MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Weissella koreensis KACC 15510 plasmid WKp2903

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015756	ATT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015756	TGT	2	6	32	37	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015756	TA	4	8	56	63	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015756	CAA	2	6	79	84	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015756	ATT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015756	AAT	2	6	103	108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015756	TTTTTA	2	12	144	155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015756	CACTT	2	10	185	194	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015756	A	6	6	197	202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015756	CT	3	6	267	272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015756	TAAA	2	8	320	327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015756	TTC	2	6	390	395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015756	T	7	7	499	505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015756	TA	3	6	592	597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015756	ATA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
16	NC_015756	CAC	2	6	644	649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339635251
17	NC_015756	A	7	7	683	689	100 %	0 %	0 %	0 %	339635251
18	NC_015756	AAT	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
19	NC_015756	ACT	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635251
20	NC_015756	TGAA	2	8	763	770	50 %	25 %	25 %	0 %	339635251
21	NC_015756	GAC	2	6	780	785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339635251
22	NC_015756	AAT	2	6	896	901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
23	NC_015756	ATA	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
24	NC_015756	CAA	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635251
25	NC_015756	GAAC	2	8	1137	1144	50 %	0 %	25 %	25 %	339635251
26	NC_015756	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635251
27	NC_015756	AT	3	6	1165	1170	50 %	50 %	0 %	0 %	339635251
28	NC_015756	ATG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015756	TGT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015756	TG	3	6	1268	1273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015756	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015756	A	7	7	1313	1319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015756	CGTAT	2	10	1351	1360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015756	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015756	AGA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015756	AAAG	2	8	1495	1502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015756	TCG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015756	T	7	7	1536	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015756	TTA	2	6	1655	1660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015756	A	8	8	1672	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015756	GATA	2	8	1756	1763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015756	T	6	6	1783	1788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015756	CCG	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015756	ATT	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015756	T	6	6	2077	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015756	GAG	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015756	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635252
48	NC_015756	CAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635252
49	NC_015756	GAA	2	6	2335	2340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
50	NC_015756	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	339635252
51	NC_015756	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	339635252
52	NC_015756	TGA	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635252
53	NC_015756	AAG	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
54	NC_015756	A	6	6	2589	2594	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
55	NC_015756	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
56	NC_015756	ACA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635252
57	NC_015756	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635252
58	NC_015756	GT	3	6	2879	2884	0 %	50 %	50 %	0 %	339635252
59	NC_015756	GAA	2	6	2895	2900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
60	NC_015756	GAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
61	NC_015756	TATGC	2	10	3055	3064	20 %	40 %	20 %	20 %	339635252
62	NC_015756	ACTC	2	8	3156	3163	25 %	25 %	0 %	50 %	339635252
63	NC_015756	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
64	NC_015756	GAC	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339635252
65	NC_015756	TAGAT	2	10	3243	3252	40 %	40 %	20 %	0 %	339635252
66	NC_015756	AATC	2	8	3279	3286	50 %	25 %	0 %	25 %	339635252
67	NC_015756	AAT	2	6	3386	3391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015756	TAA	2	6	3423	3428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015756	CAAAA	2	10	3476	3485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015756	TGTTT	2	10	3527	3536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015756	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015756	TAT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015756	TAT	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015756	A	6	6	3658	3663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015756	TAA	2	6	3755	3760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015756	CAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015756	AC	3	6	3871	3876	50 %	0 %	0 %	50 %	339635253
78	NC_015756	GTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635253
79	NC_015756	C	6	6	4001	4006	0 %	0 %	0 %	100 %	339635253
80	NC_015756	TTTA	2	8	4020	4027	25 %	75 %	0 %	0 %	339635253
81	NC_015756	GTT	2	6	4039	4044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635253
82	NC_015756	T	7	7	4048	4054	0 %	100 %	0 %	0 %	339635253
83	NC_015756	TGA	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
84	NC_015756	CAA	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635253
85	NC_015756	AAG	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
86	NC_015756	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
87	NC_015756	T	7	7	4120	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	339635253
88	NC_015756	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
89	NC_015756	TTA	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635253
90	NC_015756	TAAT	2	8	4251	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	339635253
91	NC_015756	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635253
92	NC_015756	AGTA	2	8	4310	4317	50 %	25 %	25 %	0 %	339635253
93	NC_015756	AAT	2	6	4321	4326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635253
94	NC_015756	CAAT	2	8	4354	4361	50 %	25 %	0 %	25 %	339635253
95	NC_015756	GA	3	6	4390	4395	50 %	0 %	50 %	0 %	339635253
96	NC_015756	TGA	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
97	NC_015756	A	6	6	4494	4499	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
98	NC_015756	TGAA	2	8	4506	4513	50 %	25 %	25 %	0 %	339635253
99	NC_015756	AC	3	6	4534	4539	50 %	0 %	0 %	50 %	339635253
100	NC_015756	A	6	6	4568	4573	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
101	NC_015756	A	6	6	4610	4615	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
102	NC_015756	GAT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
103	NC_015756	GAT	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
104	NC_015756	AAG	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
105	NC_015756	AGA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
106	NC_015756	AT	3	6	4762	4767	50 %	50 %	0 %	0 %	339635253
107	NC_015756	TAC	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635253
108	NC_015756	ACAA	2	8	4887	4894	75 %	0 %	0 %	25 %	339635253
109	NC_015756	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
110	NC_015756	GAG	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339635254
111	NC_015756	ACAA	2	8	5070	5077	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
112	NC_015756	CAAA	2	8	5085	5092	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
113	NC_015756	GTT	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635254
114	NC_015756	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
115	NC_015756	ACAA	2	8	5160	5167	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
116	NC_015756	ACAA	2	8	5194	5201	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
117	NC_015756	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635254
118	NC_015756	CAA	2	6	5355	5360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635254
119	NC_015756	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
120	NC_015756	ATG	3	9	5443	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635254
121	NC_015756	AAG	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
122	NC_015756	ACAA	2	8	5473	5480	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
123	NC_015756	AACCTA	2	12	5512	5523	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	339635254
124	NC_015756	GTG	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339635254
125	NC_015756	A	6	6	5558	5563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015756	AGA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015756	TCT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015756	T	6	6	5654	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015756	A	6	6	5675	5680	100 %	0 %	0 %	0 %	339635255
130	NC_015756	TTG	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635255
131	NC_015756	GAA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635255
132	NC_015756	AAT	2	6	5972	5977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015756	ATTT	2	8	5988	5995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015756	A	6	6	5996	6001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015756	ACGTTT	2	12	6042	6053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_015756	AGG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015756	AGG	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015756	TAG	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635256
139	NC_015756	ATC	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635256
140	NC_015756	GAAA	2	8	6199	6206	75 %	0 %	25 %	0 %	339635256
141	NC_015756	A	6	6	6204	6209	100 %	0 %	0 %	0 %	339635256
142	NC_015756	AAG	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635256
143	NC_015756	ATTT	2	8	6295	6302	25 %	75 %	0 %	0 %	339635256
144	NC_015756	TAC	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635256
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410	NC_015756	T	6	6	17895	17900	0 %	100 %	0 %	0 %	339635272
411	NC_015756	ATA	2	6	18025	18030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635272
412	NC_015756	TGA	2	6	18059	18064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635272
413	NC_015756	ACC	2	6	18111	18116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339635272
414	NC_015756	ACC	2	6	18120	18125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339635272
415	NC_015756	AAG	2	6	18133	18138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635272
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417	NC_015756	TAAT	2	8	18256	18263	50 %	50 %	0 %	0 %	339635272
418	NC_015756	GAG	2	6	18414	18419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339635272
419	NC_015756	GT	3	6	18515	18520	0 %	50 %	50 %	0 %	339635272
420	NC_015756	TAT	2	6	18548	18553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635272
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422	NC_015756	GGCT	2	8	18659	18666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
423	NC_015756	CGTGGA	2	12	18740	18751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
424	NC_015756	T	6	6	18758	18763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_015756	CTT	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_015756	TTG	2	6	18840	18845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_015756	TGCT	2	8	18861	18868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
428	NC_015756	AG	3	6	18875	18880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
429	NC_015756	TGAC	2	8	18911	18918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
430	NC_015756	TGA	2	6	18933	18938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.