MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Waddlia chondrophila WSU 86-1044 chromosome

Total Repeats: 40217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014225	T	6	6	174	179	0 %	100 %	0 %	0 %	297620247
2	NC_014225	CAA	2	6	196	201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620247
3	NC_014225	CAA	2	6	219	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620247
4	NC_014225	AATCG	2	10	233	242	40 %	20 %	20 %	20 %	297620247
5	NC_014225	A	7	7	251	257	100 %	0 %	0 %	0 %	297620247
6	NC_014225	GAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
7	NC_014225	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620248
8	NC_014225	AACA	2	8	450	457	75 %	0 %	0 %	25 %	297620248
9	NC_014225	AGG	2	6	536	541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620248
10	NC_014225	GAA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
11	NC_014225	AGAGA	2	10	647	656	60 %	0 %	40 %	0 %	297620248
12	NC_014225	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620248
13	NC_014225	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620248
14	NC_014225	CT	3	6	877	882	0 %	50 %	0 %	50 %	297620248
15	NC_014225	AG	4	8	1025	1032	50 %	0 %	50 %	0 %	297620248
16	NC_014225	GCG	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620248
17	NC_014225	AGC	3	9	1161	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620248
18	NC_014225	AGA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
19	NC_014225	GGC	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620248
20	NC_014225	GCA	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620248
21	NC_014225	CAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620248
22	NC_014225	CTA	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620248
23	NC_014225	A	6	6	1535	1540	100 %	0 %	0 %	0 %	297620248
24	NC_014225	GAAAAA	2	12	1619	1630	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297620248
25	NC_014225	TACA	2	8	1934	1941	50 %	25 %	0 %	25 %	297620249
26	NC_014225	AGG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620249
27	NC_014225	GC	3	6	1980	1985	0 %	0 %	50 %	50 %	297620249
28	NC_014225	AAAG	2	8	2079	2086	75 %	0 %	25 %	0 %	297620249
29	NC_014225	CGG	2	6	2183	2188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620250
30	NC_014225	CTG	2	6	2224	2229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620250
31	NC_014225	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	297620250
32	NC_014225	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620250
33	NC_014225	CAAC	2	8	2382	2389	50 %	0 %	0 %	50 %	297620250
34	NC_014225	CTT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620251
35	NC_014225	TCA	3	9	2443	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620251
36	NC_014225	TG	3	6	2522	2527	0 %	50 %	50 %	0 %	297620251
37	NC_014225	ATA	2	6	2528	2533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620251
38	NC_014225	TCAA	2	8	2598	2605	50 %	25 %	0 %	25 %	297620251
39	NC_014225	AAT	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620251
40	NC_014225	ATT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620251
41	NC_014225	T	6	6	2676	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
42	NC_014225	CTT	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620251
43	NC_014225	T	7	7	2734	2740	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
44	NC_014225	T	6	6	2757	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
45	NC_014225	A	6	6	2778	2783	100 %	0 %	0 %	0 %	297620251
46	NC_014225	ATC	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620251
47	NC_014225	GATG	2	8	2923	2930	25 %	25 %	50 %	0 %	297620252
48	NC_014225	A	6	6	2963	2968	100 %	0 %	0 %	0 %	297620252
49	NC_014225	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620252
50	NC_014225	AG	3	6	3097	3102	50 %	0 %	50 %	0 %	297620252
51	NC_014225	TGA	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620252
52	NC_014225	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	297620253
53	NC_014225	AG	3	6	3273	3278	50 %	0 %	50 %	0 %	297620253
54	NC_014225	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
55	NC_014225	ATC	3	9	3291	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
56	NC_014225	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
57	NC_014225	CAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
58	NC_014225	TCG	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620253
59	NC_014225	ATC	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
60	NC_014225	CAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
61	NC_014225	AGT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620254
62	NC_014225	GCATCA	2	12	3843	3854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297620254
63	NC_014225	GTATCC	2	12	3866	3877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297620254
64	NC_014225	TCGC	2	8	3881	3888	0 %	25 %	25 %	50 %	297620254
65	NC_014225	GT	3	6	3910	3915	0 %	50 %	50 %	0 %	297620254
66	NC_014225	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297620254
67	NC_014225	GTC	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620254
68	NC_014225	TCA	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620254
69	NC_014225	T	6	6	4060	4065	0 %	100 %	0 %	0 %	297620254
70	NC_014225	CTTG	2	8	4125	4132	0 %	50 %	25 %	25 %	297620254
71	NC_014225	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	297620254
72	NC_014225	GTT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297620254
73	NC_014225	GATT	2	8	4472	4479	25 %	50 %	25 %	0 %	297620255
74	NC_014225	GAG	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620255
75	NC_014225	AGA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620255
76	NC_014225	TG	3	6	4603	4608	0 %	50 %	50 %	0 %	297620255
77	NC_014225	TGG	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297620255
78	NC_014225	CGAT	2	8	4822	4829	25 %	25 %	25 %	25 %	297620255
79	NC_014225	CA	3	6	4881	4886	50 %	0 %	0 %	50 %	297620255
80	NC_014225	CAA	2	6	4908	4913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620255
81	NC_014225	GTAAAA	2	12	4929	4940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297620255
82	NC_014225	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
83	NC_014225	AACGAT	2	12	5003	5014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297620255
84	NC_014225	GCA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620255
85	NC_014225	TGG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297620255
86	NC_014225	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	297620255
87	NC_014225	ATT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
88	NC_014225	GCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620255
89	NC_014225	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620255
90	NC_014225	T	6	6	5223	5228	0 %	100 %	0 %	0 %	297620255
91	NC_014225	GAA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620255
92	NC_014225	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
93	NC_014225	GAAC	2	8	5304	5311	50 %	0 %	25 %	25 %	297620255
94	NC_014225	GATA	2	8	5312	5319	50 %	25 %	25 %	0 %	297620255
95	NC_014225	CGT	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620255
96	NC_014225	CGATC	2	10	5389	5398	20 %	20 %	20 %	40 %	297620255
97	NC_014225	ATCT	2	8	5488	5495	25 %	50 %	0 %	25 %	297620255
98	NC_014225	CAAA	2	8	5538	5545	75 %	0 %	0 %	25 %	297620255
99	NC_014225	G	6	6	5547	5552	0 %	0 %	100 %	0 %	297620255
100	NC_014225	GAAA	2	8	5566	5573	75 %	0 %	25 %	0 %	297620255
101	NC_014225	TCT	2	6	5594	5599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620255
102	NC_014225	AATG	2	8	5606	5613	50 %	25 %	25 %	0 %	297620255
103	NC_014225	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620256
104	NC_014225	GGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620256
105	NC_014225	GCA	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620256
106	NC_014225	CAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620256
107	NC_014225	TGCC	2	8	5897	5904	0 %	25 %	25 %	50 %	297620256
108	NC_014225	CTA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620256
109	NC_014225	A	6	6	5944	5949	100 %	0 %	0 %	0 %	297620256
110	NC_014225	GAAAAA	2	12	6028	6039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297620256
111	NC_014225	T	6	6	6301	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	297620257
112	NC_014225	AATG	2	8	6314	6321	50 %	25 %	25 %	0 %	297620257
113	NC_014225	TGT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297620257
114	NC_014225	T	8	8	6392	6399	0 %	100 %	0 %	0 %	297620257
115	NC_014225	ATTTG	2	10	6418	6427	20 %	60 %	20 %	0 %	297620257
116	NC_014225	TTC	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620257
117	NC_014225	ACC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297620257
118	NC_014225	AGG	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620258
119	NC_014225	A	6	6	6596	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	297620258
120	NC_014225	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297620258
121	NC_014225	CCTC	2	8	6706	6713	0 %	25 %	0 %	75 %	297620258
122	NC_014225	GTC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620258
123	NC_014225	GCTT	2	8	6786	6793	0 %	50 %	25 %	25 %	297620258
124	NC_014225	GAA	2	6	6864	6869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620258
125	NC_014225	ATGA	2	8	6878	6885	50 %	25 %	25 %	0 %	297620258
126	NC_014225	TTC	2	6	6888	6893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620258
127	NC_014225	AGC	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620258
128	NC_014225	CAA	2	6	7100	7105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620258
129	NC_014225	TCA	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620258
130	NC_014225	ATC	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620258
131	NC_014225	AAG	2	6	7195	7200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620258
132	NC_014225	TCC	2	6	7250	7255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297620258
133	NC_014225	TCC	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297620258
134	NC_014225	TAA	2	6	7355	7360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620258
135	NC_014225	T	6	6	7391	7396	0 %	100 %	0 %	0 %	297620258
136	NC_014225	TAA	2	6	7409	7414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620258
137	NC_014225	AGTT	2	8	7417	7424	25 %	50 %	25 %	0 %	297620258
138	NC_014225	T	7	7	7432	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	297620258
139	NC_014225	CAT	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620258
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146	NC_014225	AAAGC	2	10	8007	8016	60 %	0 %	20 %	20 %	297620259
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149	NC_014225	TA	4	8	8164	8171	50 %	50 %	0 %	0 %	297620260
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253	NC_014225	CTTT	2	8	13374	13381	0 %	75 %	0 %	25 %	297620263
254	NC_014225	T	7	7	13379	13385	0 %	100 %	0 %	0 %	297620263
255	NC_014225	CAT	2	6	13419	13424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
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258	NC_014225	T	6	6	13673	13678	0 %	100 %	0 %	0 %	297620263
259	NC_014225	TTTC	2	8	13685	13692	0 %	75 %	0 %	25 %	297620263
260	NC_014225	CTT	2	6	13754	13759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620263
261	NC_014225	ATC	2	6	13773	13778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
262	NC_014225	CAT	3	9	13812	13820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
263	NC_014225	CTG	2	6	13906	13911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620263
264	NC_014225	TAA	2	6	13952	13957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620263
265	NC_014225	GCA	2	6	14004	14009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620263
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267	NC_014225	ACG	2	6	14095	14100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620263
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391	NC_014225	GTT	2	6	22079	22084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297620272
392	NC_014225	CGAT	2	8	22108	22115	25 %	25 %	25 %	25 %	297620272
393	NC_014225	AGG	2	6	22193	22198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620272
394	NC_014225	A	6	6	22231	22236	100 %	0 %	0 %	0 %	297620272
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