MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Waddlia chondrophila WSU 86-1044 plasmid pWc

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014226	ACC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014226	TAT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014226	TAA	2	6	84	89	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014226	CATC	2	8	108	115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014226	AT	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014226	AC	3	6	392	397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014226	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014226	ATT	2	6	1434	1439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014226	A	6	6	1487	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014226	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014226	TA	3	6	1509	1514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014226	TGA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014226	TGA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014226	T	6	6	2185	2190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014226	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014226	TCA	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014226	TAAA	2	8	2280	2287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014226	A	6	6	2285	2290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014226	T	6	6	2295	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014226	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014226	A	6	6	2359	2364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014226	A	6	6	2377	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014226	TAA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014226	AATA	2	8	2521	2528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014226	AAT	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014226	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014226	A	6	6	2672	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014226	TC	3	6	3820	3825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014226	TAAA	2	8	4135	4142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014226	A	6	6	4187	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014226	TAAAT	2	10	4202	4211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014226	ACTA	2	8	6473	6480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014226	TTG	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014226	TTAT	2	8	6579	6586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014226	T	7	7	6589	6595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014226	ATA	2	6	6637	6642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014226	A	8	8	6716	6723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014226	T	7	7	11306	11312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014226	AAT	2	6	11330	11335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014226	AT	3	6	11361	11366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014226	TA	3	6	11391	11396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014226	TTGC	2	8	11411	11418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014226	TTCT	2	8	11561	11568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014226	ATT	2	6	11586	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014226	CA	3	6	11594	11599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014226	CATT	2	8	13876	13883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014226	TTG	2	6	13925	13930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014226	GTT	2	6	13957	13962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014226	A	7	7	14395	14401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014226	TTG	2	6	14431	14436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014226	TAA	2	6	14463	14468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014226	T	7	7	15096	15102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014226	TA	3	6	15130	15135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014226	ATTG	2	8	15220	15227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014226	AAT	2	6	15266	15271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014226	GT	4	8	15412	15419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014226	TTC	2	6	15424	15429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014226	CCAAG	2	10	15478	15487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014226	T	7	7	15577	15583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.