	484826	484833	0 %	25 %	75 %	0 %	15837080
10052	NC_002488	TCA	2	6	484882	484887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
10053	NC_002488	GCT	2	6	484908	484913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10054	NC_002488	TTG	2	6	484924	484929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837080
10055	NC_002488	CAT	2	6	485007	485012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
10056	NC_002488	CAT	2	6	485043	485048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
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10058	NC_002488	GTTG	2	8	485111	485118	0 %	50 %	50 %	0 %	15837080
10059	NC_002488	TGT	2	6	485194	485199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837080
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10061	NC_002488	GCG	2	6	485283	485288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837080
10062	NC_002488	ACA	2	6	485305	485310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837080
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10064	NC_002488	TGC	2	6	485708	485713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10065	NC_002488	ACA	3	9	485719	485727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15837080
10066	NC_002488	ATC	2	6	485808	485813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
10067	NC_002488	ATC	2	6	485824	485829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
10068	NC_002488	TGGT	2	8	485888	485895	0 %	50 %	50 %	0 %	15837080
10069	NC_002488	TGG	2	6	485905	485910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10070	NC_002488	G	7	7	485963	485969	0 %	0 %	100 %	0 %	15837080
10071	NC_002488	TCT	2	6	485974	485979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837080
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10073	NC_002488	TGC	2	6	486050	486055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10074	NC_002488	GGT	2	6	486060	486065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837080
10075	NC_002488	GGTCA	2	10	486075	486084	20 %	20 %	40 %	20 %	15837080
10076	NC_002488	T	6	6	486205	486210	0 %	100 %	0 %	0 %	15837080
10077	NC_002488	CTG	2	6	486253	486258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837080
10078	NC_002488	TCA	2	6	486286	486291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837080
10079	NC_002488	GAT	2	6	486364	486369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837080
10080	NC_002488	GCAGGC	2	12	486396	486407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_002488	TTGA	2	8	486443	486450	25 %	50 %	25 %	0 %	15837081
10082	NC_002488	GTC	2	6	486484	486489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837081
10083	NC_002488	TGG	2	6	486555	486560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837081
10084	NC_002488	ATCTT	2	10	486661	486670	20 %	60 %	0 %	20 %	15837081
10085	NC_002488	TTG	2	6	486678	486683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837081
10086	NC_002488	AAT	2	6	486879	486884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_002488	T	7	7	487075	487081	0 %	100 %	0 %	0 %	15837082
10088	NC_002488	TTC	3	9	487207	487215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837082
10089	NC_002488	ATC	2	6	487247	487252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837082
10090	NC_002488	TGA	2	6	487273	487278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837082
10091	NC_002488	AAG	2	6	487313	487318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15837082
10092	NC_002488	GC	3	6	487343	487348	0 %	0 %	50 %	50 %	15837082
10093	NC_002488	AGC	2	6	487366	487371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837082
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10100	NC_002488	GGC	2	6	487809	487814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837082
10101	NC_002488	TGA	2	6	487982	487987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837082
10102	NC_002488	TG	3	6	488029	488034	0 %	50 %	50 %	0 %	15837082
10103	NC_002488	ATG	2	6	488045	488050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15837082
10104	NC_002488	GCC	2	6	488103	488108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837082
10105	NC_002488	C	6	6	488148	488153	0 %	0 %	0 %	100 %	15837082
10106	NC_002488	TG	3	6	488187	488192	0 %	50 %	50 %	0 %	15837082
10107	NC_002488	CGT	2	6	488258	488263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837083
10108	NC_002488	CGT	2	6	488330	488335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837083
10109	NC_002488	GGC	2	6	488354	488359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837083
10110	NC_002488	TTC	2	6	488367	488372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15837083
10111	NC_002488	CG	3	6	488375	488380	0 %	0 %	50 %	50 %	15837083
10112	NC_002488	T	7	7	488391	488397	0 %	100 %	0 %	0 %	15837083
10113	NC_002488	AGC	2	6	488410	488415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837083
10114	NC_002488	TCA	2	6	488498	488503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15837083
10115	NC_002488	GTC	2	6	488535	488540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837084
10116	NC_002488	GTC	2	6	488550	488555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837084
10117	NC_002488	GCATAG	2	12	488560	488571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15837084
10118	NC_002488	GTT	2	6	488580	488585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15837084
10119	NC_002488	CGC	2	6	488602	488607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837084
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10372	NC_002488	GC	3	6	500483	500488	0 %	0 %	50 %	50 %	15837107
10373	NC_002488	GTG	2	6	500493	500498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15837107
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10380	NC_002488	GCA	2	6	500846	500851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15837107
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10485	NC_002488	ACG	2	6	505537	505542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10487	NC_002488	GGC	2	6	505668	505673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10488	NC_002488	CGG	2	6	505684	505689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10489	NC_002488	CGC	2	6	505749	505754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10490	NC_002488	CGT	2	6	505757	505762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10491	NC_002488	AC	3	6	505811	505816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10492	NC_002488	TGC	2	6	505869	505874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15837111
10493	NC_002488	TCCG	2	8	505883	505890	0 %	25 %	25 %	50 %	15837111
10494	NC_002488	CG	3	6	505911	505916	0 %	0 %	50 %	50 %	15837111
10495	NC_002488	CGC	3	9	505963	505971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837111
10496	NC_002488	GCC	2	6	505976	505981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15837111
10497	NC_002488	GGC	2	6	505991	505996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837111
10498	NC_002488	CATTGC	2	12	506005	506016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15837111
10499	NC_002488	GCG	2	6	506034	506039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15837111
10500	NC_002488	ACC	2	6	506053	506058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15837111

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