MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis chromosome

Total Repeats: 21659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004344	TTG	2	6	216	221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32490750
2	NC_004344	GGT	2	6	224	229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32490750
3	NC_004344	GCA	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32490750
4	NC_004344	AAATG	2	10	264	273	60 %	20 %	20 %	0 %	32490750
5	NC_004344	TAA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
6	NC_004344	GGA	2	6	338	343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32490750
7	NC_004344	AAT	2	6	388	393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
8	NC_004344	GCT	2	6	401	406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490750
9	NC_004344	CAG	2	6	453	458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32490750
10	NC_004344	CAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32490750
11	NC_004344	ATAG	2	8	479	486	50 %	25 %	25 %	0 %	32490750
12	NC_004344	TTC	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32490750
13	NC_004344	A	6	6	510	515	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
14	NC_004344	ATCAA	2	10	520	529	60 %	20 %	0 %	20 %	32490750
15	NC_004344	A	7	7	528	534	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
16	NC_004344	TATT	2	8	539	546	25 %	75 %	0 %	0 %	32490750
17	NC_004344	ACA	2	6	547	552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32490750
18	NC_004344	A	7	7	576	582	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
19	NC_004344	TAA	3	9	615	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
20	NC_004344	TAA	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
21	NC_004344	TAC	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490750
22	NC_004344	TCT	2	6	719	724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32490750
23	NC_004344	AAAAG	2	10	745	754	80 %	0 %	20 %	0 %	32490750
24	NC_004344	CTC	2	6	789	794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32490750
25	NC_004344	TTG	2	6	882	887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32490750
26	NC_004344	AAC	2	6	900	905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32490750
27	NC_004344	TA	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	32490750
28	NC_004344	ACAA	2	8	926	933	75 %	0 %	0 %	25 %	32490750
29	NC_004344	ATA	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
30	NC_004344	TTA	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490750
31	NC_004344	ATA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
32	NC_004344	AGA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
33	NC_004344	GTT	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32490750
34	NC_004344	A	6	6	1052	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
35	NC_004344	TCA	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490750
36	NC_004344	T	7	7	1071	1077	0 %	100 %	0 %	0 %	32490750
37	NC_004344	AAT	2	6	1094	1099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
38	NC_004344	AT	3	6	1106	1111	50 %	50 %	0 %	0 %	32490750
39	NC_004344	ATT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490750
40	NC_004344	AAT	2	6	1267	1272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
41	NC_004344	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	32490750
42	NC_004344	ACT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490750
43	NC_004344	GAA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
44	NC_004344	ATT	2	6	1339	1344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490750
45	NC_004344	TGC	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490750
46	NC_004344	A	6	6	1372	1377	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
47	NC_004344	TGA	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32490750
48	NC_004344	ATTA	2	8	1495	1502	50 %	50 %	0 %	0 %	32490750
49	NC_004344	AGA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
50	NC_004344	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
51	NC_004344	AAT	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
52	NC_004344	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
53	NC_004344	AAT	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
54	NC_004344	TAA	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
55	NC_004344	A	8	8	1592	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
56	NC_004344	A	6	6	1618	1623	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
57	NC_004344	A	6	6	1627	1632	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
58	NC_004344	TAA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
59	NC_004344	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
60	NC_004344	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
61	NC_004344	AATT	2	8	1669	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	32490750
62	NC_004344	TAA	2	6	1684	1689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
63	NC_004344	CTG	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490750
64	NC_004344	CGT	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490750
65	NC_004344	GAA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
66	NC_004344	ATA	2	6	1793	1798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490750
67	NC_004344	AT	3	6	1831	1836	50 %	50 %	0 %	0 %	32490750
68	NC_004344	AAGAAA	2	12	1845	1856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	32490750
69	NC_004344	A	7	7	1862	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
70	NC_004344	TAC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490750
71	NC_004344	CAT	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490750
72	NC_004344	AAAT	2	8	1899	1906	75 %	25 %	0 %	0 %	32490750
73	NC_004344	A	7	7	1910	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
74	NC_004344	AAG	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490750
75	NC_004344	CAG	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32490750
76	NC_004344	TAT	2	6	2020	2025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490750
77	NC_004344	A	8	8	2039	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	32490750
78	NC_004344	AAAT	2	8	2063	2070	75 %	25 %	0 %	0 %	32490750
79	NC_004344	CAAT	2	8	2241	2248	50 %	25 %	0 %	25 %	32490751
80	NC_004344	AT	4	8	2265	2272	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
81	NC_004344	CAT	2	6	2275	2280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490751
82	NC_004344	A	6	6	2283	2288	100 %	0 %	0 %	0 %	32490751
83	NC_004344	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490751
84	NC_004344	T	7	7	2371	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
85	NC_004344	T	7	7	2379	2385	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
86	NC_004344	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490751
87	NC_004344	T	7	7	2396	2402	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
88	NC_004344	GTT	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32490751
89	NC_004344	T	6	6	2407	2412	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
90	NC_004344	TA	3	6	2416	2421	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
91	NC_004344	A	7	7	2424	2430	100 %	0 %	0 %	0 %	32490751
92	NC_004344	TAG	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32490751
93	NC_004344	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490751
94	NC_004344	ATA	2	6	2519	2524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490751
95	NC_004344	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490751
96	NC_004344	TTTG	2	8	2560	2567	0 %	75 %	25 %	0 %	32490751
97	NC_004344	AT	3	6	2616	2621	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
98	NC_004344	AT	3	6	2639	2644	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
99	NC_004344	CAT	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490751
100	NC_004344	ATATTA	2	12	2672	2683	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
101	NC_004344	T	7	7	2705	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
102	NC_004344	TTG	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32490751
103	NC_004344	T	7	7	2753	2759	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
104	NC_004344	T	9	9	2767	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	32490751
105	NC_004344	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490751
106	NC_004344	AATT	2	8	2822	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
107	NC_004344	TTTTA	2	10	2898	2907	20 %	80 %	0 %	0 %	32490751
108	NC_004344	TGG	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32490751
109	NC_004344	ATT	3	9	2977	2985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490751
110	NC_004344	ATTT	2	8	2994	3001	25 %	75 %	0 %	0 %	32490751
111	NC_004344	TA	3	6	3018	3023	50 %	50 %	0 %	0 %	32490751
112	NC_004344	TA	3	6	3101	3106	50 %	50 %	0 %	0 %	32490752
113	NC_004344	GCT	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490752
114	NC_004344	GGAATT	2	12	3154	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32490752
115	NC_004344	AGG	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32490752
116	NC_004344	GCT	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32490752
117	NC_004344	T	6	6	3232	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	32490752
118	NC_004344	GCA	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32490752
119	NC_004344	T	8	8	3367	3374	0 %	100 %	0 %	0 %	32490753
120	NC_004344	T	9	9	3380	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	32490753
121	NC_004344	AT	4	8	3396	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	32490753
122	NC_004344	TAG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32490753
123	NC_004344	AGAGA	2	10	3431	3440	60 %	0 %	40 %	0 %	32490753
124	NC_004344	A	7	7	3510	3516	100 %	0 %	0 %	0 %	32490753
125	NC_004344	TTA	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32490753
126	NC_004344	AGA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490753
127	NC_004344	A	7	7	3597	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	32490753
128	NC_004344	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	32490753
129	NC_004344	A	9	9	3662	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	32490753
130	NC_004344	TG	3	6	3674	3679	0 %	50 %	50 %	0 %	32490753
131	NC_004344	ATA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490753
132	NC_004344	A	6	6	3725	3730	100 %	0 %	0 %	0 %	32490753
133	NC_004344	TAAA	2	8	3746	3753	75 %	25 %	0 %	0 %	32490753
134	NC_004344	A	7	7	3751	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	32490753
135	NC_004344	CAT	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32490753
136	NC_004344	AT	3	6	3823	3828	50 %	50 %	0 %	0 %	32490754
137	NC_004344	ATCT	2	8	3842	3849	25 %	50 %	0 %	25 %	32490754
138	NC_004344	ATA	2	6	3890	3895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32490754
139	NC_004344	TAG	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32490754
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141	NC_004344	AGA	2	6	3921	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32490754
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