MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Weeksella virosa DSM 16922 chromosome

Total Repeats: 7171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015144	ATACTA	2	12	2	13	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015144	A	7	7	1478	1484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015144	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015144	TC	3	6	2718	2723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015144	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015144	TTA	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015144	TTATT	2	10	4670	4679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015144	ACAA	2	8	4691	4698	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015144	T	8	8	4705	4712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015144	T	6	6	5125	5130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015144	A	6	6	5154	5159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015144	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015144	A	7	7	5173	5179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015144	TCTA	2	8	9633	9640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015144	TAGA	2	8	9648	9655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015144	TA	5	10	9684	9693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015144	TACAA	2	10	9710	9719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015144	TAGTT	2	10	10758	10767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015144	AAAT	2	8	10778	10785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015144	T	7	7	10788	10794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015144	A	6	6	10859	10864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015144	A	7	7	10873	10879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015144	A	7	7	10896	10902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015144	TTG	2	6	10910	10915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015144	AGG	2	6	10926	10931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015144	T	6	6	10990	10995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015144	A	8	8	11003	11010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015144	TA	3	6	11011	11016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015144	A	6	6	12283	12288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015144	T	7	7	16577	16583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015144	ATT	2	6	20592	20597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015144	T	7	7	20596	20602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015144	GTT	2	6	20652	20657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015144	CATCTT	2	12	20665	20676	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015144	CTT	2	6	20794	20799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015144	TCT	2	6	20823	20828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015144	TAGAA	2	10	20874	20883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015144	TAC	2	6	20913	20918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015144	T	6	6	20948	20953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015144	GT	3	6	20968	20973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015144	A	6	6	20974	20979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015144	TCCTTT	2	12	20988	20999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015144	CAC	2	6	21003	21008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015144	TCT	2	6	21112	21117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015144	TGAT	2	8	21128	21135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015144	TCC	2	6	21181	21186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015144	TTTA	2	8	21203	21210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015144	TGA	2	6	21283	21288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015144	ATT	2	6	21343	21348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015144	ATT	3	9	21392	21400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015144	AAT	2	6	21405	21410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015144	TTTG	2	8	21450	21457	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015144	ACAAAT	2	12	21464	21475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015144	TTTA	2	8	22951	22958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015144	TTTC	2	8	22974	22981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015144	GGAAAA	2	12	22995	23006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015144	A	6	6	23003	23008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015144	A	7	7	23013	23019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015144	TCT	2	6	23020	23025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015144	ATAA	2	8	23077	23084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015144	AACA	2	8	23121	23128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015144	TA	3	6	24442	24447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015144	TGA	2	6	24455	24460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015144	TCA	2	6	24462	24467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015144	A	7	7	25345	25351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015144	CAAA	2	8	25355	25362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015144	ACA	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015144	A	6	6	26831	26836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015144	ATTT	2	8	26863	26870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015144	ATAC	2	8	26878	26885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015144	T	8	8	32794	32801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015144	A	6	6	32830	32835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015144	GGTT	2	8	32836	32843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015144	TAT	2	6	32846	32851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015144	A	7	7	32853	32859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015144	AGA	2	6	32881	32886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015144	A	8	8	32908	32915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015144	TAA	2	6	32923	32928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015144	AATA	2	8	32963	32970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015144	A	6	6	32973	32978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015144	TAT	2	6	32982	32987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015144	AAT	2	6	33600	33605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015144	A	6	6	33614	33619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015144	T	6	6	33644	33649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015144	T	8	8	33684	33691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015144	TAA	2	6	33703	33708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015144	TAAGA	2	10	33771	33780	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015144	TAG	2	6	33787	33792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015144	AAC	2	6	33817	33822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015144	TGAA	2	8	33839	33846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015144	AAG	2	6	33858	33863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015144	TAA	2	6	33870	33875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015144	ATG	2	6	35272	35277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015144	T	9	9	35314	35322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015144	A	6	6	35368	35373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015144	AAATAA	2	12	35412	35423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015144	TACTT	2	10	37848	37857	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015144	ATC	2	6	37883	37888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015144	ATTT	2	8	37906	37913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015144	T	8	8	37926	37933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015144	TAA	2	6	37942	37947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015144	ATA	2	6	37962	37967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015144	TATT	2	8	37981	37988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015144	ATT	2	6	37994	37999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015144	ACA	2	6	40736	40741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015144	A	6	6	42608	42613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015144	T	11	11	42635	42645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015144	TTC	2	6	42647	42652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015144	CTA	2	6	42658	42663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015144	TA	3	6	42682	42687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015144	T	6	6	42689	42694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015144	A	8	8	42699	42706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015144	TAA	2	6	42724	42729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015144	A	6	6	42728	42733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015144	ATT	2	6	43857	43862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015144	ATT	2	6	43885	43890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015144	T	7	7	43955	43961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015144	A	7	7	43970	43976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015144	TAT	2	6	44759	44764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015144	GGAA	2	8	44846	44853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015144	T	7	7	46137	46143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015144	TCA	2	6	46183	46188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015144	T	6	6	46996	47001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015144	GGA	2	6	47084	47089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015144	TTTA	2	8	48235	48242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015144	TAA	2	6	49159	49164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015144	TAT	2	6	49174	49179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015144	TTA	2	6	49734	49739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015144	TGG	2	6	49759	49764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015144	T	7	7	49784	49790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015144	ATG	2	6	49807	49812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015144	ATT	2	6	50666	50671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015144	T	9	9	50670	50678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015144	CGG	2	6	50791	50796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015144	T	6	6	51755	51760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015144	CTC	2	6	51776	51781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015144	T	6	6	51889	51894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015144	T	6	6	51931	51936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015144	CG	3	6	53091	53096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015144	T	6	6	53145	53150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015144	CTT	2	6	53180	53185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015144	CCT	2	6	53256	53261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015144	TC	3	6	53303	53308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015144	A	7	7	53362	53368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015144	TAA	2	6	53504	53509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015144	TATT	2	8	53510	53517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015144	TTGCT	2	10	53612	53621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015144	TAT	2	6	53664	53669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015144	ATT	2	6	53702	53707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015144	A	6	6	53730	53735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015144	TTA	2	6	53742	53747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_015144	AAT	2	6	102152	102157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_015144	TAA	2	6	145503	145508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015144	A	7	7	145507	145513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015144	AAG	2	6	145547	145552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015144	TTG	2	6	145591	145596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015144	TG	3	6	145595	145600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_015144	TAC	2	6	145604	145609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_015144	T	7	7	146255	146261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015144	T	7	7	146268	146274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015144	CA	3	6	146284	146289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_015144	TTTA	2	8	146351	146358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015144	TTTCA	2	10	146369	146378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
452	NC_015144	TTG	2	6	146407	146412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015144	T	6	6	149173	149178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015144	TGCA	2	8	149180	149187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_015144	TAAAAA	2	12	149286	149297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015144	GT	3	6	150097	150102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015144	TAA	2	6	150229	150234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_015144	TA	3	6	151732	151737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_015144	AT	3	6	152013	152018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_015144	T	6	6	152043	152048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_015144	TCC	2	6	152067	152072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_015144	CATT	2	8	152082	152089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_015144	T	7	7	152088	152094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_015144	ACT	2	6	152097	152102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_015144	T	6	6	152174	152179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_015144	GTT	2	6	152326	152331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_015144	ATTT	2	8	153310	153317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015144	TAA	2	6	153339	153344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015144	AAT	2	6	153365	153370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_015144	TAAA	2	8	154499	154506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_015144	TCA	2	6	154507	154512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_015144	A	7	7	154528	154534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_015144	A	8	8	154536	154543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_015144	T	8	8	154572	154579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015144	T	6	6	154597	154602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015144	CAA	2	6	157589	157594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_015144	A	6	6	157593	157598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015144	TGTAAA	2	12	159640	159651	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_015144	CCTA	2	8	160297	160304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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488	NC_015144	TCT	2	6	162972	162977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_015144	TAT	2	6	163004	163009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015144	TGTA	2	8	163016	163023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_015144	CAA	2	6	163037	163042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_015144	A	6	6	163045	163050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_015144	ATT	2	6	163057	163062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_015144	A	6	6	164685	164690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015144	TTTA	2	8	164694	164701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_015144	TAAA	2	8	164704	164711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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