MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi

Total Repeats: 16830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006833	AT	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	58584262
2	NC_006833	GAGC	2	8	122	129	25 %	0 %	50 %	25 %	58584262
3	NC_006833	AGT	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
4	NC_006833	AGT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
5	NC_006833	AGG	2	6	175	180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584262
6	NC_006833	GCAGG	2	10	185	194	20 %	0 %	60 %	20 %	58584262
7	NC_006833	ACA	2	6	289	294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584262
8	NC_006833	GTA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
9	NC_006833	GCA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
10	NC_006833	CGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
11	NC_006833	AGA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584262
12	NC_006833	CATA	2	8	586	593	50 %	25 %	0 %	25 %	58584262
13	NC_006833	AGC	2	6	606	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
14	NC_006833	GAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584262
15	NC_006833	CAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584262
16	NC_006833	ATA	2	6	846	851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584262
17	NC_006833	CTG	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584262
18	NC_006833	ATT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584262
19	NC_006833	A	6	6	895	900	100 %	0 %	0 %	0 %	58584262
20	NC_006833	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	58584262
21	NC_006833	ATA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584262
22	NC_006833	TGC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584262
23	NC_006833	A	8	8	1305	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
24	NC_006833	A	7	7	1362	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
25	NC_006833	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584263
26	NC_006833	TGGA	2	8	1415	1422	25 %	25 %	50 %	0 %	58584263
27	NC_006833	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
28	NC_006833	ATA	2	6	1466	1471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
29	NC_006833	TGGTGC	2	12	1503	1514	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	58584263
30	NC_006833	TAT	2	6	1523	1528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
31	NC_006833	TGG	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58584263
32	NC_006833	TTG	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584263
33	NC_006833	A	7	7	1696	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
34	NC_006833	CAG	2	6	1736	1741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584263
35	NC_006833	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	58584263
36	NC_006833	ATT	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
37	NC_006833	ATATA	2	10	1835	1844	60 %	40 %	0 %	0 %	58584263
38	NC_006833	TTC	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584263
39	NC_006833	AGC	3	9	2037	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584263
40	NC_006833	TTA	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
41	NC_006833	TTTG	2	8	2181	2188	0 %	75 %	25 %	0 %	58584263
42	NC_006833	TTG	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584263
43	NC_006833	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
44	NC_006833	ATC	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584263
45	NC_006833	GAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584263
46	NC_006833	TTA	2	6	2324	2329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
47	NC_006833	AAC	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584263
48	NC_006833	ATT	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
49	NC_006833	GTTAA	2	10	2400	2409	40 %	40 %	20 %	0 %	58584263
50	NC_006833	TTC	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584264
51	NC_006833	TTG	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584264
52	NC_006833	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584264
53	NC_006833	CTA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584264
54	NC_006833	TCCT	2	8	3011	3018	0 %	50 %	0 %	50 %	58584264
55	NC_006833	TAATG	2	10	3043	3052	40 %	40 %	20 %	0 %	58584264
56	NC_006833	TTG	2	6	3057	3062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584264
57	NC_006833	TCTT	2	8	3078	3085	0 %	75 %	0 %	25 %	58584264
58	NC_006833	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	58584264
59	NC_006833	T	6	6	3840	3845	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
60	NC_006833	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
61	NC_006833	TA	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	58584265
62	NC_006833	TAA	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584265
63	NC_006833	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58584265
64	NC_006833	CTATA	2	10	3973	3982	40 %	40 %	0 %	20 %	58584265
65	NC_006833	TGT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
66	NC_006833	TTG	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
67	NC_006833	TGA	2	6	4101	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
68	NC_006833	TAG	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
69	NC_006833	AAT	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584265
70	NC_006833	GTTGGA	2	12	4138	4149	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58584265
71	NC_006833	A	6	6	4204	4209	100 %	0 %	0 %	0 %	58584265
72	NC_006833	TAG	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
73	NC_006833	T	6	6	4281	4286	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
74	NC_006833	TTGG	2	8	4298	4305	0 %	50 %	50 %	0 %	58584265
75	NC_006833	TA	3	6	4314	4319	50 %	50 %	0 %	0 %	58584265
76	NC_006833	GTT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
77	NC_006833	TTC	2	6	4360	4365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
78	NC_006833	AGA	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584265
79	NC_006833	CAA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584265
80	NC_006833	T	6	6	4462	4467	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
81	NC_006833	TGGT	2	8	4478	4485	0 %	50 %	50 %	0 %	58584265
82	NC_006833	TCT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
83	NC_006833	ATT	2	6	4657	4662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
84	NC_006833	TGT	2	6	4725	4730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
85	NC_006833	CTT	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
86	NC_006833	T	7	7	4869	4875	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
87	NC_006833	TAG	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
88	NC_006833	GCT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584265
89	NC_006833	ATT	2	6	4975	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
90	NC_006833	T	6	6	5003	5008	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
91	NC_006833	AG	3	6	5101	5106	50 %	0 %	50 %	0 %	58584266
92	NC_006833	TGA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
93	NC_006833	AG	5	10	5164	5173	50 %	0 %	50 %	0 %	58584266
94	NC_006833	TAA	2	6	5263	5268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
95	NC_006833	TA	3	6	5282	5287	50 %	50 %	0 %	0 %	58584266
96	NC_006833	ACT	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584266
97	NC_006833	GGA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584266
98	NC_006833	GCG	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58584266
99	NC_006833	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584266
100	NC_006833	TAA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
101	NC_006833	ATG	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
102	NC_006833	A	6	6	5852	5857	100 %	0 %	0 %	0 %	58584266
103	NC_006833	CTG	3	9	6201	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584266
104	NC_006833	ACA	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584266
105	NC_006833	TAA	2	6	6258	6263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
106	NC_006833	ATTA	2	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	58584266
107	NC_006833	AAC	2	6	6293	6298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584266
108	NC_006833	GA	3	6	6308	6313	50 %	0 %	50 %	0 %	58584266
109	NC_006833	TGA	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
110	NC_006833	TATT	2	8	6355	6362	25 %	75 %	0 %	0 %	58584266
111	NC_006833	AGT	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
112	NC_006833	AATCC	2	10	7475	7484	40 %	20 %	0 %	40 %	58584267
113	NC_006833	CAT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584267
114	NC_006833	TTG	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584267
115	NC_006833	ATT	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584267
116	NC_006833	TC	3	6	7542	7547	0 %	50 %	0 %	50 %	58584267
117	NC_006833	TATC	2	8	7627	7634	25 %	50 %	0 %	25 %	58584267
118	NC_006833	CAG	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584267
119	NC_006833	TCA	2	6	7698	7703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584267
120	NC_006833	T	6	6	7712	7717	0 %	100 %	0 %	0 %	58584267
121	NC_006833	TTA	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584267
122	NC_006833	AGT	2	6	7728	7733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584267
123	NC_006833	ACT	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584267
124	NC_006833	GATT	2	8	7853	7860	25 %	50 %	25 %	0 %	58584267
125	NC_006833	CTA	2	6	8005	8010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584267
126	NC_006833	AAG	2	6	8141	8146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584267
127	NC_006833	CCA	2	6	8148	8153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58584267
128	NC_006833	GATT	2	8	8168	8175	25 %	50 %	25 %	0 %	58584267
129	NC_006833	T	6	6	8252	8257	0 %	100 %	0 %	0 %	58584267
130	NC_006833	TCT	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584267
131	NC_006833	CAA	2	6	8284	8289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584267
132	NC_006833	AGTAT	2	10	8325	8334	40 %	40 %	20 %	0 %	58584267
133	NC_006833	ACA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584267
134	NC_006833	T	6	6	8346	8351	0 %	100 %	0 %	0 %	58584267
135	NC_006833	CTT	2	6	8356	8361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584267
136	NC_006833	GATT	2	8	8369	8376	25 %	50 %	25 %	0 %	58584267
137	NC_006833	T	6	6	8456	8461	0 %	100 %	0 %	0 %	58584267
138	NC_006833	AT	3	6	8465	8470	50 %	50 %	0 %	0 %	58584267
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276	NC_006833	GAAA	2	8	18351	18358	75 %	0 %	25 %	0 %	58584273
277	NC_006833	T	7	7	18363	18369	0 %	100 %	0 %	0 %	58584273
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285	NC_006833	TG	4	8	18662	18669	0 %	50 %	50 %	0 %	58584273
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289	NC_006833	TAAT	2	8	18807	18814	50 %	50 %	0 %	0 %	58584273
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404	NC_006833	AAT	2	6	24833	24838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584279
405	NC_006833	AAAATG	2	12	24863	24874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58584279
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489	NC_006833	CTT	2	6	31735	31740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584282
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